MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 55789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017068	GCT	2	6	162256	162261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752963
3002	NC_017068	CAG	2	6	162486	162491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752964
3003	NC_017068	GGA	2	6	162516	162521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752964
3004	NC_017068	CTA	2	6	162525	162530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752964
3005	NC_017068	GCA	2	6	162557	162562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752964
3006	NC_017068	GGA	2	6	162594	162599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752964
3007	NC_017068	GCG	2	6	162612	162617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752964
3008	NC_017068	CAG	2	6	162649	162654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752964
3009	NC_017068	TGA	2	6	162660	162665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752964
3010	NC_017068	GGCG	2	8	162675	162682	0 %	0 %	75 %	25 %	383752964
3011	NC_017068	GGCA	2	8	162702	162709	25 %	0 %	50 %	25 %	383752964
3012	NC_017068	TGG	2	6	162758	162763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752964
3013	NC_017068	CAA	2	6	162789	162794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752964
3014	NC_017068	AGG	2	6	162980	162985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752964
3015	NC_017068	CAG	2	6	163033	163038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752964
3016	NC_017068	GAT	2	6	163051	163056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752964
3017	NC_017068	GCC	2	6	163071	163076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752964
3018	NC_017068	ACA	2	6	163091	163096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752964
3019	NC_017068	CAT	2	6	163110	163115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752964
3020	NC_017068	ACA	2	6	163211	163216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752964
3021	NC_017068	ATC	2	6	163354	163359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752964
3022	NC_017068	GGC	2	6	163387	163392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752964
3023	NC_017068	CGG	2	6	163416	163421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752964
3024	NC_017068	ATG	2	6	163427	163432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752964
3025	NC_017068	GGC	2	6	163507	163512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752964
3026	NC_017068	CAA	2	6	163548	163553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752964
3027	NC_017068	GGT	2	6	163566	163571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752964
3028	NC_017068	ATA	2	6	163628	163633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752964
3029	NC_017068	GGC	2	6	163663	163668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752964
3030	NC_017068	TGG	2	6	163844	163849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752964
3031	NC_017068	TGG	2	6	163934	163939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752965
3032	NC_017068	TGT	2	6	164010	164015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752965
3033	NC_017068	GCAG	2	8	164047	164054	25 %	0 %	50 %	25 %	383752965
3034	NC_017068	GCG	2	6	164158	164163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752965
3035	NC_017068	CAT	2	6	164260	164265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752965
3036	NC_017068	CTG	2	6	164399	164404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3037	NC_017068	CTT	3	9	164413	164421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752965
3038	NC_017068	TCT	2	6	164454	164459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752965
3039	NC_017068	TATG	2	8	164506	164513	25 %	50 %	25 %	0 %	383752965
3040	NC_017068	TGC	2	6	164580	164585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3041	NC_017068	ATG	2	6	164648	164653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752965
3042	NC_017068	TTA	2	6	164698	164703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752965
3043	NC_017068	CAT	2	6	164743	164748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752965
3044	NC_017068	TCA	2	6	164793	164798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752965
3045	NC_017068	TCG	2	6	164809	164814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3046	NC_017068	TGG	2	6	164815	164820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752965
3047	NC_017068	GGT	2	6	164836	164841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752965
3048	NC_017068	TTA	2	6	164872	164877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752965
3049	NC_017068	CAT	2	6	164944	164949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752965
3050	NC_017068	CAA	2	6	164950	164955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752965
3051	NC_017068	TGA	2	6	165016	165021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752965
3052	NC_017068	CGC	2	6	165038	165043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752965
3053	NC_017068	CTG	2	6	165071	165076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3054	NC_017068	CTG	2	6	165107	165112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3055	NC_017068	CAG	2	6	165155	165160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3056	NC_017068	CTC	2	6	165275	165280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752965
3057	NC_017068	GCA	2	6	165312	165317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752965
3058	NC_017068	ATG	2	6	165414	165419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752965
3059	NC_017068	A	6	6	165493	165498	100 %	0 %	0 %	0 %	383752966
3060	NC_017068	GACC	2	8	165537	165544	25 %	0 %	25 %	50 %	383752966
3061	NC_017068	GGA	2	6	165666	165671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752966
3062	NC_017068	ATG	2	6	165689	165694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752966
3063	NC_017068	ACA	2	6	165704	165709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752966
3064	NC_017068	CAA	2	6	165720	165725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752966
3065	NC_017068	CTG	2	6	165736	165741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752966
3066	NC_017068	GAA	2	6	165763	165768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752966
3067	NC_017068	CAT	2	6	165811	165816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752966
3068	NC_017068	AAGG	2	8	165826	165833	50 %	0 %	50 %	0 %	383752966
3069	NC_017068	CTGG	2	8	165870	165877	0 %	25 %	50 %	25 %	383752966
3070	NC_017068	GCA	2	6	165932	165937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752966
3071	NC_017068	GGA	2	6	165939	165944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752966
3072	NC_017068	ATG	2	6	165947	165952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752966
3073	NC_017068	ATC	2	6	165970	165975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752966
3074	NC_017068	CAG	2	6	166039	166044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752966
3075	NC_017068	CAA	2	6	166053	166058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752966
3076	NC_017068	TGG	2	6	166118	166123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752966
