MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 75648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017322	TCG	2	6	167684	167689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528251
3502	NC_017322	AGC	2	6	167732	167737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528251
3503	NC_017322	CGT	2	6	167793	167798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528251
3504	NC_017322	CGC	2	6	167848	167853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528251
3505	NC_017322	GGC	2	6	167883	167888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528251
3506	NC_017322	GCC	2	6	168014	168019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3507	NC_017322	GCG	2	6	168090	168095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528252
3508	NC_017322	CGA	2	6	168144	168149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3509	NC_017322	GCC	2	6	168187	168192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3510	NC_017322	AGCCGA	2	12	168207	168218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3511	NC_017322	CG	3	6	168240	168245	0 %	0 %	50 %	50 %	384528252
3512	NC_017322	CTC	2	6	168262	168267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528252
3513	NC_017322	CG	3	6	168275	168280	0 %	0 %	50 %	50 %	384528252
3514	NC_017322	GCT	2	6	168309	168314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3515	NC_017322	TCG	2	6	168452	168457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3516	NC_017322	GCC	2	6	168521	168526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3517	NC_017322	TCT	2	6	168534	168539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528252
3518	NC_017322	TCG	2	6	168560	168565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3519	NC_017322	GGC	2	6	168604	168609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528252
3520	NC_017322	ATC	2	6	168617	168622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3521	NC_017322	CGG	2	6	168625	168630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528252
3522	NC_017322	CG	3	6	168699	168704	0 %	0 %	50 %	50 %	384528252
3523	NC_017322	GAC	2	6	168712	168717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3524	NC_017322	CGC	2	6	168736	168741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3525	NC_017322	CAT	2	6	168808	168813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3526	NC_017322	GAA	2	6	168829	168834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528252
3527	NC_017322	CTT	2	6	168961	168966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528252
3528	NC_017322	CCG	2	6	169029	169034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3529	NC_017322	AGC	2	6	169052	169057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3530	NC_017322	TCC	2	6	169067	169072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528252
3531	NC_017322	GCC	2	6	169177	169182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3532	NC_017322	CGC	2	6	169183	169188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3533	NC_017322	CGA	2	6	169227	169232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3534	NC_017322	CCGG	3	12	169265	169276	0 %	0 %	50 %	50 %	384528252
3535	NC_017322	CG	3	6	169277	169282	0 %	0 %	50 %	50 %	384528252
3536	NC_017322	ATC	2	6	169322	169327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3537	NC_017322	GTC	2	6	169340	169345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3538	NC_017322	GCT	2	6	169368	169373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3539	NC_017322	GATCGC	2	12	169429	169440	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3540	NC_017322	GCG	2	6	169465	169470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528252
3541	NC_017322	GGC	2	6	169483	169488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528252
3542	NC_017322	GGCG	2	8	169507	169514	0 %	0 %	75 %	25 %	384528252
3543	NC_017322	GCC	3	9	169522	169530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3544	NC_017322	ATC	2	6	169586	169591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3545	NC_017322	ACC	2	6	169625	169630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528252
3546	NC_017322	GAG	2	6	169673	169678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528252
3547	NC_017322	GTC	2	6	169682	169687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3548	NC_017322	ATC	2	6	169688	169693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3549	NC_017322	GCC	2	6	169738	169743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3550	NC_017322	GCGA	2	8	169826	169833	25 %	0 %	50 %	25 %	384528252
3551	NC_017322	GCC	2	6	169846	169851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528252
3552	NC_017322	CTT	2	6	169969	169974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528252
3553	NC_017322	ATC	2	6	170009	170014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3554	NC_017322	AGG	2	6	170037	170042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528252
3555	NC_017322	TGA	2	6	170055	170060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528252
3556	NC_017322	GTC	2	6	170087	170092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528252
3557	NC_017322	TCA	2	6	170118	170123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528252
3558	NC_017322	CGTCGG	2	12	170184	170195	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384528252
3559	NC_017322	GGATC	2	10	170237	170246	20 %	20 %	40 %	20 %	384528253
3560	NC_017322	GAT	2	6	170257	170262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528253
3561	NC_017322	TCG	2	6	170333	170338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3562	NC_017322	ATC	2	6	170354	170359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528253
3563	NC_017322	CGC	2	6	170397	170402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528253
3564	NC_017322	GCA	2	6	170451	170456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3565	NC_017322	CGC	2	6	170631	170636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528253
3566	NC_017322	CGA	2	6	170673	170678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3567	NC_017322	GGA	2	6	170683	170688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528253
