MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 1931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017052	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383489965
2	NC_017052	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383489967
3	NC_017052	TGGTC	2	10	10864	10873	0 %	40 %	40 %	20 %	383489973
4	NC_017052	TGGCT	2	10	11014	11023	0 %	40 %	40 %	20 %	383489973
5	NC_017052	AGCCT	2	10	15982	15991	20 %	20 %	20 %	40 %	383489977
6	NC_017052	CTTGG	2	10	21017	21026	0 %	40 %	40 %	20 %	383489980
7	NC_017052	ATGCC	2	10	21918	21927	20 %	20 %	20 %	40 %	383489981
8	NC_017052	TGTCA	2	10	22615	22624	20 %	40 %	20 %	20 %	383489981
9	NC_017052	TGCTT	2	10	24570	24579	0 %	60 %	20 %	20 %	383489983
10	NC_017052	TCCAA	2	10	30962	30971	40 %	20 %	0 %	40 %	383489987
11	NC_017052	GCATG	2	10	31146	31155	20 %	20 %	40 %	20 %	383489987
12	NC_017052	TCGAT	2	10	31249	31258	20 %	40 %	20 %	20 %	383489987
13	NC_017052	TAAGC	2	10	32017	32026	40 %	20 %	20 %	20 %	383489987
14	NC_017052	TTTGG	2	10	32347	32356	0 %	60 %	40 %	0 %	383489987
15	NC_017052	GGAAC	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	383489989
16	NC_017052	TCCCA	2	10	34076	34085	20 %	20 %	0 %	60 %	383489990
17	NC_017052	TTCAC	2	10	35101	35110	20 %	40 %	0 %	40 %	383489990
18	NC_017052	GCAGA	2	10	35185	35194	40 %	0 %	40 %	20 %	383489990
19	NC_017052	CCCAG	2	10	35308	35317	20 %	0 %	20 %	60 %	383489990
20	NC_017052	ACAAT	2	10	36267	36276	60 %	20 %	0 %	20 %	383489991
21	NC_017052	AAAGT	2	10	39212	39221	60 %	20 %	20 %	0 %	383489993
22	NC_017052	CTGGA	2	10	40061	40070	20 %	20 %	40 %	20 %	383489994
23	NC_017052	ATTAC	2	10	40757	40766	40 %	40 %	0 %	20 %	383489994
24	NC_017052	TTTCA	2	10	40950	40959	20 %	60 %	0 %	20 %	383489994
25	NC_017052	TTAGA	2	10	41237	41246	40 %	40 %	20 %	0 %	383489994
26	NC_017052	TCCAT	2	10	41905	41914	20 %	40 %	0 %	40 %	383489994
27	NC_017052	AAAAC	2	10	43396	43405	80 %	0 %	0 %	20 %	383489995
28	NC_017052	ATTGG	2	10	44430	44439	20 %	40 %	40 %	0 %	383489996
29	NC_017052	ACGGG	2	10	46160	46169	20 %	0 %	60 %	20 %	383489998
30	NC_017052	CTGGG	2	10	49828	49837	0 %	20 %	60 %	20 %	383490002
31	NC_017052	TTTGG	2	10	54038	54047	0 %	60 %	40 %	0 %	383490006
32	NC_017052	AGTTT	2	10	55651	55660	20 %	60 %	20 %	0 %	383490007
33	NC_017052	AAAAC	2	10	57512	57521	80 %	0 %	0 %	20 %	383490010
34	NC_017052	CCATG	2	10	58347	58356	20 %	20 %	20 %	40 %	383490010
35	NC_017052	GGTCA	2	10	59261	59270	20 %	20 %	40 %	20 %	383490011
36	NC_017052	TCCGT	2	10	64282	64291	0 %	40 %	20 %	40 %	383490015
37	NC_017052	TTGCT	2	10	64328	64337	0 %	60 %	20 %	20 %	383490015
38	NC_017052	GCTGG	2	10	66665	66674	0 %	20 %	60 %	20 %	383490018
39	NC_017052	GCTTT	2	10	79538	79547	0 %	60 %	20 %	20 %	383490031
40	NC_017052	TCCCG	2	10	80136	80145	0 %	20 %	20 %	60 %	383490031
41	NC_017052	CCAAA	2	10	81602	81611	60 %	0 %	0 %	40 %	383490032
42	NC_017052	GTTGG	2	10	82298	82307	0 %	40 %	60 %	0 %	383490034
43	NC_017052	CCTCA	2	10	83584	83593	20 %	20 %	0 %	60 %	383490034
44	NC_017052	CAAAC	2	10	89081	89090	60 %	0 %	0 %	40 %	383490040
45	NC_017052	GCCAG	2	10	89923	89932	20 %	0 %	40 %	40 %	383490040
46	NC_017052	ATAGG	2	10	90744	90753	40 %	20 %	40 %	0 %	383490041
47	NC_017052	AGGCC	2	10	94218	94227	20 %	0 %	40 %	40 %	383490043
