MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017325	GTCG	2	8	181424	181431	0 %	25 %	50 %	25 %	384534628
4002	NC_017325	CGA	2	6	181432	181437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4003	NC_017325	CGG	2	6	181470	181475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4004	NC_017325	TGG	2	6	181497	181502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534628
4005	NC_017325	GCCT	2	8	181507	181514	0 %	25 %	25 %	50 %	384534628
4006	NC_017325	TCG	3	9	181575	181583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4007	NC_017325	CG	3	6	181582	181587	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4008	NC_017325	GCCA	2	8	181614	181621	25 %	0 %	25 %	50 %	384534628
4009	NC_017325	CGGCG	2	10	181645	181654	0 %	0 %	60 %	40 %	384534628
4010	NC_017325	TCTT	2	8	181672	181679	0 %	75 %	0 %	25 %	384534628
4011	NC_017325	TGC	2	6	181685	181690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4012	NC_017325	GCC	2	6	181715	181720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
4013	NC_017325	GCA	2	6	181798	181803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4014	NC_017325	GCC	2	6	181880	181885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
4015	NC_017325	CGA	2	6	181945	181950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4016	NC_017325	TGC	2	6	181974	181979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4017	NC_017325	GCC	2	6	182063	182068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
4018	NC_017325	CGA	2	6	182074	182079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4019	NC_017325	GCG	2	6	182127	182132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4020	NC_017325	GC	3	6	182173	182178	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4021	NC_017325	TGC	2	6	182196	182201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4022	NC_017325	GCC	2	6	182271	182276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
4023	NC_017325	GGT	2	6	182341	182346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534628
4024	NC_017325	GAC	2	6	182402	182407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4025	NC_017325	CGA	2	6	182455	182460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4026	NC_017325	GC	3	6	182463	182468	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4027	NC_017325	GCC	2	6	182487	182492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
4028	NC_017325	GCG	2	6	182501	182506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4029	NC_017325	GA	3	6	182519	182524	50 %	0 %	50 %	0 %	384534628
4030	NC_017325	GTG	2	6	182528	182533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534628
4031	NC_017325	TCG	3	9	182550	182558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4032	NC_017325	AGC	2	6	182616	182621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4033	NC_017325	GGC	2	6	182642	182647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4034	NC_017325	CCAG	2	8	182791	182798	25 %	0 %	25 %	50 %	384534628
4035	NC_017325	ATCGG	2	10	182811	182820	20 %	20 %	40 %	20 %	384534628
4036	NC_017325	GGC	2	6	182863	182868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4037	NC_017325	CG	3	6	182874	182879	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4038	NC_017325	GAA	2	6	182960	182965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534628
4039	NC_017325	AGC	2	6	182991	182996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4040	NC_017325	GCT	2	6	183001	183006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4041	NC_017325	CGGG	2	8	183028	183035	0 %	0 %	75 %	25 %	384534628
4042	NC_017325	TCTGCC	2	12	183043	183054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384534628
4043	NC_017325	GCG	2	6	183064	183069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4044	NC_017325	GCG	2	6	183163	183168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
4045	NC_017325	GC	3	6	183199	183204	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4046	NC_017325	CGGG	2	8	183205	183212	0 %	0 %	75 %	25 %	384534628
4047	NC_017325	CGA	2	6	183235	183240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4048	NC_017325	CGCC	2	8	183304	183311	0 %	0 %	25 %	75 %	384534628
4049	NC_017325	GC	3	6	183342	183347	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
4050	NC_017325	ACC	2	6	183370	183375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534628
4051	NC_017325	CTG	2	6	183679	183684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534629
4052	NC_017325	GGC	2	6	183742	183747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534629
4053	NC_017325	CG	3	6	183760	183765	0 %	0 %	50 %	50 %	384534629
4054	NC_017325	GCCG	2	8	183873	183880	0 %	0 %	50 %	50 %	384534629
4055	NC_017325	CGC	2	6	183954	183959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534629
4056	NC_017325	CAT	2	6	183960	183965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534629
4057	NC_017325	CGAA	2	8	184009	184016	50 %	0 %	25 %	25 %	384534629
4058	NC_017325	CGC	2	6	184053	184058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534629
4059	NC_017325	CGC	2	6	184154	184159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534630
4060	NC_017325	GC	3	6	184220	184225	0 %	0 %	50 %	50 %	384534630
4061	NC_017325	AGG	2	6	184270	184275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534630
