MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017325	GTC	2	6	158017	158022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534608
3502	NC_017325	TTC	2	6	158035	158040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534608
3503	NC_017325	GTA	2	6	158044	158049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534608
3504	NC_017325	GC	3	6	158082	158087	0 %	0 %	50 %	50 %	384534608
3505	NC_017325	GC	3	6	158294	158299	0 %	0 %	50 %	50 %	384534609
3506	NC_017325	GGC	2	6	158306	158311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534609
3507	NC_017325	GGCC	2	8	158346	158353	0 %	0 %	50 %	50 %	384534609
3508	NC_017325	GCCTTG	2	12	158393	158404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534609
3509	NC_017325	CTGC	2	8	158437	158444	0 %	25 %	25 %	50 %	384534609
3510	NC_017325	CGC	2	6	158445	158450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534609
3511	NC_017325	CG	3	6	158500	158505	0 %	0 %	50 %	50 %	384534609
3512	NC_017325	CGG	2	6	158523	158528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534609
3513	NC_017325	TCA	2	6	158582	158587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534609
3514	NC_017325	CGG	2	6	158616	158621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534609
3515	NC_017325	GC	3	6	158688	158693	0 %	0 %	50 %	50 %	384534609
3516	NC_017325	GAC	2	6	158697	158702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534609
3517	NC_017325	ACG	2	6	158734	158739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534609
3518	NC_017325	T	6	6	158770	158775	0 %	100 %	0 %	0 %	384534609
3519	NC_017325	GGT	2	6	158798	158803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534609
3520	NC_017325	GACT	2	8	158873	158880	25 %	25 %	25 %	25 %	384534609
3521	NC_017325	CGG	2	6	159017	159022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534610
3522	NC_017325	TCG	2	6	159046	159051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3523	NC_017325	GTC	2	6	159070	159075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3524	NC_017325	TTG	2	6	159112	159117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534610
3525	NC_017325	GAT	2	6	159126	159131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534610
3526	NC_017325	GCT	2	6	159157	159162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3527	NC_017325	GCC	2	6	159201	159206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534610
3528	NC_017325	GCT	2	6	159281	159286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3529	NC_017325	CGG	2	6	159307	159312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534610
3530	NC_017325	CTG	2	6	159324	159329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3531	NC_017325	CAG	2	6	159363	159368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3532	NC_017325	GGCCG	2	10	159393	159402	0 %	0 %	60 %	40 %	384534610
3533	NC_017325	CGC	2	6	159461	159466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534610
3534	NC_017325	TCG	2	6	159497	159502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3535	NC_017325	GAC	3	9	159510	159518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3536	NC_017325	GCG	2	6	159551	159556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534610
3537	NC_017325	ACC	3	9	159574	159582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534610
3538	NC_017325	TCG	2	6	159647	159652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534610
3539	NC_017325	GAA	2	6	159663	159668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534610
3540	NC_017325	CCA	2	6	159722	159727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534610
3541	NC_017325	GCG	2	6	159799	159804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534610
3542	NC_017325	CCG	2	6	159851	159856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534610
3543	NC_017325	GC	4	8	159874	159881	0 %	0 %	50 %	50 %	384534610
3544	NC_017325	CCG	2	6	159989	159994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534610
3545	NC_017325	GAGCG	2	10	160060	160069	20 %	0 %	60 %	20 %	384534610
3546	NC_017325	CCG	2	6	160072	160077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534610
3547	NC_017325	GC	3	6	160316	160321	0 %	0 %	50 %	50 %	384534611
3548	NC_017325	GAT	2	6	160397	160402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534611
3549	NC_017325	GCCCG	2	10	160474	160483	0 %	0 %	40 %	60 %	384534611
3550	NC_017325	GTC	2	6	160526	160531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534611
3551	NC_017325	CG	3	6	160665	160670	0 %	0 %	50 %	50 %	384534611
3552	NC_017325	CGG	2	6	160707	160712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534611
3553	NC_017325	CTG	2	6	160835	160840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534611
3554	NC_017325	TCG	2	6	160863	160868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534611
3555	NC_017325	CGG	3	9	160891	160899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534611
3556	NC_017325	CA	3	6	160967	160972	50 %	0 %	0 %	50 %	384534611
3557	NC_017325	GGT	2	6	160975	160980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534611
3558	NC_017325	GCCGCG	2	12	161037	161048	0 %	0 %	50 %	50 %	384534611
3559	NC_017325	GCC	2	6	161110	161115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534611
3560	NC_017325	CTT	2	6	161182	161187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534611
