MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C chromosome

Total Repeats: 75648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017322	TGCCGG	2	12	45440	45451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384528149
1002	NC_017322	GCC	2	6	45455	45460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528149
1003	NC_017322	CGA	2	6	45488	45493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1004	NC_017322	TCG	2	6	45505	45510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1005	NC_017322	GCG	2	6	45513	45518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528149
1006	NC_017322	CTG	2	6	45567	45572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1007	NC_017322	GGC	2	6	45612	45617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528149
1008	NC_017322	CGG	2	6	45622	45627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528149
1009	NC_017322	CCCG	2	8	45634	45641	0 %	0 %	25 %	75 %	384528149
1010	NC_017322	GGC	2	6	45657	45662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528149
1011	NC_017322	GAT	2	6	45677	45682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528149
1012	NC_017322	CGA	2	6	45704	45709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1013	NC_017322	CTC	2	6	45741	45746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528149
1014	NC_017322	CG	3	6	45816	45821	0 %	0 %	50 %	50 %	384528149
1015	NC_017322	GAT	2	6	45839	45844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528149
1016	NC_017322	GCG	2	6	45849	45854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528149
1017	NC_017322	CAG	2	6	45868	45873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1018	NC_017322	TTG	2	6	45874	45879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528149
1019	NC_017322	GTG	2	6	45886	45891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528149
1020	NC_017322	GTA	2	6	45900	45905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528149
1021	NC_017322	G	6	6	45922	45927	0 %	0 %	100 %	0 %	384528149
1022	NC_017322	T	6	6	45991	45996	0 %	100 %	0 %	0 %	384528149
1023	NC_017322	GAC	2	6	46001	46006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1024	NC_017322	GCA	2	6	46026	46031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528149
1025	NC_017322	GAA	2	6	46058	46063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528149
1026	NC_017322	AAG	2	6	46218	46223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528150
1027	NC_017322	TCG	2	6	46268	46273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528150
1028	NC_017322	CAG	2	6	46329	46334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528150
1029	NC_017322	TTC	3	9	46419	46427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528150
1030	NC_017322	GGC	3	9	46446	46454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528150
1031	NC_017322	CCGGG	2	10	46456	46465	0 %	0 %	60 %	40 %	384528150
1032	NC_017322	CGT	2	6	46493	46498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528150
1033	NC_017322	GCC	2	6	46602	46607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528150
1034	NC_017322	GGC	2	6	46625	46630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528150
1035	NC_017322	GC	3	6	46964	46969	0 %	0 %	50 %	50 %	384528151
1036	NC_017322	GT	3	6	47019	47024	0 %	50 %	50 %	0 %	384528151
1037	NC_017322	CGA	2	6	47036	47041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1038	NC_017322	CGA	2	6	47122	47127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1039	NC_017322	GCC	2	6	47162	47167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528151
1040	NC_017322	AAGA	2	8	47178	47185	75 %	0 %	25 %	0 %	384528151
1041	NC_017322	ACG	2	6	47197	47202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1042	NC_017322	TCA	2	6	47203	47208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528151
1043	NC_017322	CGG	2	6	47227	47232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1044	NC_017322	TTC	2	6	47302	47307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528151
1045	NC_017322	GCC	2	6	47349	47354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528151
1046	NC_017322	GAA	2	6	47367	47372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528151
1047	NC_017322	CAT	2	6	47390	47395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528151
1048	NC_017322	TGCC	2	8	47405	47412	0 %	25 %	25 %	50 %	384528151
1049	NC_017322	CCG	2	6	47419	47424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528151
1050	NC_017322	CTA	2	6	47444	47449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528151
1051	NC_017322	AAG	2	6	47487	47492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528151
1052	NC_017322	GGCGAA	2	12	47493	47504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384528151
1053	NC_017322	GCCG	2	8	47564	47571	0 %	0 %	50 %	50 %	384528151
1054	NC_017322	CGA	2	6	47606	47611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1055	NC_017322	CCA	2	6	47623	47628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528151
1056	NC_017322	CGA	2	6	47687	47692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1057	NC_017322	CGG	2	6	47732	47737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1058	NC_017322	ATC	2	6	47772	47777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528151
1059	NC_017322	GGC	2	6	47790	47795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1060	NC_017322	GGC	2	6	47808	47813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1061	NC_017322	GCC	2	6	47856	47861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528151
1062	NC_017322	CGT	2	6	47888	47893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1063	NC_017322	GCG	2	6	47895	47900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1064	NC_017322	GCACG	2	10	47978	47987	20 %	0 %	40 %	40 %	384528151
1065	NC_017322	CCG	2	6	48056	48061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528151
1066	NC_017322	AAG	2	6	48181	48186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528151
1067	NC_017322	TCG	2	6	48201	48206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528151
1068	NC_017322	GCG	2	6	48222	48227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528151
