MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 3662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017319	TG	3	6	35050	35055	0 %	50 %	50 %	0 %	384546017
502	NC_017319	CCG	2	6	35072	35077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546017
503	NC_017319	GAA	2	6	35108	35113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546017
504	NC_017319	CG	3	6	35117	35122	0 %	0 %	50 %	50 %	384546017
505	NC_017319	CTG	2	6	35133	35138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546017
506	NC_017319	AG	4	8	35230	35237	50 %	0 %	50 %	0 %	384546018
507	NC_017319	T	6	6	35596	35601	0 %	100 %	0 %	0 %	384546019
508	NC_017319	GC	3	6	35741	35746	0 %	0 %	50 %	50 %	384546019
509	NC_017319	AGCA	2	8	35808	35815	50 %	0 %	25 %	25 %	384546019
510	NC_017319	AGC	3	9	35823	35831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546019
511	NC_017319	TGC	2	6	35848	35853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546019
512	NC_017319	GAT	2	6	36000	36005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546019
513	NC_017319	CAT	2	6	36014	36019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546019
514	NC_017319	AGT	2	6	36021	36026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546019
515	NC_017319	AGT	2	6	36029	36034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546019
516	NC_017319	T	6	6	36452	36457	0 %	100 %	0 %	0 %	384546020
517	NC_017319	ATA	2	6	36491	36496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
518	NC_017319	CAT	2	6	36553	36558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546020
519	NC_017319	TGC	2	6	36590	36595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546020
520	NC_017319	ATG	2	6	36596	36601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546020
521	NC_017319	AAG	2	6	36614	36619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546020
522	NC_017319	TTG	2	6	36623	36628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546020
523	NC_017319	TCT	2	6	36715	36720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546020
524	NC_017319	T	7	7	36726	36732	0 %	100 %	0 %	0 %	384546020
525	NC_017319	CAA	2	6	36733	36738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546020
526	NC_017319	AGA	2	6	36767	36772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546020
527	NC_017319	TATCGA	2	12	36776	36787	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546020
528	NC_017319	TA	3	6	36790	36795	50 %	50 %	0 %	0 %	384546020
529	NC_017319	TCA	2	6	36804	36809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546020
530	NC_017319	TCTT	2	8	36844	36851	0 %	75 %	0 %	25 %	384546020
531	NC_017319	CCT	3	9	36898	36906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546020
532	NC_017319	AG	3	6	36908	36913	50 %	0 %	50 %	0 %	384546020
533	NC_017319	T	7	7	36922	36928	0 %	100 %	0 %	0 %	384546020
534	NC_017319	ATT	2	6	36984	36989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546020
535	NC_017319	TAA	2	6	36991	36996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
536	NC_017319	TAA	3	9	37001	37009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
537	NC_017319	T	7	7	37055	37061	0 %	100 %	0 %	0 %	384546020
538	NC_017319	ATA	2	6	37173	37178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546020
539	NC_017319	CAT	2	6	37229	37234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546020
540	NC_017319	GAAG	2	8	37911	37918	50 %	0 %	50 %	0 %	384546021
541	NC_017319	TC	3	6	38019	38024	0 %	50 %	0 %	50 %	384546021
542	NC_017319	ATC	2	6	38294	38299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546022
543	NC_017319	TAT	3	9	38319	38327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546022
544	NC_017319	TAC	2	6	38338	38343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546022
545	NC_017319	A	6	6	38366	38371	100 %	0 %	0 %	0 %	384546022
546	NC_017319	TA	3	6	38377	38382	50 %	50 %	0 %	0 %	384546022
547	NC_017319	CTG	2	6	38397	38402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546022
548	NC_017319	TGA	2	6	38476	38481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546022
549	NC_017319	AG	3	6	38616	38621	50 %	0 %	50 %	0 %	384546023
550	NC_017319	TGC	2	6	38652	38657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546023
551	NC_017319	ATG	2	6	38677	38682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546023
552	NC_017319	TTCCAT	2	12	38707	38718	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384546023
553	NC_017319	TCCT	2	8	38725	38732	0 %	50 %	0 %	50 %	384546023
554	NC_017319	GTG	2	6	38750	38755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546023
555	NC_017319	A	6	6	38953	38958	100 %	0 %	0 %	0 %	384546024
556	NC_017319	GTGAT	2	10	38999	39008	20 %	40 %	40 %	0 %	384546024
557	NC_017319	GCTG	2	8	39065	39072	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
558	NC_017319	GGA	2	6	39095	39100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546024
559	NC_017319	TCT	2	6	39150	39155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546024
560	NC_017319	CTG	2	6	39160	39165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546024
561	NC_017319	TGGC	2	8	39198	39205	0 %	25 %	50 %	25 %	384546024
562	NC_017319	AATCTG	2	12	39280	39291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384546024
563	NC_017319	ACA	2	6	39294	39299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546024
564	NC_017319	CAT	2	6	39696	39701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546025
