MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 80662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017325	GCG	2	6	225304	225309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5002	NC_017325	GGA	2	6	225341	225346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534664
5003	NC_017325	CGC	2	6	225431	225436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5004	NC_017325	GCC	2	6	225499	225504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5005	NC_017325	CGG	2	6	225587	225592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5006	NC_017325	GC	4	8	225607	225614	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5007	NC_017325	GATCG	2	10	225627	225636	20 %	20 %	40 %	20 %	384534664
5008	NC_017325	GCA	2	6	225659	225664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5009	NC_017325	CCA	2	6	225671	225676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534664
5010	NC_017325	GCC	2	6	225691	225696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5011	NC_017325	TTC	2	6	225820	225825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534664
5012	NC_017325	AGT	2	6	225830	225835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534664
5013	NC_017325	TCCG	2	8	225895	225902	0 %	25 %	25 %	50 %	384534664
5014	NC_017325	G	6	6	225905	225910	0 %	0 %	100 %	0 %	384534664
5015	NC_017325	GAT	2	6	225954	225959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534664
5016	NC_017325	TGG	2	6	225964	225969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534664
5017	NC_017325	GC	3	6	226014	226019	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5018	NC_017325	GCCGG	2	10	226048	226057	0 %	0 %	60 %	40 %	384534664
5019	NC_017325	TGC	2	6	226086	226091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5020	NC_017325	TCG	2	6	226102	226107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5021	NC_017325	CCG	2	6	226118	226123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5022	NC_017325	CCT	2	6	226139	226144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534664
5023	NC_017325	GCC	2	6	226159	226164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5024	NC_017325	GGCC	2	8	226175	226182	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5025	NC_017325	CGA	2	6	226211	226216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5026	NC_017325	CGA	2	6	226229	226234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5027	NC_017325	CCGA	2	8	226273	226280	25 %	0 %	25 %	50 %	384534664
5028	NC_017325	CGG	2	6	226292	226297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5029	NC_017325	CGAG	2	8	226319	226326	25 %	0 %	50 %	25 %	384534664
5030	NC_017325	AGC	2	6	226354	226359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5031	NC_017325	GGTC	2	8	226403	226410	0 %	25 %	50 %	25 %	384534664
5032	NC_017325	CTT	2	6	226562	226567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534664
5033	NC_017325	GGT	2	6	226616	226621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534664
5034	NC_017325	GAT	2	6	226635	226640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534664
5035	NC_017325	GAT	2	6	226649	226654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534664
5036	NC_017325	GGC	2	6	226704	226709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5037	NC_017325	CG	4	8	226716	226723	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5038	NC_017325	CTTC	2	8	226727	226734	0 %	50 %	0 %	50 %	384534664
5039	NC_017325	GGC	2	6	226749	226754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5040	NC_017325	CCG	2	6	226820	226825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5041	NC_017325	CCGGAT	2	12	226853	226864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5042	NC_017325	TGA	2	6	226868	226873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534664
5043	NC_017325	GCC	2	6	226890	226895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5044	NC_017325	TCA	2	6	227063	227068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534664
5045	NC_017325	CCG	2	6	227180	227185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5046	NC_017325	ATC	2	6	227263	227268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534664
5047	NC_017325	CAG	2	6	227271	227276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5048	NC_017325	CG	3	6	227291	227296	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5049	NC_017325	CGA	2	6	227345	227350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5050	NC_017325	CGGT	2	8	227386	227393	0 %	25 %	50 %	25 %	384534664
5051	NC_017325	GCG	2	6	227394	227399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5052	NC_017325	GAC	2	6	227409	227414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5053	NC_017325	GCC	2	6	227415	227420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5054	NC_017325	GC	3	6	227487	227492	0 %	0 %	50 %	50 %	384534664
5055	NC_017325	CGA	2	6	227504	227509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5056	NC_017325	CGC	2	6	227537	227542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534664
5057	NC_017325	CGA	2	6	227543	227548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5058	NC_017325	TC	3	6	227561	227566	0 %	50 %	0 %	50 %	384534664
5059	NC_017325	CGG	2	6	227717	227722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5060	NC_017325	TCG	2	6	227731	227736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5061	NC_017325	GCT	2	6	227861	227866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534664
5062	NC_017325	CGG	2	6	227909	227914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5063	NC_017325	CGG	2	6	227945	227950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534664
