MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 1095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	CAA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760554
2	NC_017076	CAG	2	6	230	235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
3	NC_017076	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760554
4	NC_017076	CAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
5	NC_017076	ATC	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
6	NC_017076	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
7	NC_017076	CAT	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
8	NC_017076	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760554
9	NC_017076	GCA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
10	NC_017076	GCT	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760554
11	NC_017076	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760554
12	NC_017076	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760554
13	NC_017076	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760554
14	NC_017076	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760555
15	NC_017076	GAA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
16	NC_017076	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
17	NC_017076	TAC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
18	NC_017076	ATG	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
19	NC_017076	CAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
20	NC_017076	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
21	NC_017076	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
22	NC_017076	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
23	NC_017076	GTC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760555
24	NC_017076	CTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
25	NC_017076	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
26	NC_017076	TTG	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760556
27	NC_017076	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
28	NC_017076	GTG	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760556
29	NC_017076	TCC	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760556
30	NC_017076	GAT	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
31	NC_017076	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
32	NC_017076	CTG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760556
33	NC_017076	CTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
34	NC_017076	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760556
35	NC_017076	AAG	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
36	NC_017076	GAT	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
37	NC_017076	CAT	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
38	NC_017076	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
39	NC_017076	TTA	2	6	3858	3863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
40	NC_017076	AGC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
41	NC_017076	AAG	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
42	NC_017076	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
43	NC_017076	TAT	2	6	4202	4207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760557
44	NC_017076	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760557
45	NC_017076	GAA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
46	NC_017076	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
47	NC_017076	CAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760557
48	NC_017076	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
49	NC_017076	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
50	NC_017076	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760558
51	NC_017076	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
52	NC_017076	CAC	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
53	NC_017076	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760558
54	NC_017076	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
55	NC_017076	ACC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
56	NC_017076	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760558
57	NC_017076	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760558
58	NC_017076	CAG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760559
59	NC_017076	TCA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760560
60	NC_017076	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
61	NC_017076	CGC	2	6	5767	5772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
62	NC_017076	AGG	3	9	5773	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760560
63	NC_017076	CTG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
64	NC_017076	TGA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760560
65	NC_017076	TGG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760560
66	NC_017076	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760560
67	NC_017076	ATA	2	6	6098	6103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760560
68	NC_017076	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760560
69	NC_017076	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
70	NC_017076	TCC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760560
71	NC_017076	CTG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
72	NC_017076	CAC	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
73	NC_017076	GCC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
74	NC_017076	GCT	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
75	NC_017076	CCA	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
76	NC_017076	CAC	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
77	NC_017076	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
78	NC_017076	CAC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
79	NC_017076	CGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
80	NC_017076	CCG	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
81	NC_017076	CCT	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760561
82	NC_017076	ATT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760561
83	NC_017076	CGT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
84	NC_017076	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
85	NC_017076	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760561
86	NC_017076	TAA	2	6	7750	7755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
87	NC_017076	TGG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760561
88	NC_017076	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760561
89	NC_017076	CAT	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
90	NC_017076	GAT	3	9	8003	8011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760561
91	NC_017076	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
92	NC_017076	AAT	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
93	NC_017076	ATC	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
94	NC_017076	TTG	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760561
95	NC_017076	TCT	2	6	8311	8316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760562
96	NC_017076	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
97	NC_017076	ATC	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
98	NC_017076	TCC	2	6	8673	8678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760562
99	NC_017076	TGT	2	6	8704	8709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760562
100	NC_017076	CCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760562
101	NC_017076	GTA	2	6	8828	8833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760562
102	NC_017076	TCC	2	6	8907	8912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760562
103	NC_017076	CCA	2	6	9067	9072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760562
104	NC_017076	TCA	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
105	NC_017076	TTG	2	6	9458	9463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760563
106	NC_017076	TCT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
107	NC_017076	CAT	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
108	NC_017076	ATC	2	6	9525	9530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
109	NC_017076	TCA	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
110	NC_017076	ATA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760563
111	NC_017076	ATC	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
112	NC_017076	TTC	3	9	9722	9730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
113	NC_017076	TAA	2	6	9743	9748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760563
114	NC_017076	AGA	2	6	9923	9928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760563
115	NC_017076	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760563
116	NC_017076	CTG	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760563
117	NC_017076	TCT	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
118	NC_017076	CTG	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760565
119	NC_017076	AGC	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760565
120	NC_017076	GAT	2	6	10493	10498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760565
121	NC_017076	TCC	2	6	10559	10564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760565
122	NC_017076	CAG	2	6	10570	10575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760565
123	NC_017076	GCT	2	6	10662	10667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760565
124	NC_017076	TCA	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760565
125	NC_017076	ATG	2	6	10732	10737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760565
126	NC_017076	AGC	2	6	10918	10923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760565
127	NC_017076	CTG	2	6	10926	10931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760565
128	NC_017076	TTC	2	6	10978	10983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760565
129	NC_017076	GCC	2	6	11050	11055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760565
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253	NC_017076	CAT	2	6	21890	21895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
254	NC_017076	TCA	2	6	21905	21910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
255	NC_017076	TCT	2	6	21916	21921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760578
256	NC_017076	ATT	2	6	21948	21953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760578
257	NC_017076	ATG	2	6	22040	22045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760578
258	NC_017076	AAT	2	6	22073	22078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760578
259	NC_017076	GGT	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760578
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261	NC_017076	CCG	2	6	22425	22430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760578
262	NC_017076	ATC	2	6	22434	22439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
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265	NC_017076	ATC	2	6	22566	22571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
266	NC_017076	AGT	2	6	22624	22629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760578
267	NC_017076	ATC	2	6	22653	22658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
268	NC_017076	TCA	2	6	22744	22749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760578
269	NC_017076	TAA	2	6	22761	22766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760578
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281	NC_017076	AAT	2	6	23922	23927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760580
282	NC_017076	TAA	2	6	23946	23951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760580
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