1069	NC_017322	CG	3	6	48231	48236	0 %	0 %	50 %	50 %	384528151
1070	NC_017322	CG	3	6	48475	48480	0 %	0 %	50 %	50 %	384528152
1071	NC_017322	GCC	2	6	48508	48513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528152
1072	NC_017322	GGC	2	6	48542	48547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1073	NC_017322	CTG	2	6	48561	48566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528152
1074	NC_017322	CGG	3	9	48662	48670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1075	NC_017322	AGGCGA	2	12	48769	48780	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384528152
1076	NC_017322	ACG	4	12	48799	48810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528152
1077	NC_017322	CGG	2	6	48835	48840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1078	NC_017322	GCG	2	6	48902	48907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1079	NC_017322	GGC	2	6	48957	48962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1080	NC_017322	CGG	2	6	49045	49050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528152
1081	NC_017322	CCG	2	6	49115	49120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528152
1082	NC_017322	GTC	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528153
1083	NC_017322	GCC	2	6	49332	49337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528153
1084	NC_017322	GAA	2	6	49340	49345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528153
1085	NC_017322	CAG	2	6	49367	49372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528153
1086	NC_017322	GATC	2	8	49408	49415	25 %	25 %	25 %	25 %	384528153
1087	NC_017322	CCT	2	6	49456	49461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528153
1088	NC_017322	TTC	2	6	49518	49523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528153
1089	NC_017322	AGG	2	6	49674	49679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528154
1090	NC_017322	GCG	2	6	49749	49754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528154
1091	NC_017322	GTC	2	6	49827	49832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528154
1092	NC_017322	TCC	2	6	49845	49850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528154
1093	NC_017322	CCGCGA	2	12	49858	49869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384528154
1094	NC_017322	GC	3	6	49891	49896	0 %	0 %	50 %	50 %	384528154
1095	NC_017322	CGG	2	6	49897	49902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528154
1096	NC_017322	CGC	2	6	49909	49914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528154
1097	NC_017322	GGA	2	6	49935	49940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528154
1098	NC_017322	CCA	2	6	49996	50001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528154
1099	NC_017322	ATC	3	9	50218	50226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528155
1100	NC_017322	GAC	2	6	50245	50250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1101	NC_017322	GCG	2	6	50251	50256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1102	NC_017322	GGA	2	6	50283	50288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528155
1103	NC_017322	CTGACA	2	12	50332	50343	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384528155
1104	NC_017322	CGA	2	6	50484	50489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1105	NC_017322	CGA	2	6	50492	50497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1106	NC_017322	AGC	2	6	50510	50515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1107	NC_017322	TCG	2	6	50531	50536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1108	NC_017322	GC	3	6	50544	50549	0 %	0 %	50 %	50 %	384528155
1109	NC_017322	GCCCTG	2	12	50602	50613	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384528155
1110	NC_017322	TGA	2	6	50654	50659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528155
1111	NC_017322	GCG	2	6	50663	50668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1112	NC_017322	CTT	2	6	50670	50675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528155
1113	NC_017322	GGC	2	6	50680	50685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1114	NC_017322	GCG	2	6	50698	50703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1115	NC_017322	ATG	2	6	50770	50775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528155
1116	NC_017322	CGG	2	6	50846	50851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1117	NC_017322	TTC	2	6	50878	50883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528155
1118	NC_017322	CGG	2	6	50916	50921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528155
1119	NC_017322	CAC	2	6	51018	51023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528155
1120	NC_017322	TGG	2	6	51043	51048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528155
1121	NC_017322	CGA	3	9	51093	51101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528155
1122	NC_017322	CTT	2	6	51105	51110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528155
1123	NC_017322	GA	3	6	51143	51148	50 %	0 %	50 %	0 %	384528155
1124	NC_017322	TTC	2	6	51245	51250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528156
1125	NC_017322	GGC	2	6	51320	51325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528156
1126	NC_017322	GCG	2	6	51331	51336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528156
1127	NC_017322	AGC	2	6	51362	51367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528156
1128	NC_017322	CGCA	2	8	51368	51375	25 %	0 %	25 %	50 %	384528156
1129	NC_017322	GCA	2	6	51394	51399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528156
1130	NC_017322	GC	3	6	51457	51462	0 %	0 %	50 %	50 %	384528156
1131	NC_017322	TCG	2	6	51477	51482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528156
1132	NC_017322	GGC	2	6	51497	51502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528156
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1141	NC_017322	CGA	2	6	51682	51687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528156
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1153	NC_017322	GGC	2	6	52124	52129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528156
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1232	NC_017322	GGC	2	6	55955	55960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528158