565	NC_017319	CGT	2	6	39721	39726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546025
566	NC_017319	GTA	2	6	39783	39788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546025
567	NC_017319	AAC	2	6	39832	39837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546025
568	NC_017319	TTA	2	6	39853	39858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546025
569	NC_017319	AGC	2	6	39930	39935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546025
570	NC_017319	GAG	2	6	39978	39983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546025
571	NC_017319	TGA	2	6	40100	40105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546025
572	NC_017319	TAC	2	6	40128	40133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546025
573	NC_017319	ACG	3	9	40156	40164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546025
574	NC_017319	CTG	2	6	40193	40198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546025
575	NC_017319	CTT	2	6	40248	40253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546025
576	NC_017319	AGCGA	2	10	40261	40270	40 %	0 %	40 %	20 %	384546025
577	NC_017319	CCG	2	6	40310	40315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546025
578	NC_017319	ATC	3	9	40416	40424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546025
579	NC_017319	GCGT	2	8	40475	40482	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
580	NC_017319	ATG	2	6	40516	40521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546025
581	NC_017319	GCG	2	6	40572	40577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546025
582	NC_017319	GCTG	2	8	40654	40661	0 %	25 %	50 %	25 %	384546025
583	NC_017319	CAA	2	6	40664	40669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546025
584	NC_017319	CAG	2	6	40671	40676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546025
585	NC_017319	TGT	2	6	40687	40692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546025
586	NC_017319	GTTT	2	8	40718	40725	0 %	75 %	25 %	0 %	384546025
587	NC_017319	TCG	2	6	40726	40731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546025
588	NC_017319	TAT	2	6	41230	41235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546026
589	NC_017319	ACA	2	6	41247	41252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
590	NC_017319	ATT	2	6	41310	41315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546026
591	NC_017319	ATCT	2	8	41421	41428	25 %	50 %	0 %	25 %	384546026
592	NC_017319	AAC	2	6	41470	41475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
593	NC_017319	A	6	6	41488	41493	100 %	0 %	0 %	0 %	384546026
594	NC_017319	CCA	2	6	41519	41524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546026
595	NC_017319	AGA	2	6	41590	41595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546026
596	NC_017319	ATA	2	6	41667	41672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546026
597	NC_017319	C	7	7	41749	41755	0 %	0 %	0 %	100 %	384546026
598	NC_017319	CTGGCT	2	12	41777	41788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546026
599	NC_017319	AAT	2	6	41789	41794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546026
600	NC_017319	AAC	2	6	41802	41807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
601	NC_017319	AAT	3	9	41849	41857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546026
602	NC_017319	ACA	2	6	41861	41866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
603	NC_017319	ACA	2	6	41953	41958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546026
604	NC_017319	ACC	2	6	41963	41968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546026
605	NC_017319	ATT	2	6	41976	41981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546026
606	NC_017319	ACAA	2	8	42078	42085	75 %	0 %	0 %	25 %	384546026
607	NC_017319	CAG	2	6	42254	42259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546026
608	NC_017319	TGC	2	6	42271	42276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546026
609	NC_017319	CCT	2	6	42337	42342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546026
610	NC_017319	GCTCT	2	10	42386	42395	0 %	40 %	20 %	40 %	384546026
611	NC_017319	GGA	2	6	42430	42435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546026
612	NC_017319	CT	3	6	42527	42532	0 %	50 %	0 %	50 %	384546026
613	NC_017319	GAAT	2	8	42625	42632	50 %	25 %	25 %	0 %	384546026
614	NC_017319	GCAG	2	8	42703	42710	25 %	0 %	50 %	25 %	384546026
615	NC_017319	GATGCG	2	12	42791	42802	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384546026
616	NC_017319	CAG	2	6	42842	42847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546026
617	NC_017319	TGAC	2	8	42861	42868	25 %	25 %	25 %	25 %	384546026
618	NC_017319	CAC	2	6	43129	43134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546027
619	NC_017319	A	6	6	43253	43258	100 %	0 %	0 %	0 %	384546027
620	NC_017319	GTT	2	6	43475	43480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546028
621	NC_017319	TTAC	2	8	43663	43670	25 %	50 %	0 %	25 %	384546028
622	NC_017319	TCA	2	6	43705	43710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546028
623	NC_017319	GTAT	2	8	43850	43857	25 %	50 %	25 %	0 %	384546028
624	NC_017319	AC	3	6	43867	43872	50 %	0 %	0 %	50 %	384546028
625	NC_017319	GTGG	2	8	44030	44037	0 %	25 %	75 %	0 %	384546028
626	NC_017319	CGA	2	6	44052	44057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546028
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628	NC_017319	GCAGAA	2	12	44088	44099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384546028
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