MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 3662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017319	AGC	2	6	99254	99259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546100
1502	NC_017319	GAG	2	6	99302	99307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546100
1503	NC_017319	TGA	2	6	99424	99429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546100
1504	NC_017319	TAC	2	6	99452	99457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546100
1505	NC_017319	ACG	3	9	99480	99488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546100
1506	NC_017319	CTG	2	6	99517	99522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546100
1507	NC_017319	CTT	2	6	99572	99577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546100
1508	NC_017319	AGCGA	2	10	99585	99594	40 %	0 %	40 %	20 %	384546100
1509	NC_017319	CCG	2	6	99634	99639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546100
1510	NC_017319	ATC	3	9	99740	99748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546100
1511	NC_017319	GCGT	2	8	99799	99806	0 %	25 %	50 %	25 %	384546100
1512	NC_017319	ATG	2	6	99840	99845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546100
1513	NC_017319	GCG	2	6	99896	99901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546100
1514	NC_017319	GCTG	2	8	99978	99985	0 %	25 %	50 %	25 %	384546100
1515	NC_017319	CAA	2	6	99988	99993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546100
1516	NC_017319	CAG	2	6	99995	100000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546100
1517	NC_017319	TGT	2	6	100011	100016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546100
1518	NC_017319	GTTT	2	8	100042	100049	0 %	75 %	25 %	0 %	384546100
1519	NC_017319	TCG	2	6	100050	100055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546100
1520	NC_017319	T	6	6	100456	100461	0 %	100 %	0 %	0 %	384546101
1521	NC_017319	CTG	2	6	100486	100491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546101
1522	NC_017319	CAGC	2	8	100561	100568	25 %	0 %	25 %	50 %	384546101
1523	NC_017319	ACCTT	2	10	100679	100688	20 %	40 %	0 %	40 %	384546101
1524	NC_017319	GA	3	6	100722	100727	50 %	0 %	50 %	0 %	384546101
1525	NC_017319	ACA	2	6	100827	100832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546101
1526	NC_017319	CG	3	6	100836	100841	0 %	0 %	50 %	50 %	384546101
1527	NC_017319	CAC	2	6	100845	100850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546101
1528	NC_017319	AAG	2	6	100853	100858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546101
1529	NC_017319	ACA	2	6	100923	100928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546101
1530	NC_017319	GTC	2	6	101010	101015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546101
1531	NC_017319	CGAAC	2	10	101028	101037	40 %	0 %	20 %	40 %	384546101
1532	NC_017319	GCTCCT	2	12	101043	101054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384546101
1533	NC_017319	GA	4	8	101063	101070	50 %	0 %	50 %	0 %	384546101
1534	NC_017319	GAAT	2	8	101073	101080	50 %	25 %	25 %	0 %	384546101
1535	NC_017319	CAG	2	6	101220	101225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546101
1536	NC_017319	GGC	2	6	101243	101248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546101
1537	NC_017319	GTTAT	2	10	102777	102786	20 %	60 %	20 %	0 %	384546102
1538	NC_017319	AT	3	6	102821	102826	50 %	50 %	0 %	0 %	384546102
1539	NC_017319	TCA	2	6	102833	102838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546102
1540	NC_017319	GTT	2	6	102880	102885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546102
1541	NC_017319	T	6	6	102884	102889	0 %	100 %	0 %	0 %	384546102
1542	NC_017319	TGC	2	6	102941	102946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546102
1543	NC_017319	TAA	2	6	103054	103059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546102
1544	NC_017319	ATA	2	6	103093	103098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546102
1545	NC_017319	CTT	2	6	103149	103154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546102
1546	NC_017319	GAA	2	6	103176	103181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546102
1547	NC_017319	T	6	6	103189	103194	0 %	100 %	0 %	0 %	384546102
1548	NC_017319	TTTA	2	8	103209	103216	25 %	75 %	0 %	0 %	384546102
1549	NC_017319	TTA	2	6	103233	103238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546102
1550	NC_017319	TCT	2	6	103281	103286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546102
1551	NC_017319	ATT	2	6	103399	103404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546102
1552	NC_017319	AAG	3	9	103433	103441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546102
1553	NC_017319	TC	3	6	104507	104512	0 %	50 %	0 %	50 %	384546103
1554	NC_017319	TGTTT	2	10	104518	104527	0 %	80 %	20 %	0 %	384546103
1555	NC_017319	TGTT	2	8	104556	104563	0 %	75 %	25 %	0 %	384546103
1556	NC_017319	TCTTT	2	10	104570	104579	0 %	80 %	0 %	20 %	384546103
1557	NC_017319	AAAT	2	8	104604	104611	75 %	25 %	0 %	0 %	384546103
1558	NC_017319	ATG	2	6	104663	104668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546103
1559	NC_017319	T	6	6	104680	104685	0 %	100 %	0 %	0 %	384546103
1560	NC_017319	AT	3	6	104686	104691	50 %	50 %	0 %	0 %	384546103
1561	NC_017319	TTC	2	6	104725	104730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546103
1562	NC_017319	TAA	2	6	104786	104791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546103
1563	NC_017319	AAT	2	6	104795	104800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546103
1564	NC_017319	AAGTT	2	10	104816	104825	40 %	40 %	20 %	0 %	384546103