3077	NC_017068	GCG	2	6	166253	166258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752966
3078	NC_017068	GCTG	2	8	166334	166341	0 %	25 %	50 %	25 %	383752966
3079	NC_017068	TGA	2	6	166389	166394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752966
3080	NC_017068	TCA	2	6	166397	166402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752966
3081	NC_017068	GGC	2	6	166459	166464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752966
3082	NC_017068	CCA	2	6	166469	166474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752966
3083	NC_017068	CTA	2	6	166506	166511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752966
3084	NC_017068	GGC	2	6	166566	166571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752966
3085	NC_017068	GAT	2	6	166668	166673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752967
3086	NC_017068	AGA	2	6	166679	166684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752967
3087	NC_017068	GCA	2	6	166705	166710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752967
3088	NC_017068	GCC	2	6	166747	166752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752967
3089	NC_017068	GCC	2	6	166773	166778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752967
3090	NC_017068	TAT	2	6	166789	166794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752967
3091	NC_017068	GAT	2	6	166795	166800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752967
3092	NC_017068	CAA	2	6	166815	166820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752967
3093	NC_017068	AAG	2	6	166855	166860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752967
3094	NC_017068	CAT	2	6	166866	166871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752967
3095	NC_017068	CCGGG	2	10	166923	166932	0 %	0 %	60 %	40 %	383752967
3096	NC_017068	GAAG	2	8	167025	167032	50 %	0 %	50 %	0 %	383752967
3097	NC_017068	TGA	2	6	167109	167114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752967
3098	NC_017068	ACA	2	6	167123	167128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752967
3099	NC_017068	GAT	2	6	167146	167151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752967
3100	NC_017068	GAA	2	6	167166	167171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752967
3101	NC_017068	GCT	2	6	167178	167183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752967
3102	NC_017068	GCTG	2	8	167215	167222	0 %	25 %	50 %	25 %	383752967
3103	NC_017068	CAA	2	6	167310	167315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752967
3104	NC_017068	CGTG	2	8	167349	167356	0 %	25 %	50 %	25 %	383752967
3105	NC_017068	TAT	2	6	167410	167415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752967
3106	NC_017068	CTT	2	6	167639	167644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752967
3107	NC_017068	GCA	3	9	167717	167725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752967
3108	NC_017068	GAT	2	6	167842	167847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752967
3109	NC_017068	GCC	2	6	167873	167878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752967
3110	NC_017068	GGC	2	6	167919	167924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752967
3111	NC_017068	CTG	2	6	167959	167964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752967
3112	NC_017068	GAA	2	6	168006	168011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752967
3113	NC_017068	ATT	2	6	168164	168169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752967
3114	NC_017068	GCA	2	6	168223	168228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752968
3115	NC_017068	TG	3	6	168235	168240	0 %	50 %	50 %	0 %	383752968
3116	NC_017068	AGCCTG	2	12	168328	168339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383752968
3117	NC_017068	GAT	2	6	168361	168366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752968
3118	NC_017068	ATGG	2	8	168391	168398	25 %	25 %	50 %	0 %	383752968
3119	NC_017068	TGG	2	6	168404	168409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752968
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3122	NC_017068	CAA	2	6	168591	168596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752968
3123	NC_017068	GCA	2	6	168665	168670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752968
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3231	NC_017068	CAC	2	6	174981	174986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752974
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3234	NC_017068	ACC	2	6	175042	175047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752974
3235	NC_017068	CCG	2	6	175064	175069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752974
3236	NC_017068	GCC	2	6	175105	175110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752974
3237	NC_017068	GCAGA	2	10	175129	175138	40 %	0 %	40 %	20 %	383752974
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3239	NC_017068	ATG	2	6	175350	175355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752975
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3354	NC_017068	GCCA	2	8	182409	182416	25 %	0 %	25 %	50 %	383752981
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3479	NC_017068	GTT	3	9	189039	189047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752989
3480	NC_017068	CTG	2	6	189088	189093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3481	NC_017068	GCT	2	6	189112	189117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3482	NC_017068	ATG	2	6	189194	189199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752989
3483	NC_017068	CAG	2	6	189209	189214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3484	NC_017068	CTG	2	6	189223	189228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3485	NC_017068	GATT	2	8	189231	189238	25 %	50 %	25 %	0 %	383752989
3486	NC_017068	TGC	2	6	189243	189248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3487	NC_017068	AGG	2	6	189269	189274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752989
3488	NC_017068	CAG	2	6	189282	189287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3489	NC_017068	TGGGC	2	10	189354	189363	0 %	20 %	60 %	20 %	383752989
3490	NC_017068	ATG	2	6	189431	189436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752989
3491	NC_017068	GCA	2	6	189440	189445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752989
3492	NC_017068	AGG	2	6	189465	189470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752989
3493	NC_017068	GTG	2	6	189472	189477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752989
3494	NC_017068	ATG	2	6	189517	189522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752989
3495	NC_017068	ATG	2	6	189553	189558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752989
3496	NC_017068	ACC	2	6	189694	189699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752989
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3498	NC_017068	ACTT	2	8	189745	189752	25 %	50 %	0 %	25 %	383752989
3499	NC_017068	ACC	2	6	189808	189813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752989
3500	NC_017068	CCG	2	6	189819	189824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752989

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