MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 3662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017319	GTTT	2	8	68547	68554	0 %	75 %	25 %	0 %	384546058
1002	NC_017319	AT	3	6	68640	68645	50 %	50 %	0 %	0 %	384546058
1003	NC_017319	ATC	2	6	68653	68658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546058
1004	NC_017319	CGTTA	2	10	68664	68673	20 %	40 %	20 %	20 %	384546058
1005	NC_017319	CAA	2	6	68678	68683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546058
1006	NC_017319	TCC	2	6	68721	68726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546058
1007	NC_017319	T	6	6	68850	68855	0 %	100 %	0 %	0 %	384546058
1008	NC_017319	TCC	2	6	68973	68978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546058
1009	NC_017319	GAA	2	6	68983	68988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546058
1010	NC_017319	CGT	2	6	69000	69005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546058
1011	NC_017319	ATC	2	6	69058	69063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546058
1012	NC_017319	ATC	2	6	69073	69078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546058
1013	NC_017319	ATA	2	6	69083	69088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546058
1014	NC_017319	CTG	2	6	69099	69104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546058
1015	NC_017319	GTTT	2	8	69117	69124	0 %	75 %	25 %	0 %	384546058
1016	NC_017319	GGT	2	6	69187	69192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546058
1017	NC_017319	G	9	9	69219	69227	0 %	0 %	100 %	0 %	384546058
1018	NC_017319	GGT	2	6	69244	69249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546058
1019	NC_017319	CTT	2	6	69262	69267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546058
1020	NC_017319	CTGT	2	8	69277	69284	0 %	50 %	25 %	25 %	384546058
1021	NC_017319	ATT	2	6	69340	69345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546058
1022	NC_017319	TTA	2	6	69346	69351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546058
1023	NC_017319	AAG	2	6	69482	69487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546058
1024	NC_017319	TTG	2	6	69542	69547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546058
1025	NC_017319	TTG	2	6	69566	69571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546058
1026	NC_017319	G	6	6	69587	69592	0 %	0 %	100 %	0 %	384546058
1027	NC_017319	CTG	2	6	69617	69622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546058
1028	NC_017319	CAT	2	6	69630	69635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546058
1029	NC_017319	TGA	2	6	69644	69649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546058
1030	NC_017319	TGAG	2	8	70075	70082	25 %	25 %	50 %	0 %	384546060
1031	NC_017319	GCT	2	6	70096	70101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546060
1032	NC_017319	CCG	2	6	70153	70158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546060
1033	NC_017319	TGA	2	6	70197	70202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546060
1034	NC_017319	TTC	2	6	70214	70219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546060
1035	NC_017319	ATG	2	6	70227	70232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546060
1036	NC_017319	CAC	2	6	70284	70289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546061
1037	NC_017319	AGG	2	6	70300	70305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546061
1038	NC_017319	CAG	2	6	70410	70415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546061
1039	NC_017319	CAC	2	6	70418	70423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546061
1040	NC_017319	CGC	2	6	70427	70432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546061
1041	NC_017319	GAA	2	6	70446	70451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546061
1042	NC_017319	TTTC	2	8	70461	70468	0 %	75 %	0 %	25 %	384546061
1043	NC_017319	TCCGCC	2	12	70510	70521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384546061
1044	NC_017319	TCA	2	6	70528	70533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546061
1045	NC_017319	TAA	2	6	70537	70542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546061
1046	NC_017319	T	6	6	70596	70601	0 %	100 %	0 %	0 %	384546061
1047	NC_017319	TTC	2	6	70615	70620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546061
1048	NC_017319	CCA	2	6	70622	70627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546061
1049	NC_017319	GCT	2	6	70664	70669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546061
1050	NC_017319	ACTCTG	2	12	70685	70696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384546061
1051	NC_017319	CTT	2	6	70751	70756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546061
1052	NC_017319	CGCA	2	8	70764	70771	25 %	0 %	25 %	50 %	384546061
1053	NC_017319	CGGG	2	8	70804	70811	0 %	0 %	75 %	25 %	384546062
1054	NC_017319	ATC	2	6	70881	70886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546062
1055	NC_017319	ATA	2	6	70902	70907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546062
1056	NC_017319	GGA	2	6	70926	70931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546062
1057	NC_017319	TCG	2	6	70955	70960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546062
1058	NC_017319	CCAC	2	8	70975	70982	25 %	0 %	0 %	75 %	384546062
1059	NC_017319	TG	3	6	71139	71144	0 %	50 %	50 %	0 %	384546062