5064	NC_017325	ATT	2	6	228390	228395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534665
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5069	NC_017325	CGG	3	9	228756	228764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534665
5070	NC_017325	GGT	2	6	228774	228779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534665
5071	NC_017325	TCG	2	6	228875	228880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534665
5072	NC_017325	GGC	2	6	228897	228902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534665
5073	NC_017325	GC	3	6	228952	228957	0 %	0 %	50 %	50 %	384534665
5074	NC_017325	GACGTC	2	12	229011	229022	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384534665
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5080	NC_017325	CGG	3	9	229368	229376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534665
5081	NC_017325	CGGAC	2	10	229379	229388	20 %	0 %	40 %	40 %	384534665
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5085	NC_017325	TCG	2	6	229559	229564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534665
5086	NC_017325	TCG	2	6	229646	229651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534665
5087	NC_017325	CAA	2	6	229710	229715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534665
5088	NC_017325	CGG	2	6	230115	230120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534666
5089	NC_017325	GCG	2	6	230138	230143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534666
5090	NC_017325	CCG	2	6	230156	230161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534666
5091	NC_017325	CGC	2	6	230183	230188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534666
5092	NC_017325	GTC	2	6	230191	230196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534666
5093	NC_017325	CGGC	2	8	230216	230223	0 %	0 %	50 %	50 %	384534666
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5098	NC_017325	CGATC	2	10	230830	230839	20 %	20 %	20 %	40 %	384534667
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5102	NC_017325	CGA	2	6	230971	230976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534667
5103	NC_017325	CG	3	6	231004	231009	0 %	0 %	50 %	50 %	384534667
5104	NC_017325	AAGA	2	8	231026	231033	75 %	0 %	25 %	0 %	384534667
5105	NC_017325	CGCA	2	8	231068	231075	25 %	0 %	25 %	50 %	384534667
5106	NC_017325	CGT	2	6	231140	231145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534667
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5109	NC_017325	CG	4	8	231237	231244	0 %	0 %	50 %	50 %	384534667
5110	NC_017325	GCCAAG	2	12	231293	231304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534667
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5113	NC_017325	TGC	2	6	231456	231461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534667
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5119	NC_017325	GAGG	2	8	231716	231723	25 %	0 %	75 %	0 %	384534667
5120	NC_017325	ATC	2	6	231731	231736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534667
5121	NC_017325	TGG	2	6	231740	231745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534667
5122	NC_017325	AAG	2	6	231746	231751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534667
5123	NC_017325	TCT	2	6	231783	231788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534667
5124	NC_017325	ATC	2	6	231812	231817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534667
5125	NC_017325	GAAC	2	8	231867	231874	50 %	0 %	25 %	25 %	384534667
5126	NC_017325	CCGA	2	8	231902	231909	25 %	0 %	25 %	50 %	384534667
5127	NC_017325	GCC	2	6	232325	232330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534668
5128	NC_017325	GAA	2	6	232357	232362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534668
5129	NC_017325	CGA	2	6	232372	232377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534668
5130	NC_017325	CGC	2	6	232418	232423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534668
5131	NC_017325	CGG	2	6	232514	232519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534669
5132	NC_017325	CGC	2	6	232524	232529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534669
5133	NC_017325	TCT	2	6	232631	232636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534669
5134	NC_017325	TGC	2	6	232969	232974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5135	NC_017325	ACG	2	6	232980	232985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534670
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5140	NC_017325	TGC	2	6	233193	233198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5141	NC_017325	CGAC	2	8	233233	233240	25 %	0 %	25 %	50 %	384534670
5142	NC_017325	TCG	2	6	233278	233283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5143	NC_017325	ACG	2	6	233284	233289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5144	NC_017325	GAC	2	6	233294	233299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5145	NC_017325	GCT	2	6	233312	233317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534670
5146	NC_017325	CTT	2	6	233467	233472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534671
5147	NC_017325	GCC	2	6	233485	233490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534671
5148	NC_017325	ATG	2	6	233627	233632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534671
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5150	NC_017325	CAT	2	6	233654	233659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534671
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5152	NC_017325	CGG	2	6	233711	233716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534672
5153	NC_017325	GCC	2	6	233787	233792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534672
