MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017073	AGT	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755758
2	NC_017073	AAG	2	6	25	30	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755758
3	NC_017073	GGC	2	6	31	36	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755758
4	NC_017073	AAC	2	6	45	50	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755758
5	NC_017073	TTA	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755758
6	NC_017073	AAG	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755758
7	NC_017073	ACT	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755758
8	NC_017073	CAT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755758
9	NC_017073	TAA	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755758
10	NC_017073	AAG	2	6	844	849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
11	NC_017073	ACC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755759
12	NC_017073	GAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
13	NC_017073	CGT	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755759
14	NC_017073	CGC	2	6	1041	1046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755759
15	NC_017073	AAG	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
16	NC_017073	GAA	2	6	1082	1087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
17	NC_017073	CCT	2	6	1101	1106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755759
18	NC_017073	GAA	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755759
19	NC_017073	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755760
20	NC_017073	TCG	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755760
21	NC_017073	TCA	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755760
22	NC_017073	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755760
23	NC_017073	GAT	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
24	NC_017073	TGC	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
25	NC_017073	ACA	2	6	2030	2035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755761
26	NC_017073	CTT	2	6	2064	2069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
27	NC_017073	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
28	NC_017073	ATC	2	6	2151	2156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755761
29	NC_017073	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755761
30	NC_017073	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755761
31	NC_017073	GGA	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755761
32	NC_017073	AGC	2	6	2467	2472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
33	NC_017073	TTC	2	6	2493	2498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
34	NC_017073	CCG	2	6	2669	2674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
35	NC_017073	TTG	2	6	2934	2939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755761
36	NC_017073	TCA	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755761
37	NC_017073	GTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
38	NC_017073	TCG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
39	NC_017073	ATA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755761
40	NC_017073	GGC	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755761
41	NC_017073	TGC	2	6	3385	3390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
42	NC_017073	TCG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
43	NC_017073	ACG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
44	NC_017073	TTC	2	6	3558	3563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
45	NC_017073	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
46	NC_017073	CTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
47	NC_017073	GAA	2	6	3611	3616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755761
48	NC_017073	CGT	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
49	NC_017073	CCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
50	NC_017073	GCA	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755761
51	NC_017073	ATT	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755761
52	NC_017073	GAT	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
53	NC_017073	CTT	2	6	4058	4063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755761
54	NC_017073	CCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755761
55	NC_017073	ACC	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755761
56	NC_017073	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755761
57	NC_017073	GAT	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755761
58	NC_017073	CAA	2	6	4811	4816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755761
59	NC_017073	TCA	2	6	4949	4954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755762
60	NC_017073	AAC	2	6	5509	5514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755764
61	NC_017073	TCC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755764
62	NC_017073	ATA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755764
63	NC_017073	GCT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755764
64	NC_017073	ATC	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755765
65	NC_017073	CAT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755765
66	NC_017073	TTC	3	9	5975	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755766
67	NC_017073	AAT	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755766
68	NC_017073	CAA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755766
69	NC_017073	GCA	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755766
70	NC_017073	GTC	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755766
71	NC_017073	CGG	2	6	6253	6258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755766
72	NC_017073	TCC	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755766
73	NC_017073	ATC	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755766
74	NC_017073	CTT	3	9	6392	6400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755766
75	NC_017073	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755766
76	NC_017073	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755766
77	NC_017073	GCT	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755766
78	NC_017073	AAG	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755766
79	NC_017073	TTC	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755767
80	NC_017073	CGA	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755767
81	NC_017073	ATT	2	6	7254	7259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755767
82	NC_017073	TGT	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755767
83	NC_017073	GCT	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755768
84	NC_017073	GCA	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755768
85	NC_017073	CTC	2	6	8043	8048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755769
86	NC_017073	CCA	2	6	8086	8091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755769
87	NC_017073	CAA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755769
88	NC_017073	CAG	2	6	8345	8350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755769
89	NC_017073	AGC	2	6	8363	8368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755769
90	NC_017073	TTC	2	6	8601	8606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755769
91	NC_017073	CAT	2	6	8631	8636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755770
92	NC_017073	ACC	2	6	8667	8672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755770
93	NC_017073	AAG	2	6	8734	8739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755770
94	NC_017073	ACC	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755771
95	NC_017073	CGA	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755771
96	NC_017073	TAA	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755771
97	NC_017073	TCG	2	6	9040	9045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755771
98	NC_017073	ATA	2	6	9159	9164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755772
99	NC_017073	ACT	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755772
100	NC_017073	TTA	2	6	9352	9357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755772
101	NC_017073	ATC	2	6	9395	9400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755772
102	NC_017073	TCG	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755772
103	NC_017073	GAA	2	6	9709	9714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755772
104	NC_017073	GCC	2	6	9830	9835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755772
105	NC_017073	CAC	2	6	9856	9861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755772
106	NC_017073	GTA	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755772
107	NC_017073	ACG	2	6	9979	9984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755772
108	NC_017073	GAA	2	6	10017	10022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755772
109	NC_017073	TCG	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755772
110	NC_017073	CCA	2	6	10105	10110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755772
111	NC_017073	CCA	2	6	10169	10174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755772
112	NC_017073	CTT	2	6	10279	10284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755772
113	NC_017073	GAT	2	6	10303	10308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755772
114	NC_017073	ATA	2	6	10317	10322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755772
115	NC_017073	CAG	2	6	10486	10491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755772
116	NC_017073	CAA	2	6	10503	10508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755772
117	NC_017073	AGC	2	6	10540	10545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755772
118	NC_017073	AAT	2	6	10558	10563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755772
119	NC_017073	TAT	2	6	10651	10656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755772
120	NC_017073	TCG	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755772
121	NC_017073	TAT	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755772
122	NC_017073	AGG	2	6	10717	10722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755772
123	NC_017073	ATC	2	6	10853	10858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755772
124	NC_017073	CAA	2	6	10882	10887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755772
125	NC_017073	CTT	2	6	11035	11040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755772
126	NC_017073	TTC	2	6	11085	11090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755772
127	NC_017073	CGT	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755772
128	NC_017073	AAT	2	6	11302	11307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755772
129	NC_017073	GCA	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755772
130	NC_017073	TAT	2	6	11518	11523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755772
131	NC_017073	ATC	2	6	11541	11546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755772
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283	NC_017073	TTA	3	9	24648	24656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755780
284	NC_017073	TGA	2	6	24672	24677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755780
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