1060	NC_017319	ATAC	2	8	71155	71162	50 %	25 %	0 %	25 %	384546062
1061	NC_017319	ATG	2	6	71301	71306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546062
1062	NC_017319	GTAA	2	8	71342	71349	50 %	25 %	25 %	0 %	384546062
1063	NC_017319	CCAC	2	8	71356	71363	25 %	0 %	0 %	75 %	384546062
1064	NC_017319	AAC	2	6	71532	71537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546062
1065	NC_017319	CAT	2	6	71749	71754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546063
1066	NC_017319	T	6	6	71754	71759	0 %	100 %	0 %	0 %	384546063
1067	NC_017319	GCG	2	6	71823	71828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546063
1068	NC_017319	GGT	2	6	71877	71882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546063
1069	NC_017319	GAA	2	6	72356	72361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546065
1070	NC_017319	TCA	2	6	72373	72378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546065
1071	NC_017319	CGG	2	6	72417	72422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546065
1072	NC_017319	CTCA	2	8	72493	72500	25 %	25 %	0 %	50 %	384546065
1073	NC_017319	CAG	3	9	72621	72629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546065
1074	NC_017319	ACG	2	6	72677	72682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546065
1075	NC_017319	C	6	6	72702	72707	0 %	0 %	0 %	100 %	384546065
1076	NC_017319	TCA	2	6	72714	72719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546065
1077	NC_017319	TGA	2	6	72721	72726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546065
1078	NC_017319	TCAG	2	8	72744	72751	25 %	25 %	25 %	25 %	384546065
1079	NC_017319	GAA	2	6	72752	72757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546065
1080	NC_017319	TTC	2	6	72767	72772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546065
1081	NC_017319	GCA	2	6	72863	72868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546065
1082	NC_017319	TCAAA	2	10	72916	72925	60 %	20 %	0 %	20 %	384546065
1083	NC_017319	CAGA	2	8	72943	72950	50 %	0 %	25 %	25 %	384546065
1084	NC_017319	CAG	2	6	73385	73390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546066
1085	NC_017319	CG	3	6	73401	73406	0 %	0 %	50 %	50 %	384546066
1086	NC_017319	TTC	2	6	73410	73415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546066
1087	NC_017319	CGG	2	6	73446	73451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546066
1088	NC_017319	GCC	2	6	73463	73468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546066
1089	NC_017319	ATCC	2	8	73553	73560	25 %	25 %	0 %	50 %	384546066
1090	NC_017319	TC	3	6	73588	73593	0 %	50 %	0 %	50 %	384546066
1091	NC_017319	CA	3	6	73594	73599	50 %	0 %	0 %	50 %	384546066
1092	NC_017319	CGG	2	6	73786	73791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546067
1093	NC_017319	CTT	2	6	73792	73797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546067
1094	NC_017319	GC	3	6	73816	73821	0 %	0 %	50 %	50 %	384546067
1095	NC_017319	TCC	2	6	73827	73832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546067
1096	NC_017319	GCCG	2	8	73834	73841	0 %	0 %	50 %	50 %	384546067
1097	NC_017319	T	7	7	73842	73848	0 %	100 %	0 %	0 %	384546067
1098	NC_017319	TCC	2	6	73873	73878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546067
1099	NC_017319	CGT	2	6	73912	73917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546067
1100	NC_017319	GAC	2	6	74100	74105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546067
1101	NC_017319	AGA	2	6	74127	74132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546067
1102	NC_017319	GGC	2	6	74158	74163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546067
1103	NC_017319	CAG	2	6	74167	74172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546067
1104	NC_017319	CAG	2	6	74203	74208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546067
1105	NC_017319	T	6	6	74324	74329	0 %	100 %	0 %	0 %	384546067
1106	NC_017319	GGCA	2	8	74340	74347	25 %	0 %	50 %	25 %	384546067
1107	NC_017319	CCGC	2	8	74483	74490	0 %	0 %	25 %	75 %	384546067
1108	NC_017319	AGGA	2	8	74495	74502	50 %	0 %	50 %	0 %	384546067
1109	NC_017319	TGGT	2	8	74513	74520	0 %	50 %	50 %	0 %	384546067
1110	NC_017319	CAC	3	9	74556	74564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546067
1111	NC_017319	ACG	2	6	74612	74617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546068
1112	NC_017319	AGG	2	6	74698	74703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546068
1113	NC_017319	ATT	2	6	74747	74752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546068
1114	NC_017319	TG	3	6	74818	74823	0 %	50 %	50 %	0 %	384546069
1115	NC_017319	GCC	2	6	74887	74892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546069
1116	NC_017319	TTC	2	6	75063	75068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546069
1117	NC_017319	TTC	2	6	75243	75248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546070
1118	NC_017319	T	8	8	75273	75280	0 %	100 %	0 %	0 %	384546070
1119	NC_017319	TTC	2	6	75299	75304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546070
1120	NC_017319	T	6	6	75321	75326	0 %	100 %	0 %	0 %	384546070
1121	NC_017319	ATT	2	6	75327	75332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546070
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1125	NC_017319	ACAA	2	8	75510	75517	75 %	0 %	0 %	25 %	384546070
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