MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017078	TACT	2	8	26450	26457	25 %	50 %	0 %	25 %	383760714
502	NC_017078	A	6	6	26516	26521	100 %	0 %	0 %	0 %	383760714
503	NC_017078	AG	3	6	26580	26585	50 %	0 %	50 %	0 %	383760714
504	NC_017078	GAT	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760715
505	NC_017078	AGC	2	6	26852	26857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760715
506	NC_017078	AG	3	6	26900	26905	50 %	0 %	50 %	0 %	383760715
507	NC_017078	CTG	2	6	26917	26922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760715
508	NC_017078	GGA	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760715
509	NC_017078	A	6	6	27031	27036	100 %	0 %	0 %	0 %	383760715
510	NC_017078	TGG	2	6	27137	27142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760715
511	NC_017078	GAA	2	6	27148	27153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760715
512	NC_017078	CGA	2	6	27195	27200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760715
513	NC_017078	A	6	6	27225	27230	100 %	0 %	0 %	0 %	383760715
514	NC_017078	TGA	2	6	27387	27392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760716
515	NC_017078	TGCC	2	8	27404	27411	0 %	25 %	25 %	50 %	383760716
516	NC_017078	TG	3	6	27437	27442	0 %	50 %	50 %	0 %	383760716
517	NC_017078	AAC	2	6	27451	27456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760716
518	NC_017078	T	6	6	27732	27737	0 %	100 %	0 %	0 %	383760717
519	NC_017078	ATCT	2	8	27941	27948	25 %	50 %	0 %	25 %	383760717
520	NC_017078	AAG	2	6	28016	28021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760717
521	NC_017078	AGA	2	6	28055	28060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760717
522	NC_017078	AGA	2	6	28131	28136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760717
523	NC_017078	AAG	2	6	28150	28155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760717
524	NC_017078	GAT	2	6	28225	28230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760717
525	NC_017078	GTG	2	6	28427	28432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760718
526	NC_017078	GCA	2	6	28437	28442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760718
527	NC_017078	AT	3	6	28466	28471	50 %	50 %	0 %	0 %	383760718
528	NC_017078	TCA	2	6	28477	28482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760718
529	NC_017078	CTG	2	6	28527	28532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760718
530	NC_017078	TTC	2	6	28656	28661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760719
531	NC_017078	AAG	2	6	28665	28670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760719
532	NC_017078	GGA	2	6	28686	28691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760719
533	NC_017078	CTT	2	6	28772	28777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760719
534	NC_017078	AATC	2	8	28803	28810	50 %	25 %	0 %	25 %	383760719
535	NC_017078	CTG	2	6	28821	28826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760719
536	NC_017078	TGA	2	6	28832	28837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760719
537	NC_017078	GCC	2	6	28854	28859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760719
538	NC_017078	CCA	2	6	28895	28900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760719
539	NC_017078	CCG	2	6	28939	28944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760719
540	NC_017078	GAA	2	6	28945	28950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760719
541	NC_017078	ATC	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760719
542	NC_017078	AGG	2	6	29123	29128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760719
543	NC_017078	TCG	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760719
544	NC_017078	CAT	2	6	29159	29164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760719
545	NC_017078	TGA	2	6	29174	29179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760719
546	NC_017078	CGCA	2	8	29260	29267	25 %	0 %	25 %	50 %	383760719
547	NC_017078	CAAAT	2	10	29269	29278	60 %	20 %	0 %	20 %	383760719
548	NC_017078	CTTC	2	8	29330	29337	0 %	50 %	0 %	50 %	383760719
549	NC_017078	AAGG	2	8	29355	29362	50 %	0 %	50 %	0 %	383760719
550	NC_017078	TTG	2	6	29405	29410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760719
551	NC_017078	CTT	2	6	29462	29467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760719
552	NC_017078	ACG	2	6	29508	29513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760719
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554	NC_017078	GGAT	2	8	29576	29583	25 %	25 %	50 %	0 %	383760719
555	NC_017078	TCC	2	6	29587	29592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760719
556	NC_017078	TTCAG	2	10	29599	29608	20 %	40 %	20 %	20 %	383760719
557	NC_017078	CGG	2	6	29624	29629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760719
558	NC_017078	GTGCTT	2	12	29699	29710	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383760719
559	NC_017078	ATAA	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	383760719
560	NC_017078	CAG	2	6	29865	29870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760720