1233	NC_017322	CG	3	6	56024	56029	0 %	0 %	50 %	50 %	384528158
1234	NC_017322	GC	3	6	56040	56045	0 %	0 %	50 %	50 %	384528158
1235	NC_017322	ATG	2	6	56052	56057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528158
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1238	NC_017322	GGCC	2	8	56101	56108	0 %	0 %	50 %	50 %	384528158
1239	NC_017322	TCA	2	6	56336	56341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528159
1240	NC_017322	TTC	2	6	56342	56347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528159
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1242	NC_017322	ACG	2	6	56438	56443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528159
1243	NC_017322	CGC	2	6	56460	56465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528159
1244	NC_017322	CCT	2	6	56490	56495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528159
1245	NC_017322	AGG	2	6	56513	56518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528159
1246	NC_017322	GAG	2	6	56521	56526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528159
1247	NC_017322	AGC	2	6	56528	56533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528159
1248	NC_017322	TCA	2	6	56543	56548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528159
1249	NC_017322	GTC	2	6	56557	56562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528159
1250	NC_017322	GAG	2	6	56572	56577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528159
1251	NC_017322	ACT	2	6	56615	56620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528159
1252	NC_017322	CGC	2	6	56640	56645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528159
1253	NC_017322	CCTG	2	8	56714	56721	0 %	25 %	25 %	50 %	384528159
1254	NC_017322	GGC	2	6	56811	56816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528159
1255	NC_017322	CG	3	6	56822	56827	0 %	0 %	50 %	50 %	384528159
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1260	NC_017322	GTC	3	9	57169	57177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528160
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1265	NC_017322	ATG	2	6	57319	57324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528160
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1268	NC_017322	GAT	2	6	57393	57398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528160
1269	NC_017322	TGA	2	6	57446	57451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528160
1270	NC_017322	GCC	2	6	57523	57528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528160
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1272	NC_017322	CGGC	2	8	57565	57572	0 %	0 %	50 %	50 %	384528160
1273	NC_017322	GCCG	2	8	57640	57647	0 %	0 %	50 %	50 %	384528160
1274	NC_017322	GGAAGG	2	12	57684	57695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384528160
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1279	NC_017322	CGC	2	6	58213	58218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528161
1280	NC_017322	GGCGC	2	10	58229	58238	0 %	0 %	60 %	40 %	384528161
1281	NC_017322	TGG	2	6	58242	58247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528161
1282	NC_017322	ACG	2	6	58267	58272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528161
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1287	NC_017322	TTC	2	6	58429	58434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528161
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1350	NC_017322	CGA	2	6	62197	62202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528164
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1355	NC_017322	ATG	2	6	62307	62312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528164
1356	NC_017322	GAT	2	6	62330	62335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528164
1357	NC_017322	GCA	3	9	62344	62352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528164
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1359	NC_017322	AGGTC	2	10	62446	62455	20 %	20 %	40 %	20 %	384528164
1360	NC_017322	GGC	2	6	62478	62483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528164
1361	NC_017322	GCC	2	6	62511	62516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528164
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1363	NC_017322	ATC	2	6	62643	62648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528164
1364	NC_017322	GTC	2	6	62684	62689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528164
1365	NC_017322	AGAT	2	8	62778	62785	50 %	25 %	25 %	0 %	384528164
1366	NC_017322	GCC	2	6	62910	62915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528164
1367	NC_017322	GCC	2	6	62999	63004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528164
1368	NC_017322	ATGGCG	2	12	63090	63101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384528164
1369	NC_017322	CGT	2	6	63119	63124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528164
1370	NC_017322	CTC	2	6	63128	63133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528164
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1372	NC_017322	GCC	2	6	63350	63355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528164
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1491	NC_017322	ACC	2	6	68081	68086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528167
1492	NC_017322	GCC	3	9	68093	68101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528167
1493	NC_017322	GCCGAT	2	12	68200	68211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384528167
1494	NC_017322	CCG	2	6	68225	68230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528167
1495	NC_017322	AGC	2	6	68243	68248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528167
1496	NC_017322	GAC	2	6	68310	68315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528167
1497	NC_017322	CTT	2	6	68556	68561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528168
1498	NC_017322	GTT	2	6	68565	68570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528168
1499	NC_017322	CTT	3	9	68622	68630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528168
1500	NC_017322	GCT	2	6	68684	68689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528168

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