MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 2447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017325	CCGCG	2	10	1231	1240	0 %	0 %	40 %	60 %	384534465
2	NC_017325	CACGG	2	10	3968	3977	20 %	0 %	40 %	40 %	384534469
3	NC_017325	GCAGC	2	10	4800	4809	20 %	0 %	40 %	40 %	384534470
4	NC_017325	AGGCA	2	10	6175	6184	40 %	0 %	40 %	20 %	384534471
5	NC_017325	GTCGT	2	10	10461	10470	0 %	40 %	40 %	20 %	384534476
6	NC_017325	GGGCA	2	10	12520	12529	20 %	0 %	60 %	20 %	384534478
7	NC_017325	GGTCG	2	10	13910	13919	0 %	20 %	60 %	20 %	384534479
8	NC_017325	CGATC	2	10	14723	14732	20 %	20 %	20 %	40 %	384534480
9	NC_017325	GCCGC	2	10	15660	15669	0 %	0 %	40 %	60 %	384534481
10	NC_017325	GATCG	2	10	16475	16484	20 %	20 %	40 %	20 %	384534482
11	NC_017325	CGAGC	2	10	18102	18111	20 %	0 %	40 %	40 %	384534485
12	NC_017325	CACGG	2	10	19827	19836	20 %	0 %	40 %	40 %	384534487
13	NC_017325	GCACG	2	10	19837	19846	20 %	0 %	40 %	40 %	384534487
14	NC_017325	GGCGC	2	10	20633	20642	0 %	0 %	60 %	40 %	384534487
15	NC_017325	GGCAT	2	10	21836	21845	20 %	20 %	40 %	20 %	384534489
16	NC_017325	ACGCG	2	10	23304	23313	20 %	0 %	40 %	40 %	384534489
17	NC_017325	CCGCC	2	10	23510	23519	0 %	0 %	20 %	80 %	384534489
18	NC_017325	CGATG	2	10	24408	24417	20 %	20 %	40 %	20 %	384534490
19	NC_017325	CGCGC	2	10	26039	26048	0 %	0 %	40 %	60 %	384534492
20	NC_017325	CGAAG	2	10	27797	27806	40 %	0 %	40 %	20 %	384534493
21	NC_017325	TCGAT	2	10	28507	28516	20 %	40 %	20 %	20 %	384534493
22	NC_017325	TGACC	2	10	36825	36834	20 %	20 %	20 %	40 %	384534498
23	NC_017325	CGGCT	2	10	37118	37127	0 %	20 %	40 %	40 %	384534499
24	NC_017325	CGGCG	2	10	38297	38306	0 %	0 %	60 %	40 %	384534500
25	NC_017325	CGGAC	2	10	38402	38411	20 %	0 %	40 %	40 %	384534500
26	NC_017325	GGCCG	2	10	41417	41426	0 %	0 %	60 %	40 %	384534503
27	NC_017325	CGCGT	2	10	44085	44094	0 %	20 %	40 %	40 %	384534506
28	NC_017325	CCGGG	2	10	46371	46380	0 %	0 %	60 %	40 %	384534508
29	NC_017325	GCACG	2	10	47893	47902	20 %	0 %	40 %	40 %	384534509
30	NC_017325	CGCGG	2	10	53957	53966	0 %	0 %	60 %	40 %	384534515
31	NC_017325	CGGCG	2	10	54628	54637	0 %	0 %	60 %	40 %	384534515
32	NC_017325	GGCGC	2	10	58145	58154	0 %	0 %	60 %	40 %	384534519
33	NC_017325	GCCCA	2	10	59112	59121	20 %	0 %	20 %	60 %	384534520
34	NC_017325	AGGTC	2	10	61211	61220	20 %	20 %	40 %	20 %	384534522
35	NC_017325	GCCGC	2	10	65085	65094	0 %	0 %	40 %	60 %	384534523
36	NC_017325	GCGCC	2	10	65302	65311	0 %	0 %	40 %	60 %	384534524
37	NC_017325	AGGAG	2	10	70387	70396	40 %	0 %	60 %	0 %	384534529
38	NC_017325	CCGCG	2	10	70510	70519	0 %	0 %	40 %	60 %	384534529
39	NC_017325	TCGCC	2	10	72252	72261	0 %	20 %	20 %	60 %	384534532
40	NC_017325	TCCGC	2	10	72726	72735	0 %	20 %	20 %	60 %	384534533
41	NC_017325	TCATC	2	10	74279	74288	20 %	40 %	0 %	40 %	384534534
42	NC_017325	TGCCA	2	10	74611	74620	20 %	20 %	20 %	40 %	384534534
43	NC_017325	CCGTC	2	10	76102	76111	0 %	20 %	20 %	60 %	384534536
44	NC_017325	AGGGC	2	10	76613	76622	20 %	0 %	60 %	20 %	384534536
45	NC_017325	GCCGC	3	15	77149	77163	0 %	0 %	40 %	60 %	384534537
46	NC_017325	GCGCA	2	10	77250	77259	20 %	0 %	40 %	40 %	384534537
47	NC_017325	TCGAA	2	10	78852	78861	40 %	20 %	20 %	20 %	384534539