561	NC_017078	AGGC	2	8	29901	29908	25 %	0 %	50 %	25 %	383760720
562	NC_017078	AT	3	6	29935	29940	50 %	50 %	0 %	0 %	383760720
563	NC_017078	CTGG	2	8	29943	29950	0 %	25 %	50 %	25 %	383760720
564	NC_017078	CGA	2	6	29963	29968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760720
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567	NC_017078	CTC	2	6	30102	30107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760720
568	NC_017078	GTAA	2	8	30141	30148	50 %	25 %	25 %	0 %	383760720
569	NC_017078	GCA	2	6	30161	30166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760720
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571	NC_017078	GAT	2	6	30354	30359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760720
572	NC_017078	GGA	2	6	30459	30464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760720
573	NC_017078	GATGG	2	10	30483	30492	20 %	20 %	60 %	0 %	383760720
574	NC_017078	GA	3	6	30550	30555	50 %	0 %	50 %	0 %	383760720
575	NC_017078	CTGT	2	8	30568	30575	0 %	50 %	25 %	25 %	383760720
576	NC_017078	GTT	2	6	30674	30679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760720
577	NC_017078	TGA	2	6	30780	30785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760720
578	NC_017078	CTAAA	2	10	30867	30876	60 %	20 %	0 %	20 %	383760721
579	NC_017078	GGC	2	6	30930	30935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760721
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582	NC_017078	GAA	2	6	31050	31055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760721
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585	NC_017078	ATG	2	6	31198	31203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760721
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588	NC_017078	ATGT	2	8	31578	31585	25 %	50 %	25 %	0 %	383760722
589	NC_017078	GAT	2	6	31593	31598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760722
590	NC_017078	TTCA	2	8	31746	31753	25 %	50 %	0 %	25 %	383760722
591	NC_017078	T	6	6	31832	31837	0 %	100 %	0 %	0 %	383760722
592	NC_017078	GAGG	2	8	31866	31873	25 %	0 %	75 %	0 %	383760722
593	NC_017078	ACC	2	6	31949	31954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760723
594	NC_017078	TGA	2	6	31992	31997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760723
595	NC_017078	G	6	6	32049	32054	0 %	0 %	100 %	0 %	383760723
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597	NC_017078	GCA	2	6	32304	32309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760723
598	NC_017078	T	6	6	32361	32366	0 %	100 %	0 %	0 %	383760723
599	NC_017078	T	6	6	32374	32379	0 %	100 %	0 %	0 %	383760723
600	NC_017078	TTC	2	6	32383	32388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760723
601	NC_017078	CAG	2	6	32389	32394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760723
602	NC_017078	TCT	2	6	32408	32413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760723
603	NC_017078	ATA	3	9	32470	32478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760723
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605	NC_017078	CGGCA	2	10	32506	32515	20 %	0 %	40 %	40 %	383760723
606	NC_017078	CAT	2	6	32919	32924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760723
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608	NC_017078	GCC	2	6	33014	33019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760723
609	NC_017078	TGG	2	6	33039	33044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760723
610	NC_017078	GTT	2	6	33053	33058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760723
611	NC_017078	ATC	2	6	33059	33064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760723
612	NC_017078	CGG	2	6	33177	33182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760723
613	NC_017078	GCG	2	6	33202	33207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760723
614	NC_017078	TCA	2	6	33465	33470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760724
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616	NC_017078	GAA	2	6	33590	33595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760724
617	NC_017078	AGG	2	6	33673	33678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760724
618	NC_017078	GTA	2	6	33743	33748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760724
619	NC_017078	AT	3	6	34064	34069	50 %	50 %	0 %	0 %	383760725
620	NC_017078	GCA	2	6	34126	34131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760725
621	NC_017078	GA	3	6	34145	34150	50 %	0 %	50 %	0 %	383760725
622	NC_017078	CTTA	2	8	34253	34260	25 %	50 %	0 %	25 %	383760726
623	NC_017078	AGT	2	6	34274	34279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760726
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626	NC_017078	CTT	2	6	34427	34432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760726
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628	NC_017078	CGG	2	6	34481	34486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760726
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