MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	GC	3	6	240	245	0 %	0 %	50 %	50 %	383499152
2	NC_017054	GT	3	6	918	923	0 %	50 %	50 %	0 %	383499153
3	NC_017054	GA	3	6	1887	1892	50 %	0 %	50 %	0 %	383499155
4	NC_017054	GT	3	6	4063	4068	0 %	50 %	50 %	0 %	383499157
5	NC_017054	TC	3	6	4297	4302	0 %	50 %	0 %	50 %	383499157
6	NC_017054	GT	3	6	5811	5816	0 %	50 %	50 %	0 %	383499159
7	NC_017054	GC	3	6	7946	7951	0 %	0 %	50 %	50 %	383499162
8	NC_017054	TA	3	6	8957	8962	50 %	50 %	0 %	0 %	383499163
9	NC_017054	CA	4	8	10087	10094	50 %	0 %	0 %	50 %	383499164
10	NC_017054	GC	3	6	10936	10941	0 %	0 %	50 %	50 %	383499166
11	NC_017054	GC	3	6	11008	11013	0 %	0 %	50 %	50 %	383499166
12	NC_017054	GC	3	6	11279	11284	0 %	0 %	50 %	50 %	383499166
13	NC_017054	AC	3	6	11686	11691	50 %	0 %	0 %	50 %	383499166
14	NC_017054	AC	3	6	14377	14382	50 %	0 %	0 %	50 %	383499168
15	NC_017054	CT	3	6	16877	16882	0 %	50 %	0 %	50 %	383499170
16	NC_017054	GA	3	6	17335	17340	50 %	0 %	50 %	0 %	383499170
17	NC_017054	GA	3	6	19063	19068	50 %	0 %	50 %	0 %	383499171
18	NC_017054	GC	3	6	21116	21121	0 %	0 %	50 %	50 %	383499174
19	NC_017054	GC	3	6	21838	21843	0 %	0 %	50 %	50 %	383499175
20	NC_017054	GC	3	6	22677	22682	0 %	0 %	50 %	50 %	383499176
21	NC_017054	TC	3	6	23743	23748	0 %	50 %	0 %	50 %	383499178
22	NC_017054	TG	3	6	23769	23774	0 %	50 %	50 %	0 %	383499178
23	NC_017054	CG	3	6	23794	23799	0 %	0 %	50 %	50 %	383499178
24	NC_017054	GC	3	6	23852	23857	0 %	0 %	50 %	50 %	383499178
25	NC_017054	GC	3	6	24951	24956	0 %	0 %	50 %	50 %	383499180
26	NC_017054	TA	3	6	27334	27339	50 %	50 %	0 %	0 %	383499184
27	NC_017054	TA	3	6	28514	28519	50 %	50 %	0 %	0 %	383499185
28	NC_017054	CT	3	6	32086	32091	0 %	50 %	0 %	50 %	383499188
29	NC_017054	AT	3	6	34424	34429	50 %	50 %	0 %	0 %	383499190
30	NC_017054	AC	4	8	36043	36050	50 %	0 %	0 %	50 %	383499192
31	NC_017054	GT	3	6	37716	37721	0 %	50 %	50 %	0 %	383499194
32	NC_017054	GC	4	8	40388	40395	0 %	0 %	50 %	50 %	383499196
33	NC_017054	CA	3	6	40522	40527	50 %	0 %	0 %	50 %	383499196
34	NC_017054	GC	3	6	41029	41034	0 %	0 %	50 %	50 %	383499197
35	NC_017054	TC	3	6	41842	41847	0 %	50 %	0 %	50 %	383499198
36	NC_017054	TC	3	6	42169	42174	0 %	50 %	0 %	50 %	383499198
37	NC_017054	TA	3	6	42651	42656	50 %	50 %	0 %	0 %	383499199
38	NC_017054	AT	3	6	43069	43074	50 %	50 %	0 %	0 %	383499199
39	NC_017054	TA	3	6	43852	43857	50 %	50 %	0 %	0 %	383499200
40	NC_017054	TG	3	6	44371	44376	0 %	50 %	50 %	0 %	383499200
41	NC_017054	AC	3	6	44621	44626	50 %	0 %	0 %	50 %	383499200
42	NC_017054	GA	3	6	44930	44935	50 %	0 %	50 %	0 %	383499201
43	NC_017054	CG	3	6	45775	45780	0 %	0 %	50 %	50 %	383499201
44	NC_017054	GA	3	6	45875	45880	50 %	0 %	50 %	0 %	383499201
45	NC_017054	TC	3	6	46576	46581	0 %	50 %	0 %	50 %	383499203
46	NC_017054	CG	3	6	46621	46626	0 %	0 %	50 %	50 %	383499203
47	NC_017054	GC	3	6	46803	46808	0 %	0 %	50 %	50 %	383499203
48	NC_017054	GC	3	6	47131	47136	0 %	0 %	50 %	50 %	383499203
49	NC_017054	GC	3	6	49437	49442	0 %	0 %	50 %	50 %	383499207
50	NC_017054	CA	4	8	49863	49870	50 %	0 %	0 %	50 %	383499207
51	NC_017054	AT	3	6	49944	49949	50 %	50 %	0 %	0 %	383499207
52	NC_017054	GC	3	6	50010	50015	0 %	0 %	50 %	50 %	383499207
53	NC_017054	GC	3	6	50132	50137	0 %	0 %	50 %	50 %	383499208
54	NC_017054	GC	3	6	52736	52741	0 %	0 %	50 %	50 %	383499212
55	NC_017054	GA	3	6	53402	53407	50 %	0 %	50 %	0 %	383499213