3561	NC_017325	CCG	2	6	161211	161216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534611
3562	NC_017325	GCGGCA	2	12	161217	161228	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384534611
3563	NC_017325	TCG	2	6	161289	161294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534611
3564	NC_017325	CGTCT	2	10	161297	161306	0 %	40 %	20 %	40 %	384534611
3565	NC_017325	GAC	2	6	161710	161715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534612
3566	NC_017325	GCC	2	6	161891	161896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534612
3567	NC_017325	GCCC	2	8	161959	161966	0 %	0 %	25 %	75 %	384534612
3568	NC_017325	TCG	2	6	161970	161975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534612
3569	NC_017325	GCC	2	6	161987	161992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534612
3570	NC_017325	CGT	2	6	162037	162042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534612
3571	NC_017325	CAC	2	6	162049	162054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534612
3572	NC_017325	TGC	2	6	162215	162220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534612
3573	NC_017325	GAG	2	6	162356	162361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534612
3574	NC_017325	ATCT	2	8	162362	162369	25 %	50 %	0 %	25 %	384534612
3575	NC_017325	GCA	2	6	162450	162455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534613
3576	NC_017325	TCG	2	6	162521	162526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534613
3577	NC_017325	CG	3	6	162528	162533	0 %	0 %	50 %	50 %	384534613
3578	NC_017325	ATGG	2	8	162534	162541	25 %	25 %	50 %	0 %	384534613
3579	NC_017325	AAC	2	6	162557	162562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534613
3580	NC_017325	TGG	2	6	162623	162628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534613
3581	NC_017325	CGG	2	6	162675	162680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3582	NC_017325	GC	3	6	162762	162767	0 %	0 %	50 %	50 %	384534613
3583	NC_017325	ATG	2	6	162776	162781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534613
3584	NC_017325	ATC	2	6	162797	162802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534613
3585	NC_017325	CAG	2	6	162805	162810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534613
3586	NC_017325	TGG	2	6	162866	162871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534613
3587	NC_017325	ACG	2	6	162911	162916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534613
3588	NC_017325	GCG	2	6	162969	162974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3589	NC_017325	GGC	2	6	163039	163044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3590	NC_017325	AGG	2	6	163067	163072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534613
3591	NC_017325	GCG	2	6	163108	163113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3592	NC_017325	GCG	2	6	163181	163186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3593	NC_017325	GGC	3	9	163189	163197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534613
3594	NC_017325	GCC	2	6	163209	163214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534613
3595	NC_017325	GCAT	2	8	163242	163249	25 %	25 %	25 %	25 %	384534613
3596	NC_017325	GC	3	6	163336	163341	0 %	0 %	50 %	50 %	384534614
3597	NC_017325	TGC	2	6	163360	163365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534614
3598	NC_017325	GCA	2	6	163398	163403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534614
3599	NC_017325	CAA	2	6	163408	163413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534614
3600	NC_017325	GCG	2	6	163556	163561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534614
3601	NC_017325	TCG	2	6	163592	163597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534614
3602	NC_017325	GGA	2	6	163614	163619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534614
3603	NC_017325	TCG	3	9	163649	163657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534614
3604	NC_017325	CGG	2	6	163674	163679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534614
3605	NC_017325	CAT	2	6	163681	163686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534614
3606	NC_017325	GCTG	2	8	163713	163720	0 %	25 %	50 %	25 %	384534614
3607	NC_017325	CGGCG	2	10	163856	163865	0 %	0 %	60 %	40 %	384534615
3608	NC_017325	TCG	2	6	163893	163898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534615
3609	NC_017325	CG	3	6	163924	163929	0 %	0 %	50 %	50 %	384534615
3610	NC_017325	GTC	2	6	163931	163936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534615
3611	NC_017325	GAA	2	6	163940	163945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534615
3612	NC_017325	CGGCCT	2	12	163966	163977	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534615
3613	NC_017325	GCG	2	6	164002	164007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534615
3614	NC_017325	CGA	2	6	164023	164028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534615
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3616	NC_017325	CG	3	6	164064	164069	0 %	0 %	50 %	50 %	384534615
3617	NC_017325	GAG	2	6	164082	164087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534615
3618	NC_017325	GC	4	8	164110	164117	0 %	0 %	50 %	50 %	384534615
3619	NC_017325	CG	3	6	164145	164150	0 %	0 %	50 %	50 %	384534615
3620	NC_017325	TTCGC	2	10	164178	164187	0 %	40 %	20 %	40 %	384534615
3621	NC_017325	GTC	2	6	164232	164237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534615