4062	NC_017325	TCAG	2	8	184291	184298	25 %	25 %	25 %	25 %	384534630
4063	NC_017325	CGC	2	6	184333	184338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534630
4064	NC_017325	CG	3	6	184404	184409	0 %	0 %	50 %	50 %	384534630
4065	NC_017325	CGA	2	6	184412	184417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534630
4066	NC_017325	GAG	2	6	184449	184454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534630
4067	NC_017325	GGC	2	6	184553	184558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534630
4068	NC_017325	GGT	2	6	184618	184623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534631
4069	NC_017325	ACC	2	6	184647	184652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534631
4070	NC_017325	GAC	2	6	184673	184678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534631
4071	NC_017325	CGT	2	6	184685	184690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534631
4072	NC_017325	GAA	2	6	184694	184699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534631
4073	NC_017325	TGC	2	6	184700	184705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534631
4074	NC_017325	CGC	2	6	184792	184797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534631
4075	NC_017325	CG	3	6	184805	184810	0 %	0 %	50 %	50 %	384534631
4076	NC_017325	GAG	2	6	184841	184846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534631
4077	NC_017325	GCC	2	6	184850	184855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534631
4078	NC_017325	GCAATG	2	12	184935	184946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384534631
4079	NC_017325	AGA	2	6	184993	184998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534631
4080	NC_017325	GAA	2	6	185015	185020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534631
4081	NC_017325	AAAG	2	8	185056	185063	75 %	0 %	25 %	0 %	384534631
4082	NC_017325	TGC	2	6	185077	185082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534631
4083	NC_017325	GCG	2	6	185124	185129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534631
4084	NC_017325	TCC	2	6	185160	185165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534631
4085	NC_017325	GCT	2	6	185210	185215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534631
4086	NC_017325	GAT	2	6	185396	185401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534632
4087	NC_017325	CT	3	6	185433	185438	0 %	50 %	0 %	50 %	384534632
4088	NC_017325	GACG	2	8	185484	185491	25 %	0 %	50 %	25 %	384534632
4089	NC_017325	GCAT	2	8	185513	185520	25 %	25 %	25 %	25 %	384534632
4090	NC_017325	GCCC	2	8	185542	185549	0 %	0 %	25 %	75 %	384534632
4091	NC_017325	CCG	2	6	185614	185619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534632
4092	NC_017325	CGC	2	6	185637	185642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534632
4093	NC_017325	GC	3	6	185650	185655	0 %	0 %	50 %	50 %	384534632
4094	NC_017325	TCC	2	6	185670	185675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534632
4095	NC_017325	CCGC	2	8	185843	185850	0 %	0 %	25 %	75 %	384534632
4096	NC_017325	CGA	2	6	185911	185916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534632
4097	NC_017325	GTC	2	6	185942	185947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534632
4098	NC_017325	CGG	2	6	185972	185977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534632
4099	NC_017325	GCCG	2	8	186128	186135	0 %	0 %	50 %	50 %	384534632
4100	NC_017325	CCG	2	6	186175	186180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534632
4101	NC_017325	CGGCG	2	10	186223	186232	0 %	0 %	60 %	40 %	384534632
4102	NC_017325	GGA	2	6	186251	186256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534632
4103	NC_017325	GGC	2	6	186383	186388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534633
4104	NC_017325	CGGA	2	8	186426	186433	25 %	0 %	50 %	25 %	384534633
4105	NC_017325	CGC	2	6	186456	186461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534633
4106	NC_017325	GCT	2	6	186478	186483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534633
4107	NC_017325	GGT	2	6	186484	186489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534633
4108	NC_017325	TGA	2	6	186510	186515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534633
4109	NC_017325	TCC	2	6	186564	186569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534633
4110	NC_017325	CTC	2	6	186623	186628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534633
4111	NC_017325	TCA	2	6	186654	186659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534633
4112	NC_017325	TCG	2	6	186707	186712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534634
4113	NC_017325	GCT	2	6	186723	186728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534634
4114	NC_017325	GTGCCG	2	12	186734	186745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384534634
4115	NC_017325	CAC	2	6	186774	186779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534634
4116	NC_017325	CTT	2	6	186787	186792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534634
4117	NC_017325	CGG	2	6	186801	186806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534634
4118	NC_017325	CGACG	2	10	186825	186834	20 %	0 %	40 %	40 %	384534634
4119	NC_017325	GCC	2	6	186907	186912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534634
