MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017074	AGA	2	6	27777	27782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080754
502	NC_017074	AT	3	6	27783	27788	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
503	NC_017074	CA	3	6	27792	27797	50 %	0 %	0 %	50 %	383080754
504	NC_017074	CTG	3	9	27815	27823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080754
505	NC_017074	AT	3	6	27864	27869	50 %	50 %	0 %	0 %	383080754
506	NC_017074	AGG	2	6	27962	27967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080754
507	NC_017074	CTA	2	6	28056	28061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080755
508	NC_017074	CTT	2	6	28095	28100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080755
509	NC_017074	GCAG	2	8	28228	28235	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
510	NC_017074	GGCA	2	8	28257	28264	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
511	NC_017074	AAAACG	2	12	28464	28475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383080755
512	NC_017074	CTG	2	6	28596	28601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080755
513	NC_017074	GTC	2	6	28619	28624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080755
514	NC_017074	CGCT	2	8	28626	28633	0 %	25 %	25 %	50 %	383080755
515	NC_017074	ATT	2	6	28658	28663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080755
516	NC_017074	CAGC	2	8	28683	28690	25 %	0 %	25 %	50 %	383080755
517	NC_017074	A	6	6	28703	28708	100 %	0 %	0 %	0 %	383080755
518	NC_017074	TCCT	2	8	28765	28772	0 %	50 %	0 %	50 %	383080755
519	NC_017074	GCCAAT	2	12	28808	28819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383080755
520	NC_017074	GAC	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080755
521	NC_017074	GCC	2	6	28913	28918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080755
522	NC_017074	AGA	2	6	29061	29066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080756
523	NC_017074	GAA	2	6	29164	29169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080756
524	NC_017074	TGTT	2	8	29246	29253	0 %	75 %	25 %	0 %	383080756
525	NC_017074	ACTA	2	8	29271	29278	50 %	25 %	0 %	25 %	383080756
526	NC_017074	ACGA	2	8	29282	29289	50 %	0 %	25 %	25 %	383080756
527	NC_017074	GC	4	8	29334	29341	0 %	0 %	50 %	50 %	383080756
528	NC_017074	GCAG	2	8	29358	29365	25 %	0 %	50 %	25 %	383080756
529	NC_017074	TAT	2	6	29446	29451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080756
530	NC_017074	AGA	2	6	29502	29507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080756
531	NC_017074	ATTT	2	8	29545	29552	25 %	75 %	0 %	0 %	383080756
532	NC_017074	A	6	6	29655	29660	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
533	NC_017074	GAC	2	6	29718	29723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
534	NC_017074	ACG	2	6	29821	29826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
535	NC_017074	ATAA	2	8	29844	29851	75 %	25 %	0 %	0 %	383080757
536	NC_017074	A	6	6	29877	29882	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
537	NC_017074	CTG	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080757
538	NC_017074	CGG	2	6	29909	29914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080757
539	NC_017074	CAA	2	6	29929	29934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080757
540	NC_017074	A	8	8	29944	29951	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
541	NC_017074	CTG	2	6	30034	30039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080757
542	NC_017074	CCG	2	6	30085	30090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080757
543	NC_017074	GGA	2	6	30096	30101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080757
544	NC_017074	TGG	2	6	30131	30136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080757
545	NC_017074	GAC	2	6	30168	30173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
546	NC_017074	GCG	2	6	30238	30243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080757
547	NC_017074	AAG	2	6	30262	30267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080757
548	NC_017074	CG	3	6	30369	30374	0 %	0 %	50 %	50 %	383080757
549	NC_017074	CAA	2	6	30382	30387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080757
550	NC_017074	CAG	2	6	30388	30393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
551	NC_017074	GCTG	2	8	30459	30466	0 %	25 %	50 %	25 %	383080757
552	NC_017074	GGT	2	6	30480	30485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080757
553	NC_017074	CGA	2	6	30572	30577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
554	NC_017074	CAA	2	6	30587	30592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080757
555	NC_017074	CGA	2	6	30601	30606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
556	NC_017074	GGC	2	6	30612	30617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080757
557	NC_017074	TGT	2	6	30707	30712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080757
558	NC_017074	GCA	2	6	30729	30734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
559	NC_017074	TGG	2	6	30771	30776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080757
560	NC_017074	CATA	2	8	30785	30792	50 %	25 %	0 %	25 %	383080757
561	NC_017074	TAA	2	6	30821	30826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080757
562	NC_017074	GGC	2	6	30912	30917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080757
563	NC_017074	TGG	2	6	30936	30941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080757