3622	NC_017325	CCGGA	2	10	164241	164250	20 %	0 %	40 %	40 %	384534615
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3742	NC_017325	ATC	2	6	169260	169265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534620
3743	NC_017325	GTC	2	6	169278	169283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534620
3744	NC_017325	GCT	2	6	169306	169311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534620
3745	NC_017325	GATCGC	2	12	169367	169378	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384534620
3746	NC_017325	GCG	2	6	169403	169408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534620
3747	NC_017325	GGC	2	6	169421	169426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534620
3748	NC_017325	GGCG	2	8	169445	169452	0 %	0 %	75 %	25 %	384534620
3749	NC_017325	GCC	3	9	169460	169468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534620
3750	NC_017325	ATC	2	6	169524	169529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534620
3751	NC_017325	ACC	2	6	169563	169568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534620
3752	NC_017325	GAG	2	6	169611	169616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534620
3753	NC_017325	GTC	2	6	169620	169625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534620
3754	NC_017325	ATC	2	6	169626	169631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534620
3755	NC_017325	GCC	2	6	169676	169681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534620
3756	NC_017325	GCGA	2	8	169764	169771	25 %	0 %	50 %	25 %	384534620
3757	NC_017325	GCC	2	6	169784	169789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534620
3758	NC_017325	CTT	2	6	169907	169912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534620
3759	NC_017325	ATC	2	6	169947	169952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534620
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3762	NC_017325	GTC	2	6	170025	170030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534620
3763	NC_017325	TCA	2	6	170056	170061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534620
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3766	NC_017325	GAT	2	6	170195	170200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534621
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3768	NC_017325	ATC	2	6	170292	170297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534621
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3771	NC_017325	CGC	2	6	170569	170574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534621
3772	NC_017325	CGA	2	6	170611	170616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534621
3773	NC_017325	GGA	2	6	170621	170626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534621
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3777	NC_017325	TCG	2	6	170775	170780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534621
3778	NC_017325	GAC	2	6	170819	170824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534621
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3780	NC_017325	GC	3	6	170862	170867	0 %	0 %	50 %	50 %	384534621
3781	NC_017325	CGT	2	6	170896	170901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534621
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3850	NC_017325	GGC	3	9	174843	174851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534623
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3853	NC_017325	CGG	2	6	175055	175060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534623
3854	NC_017325	GGA	2	6	175113	175118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534623
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3857	NC_017325	CGA	2	6	175281	175286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534623
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3984	NC_017325	GGTG	2	8	181051	181058	0 %	25 %	75 %	0 %	384534628
3985	NC_017325	GGC	2	6	181093	181098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
3986	NC_017325	CAT	2	6	181123	181128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534628
3987	NC_017325	GAG	2	6	181142	181147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534628
3988	NC_017325	GC	4	8	181165	181172	0 %	0 %	50 %	50 %	384534628
3989	NC_017325	CGT	2	6	181177	181182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
3990	NC_017325	CGG	2	6	181192	181197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534628
3991	NC_017325	GCC	2	6	181210	181215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
3992	NC_017325	TCT	2	6	181219	181224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534628
3993	NC_017325	GCT	2	6	181240	181245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
3994	NC_017325	AGG	2	6	181290	181295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534628
3995	NC_017325	TCG	2	6	181323	181328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
3996	NC_017325	TCG	2	6	181341	181346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
3997	NC_017325	GCGCCC	2	12	181366	181377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
3998	NC_017325	CGC	2	6	181382	181387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534628
3999	NC_017325	GTC	2	6	181394	181399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534628
4000	NC_017325	GCGA	2	8	181413	181420	25 %	0 %	50 %	25 %	384534628

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