48	NC_017052	AAGGC	2	10	99904	99913	40 %	0 %	40 %	20 %	383490048
49	NC_017052	CAGTG	2	10	100745	100754	20 %	20 %	40 %	20 %	383490048
50	NC_017052	CTTCC	2	10	101592	101601	0 %	40 %	0 %	60 %	383490049
51	NC_017052	ATAAA	2	10	103167	103176	80 %	20 %	0 %	0 %	383490051
52	NC_017052	AATAA	2	10	103396	103405	80 %	20 %	0 %	0 %	383490051
53	NC_017052	AATAT	2	10	106514	106523	60 %	40 %	0 %	0 %	383490052
54	NC_017052	CAATC	2	10	107776	107785	40 %	20 %	0 %	40 %	383490053
55	NC_017052	AATTC	2	10	111739	111748	40 %	40 %	0 %	20 %	383490058
56	NC_017052	AAAAG	2	10	111848	111857	80 %	0 %	20 %	0 %	383490058
57	NC_017052	AGATA	2	10	111932	111941	60 %	20 %	20 %	0 %	383490058
58	NC_017052	GAAAA	2	10	112266	112275	80 %	0 %	20 %	0 %	383490058
59	NC_017052	TTTTA	2	10	115159	115168	20 %	80 %	0 %	0 %	383490061
60	NC_017052	TTGTT	2	10	116293	116302	0 %	80 %	20 %	0 %	383490062
61	NC_017052	CTGGG	2	10	116676	116685	0 %	20 %	60 %	20 %	383490063
62	NC_017052	CGATA	2	10	118596	118605	40 %	20 %	20 %	20 %	383490065
63	NC_017052	AAGTT	2	10	118971	118980	40 %	40 %	20 %	0 %	383490065
64	NC_017052	GGTTA	2	10	125844	125853	20 %	40 %	40 %	0 %	383490073
65	NC_017052	TTGGA	2	10	126407	126416	20 %	40 %	40 %	0 %	383490073
66	NC_017052	TCACT	2	10	127194	127203	20 %	40 %	0 %	40 %	383490075
67	NC_017052	GAACT	2	10	127843	127852	40 %	20 %	20 %	20 %	383490075
68	NC_017052	GCCCA	2	10	130657	130666	20 %	0 %	20 %	60 %	383490078
69	NC_017052	ACTCC	2	10	130730	130739	20 %	20 %	0 %	60 %	383490078
70	NC_017052	AAAAT	2	10	130844	130853	80 %	20 %	0 %	0 %	383490078
71	NC_017052	CCAGG	2	10	133652	133661	20 %	0 %	40 %	40 %	383490081
72	NC_017052	CCGGC	2	10	134716	134725	0 %	0 %	40 %	60 %	383490083
73	NC_017052	CCAAA	2	10	136179	136188	60 %	0 %	0 %	40 %	383490083
74	NC_017052	AGCCC	2	10	140250	140259	20 %	0 %	20 %	60 %	383490085
75	NC_017052	CTTTT	2	10	140598	140607	0 %	80 %	0 %	20 %	383490086
76	NC_017052	GGCCA	2	10	142631	142640	20 %	0 %	40 %	40 %	383490089
77	NC_017052	GCCCC	2	10	144683	144692	0 %	0 %	20 %	80 %	383490092
78	NC_017052	CGGTG	2	10	144712	144721	0 %	20 %	60 %	20 %	383490092
79	NC_017052	AAATA	2	10	146778	146787	80 %	20 %	0 %	0 %	383490095
80	NC_017052	GCCAT	2	10	152497	152506	20 %	20 %	20 %	40 %	383490101
81	NC_017052	GCCCC	2	10	154597	154606	0 %	0 %	20 %	80 %	383490103
82	NC_017052	AGGGC	2	10	158468	158477	20 %	0 %	60 %	20 %	383490108
83	NC_017052	AATCA	2	10	158499	158508	60 %	20 %	0 %	20 %	383490108
84	NC_017052	TTGGA	2	10	158818	158827	20 %	40 %	40 %	0 %	383490109
85	NC_017052	AGGAG	2	10	159588	159597	40 %	0 %	60 %	0 %	383490109
86	NC_017052	AGGGG	2	10	162600	162609	20 %	0 %	80 %	0 %	383490114
87	NC_017052	TGTGG	2	10	168054	168063	0 %	40 %	60 %	0 %	383490117
88	NC_017052	TTTGG	2	10	173392	173401	0 %	60 %	40 %	0 %	383490122
89	NC_017052	GGAAA	2	10	173476	173485	60 %	0 %	40 %	0 %	383490122
90	NC_017052	CGGAG	2	10	174927	174936	20 %	0 %	60 %	20 %	383490123
91	NC_017052	TTAGG	2	10	179667	179676	20 %	40 %	40 %	0 %	383490129
92	NC_017052	GGGCC	2	10	181163	181172	0 %	0 %	60 %	40 %	383490131
93	NC_017052	GGCAA	2	10	181581	181590	40 %	0 %	40 %	20 %	383490131
94	NC_017052	CCAGG	2	10	182032	182041	20 %	0 %	40 %	40 %	383490131
95	NC_017052	AGCCA	2	10	183484	183493	40 %	0 %	20 %	40 %	383490133