564	NC_017074	AAT	2	6	31002	31007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080757
565	NC_017074	A	6	6	31259	31264	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
566	NC_017074	ACT	2	6	31276	31281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080757
567	NC_017074	CAGTA	2	10	31398	31407	40 %	20 %	20 %	20 %	383080757
568	NC_017074	GAC	2	6	31411	31416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
569	NC_017074	AGC	3	9	31506	31514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080757
570	NC_017074	TAC	2	6	31530	31535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080757
571	NC_017074	AAG	2	6	31557	31562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080757
572	NC_017074	GGC	2	6	31567	31572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080757
573	NC_017074	CAA	2	6	31595	31600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080757
574	NC_017074	AGCGT	2	10	31671	31680	20 %	20 %	40 %	20 %	383080757
575	NC_017074	AAC	2	6	31683	31688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080757
576	NC_017074	CGT	2	6	31781	31786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080757
577	NC_017074	CTG	2	6	31861	31866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080757
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581	NC_017074	AGGC	2	8	32151	32158	25 %	0 %	50 %	25 %	383080758
582	NC_017074	ACT	2	6	32253	32258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080758
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585	NC_017074	AGAAA	2	10	32347	32356	80 %	0 %	20 %	0 %	383080758
586	NC_017074	A	8	8	32354	32361	100 %	0 %	0 %	0 %	383080758
587	NC_017074	ACG	2	6	32395	32400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080759
588	NC_017074	ACA	2	6	32408	32413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080759
589	NC_017074	GCA	2	6	32435	32440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080759
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591	NC_017074	CTG	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080759
592	NC_017074	GGCT	2	8	32476	32483	0 %	25 %	50 %	25 %	383080759
593	NC_017074	GAC	2	6	32529	32534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080759
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596	NC_017074	TTG	2	6	32623	32628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080759
597	NC_017074	TTC	2	6	32681	32686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080760
598	NC_017074	GCT	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080760
599	NC_017074	AGA	3	9	32982	32990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080761
600	NC_017074	CAG	2	6	33047	33052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080761
601	NC_017074	TTG	2	6	33116	33121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080761
602	NC_017074	A	6	6	33162	33167	100 %	0 %	0 %	0 %	383080761
603	NC_017074	GC	3	6	33239	33244	0 %	0 %	50 %	50 %	383080761
604	NC_017074	GCAG	2	8	33285	33292	25 %	0 %	50 %	25 %	383080761
605	NC_017074	ACAAAC	2	12	33297	33308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080761
606	NC_017074	AACA	2	8	33315	33322	75 %	0 %	0 %	25 %	383080761
607	NC_017074	GAA	2	6	33381	33386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080761
608	NC_017074	AAG	2	6	33678	33683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080762
609	NC_017074	CCG	2	6	33711	33716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080762
610	NC_017074	TCG	2	6	33793	33798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080762
611	NC_017074	CATT	2	8	33852	33859	25 %	50 %	0 %	25 %	383080762
612	NC_017074	ACG	2	6	33864	33869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080762
613	NC_017074	CGC	2	6	33907	33912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080762
614	NC_017074	T	6	6	33990	33995	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
615	NC_017074	T	6	6	34015	34020	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
616	NC_017074	CTT	2	6	34026	34031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080763
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619	NC_017074	CTT	2	6	34258	34263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080763
620	NC_017074	AAC	2	6	34316	34321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080763
621	NC_017074	GCA	2	6	34334	34339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080763
622	NC_017074	AAC	2	6	34361	34366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080763
623	NC_017074	AAC	2	6	34381	34386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080763
624	NC_017074	T	6	6	34396	34401	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
625	NC_017074	TAT	2	6	34498	34503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080764
626	NC_017074	GTC	2	6	34605	34610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080764
627	NC_017074	AAAC	2	8	34646	34653	75 %	0 %	0 %	25 %	383080764
628	NC_017074	ACTGT	2	10	34654	34663	20 %	40 %	20 %	20 %	383080764
629	NC_017074	AT	3	6	34671	34676	50 %	50 %	0 %	0 %	383080764
630	NC_017074	GCA	2	6	34840	34845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080764
631	NC_017074	AAC	2	6	34867	34872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080764
632	NC_017074	AAC	2	6	34887	34892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080764
633	NC_017074	T	6	6	34902	34907	0 %	100 %	0 %	0 %	383080764

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