56	NC_017054	GT	3	6	53572	53577	0 %	50 %	50 %	0 %	383499213
57	NC_017054	AC	3	6	54432	54437	50 %	0 %	0 %	50 %	383499214
58	NC_017054	AG	3	6	55343	55348	50 %	0 %	50 %	0 %	383499216
59	NC_017054	CG	3	6	55611	55616	0 %	0 %	50 %	50 %	383499216
60	NC_017054	GC	3	6	56303	56308	0 %	0 %	50 %	50 %	383499216
61	NC_017054	TG	3	6	56473	56478	0 %	50 %	50 %	0 %	383499216
62	NC_017054	GC	3	6	57071	57076	0 %	0 %	50 %	50 %	383499216
63	NC_017054	CG	3	6	57967	57972	0 %	0 %	50 %	50 %	383499218
64	NC_017054	CG	3	6	58156	58161	0 %	0 %	50 %	50 %	383499218
65	NC_017054	CA	3	6	59292	59297	50 %	0 %	0 %	50 %	383499219
66	NC_017054	TC	3	6	60436	60441	0 %	50 %	0 %	50 %	383499220
67	NC_017054	TA	4	8	60952	60959	50 %	50 %	0 %	0 %	383499221
68	NC_017054	GA	3	6	61019	61024	50 %	0 %	50 %	0 %	383499221
69	NC_017054	TC	3	6	61200	61205	0 %	50 %	0 %	50 %	383499221
70	NC_017054	AT	3	6	63559	63564	50 %	50 %	0 %	0 %	383499224
71	NC_017054	TG	3	6	64367	64372	0 %	50 %	50 %	0 %	383499225
72	NC_017054	CG	3	6	65384	65389	0 %	0 %	50 %	50 %	383499226
73	NC_017054	GC	3	6	66820	66825	0 %	0 %	50 %	50 %	383499229
74	NC_017054	TC	3	6	67144	67149	0 %	50 %	0 %	50 %	383499229
75	NC_017054	TG	3	6	67605	67610	0 %	50 %	50 %	0 %	383499230
76	NC_017054	TG	3	6	67819	67824	0 %	50 %	50 %	0 %	383499231
77	NC_017054	CG	3	6	68784	68789	0 %	0 %	50 %	50 %	383499233
78	NC_017054	TG	3	6	68799	68804	0 %	50 %	50 %	0 %	383499233
79	NC_017054	GC	3	6	69006	69011	0 %	0 %	50 %	50 %	383499233
80	NC_017054	CA	3	6	69100	69105	50 %	0 %	0 %	50 %	383499233
81	NC_017054	CG	3	6	69301	69306	0 %	0 %	50 %	50 %	383499233
82	NC_017054	CG	3	6	70751	70756	0 %	0 %	50 %	50 %	383499233
83	NC_017054	GC	3	6	71458	71463	0 %	0 %	50 %	50 %	383499234
84	NC_017054	GC	3	6	71749	71754	0 %	0 %	50 %	50 %	383499235
85	NC_017054	TG	3	6	72167	72172	0 %	50 %	50 %	0 %	383499236
86	NC_017054	GC	3	6	74940	74945	0 %	0 %	50 %	50 %	383499240
87	NC_017054	GA	4	8	75043	75050	50 %	0 %	50 %	0 %	383499240
88	NC_017054	CA	3	6	75172	75177	50 %	0 %	0 %	50 %	383499240
89	NC_017054	GC	3	6	76308	76313	0 %	0 %	50 %	50 %	383499240
90	NC_017054	TC	3	6	77853	77858	0 %	50 %	0 %	50 %	383499243
91	NC_017054	AC	3	6	78292	78297	50 %	0 %	0 %	50 %	383499244
92	NC_017054	CA	3	6	78522	78527	50 %	0 %	0 %	50 %	383499245
93	NC_017054	TG	3	6	80256	80261	0 %	50 %	50 %	0 %	383499246
94	NC_017054	CT	3	6	80955	80960	0 %	50 %	0 %	50 %	383499246
95	NC_017054	TC	3	6	81005	81010	0 %	50 %	0 %	50 %	383499246
96	NC_017054	GC	3	6	81505	81510	0 %	0 %	50 %	50 %	383499246
97	NC_017054	TG	3	6	84590	84595	0 %	50 %	50 %	0 %	383499249
98	NC_017054	CG	3	6	84967	84972	0 %	0 %	50 %	50 %	383499249
99	NC_017054	AC	3	6	85407	85412	50 %	0 %	0 %	50 %	383499249
100	NC_017054	GA	3	6	85479	85484	50 %	0 %	50 %	0 %	383499249
101	NC_017054	CA	3	6	87433	87438	50 %	0 %	0 %	50 %	383499252
102	NC_017054	CG	3	6	87720	87725	0 %	0 %	50 %	50 %	383499252
103	NC_017054	GC	3	6	88750	88755	0 %	0 %	50 %	50 %	383499252
104	NC_017054	AG	3	6	88901	88906	50 %	0 %	50 %	0 %	383499252
105	NC_017054	GA	3	6	89179	89184	50 %	0 %	50 %	0 %	383499252
106	NC_017054	CA	3	6	89492	89497	50 %	0 %	0 %	50 %	383499252
107	NC_017054	AG	3	6	92485	92490	50 %	0 %	50 %	0 %	383499254
108	NC_017054	CA	3	6	93538	93543	50 %	0 %	0 %	50 %	383499255
109	NC_017054	CG	3	6	93729	93734	0 %	0 %	50 %	50 %	383499255

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.