MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	384545967
2	NC_017319	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	384545968
3	NC_017319	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	384545969
4	NC_017319	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	384545969
5	NC_017319	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	384545969
6	NC_017319	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	384545970
7	NC_017319	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	384545970
8	NC_017319	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	384545970
9	NC_017319	TAAG	2	8	3656	3663	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
10	NC_017319	TAAA	2	8	3753	3760	75 %	25 %	0 %	0 %	384545971
11	NC_017319	TTTA	2	8	4308	4315	25 %	75 %	0 %	0 %	384545971
12	NC_017319	GTAT	2	8	4398	4405	25 %	50 %	25 %	0 %	384545971
13	NC_017319	AAGT	2	8	4527	4534	50 %	25 %	25 %	0 %	384545971
14	NC_017319	CCGG	2	8	5548	5555	0 %	0 %	50 %	50 %	384545973
15	NC_017319	CGAC	2	8	5980	5987	25 %	0 %	25 %	50 %	384545974
16	NC_017319	TCTG	2	8	6857	6864	0 %	50 %	25 %	25 %	384545975
17	NC_017319	CAGC	2	8	7080	7087	25 %	0 %	25 %	50 %	384545976
18	NC_017319	TATT	2	8	7455	7462	25 %	75 %	0 %	0 %	384545977
19	NC_017319	TGTT	2	8	8415	8422	0 %	75 %	25 %	0 %	384545977
20	NC_017319	AAAT	2	8	8759	8766	75 %	25 %	0 %	0 %	384545977
21	NC_017319	ACAT	2	8	8806	8813	50 %	25 %	0 %	25 %	384545977
22	NC_017319	TTTA	2	8	9130	9137	25 %	75 %	0 %	0 %	384545977
23	NC_017319	CATG	2	8	10033	10040	25 %	25 %	25 %	25 %	384545978
24	NC_017319	CCTG	2	8	10772	10779	0 %	25 %	25 %	50 %	384545980
25	NC_017319	TCAT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	384545981
26	NC_017319	TCTT	2	8	11721	11728	0 %	75 %	0 %	25 %	384545981
27	NC_017319	CCAG	2	8	13170	13177	25 %	0 %	25 %	50 %	384545983
28	NC_017319	CTGT	2	8	13675	13682	0 %	50 %	25 %	25 %	384545985
29	NC_017319	TACT	2	8	13795	13802	25 %	50 %	0 %	25 %	384545985
30	NC_017319	CAGT	2	8	13863	13870	25 %	25 %	25 %	25 %	384545986
31	NC_017319	ACTG	2	8	13877	13884	25 %	25 %	25 %	25 %	384545986
32	NC_017319	CGTC	2	8	14316	14323	0 %	25 %	25 %	50 %	384545986
33	NC_017319	GCCG	2	8	15573	15580	0 %	0 %	50 %	50 %	384545987
34	NC_017319	TCCG	2	8	16397	16404	0 %	25 %	25 %	50 %	384545989
35	NC_017319	ATCC	2	8	16942	16949	25 %	25 %	0 %	50 %	384545989
36	NC_017319	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	384545989
37	NC_017319	ATTC	2	8	17257	17264	25 %	50 %	0 %	25 %	384545989
38	NC_017319	ATGA	2	8	18008	18015	50 %	25 %	25 %	0 %	384545991
39	NC_017319	TCAG	2	8	18090	18097	25 %	25 %	25 %	25 %	384545991
40	NC_017319	AATA	2	8	18902	18909	75 %	25 %	0 %	0 %	384545993
41	NC_017319	TTTC	2	8	19072	19079	0 %	75 %	0 %	25 %	384545993
42	NC_017319	CAGA	2	8	19504	19511	50 %	0 %	25 %	25 %	384545993
43	NC_017319	AAAT	2	8	20806	20813	75 %	25 %	0 %	0 %	384545995
44	NC_017319	GCCT	2	8	21794	21801	0 %	25 %	25 %	50 %	384545996
45	NC_017319	GGCT	2	8	21892	21899	0 %	25 %	50 %	25 %	384545996
46	NC_017319	TCGC	2	8	23357	23364	0 %	25 %	25 %	50 %	384545998
