MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5148

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1011Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017078	ATG	2	6	277286	277291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760946
5002	NC_017078	CT	3	6	277438	277443	0 %	50 %	0 %	50 %	383760946
5003	NC_017078	TGTAGC	2	12	277482	277493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383760946
5004	NC_017078	AC	3	6	277530	277535	50 %	0 %	0 %	50 %	383760946
5005	NC_017078	CTCCC	2	10	277621	277630	0 %	20 %	0 %	80 %	383760946
5006	NC_017078	CAG	2	6	277633	277638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760946
5007	NC_017078	ATG	2	6	277658	277663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760946
5008	NC_017078	GATT	2	8	277719	277726	25 %	50 %	25 %	0 %	383760946
5009	NC_017078	GCA	2	6	277731	277736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760946
5010	NC_017078	CA	3	6	277743	277748	50 %	0 %	0 %	50 %	383760947
5011	NC_017078	ATC	2	6	277781	277786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760947
5012	NC_017078	TAT	2	6	277787	277792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760947
5013	NC_017078	CAT	2	6	277798	277803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760947
5014	NC_017078	A	6	6	277816	277821	100 %	0 %	0 %	0 %	383760947
5015	NC_017078	ATA	2	6	277848	277853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760947
5016	NC_017078	AAAC	2	8	277960	277967	75 %	0 %	0 %	25 %	383760948
5017	NC_017078	GCGCTG	2	12	277990	278001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383760948
5018	NC_017078	CAT	2	6	278214	278219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760948
5019	NC_017078	CTG	3	9	278296	278304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5020	NC_017078	GCCT	2	8	278350	278357	0 %	25 %	25 %	50 %	383760948
5021	NC_017078	TCCATG	2	12	278362	278373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383760948
5022	NC_017078	GCC	2	6	278413	278418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760948
5023	NC_017078	GGT	2	6	278466	278471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760948
5024	NC_017078	CCTTT	2	10	278496	278505	0 %	60 %	0 %	40 %	383760948
5025	NC_017078	ACC	2	6	278515	278520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760948
5026	NC_017078	GCC	2	6	278524	278529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760948
5027	NC_017078	CGG	2	6	278591	278596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760948
5028	NC_017078	CTG	2	6	278614	278619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5029	NC_017078	CCTGTC	2	12	278625	278636	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383760948
5030	NC_017078	CGG	2	6	278637	278642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760948
5031	NC_017078	AGC	2	6	278643	278648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5032	NC_017078	ACT	2	6	278666	278671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760948
5033	NC_017078	CTG	3	9	278674	278682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5034	NC_017078	GCCCT	2	10	278683	278692	0 %	20 %	20 %	60 %	383760948
5035	NC_017078	CTG	2	6	278758	278763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5036	NC_017078	GACC	2	8	278793	278800	25 %	0 %	25 %	50 %	383760948
5037	NC_017078	GGC	3	9	278902	278910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760948
5038	NC_017078	GCC	2	6	278914	278919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760948
5039	NC_017078	CGGCG	2	10	278953	278962	0 %	0 %	60 %	40 %	383760948
5040	NC_017078	CAA	2	6	279012	279017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760948
5041	NC_017078	CTG	2	6	279100	279105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5042	NC_017078	CTG	2	6	279154	279159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760948
5043	NC_017078	CAT	2	6	279195	279200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760948
5044	NC_017078	CTT	2	6	279219	279224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760948
5045	NC_017078	A	6	6	279264	279269	100 %	0 %	0 %	0 %	383760948
5046	NC_017078	CAC	2	6	279644	279649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760949
5047	NC_017078	CCAG	2	8	279679	279686	25 %	0 %	25 %	50 %	383760949
5048	NC_017078	CTC	2	6	279753	279758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760949
5049	NC_017078	CGG	2	6	279780	279785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760949
5050	NC_017078	AGA	2	6	279844	279849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760949
5051	NC_017078	TTG	2	6	279852	279857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760949
5052	NC_017078	CCAG	2	8	279904	279911	25 %	0 %	25 %	50 %	383760949
5053	NC_017078	TGA	2	6	280008	280013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760950
5054	NC_017078	GACA	2	8	280113	280120	50 %	0 %	25 %	25 %	383760950
5055	NC_017078	CA	3	6	280123	280128	50 %	0 %	0 %	50 %	383760950
5056	NC_017078	GCC	2	6	280151	280156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760950
5057	NC_017078	CAG	2	6	280331	280336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5058	NC_017078	CTGC	2	8	280365	280372	0 %	25 %	25 %	50 %	383760951
5059	NC_017078	GCC	3	9	280506	280514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5060	NC_017078	CCG	2	6	280544	280549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5061	NC_017078	CTT	2	6	280558	280563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760951
5062	NC_017078	GCT	2	6	280672	280677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5063	NC_017078	GGC	2	6	280680	280685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760951
5064	NC_017078	GCC	2	6	280720	280725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5065	NC_017078	TCC	2	6	280755	280760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760951
5066	NC_017078	ATC	2	6	280763	280768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760951
5067	NC_017078	CCG	2	6	280807	280812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5068	NC_017078	TCC	2	6	280849	280854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760951
5069	NC_017078	CCT	2	6	280870	280875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760951
5070	NC_017078	CTG	2	6	280901	280906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5071	NC_017078	GCA	2	6	280924	280929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5072	NC_017078	ACC	3	9	280953	280961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760951
5073	NC_017078	CGGA	2	8	280985	280992	25 %	0 %	50 %	25 %	383760951