3568	NC_017322	GTG	2	6	170698	170703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528253
3569	NC_017322	GCC	2	6	170758	170763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528253
3570	NC_017322	GGAA	2	8	170781	170788	50 %	0 %	50 %	0 %	384528253
3571	NC_017322	TCG	2	6	170837	170842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3572	NC_017322	GAC	2	6	170881	170886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3573	NC_017322	GGC	2	6	170920	170925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528253
3574	NC_017322	GC	3	6	170924	170929	0 %	0 %	50 %	50 %	384528253
3575	NC_017322	CGT	2	6	170958	170963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3576	NC_017322	CG	3	6	170964	170969	0 %	0 %	50 %	50 %	384528253
3577	NC_017322	GCC	2	6	171061	171066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528253
3578	NC_017322	TCGAC	2	10	171093	171102	20 %	20 %	20 %	40 %	384528253
3579	NC_017322	GCC	2	6	171103	171108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528253
3580	NC_017322	GTC	2	6	171121	171126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3581	NC_017322	ATG	2	6	171290	171295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528253
3582	NC_017322	CGT	2	6	171297	171302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528253
3583	NC_017322	GC	3	6	171387	171392	0 %	0 %	50 %	50 %	384528253
3584	NC_017322	CTT	2	6	171397	171402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528253
3585	NC_017322	CG	3	6	171411	171416	0 %	0 %	50 %	50 %	384528253
3586	NC_017322	CAT	2	6	171583	171588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528254
3587	NC_017322	CAGG	2	8	171633	171640	25 %	0 %	50 %	25 %	384528254
3588	NC_017322	GAA	2	6	171652	171657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528254
3589	NC_017322	CG	3	6	171691	171696	0 %	0 %	50 %	50 %	384528254
3590	NC_017322	TCC	2	6	171722	171727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528254
3591	NC_017322	GAC	2	6	171763	171768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3592	NC_017322	TCG	2	6	171849	171854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3593	NC_017322	TTC	2	6	171878	171883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528254
3594	NC_017322	TCG	2	6	171911	171916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3595	NC_017322	GCC	2	6	171973	171978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3596	NC_017322	GCC	2	6	172102	172107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3597	NC_017322	CTG	2	6	172114	172119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3598	NC_017322	TCA	2	6	172176	172181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528254
3599	NC_017322	GTC	2	6	172192	172197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3600	NC_017322	CTC	2	6	172210	172215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528254
3601	NC_017322	GCC	2	6	172276	172281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3602	NC_017322	TCA	2	6	172302	172307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528254
3603	NC_017322	GCG	2	6	172312	172317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528254
3604	NC_017322	GAT	2	6	172333	172338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528254
3605	NC_017322	CTT	2	6	172348	172353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528254
3606	NC_017322	CG	4	8	172398	172405	0 %	0 %	50 %	50 %	384528254
3607	NC_017322	GCA	2	6	172412	172417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3608	NC_017322	TCA	3	9	172479	172487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528254
3609	NC_017322	CGC	2	6	172599	172604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3610	NC_017322	CGC	2	6	172632	172637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3611	NC_017322	GC	3	6	172695	172700	0 %	0 %	50 %	50 %	384528254
3612	NC_017322	GC	3	6	172708	172713	0 %	0 %	50 %	50 %	384528254
3613	NC_017322	GAC	2	6	172726	172731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3614	NC_017322	CGG	2	6	172755	172760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528254
3615	NC_017322	TCT	2	6	172770	172775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528254
3616	NC_017322	GCA	2	6	172824	172829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528254
3617	NC_017322	CGC	2	6	172945	172950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3618	NC_017322	CAT	2	6	172978	172983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528254
3619	NC_017322	CGG	2	6	173019	173024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528254
3620	NC_017322	GCC	2	6	173050	173055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528254
3621	NC_017322	TTC	2	6	173059	173064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528254
3622	NC_017322	GGC	2	6	173068	173073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528254
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3742	NC_017322	CGC	2	6	179110	179115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528257
3743	NC_017322	TCG	2	6	179176	179181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528257
3744	NC_017322	GCA	2	6	179188	179193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528257
3745	NC_017322	GGA	2	6	179221	179226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528257
3746	NC_017322	GCG	2	6	179239	179244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528257
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3748	NC_017322	TCA	2	6	179275	179280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528257
3749	NC_017322	TCG	2	6	179374	179379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528257
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3756	NC_017322	GAC	2	6	179842	179847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528258
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3762	NC_017322	GC	3	6	180164	180169	0 %	0 %	50 %	50 %	384528259
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3765	NC_017322	ATC	2	6	180380	180385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528259
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3768	NC_017322	GCA	2	6	180522	180527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528259