48	NC_017325	GGGTC	2	10	80222	80231	0 %	20 %	60 %	20 %	384534541
49	NC_017325	ATCCG	2	10	81378	81387	20 %	20 %	20 %	40 %	384534541
50	NC_017325	CAGCG	2	10	83969	83978	20 %	0 %	40 %	40 %	384534544
51	NC_017325	CTTTC	2	10	85424	85433	0 %	60 %	0 %	40 %	384534545
52	NC_017325	CCGAG	2	10	89785	89794	20 %	0 %	40 %	40 %	384534548
53	NC_017325	CGGCG	2	10	90559	90568	0 %	0 %	60 %	40 %	384534549
54	NC_017325	GGCTC	2	10	91108	91117	0 %	20 %	40 %	40 %	384534550
55	NC_017325	ACAAG	2	10	94836	94845	60 %	0 %	20 %	20 %	384534552
56	NC_017325	GGTCC	2	10	97184	97193	0 %	20 %	40 %	40 %	384534553
57	NC_017325	CGGAG	2	10	97640	97649	20 %	0 %	60 %	20 %	384534553
58	NC_017325	GGCCG	2	10	100628	100637	0 %	0 %	60 %	40 %	384534553
59	NC_017325	GGAAA	2	10	100942	100951	60 %	0 %	40 %	0 %	384534553
60	NC_017325	CGGGC	2	10	103973	103982	0 %	0 %	60 %	40 %	384534555
61	NC_017325	ACGGT	2	10	104995	105004	20 %	20 %	40 %	20 %	384534555
62	NC_017325	CGAGG	2	10	107367	107376	20 %	0 %	60 %	20 %	384534558
63	NC_017325	TCGTC	2	10	112112	112121	0 %	40 %	20 %	40 %	384534565
64	NC_017325	TGATG	2	10	112389	112398	20 %	40 %	40 %	0 %	384534565
65	NC_017325	GCACA	2	10	112503	112512	40 %	0 %	20 %	40 %	384534565
66	NC_017325	GATGC	2	10	113547	113556	20 %	20 %	40 %	20 %	384534565
67	NC_017325	CGAGC	2	10	117620	117629	20 %	0 %	40 %	40 %	384534569
68	NC_017325	CGGCC	2	10	119646	119655	0 %	0 %	40 %	60 %	384534570
69	NC_017325	TCGCG	2	10	121998	122007	0 %	20 %	40 %	40 %	384534574
70	NC_017325	GTCGA	2	10	124404	124413	20 %	20 %	40 %	20 %	384534576
71	NC_017325	TGGGG	2	10	125140	125149	0 %	20 %	80 %	0 %	384534577
72	NC_017325	ACCGC	2	10	125409	125418	20 %	0 %	20 %	60 %	384534577
73	NC_017325	ATCGA	2	10	125600	125609	40 %	20 %	20 %	20 %	384534577
74	NC_017325	GAGGC	2	10	126043	126052	20 %	0 %	60 %	20 %	384534578
75	NC_017325	CCGGT	2	10	128386	128395	0 %	20 %	40 %	40 %	384534581
76	NC_017325	CGCGG	2	10	129871	129880	0 %	0 %	60 %	40 %	384534583
77	NC_017325	AGGGC	2	10	130231	130240	20 %	0 %	60 %	20 %	384534584
78	NC_017325	AGTGG	2	10	130947	130956	20 %	20 %	60 %	0 %	384534584
79	NC_017325	CCGCA	2	10	131201	131210	20 %	0 %	20 %	60 %	384534585
80	NC_017325	CGGTG	2	10	131722	131731	0 %	20 %	60 %	20 %	384534586
81	NC_017325	AGACA	2	10	137807	137816	60 %	0 %	20 %	20 %	384534589
82	NC_017325	GAAGC	2	10	141656	141665	40 %	0 %	40 %	20 %	384534594
83	NC_017325	TGCCG	2	10	141799	141808	0 %	20 %	40 %	40 %	384534594
84	NC_017325	GATCG	2	10	143050	143059	20 %	20 %	40 %	20 %	384534595
85	NC_017325	GCGTC	2	10	144810	144819	0 %	20 %	40 %	40 %	384534596
86	NC_017325	TCGCG	2	10	145798	145807	0 %	20 %	40 %	40 %	384534597
87	NC_017325	CGCTT	2	10	147234	147243	0 %	40 %	20 %	40 %	384534598
88	NC_017325	GCACG	2	10	147282	147291	20 %	0 %	40 %	40 %	384534598
89	NC_017325	GAAGA	2	10	147304	147313	60 %	0 %	40 %	0 %	384534598
90	NC_017325	GGTCA	2	10	148169	148178	20 %	20 %	40 %	20 %	384534599
91	NC_017325	ATGCG	2	10	148332	148341	20 %	20 %	40 %	20 %	384534599
92	NC_017325	GCTCG	2	10	148462	148471	0 %	20 %	40 %	40 %	384534599
93	NC_017325	TCCGC	2	10	150338	150347	0 %	20 %	20 %	60 %	384534600
94	NC_017325	CTGCG	2	10	152823	152832	0 %	20 %	40 %	40 %	384534603
95	NC_017325	GCGCG	2	10	153083	153092	0 %	0 %	60 %	40 %	384534603
