MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 75648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017322	TCC	3	9	121209	121217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528208
2502	NC_017322	CAG	2	6	121232	121237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528208
2503	NC_017322	CGAC	2	8	121239	121246	25 %	0 %	25 %	50 %	384528208
2504	NC_017322	GCA	2	6	121250	121255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528208
2505	NC_017322	GAT	2	6	121256	121261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528208
2506	NC_017322	GC	3	6	121269	121274	0 %	0 %	50 %	50 %	384528208
2507	NC_017322	CTC	2	6	121289	121294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528208
2508	NC_017322	CG	3	6	121307	121312	0 %	0 %	50 %	50 %	384528208
2509	NC_017322	CGGC	2	8	121322	121329	0 %	0 %	50 %	50 %	384528208
2510	NC_017322	GAA	2	6	121430	121435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528208
2511	NC_017322	CGT	2	6	121487	121492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528208
2512	NC_017322	GC	3	6	121504	121509	0 %	0 %	50 %	50 %	384528208
2513	NC_017322	CGG	2	6	121531	121536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528208
2514	NC_017322	TGA	2	6	121552	121557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528208
2515	NC_017322	CTT	2	6	121571	121576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528208
2516	NC_017322	CGG	3	9	121594	121602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528208
2517	NC_017322	CGG	2	6	121606	121611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528208
2518	NC_017322	CCG	2	6	121618	121623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528208
2519	NC_017322	AGC	2	6	121641	121646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528208
2520	NC_017322	TGC	2	6	121677	121682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528208
2521	NC_017322	GCG	2	6	121705	121710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528208
2522	NC_017322	ACC	2	6	121740	121745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528208
2523	NC_017322	CGC	2	6	121768	121773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528208
2524	NC_017322	TTC	2	6	122179	122184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528209
2525	NC_017322	TC	3	6	122183	122188	0 %	50 %	0 %	50 %	384528209
2526	NC_017322	ATC	2	6	122190	122195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528209
2527	NC_017322	TCG	2	6	122332	122337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528209
2528	NC_017322	CGC	2	6	122369	122374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528209
2529	NC_017322	GCG	2	6	122407	122412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528209
2530	NC_017322	CCG	2	6	122433	122438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528209
2531	NC_017322	CTG	2	6	122451	122456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528209
2532	NC_017322	ATG	3	9	122475	122483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528209
2533	NC_017322	GC	3	6	122536	122541	0 %	0 %	50 %	50 %	384528209
2534	NC_017322	TGC	2	6	122573	122578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528209
2535	NC_017322	CAC	2	6	122712	122717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528210
2536	NC_017322	GCC	2	6	122725	122730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528210
2537	NC_017322	CAG	2	6	122797	122802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528210
2538	NC_017322	ATG	2	6	122806	122811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528210
2539	NC_017322	TCG	2	6	122884	122889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528210
2540	NC_017322	GC	3	6	122958	122963	0 %	0 %	50 %	50 %	384528210
2541	NC_017322	CGA	2	6	122990	122995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528210
2542	NC_017322	TCG	2	6	123004	123009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528210
2543	NC_017322	GA	3	6	123034	123039	50 %	0 %	50 %	0 %	384528210
2544	NC_017322	CAG	2	6	123112	123117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2545	NC_017322	GCC	2	6	123145	123150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2546	NC_017322	CG	3	6	123154	123159	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2547	NC_017322	CGA	2	6	123183	123188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2548	NC_017322	TCGCG	2	10	123235	123244	0 %	20 %	40 %	40 %	384528211
2549	NC_017322	AAG	2	6	123247	123252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528211
2550	NC_017322	GC	3	6	123253	123258	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2551	NC_017322	GCC	2	6	123277	123282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2552	NC_017322	GCC	2	6	123293	123298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2553	NC_017322	CGA	2	6	123306	123311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2554	NC_017322	GAC	2	6	123325	123330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2555	NC_017322	GCC	2	6	123347	123352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2556	NC_017322	GTC	2	6	123397	123402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2557	NC_017322	CGG	2	6	123537	123542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528211
2558	NC_017322	ACG	2	6	123578	123583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2559	NC_017322	CCG	3	9	123584	123592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2560	NC_017322	CGT	2	6	123678	123683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2561	NC_017322	CCG	2	6	123720	123725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
2562	NC_017322	CG	3	6	123762	123767	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2563	NC_017322	GC	3	6	123768	123773	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2564	NC_017322	TCC	2	6	123779	123784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528211
2565	NC_017322	CGA	2	6	123882	123887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2566	NC_017322	GCCG	2	8	123987	123994	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2567	NC_017322	GC	3	6	124074	124079	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2568	NC_017322	AGC	2	6	124088	124093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528211
