MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 33958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017326	AGCG	2	8	134526	134533	25 %	0 %	50 %	25 %	384538365
3002	NC_017326	CGA	2	6	134542	134547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3003	NC_017326	CGC	2	6	134617	134622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3004	NC_017326	ACG	2	6	134634	134639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3005	NC_017326	GCG	2	6	134764	134769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538365
3006	NC_017326	GAC	3	9	134780	134788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3007	NC_017326	GTC	2	6	134795	134800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3008	NC_017326	GCC	2	6	134817	134822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3009	NC_017326	GAA	2	6	134834	134839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538365
3010	NC_017326	GCG	2	6	134884	134889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538365
3011	NC_017326	GT	3	6	134892	134897	0 %	50 %	50 %	0 %	384538365
3012	NC_017326	GAT	2	6	134960	134965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538365
3013	NC_017326	GC	3	6	134978	134983	0 %	0 %	50 %	50 %	384538365
3014	NC_017326	CGT	2	6	134989	134994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3015	NC_017326	GGTCGA	2	12	135079	135090	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384538365
3016	NC_017326	GTC	2	6	135147	135152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3017	NC_017326	GCC	2	6	135161	135166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3018	NC_017326	CG	3	6	135235	135240	0 %	0 %	50 %	50 %	384538365
3019	NC_017326	CGT	2	6	135321	135326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3020	NC_017326	CCG	2	6	135327	135332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3021	NC_017326	AGCG	2	8	135362	135369	25 %	0 %	50 %	25 %	384538365
3022	NC_017326	GGC	2	6	135410	135415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538365
3023	NC_017326	CG	3	6	135504	135509	0 %	0 %	50 %	50 %	384538365
3024	NC_017326	CGG	2	6	135511	135516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538365
3025	NC_017326	CCG	2	6	135549	135554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3026	NC_017326	CGT	2	6	135566	135571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538365
3027	NC_017326	CGC	3	9	135572	135580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538365
3028	NC_017326	TCA	2	6	135586	135591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538365
3029	NC_017326	GGC	2	6	135808	135813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538366
3030	NC_017326	GAAG	2	8	135819	135826	50 %	0 %	50 %	0 %	384538366
3031	NC_017326	CCG	2	6	135827	135832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538366
3032	NC_017326	TTC	2	6	135845	135850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538366
3033	NC_017326	ATC	2	6	135860	135865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538366
3034	NC_017326	CCAC	2	8	135936	135943	25 %	0 %	0 %	75 %	384538366
3035	NC_017326	CGAGGA	2	12	135957	135968	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384538366
3036	NC_017326	CCG	2	6	136032	136037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538366
3037	NC_017326	GGAT	2	8	136060	136067	25 %	25 %	50 %	0 %	384538366
3038	NC_017326	GGC	2	6	136102	136107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538366
3039	NC_017326	GGC	2	6	136116	136121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538366
3040	NC_017326	ACG	2	6	136532	136537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3041	NC_017326	GAT	2	6	136549	136554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538367
3042	NC_017326	CGG	2	6	136598	136603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3043	NC_017326	GGC	2	6	136611	136616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3044	NC_017326	GC	4	8	136656	136663	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3045	NC_017326	GAG	2	6	136678	136683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538367
3046	NC_017326	GCCGC	2	10	136697	136706	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
3047	NC_017326	GC	3	6	136705	136710	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3048	NC_017326	CG	3	6	136760	136765	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3049	NC_017326	CTT	2	6	136827	136832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538367
3050	NC_017326	CCG	2	6	136891	136896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
3051	NC_017326	GAA	2	6	136903	136908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538367
3052	NC_017326	CGA	2	6	136923	136928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3053	NC_017326	CGG	2	6	136934	136939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3054	NC_017326	GTG	2	6	136969	136974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538367
3055	NC_017326	TCCG	2	8	136989	136996	0 %	25 %	25 %	50 %	384538367
3056	NC_017326	GTCC	2	8	137024	137031	0 %	25 %	25 %	50 %	384538367
3057	NC_017326	CTC	2	6	137035	137040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538367
3058	NC_017326	GCA	2	6	137052	137057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3059	NC_017326	CCT	2	6	137063	137068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538367
3060	NC_017326	AGCG	2	8	137097	137104	25 %	0 %	50 %	25 %	384538367
3061	NC_017326	CGTGGC	2	12	137130	137141	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384538367
3062	NC_017326	GGA	2	6	137142	137147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538367
3063	NC_017326	GGA	3	9	137253	137261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538367
3064	NC_017326	CG	3	6	137280	137285	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3065	NC_017326	CCG	2	6	137347	137352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
3066	NC_017326	GAAG	2	8	137370	137377	50 %	0 %	50 %	0 %	384538367
3067	NC_017326	CG	3	6	137379	137384	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3068	NC_017326	TGC	2	6	137436	137441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
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3070	NC_017326	GTG	2	6	137497	137502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538367
3071	NC_017326	CGG	2	6	137509	137514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3072	NC_017326	GCCGC	2	10	137545	137554	0 %	0 %	40 %	60 %	384538367
3073	NC_017326	CGC	2	6	137562	137567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
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3075	NC_017326	GCC	2	6	137590	137595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