96	NC_017325	CGGCG	2	10	154463	154472	0 %	0 %	60 %	40 %	384534605
97	NC_017325	CCGGA	2	10	157311	157320	20 %	0 %	40 %	40 %	384534607
98	NC_017325	GGCCG	2	10	159393	159402	0 %	0 %	60 %	40 %	384534610
99	NC_017325	GAGCG	2	10	160060	160069	20 %	0 %	60 %	20 %	384534610
100	NC_017325	GCCCG	2	10	160474	160483	0 %	0 %	40 %	60 %	384534611
101	NC_017325	CGTCT	2	10	161297	161306	0 %	40 %	20 %	40 %	384534611
102	NC_017325	CGGCG	2	10	163856	163865	0 %	0 %	60 %	40 %	384534615
103	NC_017325	TTCGC	2	10	164178	164187	0 %	40 %	20 %	40 %	384534615
104	NC_017325	CCGGA	2	10	164241	164250	20 %	0 %	40 %	40 %	384534615
105	NC_017325	GGAGC	2	10	167278	167287	20 %	0 %	60 %	20 %	384534618
106	NC_017325	GGATC	2	10	170175	170184	20 %	20 %	40 %	20 %	384534621
107	NC_017325	TCGAC	2	10	171031	171040	20 %	20 %	20 %	40 %	384534621
108	NC_017325	AAGCG	2	10	173913	173922	40 %	0 %	40 %	20 %	384534623
109	NC_017325	CGCAG	2	10	178728	178737	20 %	0 %	40 %	40 %	384534625
110	NC_017325	CGGCG	2	10	181645	181654	0 %	0 %	60 %	40 %	384534628
111	NC_017325	ATCGG	2	10	182811	182820	20 %	20 %	40 %	20 %	384534628
112	NC_017325	CGGCG	2	10	186223	186232	0 %	0 %	60 %	40 %	384534632
113	NC_017325	CGACG	2	10	186825	186834	20 %	0 %	40 %	40 %	384534634
114	NC_017325	AGCTG	2	10	187189	187198	20 %	20 %	40 %	20 %	384534634
115	NC_017325	CCGGC	2	10	187698	187707	0 %	0 %	40 %	60 %	384534635
116	NC_017325	CCGGC	2	10	188686	188695	0 %	0 %	40 %	60 %	384534636
117	NC_017325	AGCCG	2	10	189330	189339	20 %	0 %	40 %	40 %	384534636
118	NC_017325	CGTCG	2	10	189822	189831	0 %	20 %	40 %	40 %	384534637
119	NC_017325	GCCGC	2	10	192566	192575	0 %	0 %	40 %	60 %	384534640
120	NC_017325	GGCAT	2	10	192805	192814	20 %	20 %	40 %	20 %	384534640
121	NC_017325	CCGTT	2	10	196226	196235	0 %	40 %	20 %	40 %	384534642
122	NC_017325	AAGCG	2	10	196691	196700	40 %	0 %	40 %	20 %	384534642
123	NC_017325	ACCGG	2	10	196835	196844	20 %	0 %	40 %	40 %	384534642
124	NC_017325	TGGTC	2	10	197201	197210	0 %	40 %	40 %	20 %	384534643
125	NC_017325	CGGAG	2	10	198520	198529	20 %	0 %	60 %	20 %	384534644
126	NC_017325	CGGCG	2	10	198865	198874	0 %	0 %	60 %	40 %	384534645
127	NC_017325	CCGGC	2	10	200869	200878	0 %	0 %	40 %	60 %	384534646
128	NC_017325	GATCG	2	10	201905	201914	20 %	20 %	40 %	20 %	384534647
129	NC_017325	GGTTC	2	10	202027	202036	0 %	40 %	40 %	20 %	384534647
130	NC_017325	GGCAT	2	10	202491	202500	20 %	20 %	40 %	20 %	384534647
131	NC_017325	CGCGC	2	10	202857	202866	0 %	0 %	40 %	60 %	384534648
132	NC_017325	CGAGC	2	10	202986	202995	20 %	0 %	40 %	40 %	384534648
133	NC_017325	GAGCC	2	10	203176	203185	20 %	0 %	40 %	40 %	384534648
134	NC_017325	CGATG	2	10	203267	203276	20 %	20 %	40 %	20 %	384534648
135	NC_017325	GCCGC	2	10	203366	203375	0 %	0 %	40 %	60 %	384534649
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252	NC_017325	GAACA	2	10	414725	414734	60 %	0 %	20 %	20 %	384534844
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259	NC_017325	GCAAG	2	10	425424	425433	40 %	0 %	40 %	20 %	384534862
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261	NC_017325	GATCC	2	10	431831	431840	20 %	20 %	20 %	40 %	384534867
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