47	NC_017319	CATT	2	8	23411	23418	25 %	50 %	0 %	25 %	384545998
48	NC_017319	GCTG	2	8	25234	25241	0 %	25 %	50 %	25 %	384545999
49	NC_017319	CTCA	2	8	25729	25736	25 %	25 %	0 %	50 %	384546000
50	NC_017319	TCAG	2	8	25980	25987	25 %	25 %	25 %	25 %	384546000
51	NC_017319	CAGA	2	8	26179	26186	50 %	0 %	25 %	25 %	384546000
52	NC_017319	CCGT	2	8	26675	26682	0 %	25 %	25 %	50 %	384546002
53	NC_017319	TAAG	2	8	26973	26980	50 %	25 %	25 %	0 %	384546003
54	NC_017319	GGAT	2	8	27853	27860	25 %	25 %	50 %	0 %	384546003
55	NC_017319	ACCG	2	8	28169	28176	25 %	0 %	25 %	50 %	384546004
56	NC_017319	ACAG	2	8	28350	28357	50 %	0 %	25 %	25 %	384546004
57	NC_017319	ACGT	2	8	29031	29038	25 %	25 %	25 %	25 %	384546004
58	NC_017319	GGTT	2	8	29768	29775	0 %	50 %	50 %	0 %	384546006
59	NC_017319	TCCT	2	8	30215	30222	0 %	50 %	0 %	50 %	384546008
60	NC_017319	GCAT	2	8	30486	30493	25 %	25 %	25 %	25 %	384546008
61	NC_017319	TCCA	2	8	30755	30762	25 %	25 %	0 %	50 %	384546008
62	NC_017319	TCCA	2	8	30881	30888	25 %	25 %	0 %	50 %	384546008
63	NC_017319	CCAC	2	8	32189	32196	25 %	0 %	0 %	75 %	384546012
64	NC_017319	ATAC	2	8	32369	32376	50 %	25 %	0 %	25 %	384546012
65	NC_017319	GTAA	2	8	32556	32563	50 %	25 %	25 %	0 %	384546012
66	NC_017319	CCAC	2	8	32570	32577	25 %	0 %	0 %	75 %	384546012
67	NC_017319	CCCG	2	8	33977	33984	0 %	0 %	25 %	75 %	384546016
68	NC_017319	TCCT	2	8	34021	34028	0 %	50 %	0 %	50 %	384546016
69	NC_017319	GCGG	2	8	34033	34040	0 %	0 %	75 %	25 %	384546016
70	NC_017319	TGCC	2	8	34176	34183	0 %	25 %	25 %	50 %	384546016
71	NC_017319	CGGC	2	8	34682	34689	0 %	0 %	50 %	50 %	384546016
72	NC_017319	GGAT	2	8	34963	34970	25 %	25 %	50 %	0 %	384546017
73	NC_017319	AGCA	2	8	35808	35815	50 %	0 %	25 %	25 %	384546019
74	NC_017319	TCTT	2	8	36844	36851	0 %	75 %	0 %	25 %	384546020
75	NC_017319	GAAG	2	8	37911	37918	50 %	0 %	50 %	0 %	384546021
76	NC_017319	TCCT	2	8	38725	38732	0 %	50 %	0 %	50 %	384546023
77	NC_017319	GCTG	2	8	39065	39072	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
78	NC_017319	TGGC	2	8	39198	39205	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
79	NC_017319	GCGT	2	8	40475	40482	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
80	NC_017319	GCTG	2	8	40654	40661	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
81	NC_017319	GTTT	2	8	40718	40725	0 %	75 %	25 %	0 %	384546025
82	NC_017319	ATCT	2	8	41421	41428	25 %	50 %	0 %	25 %	384546026
83	NC_017319	ACAA	2	8	42078	42085	75 %	0 %	0 %	25 %	384546026
84	NC_017319	GAAT	2	8	42625	42632	50 %	25 %	25 %	0 %	384546026
85	NC_017319	GCAG	2	8	42703	42710	25 %	0 %	50 %	25 %	384546026
86	NC_017319	TGAC	2	8	42861	42868	25 %	25 %	25 %	25 %	384546026
87	NC_017319	TTAC	2	8	43663	43670	25 %	50 %	0 %	25 %	384546028
88	NC_017319	GTAT	2	8	43850	43857	25 %	50 %	25 %	0 %	384546028
89	NC_017319	GTGG	2	8	44030	44037	0 %	25 %	75 %	0 %	384546028
90	NC_017319	TCTG	2	8	44303	44310	0 %	50 %	25 %	25 %	384546028
91	NC_017319	ACTG	2	8	44811	44818	25 %	25 %	25 %	25 %	384546030
92	NC_017319	AACG	2	8	45116	45123	50 %	0 %	25 %	25 %	384546030
