MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 3662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017319	TAA	2	6	122941	122946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546125
2002	NC_017319	AT	3	6	122968	122973	50 %	50 %	0 %	0 %	384546125
2003	NC_017319	TA	3	6	123063	123068	50 %	50 %	0 %	0 %	384546125
2004	NC_017319	TCC	2	6	123074	123079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546125
2005	NC_017319	TCT	2	6	123132	123137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546125
2006	NC_017319	A	6	6	123176	123181	100 %	0 %	0 %	0 %	384546125
2007	NC_017319	GGA	2	6	123218	123223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546125
2008	NC_017319	TGT	2	6	123248	123253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546125
2009	NC_017319	TTA	2	6	123261	123266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546125
2010	NC_017319	AAT	2	6	123267	123272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546125
2011	NC_017319	ATT	2	6	123468	123473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546125
2012	NC_017319	TCA	2	6	123630	123635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546125
2013	NC_017319	AAAG	2	8	123698	123705	75 %	0 %	25 %	0 %	384546125
2014	NC_017319	ATA	2	6	123763	123768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546125
2015	NC_017319	TTC	2	6	123806	123811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546125
2016	NC_017319	AGTC	2	8	123915	123922	25 %	25 %	25 %	25 %	384546125
2017	NC_017319	TAA	2	6	123935	123940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546125
2018	NC_017319	TTG	2	6	124017	124022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546125
2019	NC_017319	GGT	2	6	124026	124031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546125
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2021	NC_017319	TC	3	6	124076	124081	0 %	50 %	0 %	50 %	384546125
2022	NC_017319	TTA	2	6	124184	124189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546125
2023	NC_017319	AAT	2	6	124247	124252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546125
2024	NC_017319	ACT	2	6	124263	124268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546125
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2026	NC_017319	CATT	2	8	124369	124376	25 %	50 %	0 %	25 %	384546126
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2029	NC_017319	TGGCT	2	10	124442	124451	0 %	40 %	40 %	20 %	384546126
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2033	NC_017319	AGAC	2	8	124655	124662	50 %	0 %	25 %	25 %	384546126
2034	NC_017319	TGAA	2	8	124717	124724	50 %	25 %	25 %	0 %	384546126
2035	NC_017319	CTG	2	6	124735	124740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546126
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2039	NC_017319	A	6	6	124792	124797	100 %	0 %	0 %	0 %	384546126
2040	NC_017319	ATT	2	6	124835	124840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546126
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2042	NC_017319	CAA	2	6	124912	124917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546126
2043	NC_017319	TA	3	6	124926	124931	50 %	50 %	0 %	0 %	384546126
2044	NC_017319	AATT	2	8	125062	125069	50 %	50 %	0 %	0 %	384546126
2045	NC_017319	GAT	2	6	125078	125083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546126
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2049	NC_017319	AT	3	6	125180	125185	50 %	50 %	0 %	0 %	384546126
2050	NC_017319	AAGTGA	2	12	125198	125209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546126
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2052	NC_017319	AT	3	6	125308	125313	50 %	50 %	0 %	0 %	384546126
2053	NC_017319	AGTGAA	2	12	125319	125330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384546126
2054	NC_017319	AAGA	2	8	125379	125386	75 %	0 %	25 %	0 %	384546126
2055	NC_017319	TTG	2	6	125518	125523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546127
2056	NC_017319	T	6	6	125525	125530	0 %	100 %	0 %	0 %	384546127
2057	NC_017319	TTG	2	6	125622	125627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546127
2058	NC_017319	ATT	2	6	125636	125641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546127
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2062	NC_017319	TGT	2	6	125777	125782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546127
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2066	NC_017319	CAT	2	6	126011	126016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546127
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2096	NC_017319	A	9	9	127328	127336	100 %	0 %	0 %	0 %	384546127
2097	NC_017319	TGA	2	6	127433	127438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546127
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2106	NC_017319	TTG	2	6	128023	128028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546129
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2113	NC_017319	TA	3	6	128263	128268	50 %	50 %	0 %	0 %	384546129
2114	NC_017319	T	6	6	128294	128299	0 %	100 %	0 %	0 %	384546129
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2119	NC_017319	A	7	7	128502	128508	100 %	0 %	0 %	0 %	384546129
2120	NC_017319	GT	3	6	128513	128518	0 %	50 %	50 %	0 %	384546129
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2122	NC_017319	AT	3	6	128570	128575	50 %	50 %	0 %	0 %	384546129
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2369	NC_017319	GTT	2	6	142318	142323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546155
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2495	NC_017319	GAGG	2	8	150346	150353	25 %	0 %	75 %	0 %	384546164
2496	NC_017319	ATT	2	6	150385	150390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546164
2497	NC_017319	TTC	2	6	150399	150404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546164
2498	NC_017319	TTG	2	6	150437	150442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546164
2499	NC_017319	AGT	2	6	150571	150576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546164
2500	NC_017319	GTA	2	6	150623	150628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546164

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