MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 58253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017052	GGCA	2	8	243333	243340	25 %	0 %	50 %	25 %	383490184
4002	NC_017052	TTAA	2	8	243341	243348	50 %	50 %	0 %	0 %	383490184
4003	NC_017052	AGAT	2	8	243357	243364	50 %	25 %	25 %	0 %	383490184
4004	NC_017052	CCA	2	6	243378	243383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490184
4005	NC_017052	GGC	2	6	243412	243417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490184
4006	NC_017052	A	6	6	243479	243484	100 %	0 %	0 %	0 %	383490184
4007	NC_017052	ACA	2	6	243487	243492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490184
4008	NC_017052	G	6	6	243544	243549	0 %	0 %	100 %	0 %	383490184
4009	NC_017052	T	6	6	243594	243599	0 %	100 %	0 %	0 %	383490184
4010	NC_017052	CAT	2	6	243616	243621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490184
4011	NC_017052	GGC	2	6	243685	243690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490184
4012	NC_017052	GTACA	2	10	243726	243735	40 %	20 %	20 %	20 %	383490184
4013	NC_017052	TAA	2	6	243820	243825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490184
4014	NC_017052	AGGT	2	8	243934	243941	25 %	25 %	50 %	0 %	383490184
4015	NC_017052	GTC	2	6	243981	243986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490184
4016	NC_017052	AGACA	2	10	243998	244007	60 %	0 %	20 %	20 %	383490184
4017	NC_017052	CAAA	2	8	244153	244160	75 %	0 %	0 %	25 %	383490185
4018	NC_017052	CTG	2	6	244177	244182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490185
4019	NC_017052	A	6	6	244183	244188	100 %	0 %	0 %	0 %	383490185
4020	NC_017052	T	7	7	244234	244240	0 %	100 %	0 %	0 %	383490185
4021	NC_017052	TGG	2	6	244303	244308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490185
4022	NC_017052	TGT	2	6	244341	244346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490185
4023	NC_017052	CAAA	2	8	244360	244367	75 %	0 %	0 %	25 %	383490185
4024	NC_017052	CGG	2	6	244421	244426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490185
4025	NC_017052	AGGAA	2	10	244524	244533	60 %	0 %	40 %	0 %	383490185
4026	NC_017052	T	6	6	244598	244603	0 %	100 %	0 %	0 %	383490185
4027	NC_017052	ACC	2	6	244605	244610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490185
4028	NC_017052	ATT	2	6	244695	244700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490185
4029	NC_017052	TTAA	2	8	244771	244778	50 %	50 %	0 %	0 %	383490186
4030	NC_017052	TTC	3	9	244780	244788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490186
4031	NC_017052	GCAAA	2	10	244806	244815	60 %	0 %	20 %	20 %	383490186
4032	NC_017052	AAT	2	6	244846	244851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490186
4033	NC_017052	AGT	2	6	244870	244875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490186
4034	NC_017052	TTG	2	6	244884	244889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490186
4035	NC_017052	A	7	7	244892	244898	100 %	0 %	0 %	0 %	383490186
4036	NC_017052	GCC	2	6	244907	244912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490186
4037	NC_017052	CAC	2	6	244927	244932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490186
4038	NC_017052	AATT	2	8	244945	244952	50 %	50 %	0 %	0 %	383490186
4039	NC_017052	GATT	2	8	245016	245023	25 %	50 %	25 %	0 %	383490186
4040	NC_017052	TCC	2	6	245024	245029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490186
4041	NC_017052	AATT	2	8	245182	245189	50 %	50 %	0 %	0 %	383490186
4042	NC_017052	CCA	2	6	245190	245195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490186
4043	NC_017052	GCCG	2	8	245197	245204	0 %	0 %	50 %	50 %	383490186
4044	NC_017052	TCA	2	6	245217	245222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490186
4045	NC_017052	GGC	2	6	245293	245298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490186
4046	NC_017052	AAT	2	6	245353	245358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490186
4047	NC_017052	TG	3	6	245496	245501	0 %	50 %	50 %	0 %	383490187
4048	NC_017052	CCGT	2	8	245511	245518	0 %	25 %	25 %	50 %	383490187
4049	NC_017052	CGC	2	6	245598	245603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490187
4050	NC_017052	GCC	2	6	245674	245679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490187
4051	NC_017052	CA	4	8	245728	245735	50 %	0 %	0 %	50 %	383490187
4052	NC_017052	ATC	2	6	245763	245768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490187
4053	NC_017052	GGT	2	6	245796	245801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490187
4054	NC_017052	ACC	2	6	245827	245832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490187
4055	NC_017052	CAG	2	6	246059	246064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490187
4056	NC_017052	T	6	6	246065	246070	0 %	100 %	0 %	0 %	383490187
4057	NC_017052	CCA	2	6	246165	246170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490187
4058	NC_017052	GGT	2	6	246250	246255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490187
4059	NC_017052	CAT	2	6	246264	246269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490187
4060	NC_017052	CTT	2	6	246548	246553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490187
4061	NC_017052	G	7	7	246730	246736	0 %	0 %	100 %	0 %	383490187
4062	NC_017052	TAA	2	6	246744	246749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490187
4063	NC_017052	CTT	2	6	246767	246772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490187
4064	NC_017052	A	6	6	246901	246906	100 %	0 %	0 %	0 %	383490187
4065	NC_017052	AGG	2	6	246962	246967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490187
4066	NC_017052	AAAT	2	8	247160	247167	75 %	25 %	0 %	0 %	383490188
4067	NC_017052	TGG	2	6	247298	247303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490188
4068	NC_017052	TGA	2	6	247368	247373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490188
4069	NC_017052	CCA	2	6	247395	247400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490188
4070	NC_017052	TCT	2	6	247424	247429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490188
