MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 1079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383493134
2	NC_017053	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383493135
3	NC_017053	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383493136
4	NC_017053	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383493137
5	NC_017053	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383493138
6	NC_017053	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	383493143
7	NC_017053	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	383493143
8	NC_017053	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	383493146
9	NC_017053	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	383493146
10	NC_017053	AGTGA	2	10	27250	27259	40 %	20 %	40 %	0 %	383493149
11	NC_017053	ATTTT	2	10	27949	27958	20 %	80 %	0 %	0 %	383493150
12	NC_017053	TTGAT	2	10	28138	28147	20 %	60 %	20 %	0 %	383493150
13	NC_017053	TGGTG	2	10	30222	30231	0 %	40 %	60 %	0 %	383493153
14	NC_017053	AGCAG	2	10	37470	37479	40 %	0 %	40 %	20 %	383493157
15	NC_017053	GGTCA	2	10	37834	37843	20 %	20 %	40 %	20 %	383493157
16	NC_017053	TTGGG	2	10	38230	38239	0 %	40 %	60 %	0 %	383493158
17	NC_017053	GCAGG	2	10	42310	42319	20 %	0 %	60 %	20 %	383493160
18	NC_017053	CTGCC	2	10	43274	43283	0 %	20 %	20 %	60 %	383493162
19	NC_017053	CTCAG	2	10	43667	43676	20 %	20 %	20 %	40 %	383493162
20	NC_017053	GCTTT	2	10	51024	51033	0 %	60 %	20 %	20 %	383493169
21	NC_017053	TTTTC	2	10	51222	51231	0 %	80 %	0 %	20 %	383493169
22	NC_017053	AAACC	2	10	51287	51296	60 %	0 %	0 %	40 %	383493169
23	NC_017053	ATGGT	2	10	53061	53070	20 %	40 %	40 %	0 %	383493170
24	NC_017053	ATTCA	2	10	53745	53754	40 %	40 %	0 %	20 %	383493170
25	NC_017053	TTTTA	2	10	57516	57525	20 %	80 %	0 %	0 %	383493172
26	NC_017053	AAAGC	2	10	57709	57718	60 %	0 %	20 %	20 %	383493172
27	NC_017053	TTTGG	2	10	61703	61712	0 %	60 %	40 %	0 %	383493179
28	NC_017053	TTCAC	2	10	62059	62068	20 %	40 %	0 %	40 %	383493180
29	NC_017053	GAAAT	2	10	63140	63149	60 %	20 %	20 %	0 %	383493182
30	NC_017053	TCCAA	2	10	68840	68849	40 %	20 %	0 %	40 %	383493194
31	NC_017053	CTTGG	2	10	83051	83060	0 %	40 %	40 %	20 %	383493206
32	NC_017053	TCTTA	2	10	83469	83478	20 %	60 %	0 %	20 %	383493206
33	NC_017053	CACTC	2	10	85014	85023	20 %	20 %	0 %	60 %	383493208
34	NC_017053	GATTG	2	10	87275	87284	20 %	40 %	40 %	0 %	383493209
35	NC_017053	TTGAT	2	10	97421	97430	20 %	60 %	20 %	0 %	383493214
36	NC_017053	AAATC	2	10	97589	97598	60 %	20 %	0 %	20 %	383493214
37	NC_017053	TGAAG	2	10	102905	102914	40 %	20 %	40 %	0 %	383493223
38	NC_017053	TTTAG	2	10	104764	104773	20 %	60 %	20 %	0 %	383493226
39	NC_017053	GTGTT	2	10	109168	109177	0 %	60 %	40 %	0 %	383493232
40	NC_017053	TAGGT	2	10	109991	110000	20 %	40 %	40 %	0 %	383493233
41	NC_017053	TAAAT	2	10	110124	110133	60 %	40 %	0 %	0 %	383493233
42	NC_017053	AAATC	2	10	111000	111009	60 %	20 %	0 %	20 %	383493234
43	NC_017053	GAAAA	2	10	117419	117428	80 %	0 %	20 %	0 %	383493239
44	NC_017053	GGGAA	2	10	121570	121579	40 %	0 %	60 %	0 %	383493243
