MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 1119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017069	AGG	2	6	66404	66409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755744
1002	NC_017069	TTA	2	6	66411	66416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755744
1003	NC_017069	GA	3	6	66439	66444	50 %	0 %	50 %	0 %	383755744
1004	NC_017069	CAA	2	6	66489	66494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755744
1005	NC_017069	CAA	2	6	66507	66512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755744
1006	NC_017069	AATTC	2	10	66521	66530	40 %	40 %	0 %	20 %	383755744
1007	NC_017069	ACA	2	6	66582	66587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755744
1008	NC_017069	GGCT	2	8	66635	66642	0 %	25 %	50 %	25 %	383755744
1009	NC_017069	GGGCGA	2	12	66660	66671	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	383755744
1010	NC_017069	CCG	2	6	66688	66693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755744
1011	NC_017069	TTA	2	6	66711	66716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755744
1012	NC_017069	AAG	2	6	66727	66732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755744
1013	NC_017069	GAT	2	6	66757	66762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755744
1014	NC_017069	CTG	2	6	66778	66783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755744
1015	NC_017069	CTG	2	6	66859	66864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755744
1016	NC_017069	AAG	2	6	66874	66879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755744
1017	NC_017069	CTG	2	6	66924	66929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755744
1018	NC_017069	CTG	2	6	67083	67088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755745
1019	NC_017069	TAG	2	6	67120	67125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755745
1020	NC_017069	CGC	2	6	67136	67141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755745
1021	NC_017069	GAA	2	6	67161	67166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755745
1022	NC_017069	ATG	2	6	67176	67181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755745
1023	NC_017069	TGCACC	2	12	67223	67234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383755745
1024	NC_017069	GTGTT	2	10	67264	67273	0 %	60 %	40 %	0 %	383755746
1025	NC_017069	CAT	2	6	67287	67292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755746
1026	NC_017069	AAGTGC	2	12	67318	67329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383755746
1027	NC_017069	AAT	2	6	67384	67389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755746
1028	NC_017069	ATA	2	6	67412	67417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755746
1029	NC_017069	ATG	3	9	67464	67472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755746
1030	NC_017069	TCT	2	6	67617	67622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755747
1031	NC_017069	GAGT	2	8	67636	67643	25 %	25 %	50 %	0 %	383755747
1032	NC_017069	A	6	6	67670	67675	100 %	0 %	0 %	0 %	383755747
1033	NC_017069	GGA	2	6	67681	67686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755747
1034	NC_017069	CCG	2	6	67741	67746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755747
1035	NC_017069	GCTG	2	8	67834	67841	0 %	25 %	50 %	25 %	383755747
1036	NC_017069	TGC	2	6	67894	67899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755747
1037	NC_017069	TC	3	6	67926	67931	0 %	50 %	0 %	50 %	383755748
1038	NC_017069	AGA	2	6	67962	67967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755748
1039	NC_017069	CGA	2	6	67995	68000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755748
1040	NC_017069	GAA	2	6	68008	68013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755748
1041	NC_017069	TGT	2	6	68090	68095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755748
1042	NC_017069	AGGAT	2	10	68210	68219	40 %	20 %	40 %	0 %	383755748
1043	NC_017069	TGT	2	6	68342	68347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755748
1044	NC_017069	AAG	2	6	68470	68475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755748
1045	NC_017069	TGAT	2	8	68516	68523	25 %	50 %	25 %	0 %	383755748
1046	NC_017069	CTG	2	6	68544	68549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755748
1047	NC_017069	A	6	6	68575	68580	100 %	0 %	0 %	0 %	383755748
1048	NC_017069	AAATAT	2	12	68646	68657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755748
1049	NC_017069	CTT	2	6	68831	68836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755749
1050	NC_017069	TCG	2	6	68848	68853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755749
1051	NC_017069	AAT	2	6	68968	68973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755749
1052	NC_017069	CAATC	2	10	69026	69035	40 %	20 %	0 %	40 %	383755750