4120	NC_017325	GCA	2	6	186922	186927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534634
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4122	NC_017325	GC	3	6	187056	187061	0 %	0 %	50 %	50 %	384534634
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4234	NC_017325	GCGA	2	8	191803	191810	25 %	0 %	50 %	25 %	384534640
4235	NC_017325	CGG	2	6	191813	191818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534640
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4240	NC_017325	CGA	2	6	192062	192067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534640
4241	NC_017325	GA	3	6	192070	192075	50 %	0 %	50 %	0 %	384534640
4242	NC_017325	CG	3	6	192100	192105	0 %	0 %	50 %	50 %	384534640
4243	NC_017325	CTT	2	6	192107	192112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534640
4244	NC_017325	GC	3	6	192117	192122	0 %	0 %	50 %	50 %	384534640
4245	NC_017325	GAT	2	6	192151	192156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534640
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4248	NC_017325	GC	3	6	192303	192308	0 %	0 %	50 %	50 %	384534640
4249	NC_017325	ATG	2	6	192325	192330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534640
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4252	NC_017325	CGA	2	6	192552	192557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534640
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4273	NC_017325	GTC	2	6	193272	193277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534640
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4350	NC_017325	ATC	2	6	196405	196410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534642
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4354	NC_017325	GGA	3	9	196476	196484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534642
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4357	NC_017325	CGA	2	6	196653	196658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534642
4358	NC_017325	TCG	2	6	196670	196675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534642
4359	NC_017325	AAGCG	2	10	196691	196700	40 %	0 %	40 %	20 %	384534642
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4361	NC_017325	TCG	2	6	196829	196834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534642
4362	NC_017325	ACCGG	2	10	196835	196844	20 %	0 %	40 %	40 %	384534642
4363	NC_017325	GC	3	6	196896	196901	0 %	0 %	50 %	50 %	384534642
4364	NC_017325	TGGTC	2	10	197201	197210	0 %	40 %	40 %	20 %	384534643
4365	NC_017325	CGG	2	6	197220	197225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534643
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4401	NC_017325	CGA	2	6	198837	198842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534645
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4403	NC_017325	CGGCG	2	10	198865	198874	0 %	0 %	60 %	40 %	384534645
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4467	NC_017325	CG	3	6	201773	201778	0 %	0 %	50 %	50 %	384534647
4468	NC_017325	GAT	2	6	201785	201790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534647
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4471	NC_017325	GATCG	2	10	201905	201914	20 %	20 %	40 %	20 %	384534647
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4475	NC_017325	GGTTC	2	10	202027	202036	0 %	40 %	40 %	20 %	384534647
4476	NC_017325	TCG	2	6	202086	202091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534647
4477	NC_017325	TCC	2	6	202119	202124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534647
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4479	NC_017325	GCG	2	6	202185	202190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534647
4480	NC_017325	AGC	2	6	202194	202199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534647
4481	NC_017325	GCAT	2	8	202227	202234	25 %	25 %	25 %	25 %	384534647
4482	NC_017325	TCC	2	6	202272	202277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534647
4483	NC_017325	GGCG	2	8	202405	202412	0 %	0 %	75 %	25 %	384534647
4484	NC_017325	TTC	2	6	202433	202438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534647
4485	NC_017325	CGA	2	6	202480	202485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534647
4486	NC_017325	GGCAT	2	10	202491	202500	20 %	20 %	40 %	20 %	384534647
4487	NC_017325	GGC	2	6	202508	202513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534647
4488	NC_017325	CAC	2	6	202532	202537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534648
4489	NC_017325	GGGT	2	8	202538	202545	0 %	25 %	75 %	0 %	384534648
4490	NC_017325	AGC	2	6	202612	202617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534648
4491	NC_017325	AGGT	2	8	202636	202643	25 %	25 %	50 %	0 %	384534648
4492	NC_017325	CGA	2	6	202679	202684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534648
4493	NC_017325	TCG	2	6	202691	202696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534648
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4497	NC_017325	GC	3	6	202751	202756	0 %	0 %	50 %	50 %	384534648
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4499	NC_017325	CGCGC	2	10	202857	202866	0 %	0 %	40 %	60 %	384534648
4500	NC_017325	GGC	2	6	202884	202889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534648

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