2569	NC_017322	ATG	2	6	124115	124120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528211
2570	NC_017322	GC	3	6	124153	124158	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2571	NC_017322	CGTT	2	8	124211	124218	0 %	50 %	25 %	25 %	384528211
2572	NC_017322	GC	3	6	124223	124228	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2573	NC_017322	CG	3	6	124230	124235	0 %	0 %	50 %	50 %	384528211
2574	NC_017322	CGC	2	6	124248	124253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528211
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2578	NC_017322	GC	3	6	124694	124699	0 %	0 %	50 %	50 %	384528212
2579	NC_017322	GCAG	2	8	124731	124738	25 %	0 %	50 %	25 %	384528212
2580	NC_017322	TCA	2	6	124757	124762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528212
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2582	NC_017322	GCC	2	6	124810	124815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528212
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2584	NC_017322	TCT	2	6	124992	124997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528212
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2589	NC_017322	TGC	2	6	125177	125182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528212
2590	NC_017322	CGA	2	6	125241	125246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528212
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2592	NC_017322	TCG	2	6	125261	125266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528212
2593	NC_017322	GGC	2	6	125296	125301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528212
2594	NC_017322	CCT	2	6	125319	125324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528212
2595	NC_017322	CGT	2	6	125346	125351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528212
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2600	NC_017322	TGA	2	6	125510	125515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528212
2601	NC_017322	GGC	2	6	125517	125522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528212
2602	NC_017322	AAG	2	6	125542	125547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528212
2603	NC_017322	CCGA	2	8	125575	125582	25 %	0 %	25 %	50 %	384528212
2604	NC_017322	TCG	2	6	125594	125599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528212
2605	NC_017322	GTCGA	2	10	125641	125650	20 %	20 %	40 %	20 %	384528212
2606	NC_017322	AAAC	2	8	125977	125984	75 %	0 %	0 %	25 %	384528213
2607	NC_017322	GACG	2	8	126035	126042	25 %	0 %	50 %	25 %	384528213
2608	NC_017322	GCT	2	6	126071	126076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2609	NC_017322	GCA	2	6	126086	126091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2610	NC_017322	CGG	2	6	126167	126172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528213
2611	NC_017322	GCA	2	6	126209	126214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2612	NC_017322	TCG	2	6	126223	126228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2613	NC_017322	TCG	2	6	126232	126237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
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2615	NC_017322	TCGG	2	8	126282	126289	0 %	25 %	50 %	25 %	384528213
2616	NC_017322	CAT	2	6	126293	126298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528213
2617	NC_017322	CGTC	2	8	126307	126314	0 %	25 %	25 %	50 %	384528213
2618	NC_017322	CCG	2	6	126348	126353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528213
2619	NC_017322	TGGGG	2	10	126377	126386	0 %	20 %	80 %	0 %	384528213
2620	NC_017322	TCG	2	6	126415	126420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2621	NC_017322	CG	3	6	126419	126424	0 %	0 %	50 %	50 %	384528213
2622	NC_017322	GCC	2	6	126434	126439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528213
2623	NC_017322	TTC	2	6	126552	126557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528213
2624	NC_017322	CGT	2	6	126599	126604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
2625	NC_017322	CTC	2	6	126615	126620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528213
2626	NC_017322	CTT	2	6	126627	126632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528213
2627	NC_017322	ACCGC	2	10	126646	126655	20 %	0 %	20 %	60 %	384528213
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2629	NC_017322	ATCGA	2	10	126837	126846	40 %	20 %	20 %	20 %	384528213
2630	NC_017322	GTG	2	6	126855	126860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528213
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2635	NC_017322	TCG	2	6	126925	126930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528213
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2641	NC_017322	ACA	2	6	127350	127355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528214
2642	NC_017322	CAT	2	6	127387	127392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528214
2643	NC_017322	CGCT	2	8	127406	127413	0 %	25 %	25 %	50 %	384528214
2644	NC_017322	CGC	2	6	127420	127425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528214
2645	NC_017322	TGA	2	6	127467	127472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528214
2646	NC_017322	CGG	2	6	127510	127515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528214
2647	NC_017322	GC	4	8	127538	127545	0 %	0 %	50 %	50 %	384528214
2648	NC_017322	CGC	3	9	127543	127551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528214
2649	NC_017322	GTC	2	6	127565	127570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528214
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2651	NC_017322	TCG	2	6	127642	127647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528214
2652	NC_017322	CATC	2	8	127717	127724	25 %	25 %	0 %	50 %	384528214
2653	NC_017322	GCC	3	9	127731	127739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528214
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2721	NC_017322	CGCTGC	2	12	130686	130697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384528218