45	NC_017053	GACCT	2	10	123025	123034	20 %	20 %	20 %	40 %	383493243
46	NC_017053	TCAGG	2	10	124330	124339	20 %	20 %	40 %	20 %	383493243
47	NC_017053	TTTTA	2	10	126212	126221	20 %	80 %	0 %	0 %	383493246
48	NC_017053	GCTTT	3	15	126788	126802	0 %	60 %	20 %	20 %	383493246
49	NC_017053	GTCAT	2	10	127107	127116	20 %	40 %	20 %	20 %	383493246
50	NC_017053	TAGTG	2	10	128050	128059	20 %	40 %	40 %	0 %	383493247
51	NC_017053	GTTAA	2	10	128453	128462	40 %	40 %	20 %	0 %	383493247
52	NC_017053	AATAA	2	10	128482	128491	80 %	20 %	0 %	0 %	383493247
53	NC_017053	TTGAT	2	10	129569	129578	20 %	60 %	20 %	0 %	383493248
54	NC_017053	TACCT	2	10	130972	130981	20 %	40 %	0 %	40 %	383493250
55	NC_017053	AATCA	2	10	131752	131761	60 %	20 %	0 %	20 %	383493251
56	NC_017053	TCATG	2	10	132359	132368	20 %	40 %	20 %	20 %	383493252
57	NC_017053	AACAA	2	10	133505	133514	80 %	0 %	0 %	20 %	383493253
58	NC_017053	CAAAA	2	10	134723	134732	80 %	0 %	0 %	20 %	383493255
59	NC_017053	GTCTT	2	10	134934	134943	0 %	60 %	20 %	20 %	383493255
60	NC_017053	TTTTA	2	10	135796	135805	20 %	80 %	0 %	0 %	383493255
61	NC_017053	AAAGC	2	10	136985	136994	60 %	0 %	20 %	20 %	383493257
62	NC_017053	AGTTC	2	10	137235	137244	20 %	40 %	20 %	20 %	383493257
63	NC_017053	GCTGA	2	10	137255	137264	20 %	20 %	40 %	20 %	383493257
64	NC_017053	ATCGC	2	10	140630	140639	20 %	20 %	20 %	40 %	383493260
65	NC_017053	TTGGG	2	10	142033	142042	0 %	40 %	60 %	0 %	383493261
66	NC_017053	GAAAA	2	10	147343	147352	80 %	0 %	20 %	0 %	383493266
67	NC_017053	GGATT	2	10	147460	147469	20 %	40 %	40 %	0 %	383493266
68	NC_017053	TTTTG	2	10	147980	147989	0 %	80 %	20 %	0 %	383493266
69	NC_017053	TCATG	2	10	149486	149495	20 %	40 %	20 %	20 %	383493268
70	NC_017053	GTATC	2	10	150747	150756	20 %	40 %	20 %	20 %	383493269
71	NC_017053	GTCGC	2	10	151186	151195	0 %	20 %	40 %	40 %	383493270
72	NC_017053	GCCTA	2	10	157325	157334	20 %	20 %	20 %	40 %	383493275
73	NC_017053	GCAAC	2	10	157542	157551	40 %	0 %	20 %	40 %	383493275
74	NC_017053	AAGGT	2	10	159224	159233	40 %	20 %	40 %	0 %	383493275
75	NC_017053	ATTTG	2	10	165508	165517	20 %	60 %	20 %	0 %	383493283
76	NC_017053	CAAGA	2	10	167430	167439	60 %	0 %	20 %	20 %	383493284
77	NC_017053	TTTGG	2	10	168599	168608	0 %	60 %	40 %	0 %	383493285
78	NC_017053	TGGAT	2	10	169548	169557	20 %	40 %	40 %	0 %	383493286
79	NC_017053	ACCTA	2	10	170620	170629	40 %	20 %	0 %	40 %	383493286
80	NC_017053	ATTTT	2	10	175484	175493	20 %	80 %	0 %	0 %	383493290
81	NC_017053	TCTAT	2	10	176472	176481	20 %	60 %	0 %	20 %	383493291
82	NC_017053	GTTTG	2	10	177012	177021	0 %	60 %	40 %	0 %	383493291
83	NC_017053	TGAAA	2	10	177187	177196	60 %	20 %	20 %	0 %	383493292
84	NC_017053	TTGAT	2	10	177435	177444	20 %	60 %	20 %	0 %	383493292
85	NC_017053	CCAAA	2	10	179784	179793	60 %	0 %	0 %	40 %	383493294
86	NC_017053	TCCCA	2	10	179986	179995	20 %	20 %	0 %	60 %	383493294
87	NC_017053	GCCAA	2	10	180833	180842	40 %	0 %	20 %	40 %	383493295
88	NC_017053	GGAAA	2	10	183783	183792	60 %	0 %	40 %	0 %	383493298
89	NC_017053	TAATC	2	10	186608	186617	40 %	40 %	0 %	20 %	383493302