1565	NC_017319	ATT	2	6	104849	104854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546103
1566	NC_017319	TGC	2	6	104869	104874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546103
1567	NC_017319	CG	3	6	104896	104901	0 %	0 %	50 %	50 %	384546103
1568	NC_017319	T	6	6	104914	104919	0 %	100 %	0 %	0 %	384546103
1569	NC_017319	ATGCT	2	10	104984	104993	20 %	40 %	20 %	20 %	384546103
1570	NC_017319	AT	4	8	105042	105049	50 %	50 %	0 %	0 %	384546103
1571	NC_017319	AT	3	6	105085	105090	50 %	50 %	0 %	0 %	384546103
1572	NC_017319	GAA	2	6	105160	105165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546103
1573	NC_017319	TTG	2	6	105166	105171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546103
1574	NC_017319	TTC	2	6	105205	105210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546103
1575	NC_017319	T	6	6	105240	105245	0 %	100 %	0 %	0 %	384546103
1576	NC_017319	TTA	2	6	105308	105313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546103
1577	NC_017319	CTTT	2	8	105333	105340	0 %	75 %	0 %	25 %	384546103
1578	NC_017319	CCTT	2	8	105344	105351	0 %	50 %	0 %	50 %	384546103
1579	NC_017319	CCA	2	6	105378	105383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546103
1580	NC_017319	TAA	2	6	105651	105656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546104
1581	NC_017319	AGAGAA	2	12	105725	105736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546104
1582	NC_017319	TTC	2	6	105766	105771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546104
1583	NC_017319	ATA	2	6	105816	105821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546104
1584	NC_017319	T	6	6	105822	105827	0 %	100 %	0 %	0 %	384546104
1585	NC_017319	TGC	2	6	105895	105900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546105
1586	NC_017319	TA	4	8	105903	105910	50 %	50 %	0 %	0 %	384546105
1587	NC_017319	T	6	6	105941	105946	0 %	100 %	0 %	0 %	384546105
1588	NC_017319	AT	3	6	105954	105959	50 %	50 %	0 %	0 %	384546105
1589	NC_017319	GTAA	2	8	105965	105972	50 %	25 %	25 %	0 %	384546105
1590	NC_017319	CTT	2	6	106026	106031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546105
1591	NC_017319	TGT	2	6	106125	106130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546105
1592	NC_017319	TGT	2	6	106144	106149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546105
1593	NC_017319	GA	3	6	106216	106221	50 %	0 %	50 %	0 %	384546105
1594	NC_017319	T	7	7	106249	106255	0 %	100 %	0 %	0 %	384546105
1595	NC_017319	A	6	6	106307	106312	100 %	0 %	0 %	0 %	384546105
1596	NC_017319	TGA	2	6	106408	106413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546105
1597	NC_017319	G	7	7	106451	106457	0 %	0 %	100 %	0 %	384546105
1598	NC_017319	AG	3	6	106502	106507	50 %	0 %	50 %	0 %	384546105
1599	NC_017319	TCTT	2	8	106519	106526	0 %	75 %	0 %	25 %	384546105
1600	NC_017319	ACT	2	6	106528	106533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546105
1601	NC_017319	ATT	2	6	106606	106611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1602	NC_017319	ATA	2	6	106713	106718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546105
1603	NC_017319	CAT	2	6	106749	106754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546105
1604	NC_017319	TGT	2	6	106791	106796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546105
1605	NC_017319	TAT	2	6	106806	106811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1606	NC_017319	TAT	2	6	106821	106826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1607	NC_017319	ATT	2	6	106828	106833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1608	NC_017319	TCT	2	6	106955	106960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546105
1609	NC_017319	ATC	2	6	107119	107124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546105
1610	NC_017319	GA	3	6	107131	107136	50 %	0 %	50 %	0 %	384546105
1611	NC_017319	ATT	2	6	107176	107181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1612	NC_017319	ATG	2	6	107190	107195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546105
1613	NC_017319	GAG	2	6	107209	107214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546105
1614	NC_017319	TG	3	6	107245	107250	0 %	50 %	50 %	0 %	384546105
1615	NC_017319	TTG	2	6	107251	107256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546105
1616	NC_017319	T	6	6	107391	107396	0 %	100 %	0 %	0 %	384546105
1617	NC_017319	CATT	2	8	107490	107497	25 %	50 %	0 %	25 %	384546105
1618	NC_017319	CTT	2	6	107513	107518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546105
1619	NC_017319	TCT	2	6	107525	107530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546105
1620	NC_017319	GAA	2	6	107540	107545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546105
1621	NC_017319	A	6	6	107549	107554	100 %	0 %	0 %	0 %	384546105
1622	NC_017319	TGA	2	6	107680	107685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546105
1623	NC_017319	TA	3	6	107700	107705	50 %	50 %	0 %	0 %	384546105
1624	NC_017319	TAT	2	6	107724	107729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546105
1625	NC_017319	TATCTG	2	12	107771	107782	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384546106
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1997	NC_017319	TTG	2	6	122791	122796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546125
1998	NC_017319	A	6	6	122813	122818	100 %	0 %	0 %	0 %	384546125
1999	NC_017319	AGA	2	6	122852	122857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546125
2000	NC_017319	AT	3	6	122922	122927	50 %	50 %	0 %	0 %	384546125

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