5154	NC_017325	GAA	2	6	233867	233872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534672
5155	NC_017325	CGG	2	6	233890	233895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534672
5156	NC_017325	GCT	2	6	233906	233911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534672
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5159	NC_017325	CGG	2	6	233956	233961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534672
5160	NC_017325	GCTT	2	8	234170	234177	0 %	50 %	25 %	25 %	384534672
5161	NC_017325	CAGGCG	2	12	234240	234251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384534672
5162	NC_017325	TCT	2	6	234334	234339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534672
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5165	NC_017325	TGA	2	6	234481	234486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534672
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5169	NC_017325	TCG	2	6	234663	234668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534672
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5172	NC_017325	GCGG	2	8	234758	234765	0 %	0 %	75 %	25 %	384534672
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5178	NC_017325	CGG	3	9	235046	235054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534672
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5184	NC_017325	GGT	2	6	235276	235281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534673
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5193	NC_017325	ACC	2	6	235620	235625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534673
5194	NC_017325	CGA	2	6	235633	235638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534673
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5213	NC_017325	CAAC	2	8	236485	236492	50 %	0 %	0 %	50 %	384534674
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5222	NC_017325	CGC	2	6	237073	237078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534675
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5226	NC_017325	GAAG	2	8	237220	237227	50 %	0 %	50 %	0 %	384534675
5227	NC_017325	TCG	2	6	237243	237248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534675
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5232	NC_017325	TCA	3	9	237536	237544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534676
5233	NC_017325	TCG	2	6	237605	237610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534676
5234	NC_017325	GCT	2	6	237621	237626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534676
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5237	NC_017325	GCT	2	6	237843	237848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534676
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5241	NC_017325	GCG	2	6	237969	237974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534676
5242	NC_017325	TC	3	6	237981	237986	0 %	50 %	0 %	50 %	384534676
5243	NC_017325	TTC	2	6	237991	237996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534676
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5342	NC_017325	ACT	2	6	242921	242926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534681
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5352	NC_017325	TCC	2	6	243604	243609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534682
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5360	NC_017325	CTCG	2	8	244227	244234	0 %	25 %	25 %	50 %	384534684
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5362	NC_017325	GGC	2	6	244267	244272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534684
5363	NC_017325	TGC	2	6	244276	244281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534684
5364	NC_017325	CGT	2	6	244333	244338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534684
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5367	NC_017325	TCG	2	6	244599	244604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534684
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5373	NC_017325	GCTG	2	8	244858	244865	0 %	25 %	50 %	25 %	384534685
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5403	NC_017325	CG	3	6	247825	247830	0 %	0 %	50 %	50 %	384534687
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5453	NC_017325	GTC	2	6	251025	251030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534692
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5473	NC_017325	GCA	3	9	252496	252504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534694
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5477	NC_017325	CTC	2	6	252700	252705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534695
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5480	NC_017325	CCT	2	6	252768	252773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534695
5481	NC_017325	CGA	2	6	252795	252800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534695
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5483	NC_017325	TGG	2	6	252819	252824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534695
5484	NC_017325	GGC	2	6	252844	252849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534695
5485	NC_017325	CCG	2	6	252857	252862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534695
5486	NC_017325	TGG	2	6	252882	252887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534695
5487	NC_017325	CGA	2	6	253038	253043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534696
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5491	NC_017325	GCA	2	6	253153	253158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534696
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