MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 708

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755656
2	NC_017069	GCT	2	6	530	535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
3	NC_017069	TCA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755656
4	NC_017069	GTC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
5	NC_017069	GGT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755656
6	NC_017069	AAC	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755657
7	NC_017069	ACT	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755658
8	NC_017069	AGA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755658
9	NC_017069	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
10	NC_017069	CAG	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755658
11	NC_017069	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
12	NC_017069	CTC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755658
13	NC_017069	CCT	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755659
14	NC_017069	CGT	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755659
15	NC_017069	AGT	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755660
16	NC_017069	TGG	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755660
17	NC_017069	TCA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755660
18	NC_017069	AAC	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755661
19	NC_017069	TGA	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755661
20	NC_017069	CCT	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755661
21	NC_017069	GCT	3	9	2919	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
22	NC_017069	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
23	NC_017069	TTC	2	6	3018	3023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755662
24	NC_017069	CCA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755663
25	NC_017069	TCG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755663
26	NC_017069	CAT	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755663
27	NC_017069	ATA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755663
28	NC_017069	GAA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755664
29	NC_017069	TCG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
30	NC_017069	TCG	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
31	NC_017069	ACA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755664
32	NC_017069	AAT	2	6	3826	3831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755664
33	NC_017069	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755665
34	NC_017069	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755666
35	NC_017069	ATT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755666
36	NC_017069	TGT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
37	NC_017069	CTG	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755667
38	NC_017069	TGT	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
39	NC_017069	CTA	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755668
40	NC_017069	CGC	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
41	NC_017069	TGA	2	6	5411	5416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755668
42	NC_017069	TCC	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755668
43	NC_017069	CCG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
44	NC_017069	TAG	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755669
45	NC_017069	GTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755669
46	NC_017069	GTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755669
47	NC_017069	CCT	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
48	NC_017069	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
49	NC_017069	GGC	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
50	NC_017069	TCG	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
51	NC_017069	TCT	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
52	NC_017069	CTC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
53	NC_017069	CCA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755670
54	NC_017069	CGG	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
55	NC_017069	CAT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755670
56	NC_017069	CGT	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
57	NC_017069	CCT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
58	NC_017069	GAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755670
59	NC_017069	GAT	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
60	NC_017069	ATG	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
61	NC_017069	TTG	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755671
62	NC_017069	AGT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755672
63	NC_017069	CCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755672
64	NC_017069	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755672
65	NC_017069	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755672
66	NC_017069	ATT	2	6	7361	7366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755673
67	NC_017069	ACA	2	6	9661	9666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755674
68	NC_017069	CGG	3	9	10183	10191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755675
69	NC_017069	TGT	2	6	10195	10200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755675
70	NC_017069	TGC	2	6	10259	10264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755675
71	NC_017069	TCA	2	6	10345	10350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755675
72	NC_017069	TTC	2	6	10500	10505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755676
73	NC_017069	GGA	2	6	10609	10614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755676
74	NC_017069	TGA	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755677
75	NC_017069	CTT	2	6	11171	11176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755678
76	NC_017069	AGA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755678
77	NC_017069	CGA	2	6	11652	11657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755679
78	NC_017069	CAA	2	6	11661	11666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
79	NC_017069	CAA	2	6	11697	11702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
80	NC_017069	CAA	2	6	11835	11840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755679
81	NC_017069	AGT	2	6	12012	12017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755679
82	NC_017069	AGC	2	6	12065	12070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755679
83	NC_017069	TGA	2	6	12149	12154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
84	NC_017069	GGA	2	6	12323	12328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755680
85	NC_017069	GAA	2	6	12353	12358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755680
86	NC_017069	ATT	2	6	12420	12425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
87	NC_017069	GAA	2	6	12522	12527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755680
88	NC_017069	GAG	2	6	12567	12572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755680
89	NC_017069	ATC	2	6	12591	12596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
