MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	CA	3	6	843	848	50 %	0 %	0 %	50 %	383080720
2	NC_017074	AT	3	6	2098	2103	50 %	50 %	0 %	0 %	383080721
3	NC_017074	TA	3	6	2511	2516	50 %	50 %	0 %	0 %	383080721
4	NC_017074	GC	3	6	2619	2624	0 %	0 %	50 %	50 %	383080721
5	NC_017074	AC	3	6	3165	3170	50 %	0 %	0 %	50 %	383080722
6	NC_017074	TC	3	6	4341	4346	0 %	50 %	0 %	50 %	383080724
7	NC_017074	TA	3	6	4843	4848	50 %	50 %	0 %	0 %	383080725
8	NC_017074	TA	4	8	4952	4959	50 %	50 %	0 %	0 %	383080725
9	NC_017074	AT	3	6	5250	5255	50 %	50 %	0 %	0 %	383080726
10	NC_017074	CA	3	6	6587	6592	50 %	0 %	0 %	50 %	383080727
11	NC_017074	GC	3	6	6773	6778	0 %	0 %	50 %	50 %	383080727
12	NC_017074	AC	3	6	7411	7416	50 %	0 %	0 %	50 %	383080727
13	NC_017074	CG	3	6	7712	7717	0 %	0 %	50 %	50 %	383080727
14	NC_017074	CG	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
15	NC_017074	TA	3	6	11187	11192	50 %	50 %	0 %	0 %	383080733
16	NC_017074	GA	4	8	11507	11514	50 %	0 %	50 %	0 %	383080733
17	NC_017074	AG	3	6	11574	11579	50 %	0 %	50 %	0 %	383080734
18	NC_017074	TG	4	8	12086	12093	0 %	50 %	50 %	0 %	383080735
19	NC_017074	TA	3	6	13033	13038	50 %	50 %	0 %	0 %	383080738
20	NC_017074	AG	3	6	14005	14010	50 %	0 %	50 %	0 %	383080738
21	NC_017074	TA	3	6	14345	14350	50 %	50 %	0 %	0 %	383080738
22	NC_017074	CG	3	6	14955	14960	0 %	0 %	50 %	50 %	383080739
23	NC_017074	AG	3	6	15205	15210	50 %	0 %	50 %	0 %	383080739
24	NC_017074	AG	3	6	16027	16032	50 %	0 %	50 %	0 %	383080739
25	NC_017074	TC	3	6	17263	17268	0 %	50 %	0 %	50 %	383080741
26	NC_017074	AC	3	6	18937	18942	50 %	0 %	0 %	50 %	383080744
27	NC_017074	CA	3	6	22675	22680	50 %	0 %	0 %	50 %	383080750
28	NC_017074	AT	3	6	23027	23032	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
29	NC_017074	TC	3	6	23070	23075	0 %	50 %	0 %	50 %	383080750
30	NC_017074	TA	3	6	23380	23385	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
31	NC_017074	TA	3	6	23821	23826	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
32	NC_017074	TA	3	6	23883	23888	50 %	50 %	0 %	0 %	383080750
33	NC_017074	TA	3	6	27249	27254	50 %	50 %	0 %	0 %	383080753
34	NC_017074	AT	3	6	27688	27693	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
35	NC_017074	AT	3	6	27783	27788	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
36	NC_017074	CA	3	6	27792	27797	50 %	0 %	0 %	50 %	383080754
37	NC_017074	AT	3	6	27864	27869	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
38	NC_017074	GC	4	8	29334	29341	0 %	0 %	50 %	50 %	383080756
39	NC_017074	CG	3	6	30369	30374	0 %	0 %	50 %	50 %	383080757
40	NC_017074	GC	3	6	33239	33244	0 %	0 %	50 %	50 %	383080761
41	NC_017074	AT	3	6	34671	34676	50 %	50 %	0 %	0 %	383080764

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.