93	NC_017319	ATTT	2	8	45248	45255	25 %	75 %	0 %	0 %	384546030
94	NC_017319	CGTT	2	8	45341	45348	0 %	50 %	25 %	25 %	384546031
95	NC_017319	CAAC	2	8	46129	46136	50 %	0 %	0 %	50 %	384546034
96	NC_017319	TCCT	2	8	46149	46156	0 %	50 %	0 %	50 %	384546034
97	NC_017319	GCGG	2	8	46161	46168	0 %	0 %	75 %	25 %	384546034
98	NC_017319	TGCC	2	8	46304	46311	0 %	25 %	25 %	50 %	384546034
99	NC_017319	CGGC	2	8	46810	46817	0 %	0 %	50 %	50 %	384546034
100	NC_017319	GGAT	2	8	47092	47099	25 %	25 %	50 %	0 %	384546034
101	NC_017319	TAAA	2	8	48022	48029	75 %	25 %	0 %	0 %	384546036
102	NC_017319	TTTA	2	8	48577	48584	25 %	75 %	0 %	0 %	384546036
103	NC_017319	ATTT	2	8	49117	49124	25 %	75 %	0 %	0 %	384546036
104	NC_017319	TCCT	2	8	49606	49613	0 %	50 %	0 %	50 %	384546037
105	NC_017319	GCTG	2	8	49946	49953	0 %	25 %	50 %	25 %	384546038
106	NC_017319	TTAC	2	8	50989	50996	25 %	50 %	0 %	25 %	384546040
107	NC_017319	GTAT	2	8	51176	51183	25 %	50 %	25 %	0 %	384546040
108	NC_017319	GTGG	2	8	51356	51363	0 %	25 %	75 %	0 %	384546040
109	NC_017319	TGAA	2	8	51554	51561	50 %	25 %	25 %	0 %	384546041
110	NC_017319	GTCT	2	8	51715	51722	0 %	50 %	25 %	25 %	384546041
111	NC_017319	ATAA	2	8	51917	51924	75 %	25 %	0 %	0 %	384546041
112	NC_017319	TTCA	2	8	52043	52050	25 %	50 %	0 %	25 %	384546042
113	NC_017319	CCAC	2	8	53328	53335	25 %	0 %	0 %	75 %	384546043
114	NC_017319	TAAA	2	8	53404	53411	75 %	25 %	0 %	0 %	384546043
115	NC_017319	CATT	2	8	53500	53507	25 %	50 %	0 %	25 %	384546043
116	NC_017319	AAGG	2	8	53585	53592	50 %	0 %	50 %	0 %	384546043
117	NC_017319	CTGG	2	8	53808	53815	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
118	NC_017319	CTGG	2	8	54794	54801	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
119	NC_017319	GGCT	2	8	54981	54988	0 %	25 %	50 %	25 %	384546043
120	NC_017319	CTTT	2	8	55777	55784	0 %	75 %	0 %	25 %	384546043
121	NC_017319	TAGT	2	8	55956	55963	25 %	50 %	25 %	0 %	384546043
122	NC_017319	AGGC	2	8	56483	56490	25 %	0 %	50 %	25 %	384546043
123	NC_017319	CCCG	2	8	57452	57459	0 %	0 %	25 %	75 %	384546045
124	NC_017319	TCCT	2	8	57496	57503	0 %	50 %	0 %	50 %	384546045
125	NC_017319	GCGG	2	8	57508	57515	0 %	0 %	75 %	25 %	384546045
126	NC_017319	TGCC	2	8	57651	57658	0 %	25 %	25 %	50 %	384546045
127	NC_017319	CGGC	2	8	58157	58164	0 %	0 %	50 %	50 %	384546045
128	NC_017319	GGAT	2	8	58438	58445	25 %	25 %	50 %	0 %	384546046
129	NC_017319	ACGA	2	8	59795	59802	50 %	0 %	25 %	25 %	384546049
130	NC_017319	CCAT	2	8	59819	59826	25 %	25 %	0 %	50 %	384546049
131	NC_017319	GACT	2	8	59855	59862	25 %	25 %	25 %	25 %	384546049
132	NC_017319	GCTG	2	8	60584	60591	0 %	25 %	50 %	25 %	384546049
133	NC_017319	GGCA	2	8	60665	60672	25 %	0 %	50 %	25 %	384546049
134	NC_017319	CTGA	2	8	62297	62304	25 %	25 %	25 %	25 %	384546053
135	NC_017319	CTGC	2	8	62489	62496	0 %	25 %	25 %	50 %	384546053
136	NC_017319	GTTC	2	8	62576	62583	0 %	50 %	25 %	25 %	384546053
137	NC_017319	ACAA	2	8	63060	63067	75 %	0 %	0 %	25 %	384546053
138	NC_017319	GAAT	2	8	63607	63614	50 %	25 %	25 %	0 %	384546053
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