90	NC_017069	CAA	2	6	12602	12607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755680
91	NC_017069	TCA	2	6	12682	12687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
92	NC_017069	CGC	2	6	12732	12737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755680
93	NC_017069	CTG	2	6	12765	12770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755680
94	NC_017069	ACC	2	6	12786	12791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755680
95	NC_017069	AAC	2	6	12954	12959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755680
96	NC_017069	ACT	2	6	13054	13059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755680
97	NC_017069	ATG	2	6	13068	13073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
98	NC_017069	ATT	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
99	NC_017069	ATT	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755680
100	NC_017069	TGA	2	6	13607	13612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755680
101	NC_017069	GTA	2	6	13955	13960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755681
102	NC_017069	TGC	2	6	14101	14106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755681
103	NC_017069	AGC	2	6	14205	14210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755681
104	NC_017069	ATA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755681
105	NC_017069	AAC	2	6	14290	14295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755681
106	NC_017069	AGA	2	6	14362	14367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755681
107	NC_017069	CGC	2	6	14371	14376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755681
108	NC_017069	CGG	2	6	14506	14511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755681
109	NC_017069	ATT	2	6	14594	14599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755681
110	NC_017069	GAA	2	6	14623	14628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755681
111	NC_017069	GAA	2	6	14666	14671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755681
112	NC_017069	CTA	2	6	14788	14793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755681
113	NC_017069	AAT	2	6	14830	14835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755681
114	NC_017069	TAC	2	6	15103	15108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755682
115	NC_017069	GCG	2	6	15160	15165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755682
116	NC_017069	CTG	2	6	15242	15247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755682
117	NC_017069	ATA	2	6	15265	15270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755682
118	NC_017069	TGC	2	6	15311	15316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755682
119	NC_017069	GAA	2	6	15594	15599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
120	NC_017069	GAA	2	6	15636	15641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
121	NC_017069	GCA	2	6	15681	15686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755682
122	NC_017069	GAA	2	6	15711	15716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755682
123	NC_017069	CGA	2	6	15995	16000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755682
124	NC_017069	CTG	2	6	16426	16431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755683
125	NC_017069	ACA	2	6	16486	16491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755683
126	NC_017069	GTG	2	6	16501	16506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755683
127	NC_017069	GCA	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755683
128	NC_017069	TCA	2	6	16594	16599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755683
129	NC_017069	TAC	2	6	16713	16718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755683
130	NC_017069	AAG	2	6	16881	16886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755683
131	NC_017069	ACA	2	6	16951	16956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755683
132	NC_017069	CGA	2	6	17015	17020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755683
133	NC_017069	TAT	2	6	17093	17098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755683
134	NC_017069	CTG	3	9	17101	17109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755683
135	NC_017069	CAT	2	6	17120	17125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755683
136	NC_017069	GTT	2	6	17160	17165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755683
137	NC_017069	CGT	2	6	17184	17189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755683
138	NC_017069	CTG	2	6	17200	17205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755683
139	NC_017069	TCA	2	6	17311	17316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755683
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142	NC_017069	CAT	2	6	17653	17658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755685
143	NC_017069	GGT	2	6	17812	17817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755685
144	NC_017069	TGC	2	6	17964	17969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755685
145	NC_017069	GAT	2	6	18113	18118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755685
146	NC_017069	CTT	2	6	18121	18126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755685
147	NC_017069	CGC	2	6	18393	18398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755686
148	NC_017069	ATG	2	6	18472	18477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755686
149	NC_017069	TAC	2	6	18536	18541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755686
150	NC_017069	ACT	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755686
151	NC_017069	TTG	2	6	18576	18581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755686
152	NC_017069	ATT	2	6	18639	18644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755686
153	NC_017069	ACA	2	6	18724	18729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755686
154	NC_017069	CCT	2	6	18760	18765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755687
155	NC_017069	TCC	2	6	18783	18788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755687
156	NC_017069	TGA	2	6	18811	18816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755687
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158	NC_017069	CAA	2	6	19015	19020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755687
159	NC_017069	TGT	2	6	19060	19065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755687
160	NC_017069	GTT	2	6	19165	19170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755687
161	NC_017069	GAA	2	6	19241	19246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755687
162	NC_017069	ACT	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755688
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169	NC_017069	GGA	2	6	20080	20085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755689
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498	NC_017069	ACG	2	6	53326	53331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755717
499	NC_017069	TTG	2	6	53446	53451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755717
500	NC_017069	TCA	2	6	54206	54211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755718

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