1053	NC_017069	CCAT	2	8	69098	69105	25 %	25 %	0 %	50 %	383755750
1054	NC_017069	CAT	2	6	69131	69136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755750
1055	NC_017069	GAA	2	6	69179	69184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755750
1056	NC_017069	TCGG	2	8	69217	69224	0 %	25 %	50 %	25 %	383755750
1057	NC_017069	TCTT	2	8	69241	69248	0 %	75 %	0 %	25 %	383755750
1058	NC_017069	AGG	2	6	69256	69261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755750
1059	NC_017069	GTG	2	6	69264	69269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755750
1060	NC_017069	TGGC	2	8	69381	69388	0 %	25 %	50 %	25 %	383755750
1061	NC_017069	CTC	2	6	69426	69431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755750
1062	NC_017069	CTGT	2	8	69433	69440	0 %	50 %	25 %	25 %	383755750
1063	NC_017069	TTGG	2	8	69733	69740	0 %	50 %	50 %	0 %	383755751
1064	NC_017069	AGCG	2	8	69783	69790	25 %	0 %	50 %	25 %	383755751
1065	NC_017069	T	6	6	69860	69865	0 %	100 %	0 %	0 %	383755751
1066	NC_017069	ATA	2	6	69910	69915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755751
1067	NC_017069	TG	3	6	69935	69940	0 %	50 %	50 %	0 %	383755751
1068	NC_017069	TGG	2	6	70020	70025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755751
1069	NC_017069	AAC	2	6	70030	70035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755751
1070	NC_017069	CTC	2	6	70113	70118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755751
1071	NC_017069	TGG	2	6	70140	70145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755751
1072	NC_017069	AGT	2	6	70257	70262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755751
1073	NC_017069	CCT	2	6	70359	70364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755752
1074	NC_017069	ACC	2	6	70394	70399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755752
1075	NC_017069	TA	3	6	70423	70428	50 %	50 %	0 %	0 %	383755752
1076	NC_017069	CTTGA	2	10	70493	70502	20 %	40 %	20 %	20 %	383755752
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1078	NC_017069	CT	3	6	70549	70554	0 %	50 %	0 %	50 %	383755752
1079	NC_017069	GTT	2	6	70597	70602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755752
1080	NC_017069	GTA	2	6	70603	70608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755752
1081	NC_017069	CTT	2	6	70636	70641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755752
1082	NC_017069	A	6	6	70655	70660	100 %	0 %	0 %	0 %	383755752
1083	NC_017069	CCAG	2	8	70713	70720	25 %	0 %	25 %	50 %	383755752
1084	NC_017069	CAT	2	6	70849	70854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755752
1085	NC_017069	GGT	2	6	70885	70890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755752
1086	NC_017069	GGT	2	6	70936	70941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755752
1087	NC_017069	TTC	2	6	70984	70989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755752
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1091	NC_017069	CCA	2	6	71178	71183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755753
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1094	NC_017069	TTC	2	6	71653	71658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755754
1095	NC_017069	TCC	2	6	71696	71701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755754
1096	NC_017069	TCA	2	6	71720	71725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755754
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1098	NC_017069	GAA	2	6	71761	71766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755754
1099	NC_017069	TTC	2	6	71777	71782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755754
1100	NC_017069	GCC	2	6	71893	71898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755754
1101	NC_017069	GAT	2	6	71899	71904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755754
1102	NC_017069	TTC	2	6	71906	71911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755754
1103	NC_017069	TTTC	2	8	71928	71935	0 %	75 %	0 %	25 %	383755755
1104	NC_017069	GTT	2	6	72015	72020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755755
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1107	NC_017069	AT	3	6	72337	72342	50 %	50 %	0 %	0 %	383755756
1108	NC_017069	CGG	2	6	72409	72414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755756
1109	NC_017069	TTC	2	6	72428	72433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755756
1110	NC_017069	AGG	2	6	72434	72439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383755756
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1112	NC_017069	T	6	6	72578	72583	0 %	100 %	0 %	0 %	383755756
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1118	NC_017069	AT	3	6	72840	72845	50 %	50 %	0 %	0 %	383755756
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.