MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 47191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017274	GTT	2	6	283880	283885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432858
5503	NC_017274	AGT	2	6	283916	283921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432858
5504	NC_017274	TAA	2	6	284019	284024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432858
5505	NC_017274	ATA	2	6	284027	284032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432858
5506	NC_017274	GCA	2	6	284081	284086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432858
5507	NC_017274	GAG	2	6	284129	284134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432858
5508	NC_017274	AG	3	6	284150	284155	50 %	0 %	50 %	0 %	384432858
5509	NC_017274	ATT	2	6	284327	284332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432859
5510	NC_017274	AAG	2	6	284375	284380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432859
5511	NC_017274	AAAC	2	8	284394	284401	75 %	0 %	0 %	25 %	384432859
5512	NC_017274	TA	3	6	284432	284437	50 %	50 %	0 %	0 %	384432859
5513	NC_017274	AT	3	6	284488	284493	50 %	50 %	0 %	0 %	384432859
5514	NC_017274	ATA	2	6	284501	284506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432859
5515	NC_017274	ATC	2	6	284513	284518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432859
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5517	NC_017274	TGG	2	6	284538	284543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432859
5518	NC_017274	GGT	2	6	284722	284727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432859
5519	NC_017274	CGAAT	2	10	284732	284741	40 %	20 %	20 %	20 %	384432859
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5521	NC_017274	TCT	2	6	284961	284966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432859
5522	NC_017274	GTTC	2	8	284976	284983	0 %	50 %	25 %	25 %	384432859
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5527	NC_017274	TAGT	2	8	285167	285174	25 %	50 %	25 %	0 %	384432859
5528	NC_017274	GAA	2	6	285231	285236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432860
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5530	NC_017274	TTAAT	2	10	285349	285358	40 %	60 %	0 %	0 %	384432860
5531	NC_017274	ATG	2	6	285370	285375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432860
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5534	NC_017274	ACT	2	6	285700	285705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432860
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5540	NC_017274	AGT	2	6	286253	286258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432860
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5545	NC_017274	ATC	2	6	286331	286336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432861
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5547	NC_017274	CAA	2	6	286419	286424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384432861
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5549	NC_017274	ATT	2	6	286505	286510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432861
5550	NC_017274	AGT	2	6	286539	286544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432861
5551	NC_017274	TA	3	6	286642	286647	50 %	50 %	0 %	0 %	384432861
5552	NC_017274	A	6	6	286692	286697	100 %	0 %	0 %	0 %	384432861
5553	NC_017274	AT	3	6	286733	286738	50 %	50 %	0 %	0 %	384432861
5554	NC_017274	AATA	2	8	286804	286811	75 %	25 %	0 %	0 %	384432861
5555	NC_017274	CTT	2	6	286836	286841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432861
5556	NC_017274	TAAA	2	8	286878	286885	75 %	25 %	0 %	0 %	384432861
5557	NC_017274	ACT	2	6	286922	286927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432861
5558	NC_017274	TTCATG	2	12	286996	287007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384432861
5559	NC_017274	GTTA	2	8	287083	287090	25 %	50 %	25 %	0 %	384432861
5560	NC_017274	CTA	3	9	287097	287105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432861
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5563	NC_017274	ATA	2	6	287219	287224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432861
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5569	NC_017274	AAGTT	2	10	287528	287537	40 %	40 %	20 %	0 %	384432862
5570	NC_017274	GA	3	6	287568	287573	50 %	0 %	50 %	0 %	384432862
5571	NC_017274	AGAGG	2	10	287612	287621	40 %	0 %	60 %	0 %	384432862
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5593	NC_017274	TTG	2	6	288505	288510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432863
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5595	NC_017274	GAG	2	6	288571	288576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432863
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5599	NC_017274	C	6	6	288673	288678	0 %	0 %	0 %	100 %	384432863
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5603	NC_017274	TAT	2	6	288822	288827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384432863
5604	NC_017274	AC	3	6	288855	288860	50 %	0 %	0 %	50 %	384432863
5605	NC_017274	CCT	2	6	288895	288900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432863
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5607	NC_017274	TTTGG	2	10	288935	288944	0 %	60 %	40 %	0 %	384432863
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