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3772	NC_017322	TC	3	6	180957	180962	0 %	50 %	0 %	50 %	384528260
3773	NC_017322	ATCC	2	8	180963	180970	25 %	25 %	0 %	50 %	384528260
3774	NC_017322	TCG	2	6	181004	181009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528260
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3776	NC_017322	GCG	2	6	181089	181094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528260
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3778	NC_017322	GGC	2	6	181155	181160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528260
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3782	NC_017322	CGT	2	6	181239	181244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528260
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3789	NC_017322	TCG	2	6	181403	181408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528260
3790	NC_017322	GCGCCC	2	12	181428	181439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528260
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3801	NC_017322	GCCA	2	8	181676	181683	25 %	0 %	25 %	50 %	384528260
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3803	NC_017322	TCTT	2	8	181734	181741	0 %	75 %	0 %	25 %	384528260
3804	NC_017322	TGC	2	6	181747	181752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528260
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3808	NC_017322	CGA	2	6	182007	182012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528260
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3840	NC_017322	CGA	2	6	183297	183302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528260
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3842	NC_017322	GC	3	6	183404	183409	0 %	0 %	50 %	50 %	384528260
3843	NC_017322	ACC	2	6	183432	183437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528260
3844	NC_017322	CTG	2	6	183741	183746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528261
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3846	NC_017322	CG	3	6	183822	183827	0 %	0 %	50 %	50 %	384528261
3847	NC_017322	GCCG	2	8	183935	183942	0 %	0 %	50 %	50 %	384528261
3848	NC_017322	CGC	2	6	184016	184021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528261
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3850	NC_017322	CGAA	2	8	184071	184078	50 %	0 %	25 %	25 %	384528261
3851	NC_017322	CGC	2	6	184115	184120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528261
3852	NC_017322	CGC	2	6	184216	184221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528262
3853	NC_017322	GC	3	6	184282	184287	0 %	0 %	50 %	50 %	384528262
3854	NC_017322	AGG	2	6	184332	184337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528262
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3857	NC_017322	CG	3	6	184466	184471	0 %	0 %	50 %	50 %	384528262
3858	NC_017322	CGA	2	6	184474	184479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528262
3859	NC_017322	GAG	2	6	184511	184516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528262
3860	NC_017322	GGC	2	6	184615	184620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528262
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3862	NC_017322	ACC	2	6	184709	184714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528263
3863	NC_017322	GAC	2	6	184735	184740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528263
3864	NC_017322	CGT	2	6	184747	184752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528263
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3866	NC_017322	TGC	2	6	184762	184767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528263
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3875	NC_017322	TGC	2	6	185139	185144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528263
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3882	NC_017322	GCAT	2	8	185575	185582	25 %	25 %	25 %	25 %	384528264
3883	NC_017322	GCCC	2	8	185604	185611	0 %	0 %	25 %	75 %	384528264
3884	NC_017322	CCG	2	6	185676	185681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528264
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3979	NC_017322	CGGC	2	8	189611	189618	0 %	0 %	50 %	50 %	384528268
3980	NC_017322	GCG	2	6	189619	189624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528268
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3982	NC_017322	GC	3	6	189838	189843	0 %	0 %	50 %	50 %	384528269
3983	NC_017322	CGC	3	9	189841	189849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528269
3984	NC_017322	CGTCG	2	10	189884	189893	0 %	20 %	40 %	40 %	384528269
3985	NC_017322	AGC	2	6	189903	189908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528269
3986	NC_017322	GTC	2	6	189911	189916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528269
3987	NC_017322	GGC	2	6	189935	189940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528269
3988	NC_017322	CGA	2	6	189946	189951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528269
3989	NC_017322	ATGA	2	8	189971	189978	50 %	25 %	25 %	0 %	384528269
3990	NC_017322	CGT	2	6	190094	190099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528269
3991	NC_017322	CGG	2	6	190254	190259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528270
3992	NC_017322	GGC	2	6	190387	190392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528270
3993	NC_017322	CGA	2	6	190393	190398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528270
3994	NC_017322	GA	3	6	190397	190402	50 %	0 %	50 %	0 %	384528270
3995	NC_017322	CAT	2	6	190531	190536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528270
3996	NC_017322	ATG	2	6	190544	190549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528270
3997	NC_017322	CCG	2	6	190599	190604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528270
3998	NC_017322	AGA	2	6	190626	190631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528270
3999	NC_017322	TCA	2	6	190773	190778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528271
4000	NC_017322	CAT	3	9	190792	190800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528271

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