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3078	NC_017326	GCCG	2	8	137709	137716	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3079	NC_017326	TCG	2	6	137728	137733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3080	NC_017326	GCC	2	6	137742	137747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
3081	NC_017326	GCG	2	6	137774	137779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
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3085	NC_017326	GTC	2	6	137941	137946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3086	NC_017326	TCC	2	6	137983	137988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538367
3087	NC_017326	CGA	2	6	138006	138011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3088	NC_017326	CT	3	6	138034	138039	0 %	50 %	0 %	50 %	384538367
3089	NC_017326	ACGCG	2	10	138092	138101	20 %	0 %	40 %	40 %	384538367
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3091	NC_017326	CGG	2	6	138189	138194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3092	NC_017326	TCG	2	6	138236	138241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3093	NC_017326	CAC	2	6	138246	138251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384538367
3094	NC_017326	GCT	2	6	138294	138299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3095	NC_017326	GAA	2	6	138316	138321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538367
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3098	NC_017326	CGT	2	6	138396	138401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
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3102	NC_017326	GGC	2	6	138519	138524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3103	NC_017326	CG	4	8	138525	138532	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3104	NC_017326	GC	3	6	138539	138544	0 %	0 %	50 %	50 %	384538367
3105	NC_017326	AGC	2	6	138602	138607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3106	NC_017326	TCG	2	6	138638	138643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
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3108	NC_017326	TGA	2	6	138668	138673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538367
3109	NC_017326	GGCA	2	8	138732	138739	25 %	0 %	50 %	25 %	384538367
3110	NC_017326	TCA	2	6	138779	138784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538367
3111	NC_017326	CTC	2	6	138883	138888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538367
3112	NC_017326	TGC	2	6	138902	138907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3113	NC_017326	CGG	3	9	138915	138923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538367
3114	NC_017326	GTTT	2	8	138948	138955	0 %	75 %	25 %	0 %	384538367
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3119	NC_017326	AAG	2	6	139150	139155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538367
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3121	NC_017326	GCC	2	6	139178	139183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
3122	NC_017326	CGC	2	6	139203	139208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538367
3123	NC_017326	TCG	2	6	139241	139246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3124	NC_017326	ATC	2	6	139276	139281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538367
3125	NC_017326	CGA	2	6	139317	139322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538367
3126	NC_017326	GCCG	2	8	139468	139475	0 %	0 %	50 %	50 %	384538368
3127	NC_017326	CGC	2	6	139504	139509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538368
3128	NC_017326	TCG	2	6	139560	139565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538368
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3130	NC_017326	GCG	4	12	139644	139655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538368
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3135	NC_017326	CTT	2	6	139987	139992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538369
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3137	NC_017326	GCA	2	6	140034	140039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538369
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3142	NC_017326	CCG	2	6	140177	140182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538369
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3149	NC_017326	GCC	2	6	140513	140518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538370
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3152	NC_017326	CGA	2	6	140598	140603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538370
3153	NC_017326	GAT	2	6	140671	140676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538370
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3158	NC_017326	CCT	2	6	140838	140843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538370
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3160	NC_017326	TGC	2	6	140880	140885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538370
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3162	NC_017326	GGC	2	6	140957	140962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538370
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3166	NC_017326	TGC	2	6	141270	141275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538371
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3177	NC_017326	GC	3	6	142005	142010	0 %	0 %	50 %	50 %	384538373
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3181	NC_017326	CTGG	2	8	142113	142120	0 %	25 %	50 %	25 %	384538373
3182	NC_017326	CCCATG	2	12	142207	142218	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384538373
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3185	NC_017326	CCT	2	6	142292	142297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538373
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3192	NC_017326	TCG	2	6	142426	142431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538373
3193	NC_017326	GAC	2	6	142440	142445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538373
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3195	NC_017326	CGA	2	6	142478	142483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538373
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3200	NC_017326	TCA	2	6	142634	142639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538373
3201	NC_017326	TCG	2	6	142664	142669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538373
3202	NC_017326	GCA	2	6	142715	142720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538373
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3210	NC_017326	CGCC	2	8	142913	142920	0 %	0 %	25 %	75 %	384538373
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3212	NC_017326	GTC	2	6	143013	143018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538373
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3223	NC_017326	TGA	2	6	143452	143457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538374
