MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 47191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017274	TCT	2	6	48499	48504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
1002	NC_017274	TAT	2	6	48522	48527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
1003	NC_017274	ATT	2	6	48580	48585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
1004	NC_017274	CTTT	2	8	48592	48599	0 %	75 %	0 %	25 %	384432606
1005	NC_017274	ATG	2	6	48648	48653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432606
1006	NC_017274	CTT	2	6	48671	48676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
1007	NC_017274	ATTT	2	8	48750	48757	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1008	NC_017274	TCTT	2	8	48868	48875	0 %	75 %	0 %	25 %	384432606
1009	NC_017274	ATTT	2	8	48900	48907	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1010	NC_017274	TAGT	2	8	48917	48924	25 %	50 %	25 %	0 %	384432606
1011	NC_017274	TGTA	2	8	48932	48939	25 %	50 %	25 %	0 %	384432606
1012	NC_017274	CTA	2	6	48947	48952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432606
1013	NC_017274	TAC	2	6	48956	48961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432606
1014	NC_017274	CTTTCC	2	12	48964	48975	0 %	50 %	0 %	50 %	384432606
1015	NC_017274	TTA	2	6	49036	49041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
1016	NC_017274	TTC	2	6	49098	49103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
1017	NC_017274	T	6	6	49104	49109	0 %	100 %	0 %	0 %	384432606
1018	NC_017274	ATTT	2	8	49122	49129	25 %	75 %	0 %	0 %	384432606
1019	NC_017274	TGT	2	6	49134	49139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432606
1020	NC_017274	GA	3	6	49202	49207	50 %	0 %	50 %	0 %	384432606
1021	NC_017274	TAG	2	6	49215	49220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432606
1022	NC_017274	ATT	2	6	49240	49245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
1023	NC_017274	TCC	2	6	49286	49291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432606
1024	NC_017274	TATAG	2	10	49292	49301	40 %	40 %	20 %	0 %	384432606
1025	NC_017274	TAT	2	6	49304	49309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432606
1026	NC_017274	TCT	2	6	49357	49362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432606
1027	NC_017274	ACC	2	6	49485	49490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432606
1028	NC_017274	TGA	2	6	51181	51186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432607
1029	NC_017274	T	6	6	51215	51220	0 %	100 %	0 %	0 %	384432607
1030	NC_017274	ATT	2	6	51223	51228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432607
1031	NC_017274	TTTA	2	8	51324	51331	25 %	75 %	0 %	0 %	384432607
1032	NC_017274	TAA	2	6	51421	51426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432607
1033	NC_017274	GTT	2	6	51554	51559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432607
1034	NC_017274	GTG	2	6	51588	51593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432607
1035	NC_017274	GCT	2	6	51653	51658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432607
1036	NC_017274	GA	4	8	51734	51741	50 %	0 %	50 %	0 %	384432607
1037	NC_017274	AT	3	6	51748	51753	50 %	50 %	0 %	0 %	384432607
1038	NC_017274	T	6	6	51782	51787	0 %	100 %	0 %	0 %	384432607
1039	NC_017274	TAA	2	6	51796	51801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432607
1040	NC_017274	ATCC	2	8	51848	51855	25 %	25 %	0 %	50 %	384432607
1041	NC_017274	TAT	2	6	51892	51897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432607
1042	NC_017274	TTC	2	6	51904	51909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432607
1043	NC_017274	ATGTTG	2	12	51918	51929	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384432607
1044	NC_017274	TGG	2	6	52021	52026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432607
1045	NC_017274	TCT	2	6	52039	52044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432607
1046	NC_017274	CT	3	6	52051	52056	0 %	50 %	0 %	50 %	384432607
1047	NC_017274	T	6	6	52098	52103	0 %	100 %	0 %	0 %	384432608
1048	NC_017274	ATT	2	6	52164	52169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432608
1049	NC_017274	A	6	6	52186	52191	100 %	0 %	0 %	0 %	384432608
1050	NC_017274	TAT	2	6	52285	52290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432608
1051	NC_017274	T	7	7	52321	52327	0 %	100 %	0 %	0 %	384432608
1052	NC_017274	TTC	2	6	52331	52336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432608
1053	NC_017274	ATT	2	6	52371	52376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432608
1054	NC_017274	CAA	2	6	52427	52432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432608
1055	NC_017274	AGT	2	6	52622	52627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432609