90	NC_017053	TTTAC	2	10	190740	190749	20 %	60 %	0 %	20 %	383493306
91	NC_017053	CAAAC	2	10	193260	193269	60 %	0 %	0 %	40 %	383493308
92	NC_017053	AGATA	2	10	193374	193383	60 %	20 %	20 %	0 %	383493308
93	NC_017053	ATATA	2	10	194163	194172	60 %	40 %	0 %	0 %	383493308
94	NC_017053	TTTTG	2	10	198050	198059	0 %	80 %	20 %	0 %	383493312
95	NC_017053	ATCGC	2	10	199368	199377	20 %	20 %	20 %	40 %	383493314
96	NC_017053	TTTTA	2	10	200536	200545	20 %	80 %	0 %	0 %	383493315
97	NC_017053	CTAAT	2	10	200774	200783	40 %	40 %	0 %	20 %	383493315
98	NC_017053	GAATG	2	10	201297	201306	40 %	20 %	40 %	0 %	383493315
99	NC_017053	GACAG	2	10	203725	203734	40 %	0 %	40 %	20 %	383493317
100	NC_017053	CCTTC	2	10	205724	205733	0 %	40 %	0 %	60 %	383493319
101	NC_017053	TAAGA	2	10	205769	205778	60 %	20 %	20 %	0 %	383493319
102	NC_017053	TGGAT	2	10	207858	207867	20 %	40 %	40 %	0 %	383493321
103	NC_017053	CTTTT	2	10	208028	208037	0 %	80 %	0 %	20 %	383493321
104	NC_017053	GAGAA	2	10	209399	209408	60 %	0 %	40 %	0 %	383493322
105	NC_017053	GTTAT	2	10	210424	210433	20 %	60 %	20 %	0 %	383493323
106	NC_017053	AAGAT	2	10	210510	210519	60 %	20 %	20 %	0 %	383493323
107	NC_017053	AAATG	2	10	212058	212067	60 %	20 %	20 %	0 %	383493324
108	NC_017053	CAAAT	2	10	213203	213212	60 %	20 %	0 %	20 %	383493326
109	NC_017053	CTCAT	2	10	217648	217657	20 %	40 %	0 %	40 %	383493331
110	NC_017053	TTTTC	2	10	217868	217877	0 %	80 %	0 %	20 %	383493331
111	NC_017053	TTATT	2	10	218108	218117	20 %	80 %	0 %	0 %	383493331
112	NC_017053	TTGTC	2	10	219608	219617	0 %	60 %	20 %	20 %	383493333
113	NC_017053	GCAGC	2	10	223864	223873	20 %	0 %	40 %	40 %	383493337
114	NC_017053	ATTCC	2	10	225169	225178	20 %	40 %	0 %	40 %	383493339
115	NC_017053	GTCTC	2	10	225417	225426	0 %	40 %	20 %	40 %	383493339
116	NC_017053	AATCA	2	10	229712	229721	60 %	20 %	0 %	20 %	383493344
117	NC_017053	AGCTA	2	10	233384	233393	40 %	20 %	20 %	20 %	383493346
118	NC_017053	GAAAC	2	10	233832	233841	60 %	0 %	20 %	20 %	383493346
119	NC_017053	CCAAT	2	10	236204	236213	40 %	20 %	0 %	40 %	383493349
120	NC_017053	CAAGA	2	10	236978	236987	60 %	0 %	20 %	20 %	383493349
121	NC_017053	TTTGG	2	10	239966	239975	0 %	60 %	40 %	0 %	383493351
122	NC_017053	TTTTA	2	10	244470	244479	20 %	80 %	0 %	0 %	383493354
123	NC_017053	TGGTT	2	10	246408	246417	0 %	60 %	40 %	0 %	383493356
124	NC_017053	ATTAC	2	10	247803	247812	40 %	40 %	0 %	20 %	383493357
125	NC_017053	TGATT	2	10	248816	248825	20 %	60 %	20 %	0 %	383493358
126	NC_017053	CCAAT	2	10	249073	249082	40 %	20 %	0 %	40 %	383493358
127	NC_017053	GTGAT	2	10	250670	250679	20 %	40 %	40 %	0 %	383493360
128	NC_017053	GGTTC	2	10	254766	254775	0 %	40 %	40 %	20 %	383493363
129	NC_017053	ATAGT	2	10	254886	254895	40 %	40 %	20 %	0 %	383493363
130	NC_017053	GCTTG	2	10	269532	269541	0 %	40 %	40 %	20 %	383493370
131	NC_017053	TATCA	2	10	269881	269890	40 %	40 %	0 %	20 %	383493370
132	NC_017053	GCAGA	2	10	272106	272115	40 %	0 %	40 %	20 %	383493374
133	NC_017053	ATGGT	2	10	272323	272332	20 %	40 %	40 %	0 %	383493374
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