96	NC_017052	TGATG	2	10	192324	192333	20 %	40 %	40 %	0 %	383490141
97	NC_017052	CTGAC	2	10	193171	193180	20 %	20 %	20 %	40 %	383490142
98	NC_017052	CAAAA	2	10	193643	193652	80 %	0 %	0 %	20 %	383490142
99	NC_017052	CCCAC	2	10	194242	194251	20 %	0 %	0 %	80 %	383490142
100	NC_017052	GGGTA	2	10	194666	194675	20 %	20 %	60 %	0 %	383490143
101	NC_017052	CCCAG	2	10	194711	194720	20 %	0 %	20 %	60 %	383490143
102	NC_017052	AGGAA	2	10	196687	196696	60 %	0 %	40 %	0 %	383490146
103	NC_017052	GCCAT	2	10	197609	197618	20 %	20 %	20 %	40 %	383490148
104	NC_017052	CCCAT	2	10	200922	200931	20 %	20 %	0 %	60 %	383490149
105	NC_017052	ACCTA	2	10	201777	201786	40 %	20 %	0 %	40 %	383490149
106	NC_017052	ACGGT	2	10	205274	205283	20 %	20 %	40 %	20 %	383490151
107	NC_017052	TGAAC	2	10	206187	206196	40 %	20 %	20 %	20 %	383490151
108	NC_017052	CTGTG	2	10	212768	212777	0 %	40 %	40 %	20 %	383490157
109	NC_017052	GGACA	2	10	212862	212871	40 %	0 %	40 %	20 %	383490157
110	NC_017052	GAACT	2	10	218611	218620	40 %	20 %	20 %	20 %	383490161
111	NC_017052	CCCAG	2	10	223179	223188	20 %	0 %	20 %	60 %	383490166
112	NC_017052	AACCG	2	10	227358	227367	40 %	0 %	20 %	40 %	383490170
113	NC_017052	ATTGT	2	10	229009	229018	20 %	60 %	20 %	0 %	383490172
114	NC_017052	CTTTG	2	10	230027	230036	0 %	60 %	20 %	20 %	383490172
115	NC_017052	TGGAT	2	10	235666	235675	20 %	40 %	40 %	0 %	383490176
116	NC_017052	TTAAT	2	10	235783	235792	40 %	60 %	0 %	0 %	383490176
117	NC_017052	GAAAT	2	10	238278	238287	60 %	20 %	20 %	0 %	383490178
118	NC_017052	GTACA	2	10	243726	243735	40 %	20 %	20 %	20 %	383490184
119	NC_017052	AGACA	2	10	243998	244007	60 %	0 %	20 %	20 %	383490184
120	NC_017052	AGGAA	2	10	244524	244533	60 %	0 %	40 %	0 %	383490185
121	NC_017052	GCAAA	2	10	244806	244815	60 %	0 %	20 %	20 %	383490186
122	NC_017052	CTTCT	2	10	247644	247653	0 %	60 %	0 %	40 %	383490189
123	NC_017052	CCTTT	2	10	249880	249889	0 %	60 %	0 %	40 %	383490190
124	NC_017052	CCGAA	2	10	250402	250411	40 %	0 %	20 %	40 %	383490191
125	NC_017052	TGACC	2	10	253520	253529	20 %	20 %	20 %	40 %	383490193
126	NC_017052	GAGAG	2	10	254478	254487	40 %	0 %	60 %	0 %	383490193
127	NC_017052	TGGGG	2	10	262858	262867	0 %	20 %	80 %	0 %	383490201
128	NC_017052	TTTTC	2	10	263628	263637	0 %	80 %	0 %	20 %	383490202
129	NC_017052	TAAAA	2	10	269018	269027	80 %	20 %	0 %	0 %	383490208
130	NC_017052	ATTGT	2	10	269362	269371	20 %	60 %	20 %	0 %	383490208
131	NC_017052	ACTTT	2	10	272254	272263	20 %	60 %	0 %	20 %	383490211
132	NC_017052	GGTTT	2	10	272439	272448	0 %	60 %	40 %	0 %	383490211
133	NC_017052	AAGAA	2	10	272693	272702	80 %	0 %	20 %	0 %	383490211
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252	NC_017052	ATGCC	2	10	536993	537002	20 %	20 %	20 %	40 %	383490443
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256	NC_017052	ATTTG	2	10	542456	542465	20 %	60 %	20 %	0 %	383490449
257	NC_017052	TAAAC	2	10	544111	544120	60 %	20 %	0 %	20 %	383490451
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259	NC_017052	AACCC	2	10	549221	549230	40 %	0 %	0 %	60 %	383490457
260	NC_017052	GGGAT	2	10	550663	550672	20 %	20 %	60 %	0 %	383490460
261	NC_017052	CCCAA	2	10	552215	552224	40 %	0 %	0 %	60 %	383490460
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