1056	NC_017274	A	7	7	52683	52689	100 %	0 %	0 %	0 %	384432609
1057	NC_017274	AAG	2	6	52697	52702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432609
1058	NC_017274	ATT	2	6	52737	52742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432609
1059	NC_017274	GAT	2	6	52788	52793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432609
1060	NC_017274	AGAATT	2	12	52865	52876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384432609
1061	NC_017274	AG	3	6	52880	52885	50 %	0 %	50 %	0 %	384432609
1062	NC_017274	ATTTTC	2	12	52898	52909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384432609
1063	NC_017274	GAA	3	9	52927	52935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432609
1064	NC_017274	TGA	2	6	52958	52963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432609
1065	NC_017274	ATA	2	6	52995	53000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432609
1066	NC_017274	TGAG	2	8	53005	53012	25 %	25 %	50 %	0 %	384432609
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1069	NC_017274	GAA	2	6	53168	53173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432610
1070	NC_017274	GGA	2	6	53177	53182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432610
1071	NC_017274	AT	3	6	53199	53204	50 %	50 %	0 %	0 %	384432610
1072	NC_017274	AAAG	2	8	53219	53226	75 %	0 %	25 %	0 %	384432610
1073	NC_017274	AGA	2	6	53323	53328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432610
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1075	NC_017274	ATT	2	6	53378	53383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432610
1076	NC_017274	TAT	2	6	53450	53455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432610
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1083	NC_017274	TAA	2	6	55186	55191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432611
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1085	NC_017274	CTA	2	6	55235	55240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
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1093	NC_017274	T	6	6	55498	55503	0 %	100 %	0 %	0 %	384432611
1094	NC_017274	T	6	6	55526	55531	0 %	100 %	0 %	0 %	384432611
1095	NC_017274	AAT	2	6	55537	55542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432611
1096	NC_017274	TC	3	6	55582	55587	0 %	50 %	0 %	50 %	384432611
1097	NC_017274	CTA	2	6	55591	55596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
1098	NC_017274	CAT	2	6	55622	55627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
1099	NC_017274	TAT	2	6	55635	55640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432611
1100	NC_017274	TAG	2	6	55662	55667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432611
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1103	NC_017274	TTAACT	2	12	55736	55747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384432611
1104	NC_017274	TCA	2	6	55750	55755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
1105	NC_017274	TTA	2	6	55777	55782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432611
1106	NC_017274	CCAT	2	8	55804	55811	25 %	25 %	0 %	50 %	384432611
1107	NC_017274	TAC	2	6	55829	55834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
1108	NC_017274	TTCT	2	8	55883	55890	0 %	75 %	0 %	25 %	384432611
1109	NC_017274	TAT	2	6	55955	55960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432611
1110	NC_017274	CTATTC	2	12	55994	56005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384432611
1111	NC_017274	ATTC	2	8	56081	56088	25 %	50 %	0 %	25 %	384432611
1112	NC_017274	T	6	6	56152	56157	0 %	100 %	0 %	0 %	384432611
1113	NC_017274	CTA	2	6	56174	56179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432611
1114	NC_017274	AT	3	6	56187	56192	50 %	50 %	0 %	0 %	384432611
1115	NC_017274	TCC	2	6	56208	56213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432612
1116	NC_017274	CT	3	6	56233	56238	0 %	50 %	0 %	50 %	384432612
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1119	NC_017274	CGT	2	6	56281	56286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432612
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1121	NC_017274	TAT	2	6	56297	56302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432612
1122	NC_017274	ATC	2	6	56360	56365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432612
1123	NC_017274	TTG	2	6	56374	56379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432612
1124	NC_017274	GAA	2	6	56393	56398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432612
1125	NC_017274	TC	4	8	56459	56466	0 %	50 %	0 %	50 %	384432612
1126	NC_017274	CGC	2	6	56467	56472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432612
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