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3225	NC_017326	ACG	2	6	143538	143543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538374
3226	NC_017326	CGAT	2	8	143565	143572	25 %	25 %	25 %	25 %	384538374
3227	NC_017326	GC	3	6	143575	143580	0 %	0 %	50 %	50 %	384538374
3228	NC_017326	GCA	2	6	143695	143700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538374
3229	NC_017326	GGC	2	6	143780	143785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538374
3230	NC_017326	GC	3	6	143791	143796	0 %	0 %	50 %	50 %	384538374
3231	NC_017326	CGA	2	6	143803	143808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538374
3232	NC_017326	CGT	3	9	143815	143823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538374
3233	NC_017326	GC	5	10	143830	143839	0 %	0 %	50 %	50 %	384538374
3234	NC_017326	TCA	2	6	143851	143856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538374
3235	NC_017326	T	6	6	143881	143886	0 %	100 %	0 %	0 %	384538374
3236	NC_017326	GGCG	2	8	143926	143933	0 %	0 %	75 %	25 %	384538375
3237	NC_017326	GCC	2	6	144071	144076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538375
3238	NC_017326	GCA	2	6	144112	144117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538375
3239	NC_017326	TCG	2	6	144147	144152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538375
3240	NC_017326	GGC	2	6	144185	144190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538375
3241	NC_017326	CTTC	2	8	144199	144206	0 %	50 %	0 %	50 %	384538375
3242	NC_017326	CGA	2	6	144214	144219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538375
3243	NC_017326	CGTTGC	2	12	144235	144246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538375
3244	NC_017326	GAT	2	6	144266	144271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538375
3245	NC_017326	GGC	2	6	144437	144442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538375
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3247	NC_017326	GCC	2	6	144530	144535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538375
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3249	NC_017326	CTG	2	6	145023	145028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538376
3250	NC_017326	ACG	2	6	145057	145062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538376
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3253	NC_017326	CGCCTC	2	12	145184	145195	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384538376
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3255	NC_017326	GCG	2	6	145241	145246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538376
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3257	NC_017326	CGAGGC	2	12	145331	145342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384538376
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3259	NC_017326	GCG	2	6	145424	145429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538376
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3261	NC_017326	ATC	2	6	145452	145457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538376
3262	NC_017326	GCC	2	6	145551	145556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538376
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3265	NC_017326	GCC	3	9	145823	145831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538377
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3346	NC_017326	CATCG	2	10	148804	148813	20 %	20 %	20 %	40 %	384538379
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3358	NC_017326	CCT	2	6	149330	149335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384538379
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3363	NC_017326	GCGA	2	8	149461	149468	25 %	0 %	50 %	25 %	384538379
3364	NC_017326	CG	3	6	149545	149550	0 %	0 %	50 %	50 %	384538379
3365	NC_017326	TGG	2	6	149584	149589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384538379
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3367	NC_017326	TGC	2	6	149600	149605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538379
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3374	NC_017326	TGA	2	6	149895	149900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384538380
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3441	NC_017326	CGA	2	6	153155	153160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538382
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3471	NC_017326	AGC	2	6	154619	154624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538383
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3473	NC_017326	CTT	2	6	154653	154658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384538383
3474	NC_017326	CGCGC	2	10	154735	154744	0 %	0 %	40 %	60 %	384538384
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3476	NC_017326	GGC	2	6	154826	154831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538384
3477	NC_017326	GAG	2	6	154920	154925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384538384
3478	NC_017326	CATG	2	8	154931	154938	25 %	25 %	25 %	25 %	384538384
3479	NC_017326	CG	3	6	154966	154971	0 %	0 %	50 %	50 %	384538384
3480	NC_017326	CTG	2	6	154989	154994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538384
3481	NC_017326	CGG	2	6	155020	155025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538384
3482	NC_017326	T	6	6	155161	155166	0 %	100 %	0 %	0 %	384538385
3483	NC_017326	CCG	2	6	155188	155193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538385
3484	NC_017326	TGC	2	6	155222	155227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538385
3485	NC_017326	CGC	2	6	155231	155236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538385
3486	NC_017326	GCT	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538385
3487	NC_017326	ACCGG	2	10	155278	155287	20 %	0 %	40 %	40 %	384538385
3488	NC_017326	CAT	2	6	155373	155378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384538385
3489	NC_017326	CGA	2	6	155397	155402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538385
3490	NC_017326	TCG	2	6	155429	155434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384538385
3491	NC_017326	CGG	2	6	155454	155459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538385
3492	NC_017326	AAG	2	6	155473	155478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384538385
3493	NC_017326	CGC	2	6	155492	155497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384538385
3494	NC_017326	CGG	2	6	155511	155516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384538385
3495	NC_017326	CGA	2	6	155535	155540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538385
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3500	NC_017326	AGC	2	6	155747	155752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384538385

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