MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 48907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017098	CTG	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
2	NC_017098	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
3	NC_017098	CAG	2	6	286	291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
4	NC_017098	AAC	3	9	415	423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789244
5	NC_017098	TGC	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
6	NC_017098	ATC	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
7	NC_017098	GAG	2	6	589	594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789244
8	NC_017098	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
9	NC_017098	GAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789244
10	NC_017098	GAA	2	6	721	726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
11	NC_017098	AAG	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
12	NC_017098	ACC	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
13	NC_017098	CAG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
14	NC_017098	ACT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
15	NC_017098	CTG	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
16	NC_017098	CCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
17	NC_017098	CAC	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
18	NC_017098	AGA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
19	NC_017098	CAC	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789245
20	NC_017098	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789245
21	NC_017098	TCA	2	6	1696	1701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
22	NC_017098	TGC	3	9	1730	1738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
23	NC_017098	AAC	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789245
24	NC_017098	TGC	2	6	1812	1817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
25	NC_017098	CTA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
26	NC_017098	TTC	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789245
27	NC_017098	GAT	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
28	NC_017098	ACT	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
29	NC_017098	GAT	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
30	NC_017098	GAT	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
31	NC_017098	CAG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789245
32	NC_017098	GCG	2	6	2261	2266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789245
33	NC_017098	GAG	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789245
34	NC_017098	CTG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
35	NC_017098	TTG	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789245
36	NC_017098	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
37	NC_017098	TTG	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789246
38	NC_017098	CTG	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
39	NC_017098	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
40	NC_017098	GCA	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
41	NC_017098	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
42	NC_017098	CTG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
43	NC_017098	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
44	NC_017098	GCA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
45	NC_017098	CAG	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
46	NC_017098	ACT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
47	NC_017098	TGG	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789246
48	NC_017098	TGC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
49	NC_017098	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
50	NC_017098	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
51	NC_017098	GCG	2	6	3678	3683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789246
52	NC_017098	GAG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789246
53	NC_017098	CTG	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789247
54	NC_017098	GCA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
55	NC_017098	TGA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789247
56	NC_017098	TGG	3	9	3972	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789247
57	NC_017098	ATC	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789247
58	NC_017098	GCA	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
59	NC_017098	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789247
60	NC_017098	AGC	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
61	NC_017098	AGC	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
62	NC_017098	GTC	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
63	NC_017098	CGT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
64	NC_017098	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
65	NC_017098	AAG	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
66	NC_017098	GTA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789249
67	NC_017098	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
68	NC_017098	TTC	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
69	NC_017098	ATC	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
70	NC_017098	TGC	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
71	NC_017098	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
72	NC_017098	TGG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
73	NC_017098	CGC	2	6	5388	5393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
74	NC_017098	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
75	NC_017098	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
76	NC_017098	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
77	NC_017098	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
78	NC_017098	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
79	NC_017098	GAG	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789250
80	NC_017098	GGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
81	NC_017098	CTG	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
82	NC_017098	GTG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
83	NC_017098	GCT	3	9	6101	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
84	NC_017098	GAT	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
85	NC_017098	AAG	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789250
86	NC_017098	GGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789250
87	NC_017098	TGC	3	9	6280	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
88	NC_017098	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
89	NC_017098	AAC	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789250
90	NC_017098	TCT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
91	NC_017098	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
92	NC_017098	CTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
93	NC_017098	GCT	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
94	NC_017098	GCA	3	9	6514	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
95	NC_017098	CAC	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789250
96	NC_017098	TTC	3	9	6564	6572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
97	NC_017098	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
98	NC_017098	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
99	NC_017098	GCA	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
100	NC_017098	TAC	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
101	NC_017098	GCA	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
102	NC_017098	GCA	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
103	NC_017098	AGA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789251
104	NC_017098	GGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789251
105	NC_017098	TGC	2	6	6982	6987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
106	NC_017098	GCA	2	6	6998	7003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
107	NC_017098	GCA	3	9	7007	7015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
108	NC_017098	GCC	2	6	7016	7021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789251
109	NC_017098	TTA	2	6	7110	7115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789251
110	NC_017098	ATT	3	9	7169	7177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789251
111	NC_017098	GGT	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789251
112	NC_017098	GTC	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
113	NC_017098	TGA	2	6	7338	7343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789251
114	NC_017098	GCT	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
115	NC_017098	GCG	2	6	7387	7392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789251
116	NC_017098	ATC	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789251
117	NC_017098	AAC	2	6	7412	7417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789251
118	NC_017098	TGC	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789252
119	NC_017098	TGC	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789252
120	NC_017098	GCC	2	6	8410	8415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789253
121	NC_017098	GCG	2	6	8416	8421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789253
122	NC_017098	GTG	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789253
123	NC_017098	GGA	2	6	8457	8462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789253
124	NC_017098	GGA	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789253
125	NC_017098	GGC	2	6	8559	8564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789253
126	NC_017098	TTG	2	6	8627	8632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789253
127	NC_017098	ACG	2	6	8633	8638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789253
128	NC_017098	CTG	2	6	8653	8658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789253
129	NC_017098	AGC	2	6	8716	8721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789253
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134	NC_017098	CTG	2	6	8869	8874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789253
135	NC_017098	CTG	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789253
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252	NC_017098	TCT	2	6	17492	17497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789258
253	NC_017098	AAG	2	6	17506	17511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789258
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256	NC_017098	GTC	2	6	17605	17610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789258
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261	NC_017098	TAC	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789259
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285	NC_017098	CGA	2	6	20293	20298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789262
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499	NC_017098	GTA	2	6	35012	35017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789271
500	NC_017098	CTG	3	9	35021	35029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789271

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