5074	NC_017078	GTC	2	6	281067	281072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5075	NC_017078	CAG	2	6	281117	281122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5076	NC_017078	ACCAG	2	10	281134	281143	40 %	0 %	20 %	40 %	383760951
5077	NC_017078	A	6	6	281193	281198	100 %	0 %	0 %	0 %	383760951
5078	NC_017078	AGA	2	6	281200	281205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760951
5079	NC_017078	CTG	2	6	281264	281269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5080	NC_017078	CAG	3	9	281303	281311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5081	NC_017078	GCA	2	6	281326	281331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5082	NC_017078	GCA	2	6	281395	281400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5083	NC_017078	AAAG	2	8	281466	281473	75 %	0 %	25 %	0 %	383760951
5084	NC_017078	CAG	2	6	281480	281485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5085	NC_017078	CAA	2	6	281513	281518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760951
5086	NC_017078	CCG	2	6	281544	281549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5087	NC_017078	GCA	2	6	281608	281613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5088	NC_017078	CAGG	2	8	281627	281634	25 %	0 %	50 %	25 %	383760951
5089	NC_017078	C	6	6	281676	281681	0 %	0 %	0 %	100 %	383760951
5090	NC_017078	GCC	2	6	281692	281697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760951
5091	NC_017078	CAG	2	6	281794	281799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5092	NC_017078	CCA	2	6	281806	281811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760951
5093	NC_017078	CAG	2	6	281813	281818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760951
5094	NC_017078	CAA	2	6	281903	281908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760951
5095	NC_017078	T	6	6	282019	282024	0 %	100 %	0 %	0 %	383760951
5096	NC_017078	T	6	6	282128	282133	0 %	100 %	0 %	0 %	383760952
5097	NC_017078	C	6	6	282243	282248	0 %	0 %	0 %	100 %	383760952
5098	NC_017078	CAT	2	6	282373	282378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760952
5099	NC_017078	GCA	2	6	282388	282393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5100	NC_017078	CCA	2	6	282568	282573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760952
5101	NC_017078	TCC	2	6	282579	282584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760952
5102	NC_017078	CGG	2	6	282648	282653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760952
5103	NC_017078	ACA	2	6	282654	282659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760952
5104	NC_017078	CAG	2	6	282815	282820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5105	NC_017078	AAG	2	6	282856	282861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760952
5106	NC_017078	CAT	2	6	282865	282870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760952
5107	NC_017078	GCA	2	6	282909	282914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5108	NC_017078	ACC	2	6	282920	282925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760952
5109	NC_017078	GCA	2	6	282928	282933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5110	NC_017078	GAT	2	6	282944	282949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760952
5111	NC_017078	ATT	2	6	282959	282964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760952
5112	NC_017078	TCC	2	6	282972	282977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760952
5113	NC_017078	GCC	2	6	283011	283016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760952
5114	NC_017078	GTTCCC	2	12	283039	283050	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383760952
5115	NC_017078	A	7	7	283124	283130	100 %	0 %	0 %	0 %	383760952
5116	NC_017078	GGT	2	6	283143	283148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760952
5117	NC_017078	CAG	2	6	283151	283156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5118	NC_017078	TTC	2	6	283173	283178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760952
5119	NC_017078	GCA	2	6	283228	283233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760952
5120	NC_017078	TGT	2	6	283283	283288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760952
5121	NC_017078	GCTG	2	8	283496	283503	0 %	25 %	50 %	25 %	383760953
5122	NC_017078	CCG	2	6	283619	283624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760953
5123	NC_017078	GGC	2	6	283758	283763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760953
5124	NC_017078	AGC	2	6	283781	283786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5125	NC_017078	CCA	2	6	283883	283888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760953
5126	NC_017078	CAG	2	6	283929	283934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5127	NC_017078	TCC	2	6	283941	283946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760953
5128	NC_017078	AT	3	6	283978	283983	50 %	50 %	0 %	0 %	383760953
5129	NC_017078	GCC	2	6	284005	284010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760953
5130	NC_017078	CTG	2	6	284085	284090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5131	NC_017078	AG	3	6	284092	284097	50 %	0 %	50 %	0 %	383760953
5132	NC_017078	AGC	2	6	284110	284115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5133	NC_017078	CCCCAG	2	12	284124	284135	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383760953
5134	NC_017078	ATG	2	6	284148	284153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760953
5135	NC_017078	CGC	2	6	284179	284184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760953
5136	NC_017078	CAG	2	6	284193	284198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5137	NC_017078	AAG	2	6	284230	284235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760953
5138	NC_017078	TCC	2	6	284266	284271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760953
5139	NC_017078	CTG	2	6	284280	284285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5140	NC_017078	GTC	2	6	284296	284301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760953
5141	NC_017078	GCT	2	6	284557	284562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760954
5142	NC_017078	AGA	2	6	284626	284631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760954
5143	NC_017078	GCG	2	6	284685	284690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760954
5144	NC_017078	AAG	2	6	284906	284911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760954
5145	NC_017078	CAA	2	6	284932	284937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760954
5146	NC_017078	CTG	2	6	285073	285078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760954
5147	NC_017078	ATT	2	6	285125	285130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760954
5148	NC_017078	A	6	6	285156	285161	100 %	0 %	0 %	0 %	383760954

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1011Next >