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2725	NC_017322	CGA	2	6	130753	130758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528218
2726	NC_017322	GAT	2	6	130774	130779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528218
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2729	NC_017322	CGA	2	6	131014	131019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528218
2730	NC_017322	ACG	2	6	131052	131057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528218
2731	NC_017322	CGCGG	2	10	131108	131117	0 %	0 %	60 %	40 %	384528218
2732	NC_017322	AGGTCG	2	12	131148	131159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384528218
2733	NC_017322	GTC	2	6	131177	131182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528218
2734	NC_017322	CAA	2	6	131239	131244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528218
2735	NC_017322	CCT	2	6	131245	131250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528218
2736	NC_017322	CGA	2	6	131278	131283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528218
2737	NC_017322	CG	3	6	131337	131342	0 %	0 %	50 %	50 %	384528218
2738	NC_017322	GCC	2	6	131523	131528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528219
2739	NC_017322	CAG	2	6	131531	131536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528219
2740	NC_017322	CGG	2	6	131551	131556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528219
2741	NC_017322	GCA	2	6	131602	131607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528219
2742	NC_017322	GC	3	6	131671	131676	0 %	0 %	50 %	50 %	384528219
2743	NC_017322	CGGTG	2	10	131784	131793	0 %	20 %	60 %	20 %	384528219
2744	NC_017322	TCA	2	6	131869	131874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528219
2745	NC_017322	GCTGGT	2	12	131911	131922	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384528219
2746	NC_017322	CGC	2	6	131948	131953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528219
2747	NC_017322	CGG	2	6	131965	131970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528219
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2750	NC_017322	GGCT	2	8	132069	132076	0 %	25 %	50 %	25 %	384528219
2751	NC_017322	GCT	2	6	132115	132120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528219
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2760	NC_017322	CGC	2	6	132506	132511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528219
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2770	NC_017322	CG	3	6	132881	132886	0 %	0 %	50 %	50 %	384528219
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2843	NC_017322	TCG	2	6	137007	137012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528222
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2848	NC_017322	GCG	2	6	137099	137104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528222
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2850	NC_017322	CGA	2	6	137181	137186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528222
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2853	NC_017322	TCG	2	6	137214	137219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528222
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2855	NC_017322	GC	3	6	137301	137306	0 %	0 %	50 %	50 %	384528222
2856	NC_017322	GCCT	2	8	137311	137318	0 %	25 %	25 %	50 %	384528222
2857	NC_017322	CGA	2	6	137325	137330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528222
2858	NC_017322	CGG	2	6	137334	137339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528222
2859	NC_017322	TCCT	2	8	137480	137487	0 %	50 %	0 %	50 %	384528222
2860	NC_017322	CTT	2	6	137515	137520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528222
2861	NC_017322	AGC	2	6	137550	137555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528222
2862	NC_017322	CG	3	6	137604	137609	0 %	0 %	50 %	50 %	384528222
2863	NC_017322	ATC	2	6	137651	137656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528222
2864	NC_017322	CAT	2	6	137740	137745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528222
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2971	NC_017322	GC	3	6	143272	143277	0 %	0 %	50 %	50 %	384528228
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2977	NC_017322	CCG	2	6	143471	143476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528228
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2979	NC_017322	GAA	2	6	143505	143510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528228
2980	NC_017322	GCGCAG	2	12	143578	143589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384528228
2981	NC_017322	TTC	2	6	143594	143599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528228
2982	NC_017322	GAT	2	6	143608	143613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528228
2983	NC_017322	CGG	2	6	143631	143636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528228
2984	NC_017322	TGG	2	6	143651	143656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528228
2985	NC_017322	ACGA	2	8	143663	143670	50 %	0 %	25 %	25 %	384528228
2986	NC_017322	GCC	2	6	143680	143685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528228
2987	NC_017322	CCGC	2	8	143708	143715	0 %	0 %	25 %	75 %	384528228
2988	NC_017322	GGA	2	6	143728	143733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528228
2989	NC_017322	CGGC	2	8	143745	143752	0 %	0 %	50 %	50 %	384528228
2990	NC_017322	GCG	2	6	143822	143827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528228
2991	NC_017322	CG	3	6	143841	143846	0 %	0 %	50 %	50 %	384528228
2992	NC_017322	GCC	2	6	143906	143911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528228
2993	NC_017322	AGG	2	6	143913	143918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528228
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2996	NC_017322	CGGC	2	8	144061	144068	0 %	0 %	50 %	50 %	384528228
2997	NC_017322	ACG	2	6	144084	144089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528228
2998	NC_017322	CAG	2	6	144139	144144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528228
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