4071	NC_017052	AGA	2	6	247543	247548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490188
4072	NC_017052	CTTCT	2	10	247644	247653	0 %	60 %	0 %	40 %	383490189
4073	NC_017052	CGG	2	6	247764	247769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490189
4074	NC_017052	TGG	2	6	247842	247847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490189
4075	NC_017052	ACC	2	6	247871	247876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490189
4076	NC_017052	AGC	2	6	247903	247908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490189
4077	NC_017052	AGC	2	6	247927	247932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490189
4078	NC_017052	TGGCTT	2	12	247962	247973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383490189
4079	NC_017052	CCTC	2	8	247976	247983	0 %	25 %	0 %	75 %	383490189
4080	NC_017052	G	8	8	248059	248066	0 %	0 %	100 %	0 %	383490189
4081	NC_017052	CGC	2	6	248079	248084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490189
4082	NC_017052	ATT	2	6	248168	248173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490189
4083	NC_017052	ACC	2	6	248245	248250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490189
4084	NC_017052	CCCT	2	8	248312	248319	0 %	25 %	0 %	75 %	383490189
4085	NC_017052	CAG	2	6	248353	248358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490189
4086	NC_017052	GGTC	2	8	248461	248468	0 %	25 %	50 %	25 %	383490189
4087	NC_017052	CT	3	6	248490	248495	0 %	50 %	0 %	50 %	383490189
4088	NC_017052	TTA	2	6	248636	248641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490189
4089	NC_017052	GGA	3	9	248647	248655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490189
4090	NC_017052	TCC	2	6	249067	249072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490190
4091	NC_017052	A	6	6	249088	249093	100 %	0 %	0 %	0 %	383490190
4092	NC_017052	TGG	2	6	249098	249103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490190
4093	NC_017052	AGTT	2	8	249183	249190	25 %	50 %	25 %	0 %	383490190
4094	NC_017052	GGA	2	6	249226	249231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490190
4095	NC_017052	AAGA	2	8	249284	249291	75 %	0 %	25 %	0 %	383490190
4096	NC_017052	TAA	2	6	249355	249360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490190
4097	NC_017052	ACT	2	6	249370	249375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490190
4098	NC_017052	GGC	2	6	249379	249384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490190
4099	NC_017052	AAGC	2	8	249442	249449	50 %	0 %	25 %	25 %	383490190
4100	NC_017052	CGA	2	6	249472	249477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490190
4101	NC_017052	AGGA	2	8	249564	249571	50 %	0 %	50 %	0 %	383490190
4102	NC_017052	ATT	2	6	249672	249677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490190
4103	NC_017052	TTC	2	6	249681	249686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490190
4104	NC_017052	A	8	8	249761	249768	100 %	0 %	0 %	0 %	383490190
4105	NC_017052	A	6	6	249816	249821	100 %	0 %	0 %	0 %	383490190
4106	NC_017052	CCTTT	2	10	249880	249889	0 %	60 %	0 %	40 %	383490190
4107	NC_017052	TTG	2	6	249905	249910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490190
4108	NC_017052	ATG	2	6	249914	249919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490190
4109	NC_017052	CAG	2	6	249977	249982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490190
4110	NC_017052	TTTA	2	8	250029	250036	25 %	75 %	0 %	0 %	383490190
4111	NC_017052	A	6	6	250061	250066	100 %	0 %	0 %	0 %	383490190
4112	NC_017052	GATT	3	12	250100	250111	25 %	50 %	25 %	0 %	383490190
4113	NC_017052	GCCTTC	2	12	250174	250185	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383490191
4114	NC_017052	ATCA	2	8	250203	250210	50 %	25 %	0 %	25 %	383490191
4115	NC_017052	ATT	2	6	250301	250306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490191
4116	NC_017052	AGA	2	6	250312	250317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490191
4117	NC_017052	CTG	2	6	250335	250340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490191
4118	NC_017052	CAA	2	6	250361	250366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490191
4119	NC_017052	CCGAA	2	10	250402	250411	40 %	0 %	20 %	40 %	383490191
4120	NC_017052	TGG	2	6	250459	250464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490191
4121	NC_017052	AGTGGT	2	12	250481	250492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383490191
4122	NC_017052	AGT	2	6	250505	250510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490191
4123	NC_017052	TAT	2	6	250622	250627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490191
4124	NC_017052	ATTT	2	8	250677	250684	25 %	75 %	0 %	0 %	383490191
4125	NC_017052	TGG	2	6	250701	250706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490191
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4127	NC_017052	ATTC	2	8	250794	250801	25 %	50 %	0 %	25 %	383490191
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4130	NC_017052	GCTA	2	8	250874	250881	25 %	25 %	25 %	25 %	383490191
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4232	NC_017052	ATAG	2	8	255516	255523	50 %	25 %	25 %	0 %	383490193
4233	NC_017052	TTTGCC	2	12	255551	255562	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383490193
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4241	NC_017052	AAT	2	6	256194	256199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490194
4242	NC_017052	GATG	2	8	256278	256285	25 %	25 %	50 %	0 %	383490194
4243	NC_017052	TCCC	2	8	256656	256663	0 %	25 %	0 %	75 %	383490195
4244	NC_017052	CTA	2	6	256691	256696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490195
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4492	NC_017052	CCA	2	6	272186	272191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490211
4493	NC_017052	ACTTT	2	10	272254	272263	20 %	60 %	0 %	20 %	383490211
4494	NC_017052	ATT	2	6	272272	272277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490211
4495	NC_017052	TGG	2	6	272311	272316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490211
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