MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 2713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017046	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	383494825
2	NC_017046	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	383494826
3	NC_017046	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	383494827
4	NC_017046	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	383494829
5	NC_017046	GATGA	2	10	8915	8924	40 %	20 %	40 %	0 %	383494831
6	NC_017046	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	383494836
7	NC_017046	AATCA	2	10	15506	15515	60 %	20 %	0 %	20 %	383494837
8	NC_017046	GGCTG	2	10	18851	18860	0 %	20 %	60 %	20 %	383494841
9	NC_017046	AGAGC	2	10	19372	19381	40 %	0 %	40 %	20 %	383494841
10	NC_017046	CCTGA	2	10	19913	19922	20 %	20 %	20 %	40 %	383494841
11	NC_017046	TACCG	2	10	21050	21059	20 %	20 %	20 %	40 %	383494842
12	NC_017046	GGCCG	2	10	21674	21683	0 %	0 %	60 %	40 %	383494842
13	NC_017046	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	383494843
14	NC_017046	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	383494844
15	NC_017046	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	383494844
16	NC_017046	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	383494845
17	NC_017046	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	383494846
18	NC_017046	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	383494850
19	NC_017046	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	383494850
20	NC_017046	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	383494851
21	NC_017046	TGCGT	2	10	32168	32177	0 %	40 %	40 %	20 %	383494852
22	NC_017046	AAAAG	2	10	32562	32571	80 %	0 %	20 %	0 %	383494853
23	NC_017046	TATAA	2	10	34165	34174	60 %	40 %	0 %	0 %	383494854
24	NC_017046	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	383494856
25	NC_017046	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	383494856
26	NC_017046	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	383494857
27	NC_017046	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	383494858
28	NC_017046	ACGGC	2	10	44487	44496	20 %	0 %	40 %	40 %	383494862
29	NC_017046	TTTTA	2	10	44813	44822	20 %	80 %	0 %	0 %	383494862
30	NC_017046	GGGCT	2	10	46562	46571	0 %	20 %	60 %	20 %	383494863
31	NC_017046	GCGTA	2	10	48438	48447	20 %	20 %	40 %	20 %	383494865
32	NC_017046	GACCA	2	10	49043	49052	40 %	0 %	20 %	40 %	383494865
33	NC_017046	CCGGC	2	10	49185	49194	0 %	0 %	40 %	60 %	383494865
34	NC_017046	CAGAC	2	10	50375	50384	40 %	0 %	20 %	40 %	383494865
35	NC_017046	TGTGC	2	10	53136	53145	0 %	40 %	40 %	20 %	383494870
36	NC_017046	GTTTG	2	10	55458	55467	0 %	60 %	40 %	0 %	383494871
37	NC_017046	CACTA	2	10	56589	56598	40 %	20 %	0 %	40 %	383494871
38	NC_017046	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	383494872
39	NC_017046	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	383494873
40	NC_017046	AAAAT	2	10	58953	58962	80 %	20 %	0 %	0 %	383494875
41	NC_017046	GGAAA	2	10	59740	59749	60 %	0 %	40 %	0 %	383494875
42	NC_017046	CGCTG	2	10	60230	60239	0 %	20 %	40 %	40 %	383494876
43	NC_017046	GCCTG	2	10	64787	64796	0 %	20 %	40 %	40 %	383494879
44	NC_017046	GCGCG	2	10	64941	64950	0 %	0 %	60 %	40 %	383494880
45	NC_017046	CGTGC	2	10	71368	71377	0 %	20 %	40 %	40 %	383494887
46	NC_017046	TTGAT	2	10	71538	71547	20 %	60 %	20 %	0 %	383494887
47	NC_017046	ACCGC	2	10	72098	72107	20 %	0 %	20 %	60 %	383494887
48	NC_017046	CGATG	2	10	77760	77769	20 %	20 %	40 %	20 %	383494892
49	NC_017046	GCGAA	2	10	78701	78710	40 %	0 %	40 %	20 %	383494892
50	NC_017046	CGTAC	2	10	79591	79600	20 %	20 %	20 %	40 %	383494892
51	NC_017046	TTGCC	2	10	81227	81236	0 %	40 %	20 %	40 %	383494894
52	NC_017046	CGTCC	2	10	81337	81346	0 %	20 %	20 %	60 %	383494894
53	NC_017046	TTCAG	2	10	84454	84463	20 %	40 %	20 %	20 %	383494897
54	NC_017046	GGCCA	2	10	84603	84612	20 %	0 %	40 %	40 %	383494897
55	NC_017046	GTACG	2	10	87174	87183	20 %	20 %	40 %	20 %	383494899
56	NC_017046	CAGAA	2	10	87887	87896	60 %	0 %	20 %	20 %	383494899
57	NC_017046	CCGCA	2	10	90005	90014	20 %	0 %	20 %	60 %	383494901
58	NC_017046	CGGTT	2	10	90510	90519	0 %	40 %	40 %	20 %	383494902
59	NC_017046	GCTCC	2	10	91646	91655	0 %	20 %	20 %	60 %	383494902
60	NC_017046	TGGCG	2	10	92290	92299	0 %	20 %	60 %	20 %	383494904
61	NC_017046	TTTCC	2	10	96204	96213	0 %	60 %	0 %	40 %	383494908
62	NC_017046	GTGGC	2	10	96773	96782	0 %	20 %	60 %	20 %	383494908
63	NC_017046	TGCAC	2	10	98690	98699	20 %	20 %	20 %	40 %	383494909
64	NC_017046	TGGCA	2	10	98759	98768	20 %	20 %	40 %	20 %	383494909
65	NC_017046	TCTGT	2	10	99085	99094	0 %	60 %	20 %	20 %	383494910
66	NC_017046	GCGCT	2	10	99395	99404	0 %	20 %	40 %	40 %	383494910
67	NC_017046	GGCGC	2	10	99809	99818	0 %	0 %	60 %	40 %	383494910
68	NC_017046	GCGAC	2	10	100122	100131	20 %	0 %	40 %	40 %	383494910
69	NC_017046	AACGT	2	10	102579	102588	40 %	20 %	20 %	20 %	383494913
70	NC_017046	CCCAA	2	10	104729	104738	40 %	0 %	0 %	60 %	383494916
71	NC_017046	TTGTT	2	10	105436	105445	0 %	80 %	20 %	0 %	383494916
72	NC_017046	GCTTC	2	10	106816	106825	0 %	40 %	20 %	40 %	383494917
73	NC_017046	TGCGT	2	10	107103	107112	0 %	40 %	40 %	20 %	383494917
74	NC_017046	TGATC	2	10	108803	108812	20 %	40 %	20 %	20 %	383494918
75	NC_017046	TGGCG	2	10	111963	111972	0 %	20 %	60 %	20 %	383494920
76	NC_017046	AGCGC	2	10	112523	112532	20 %	0 %	40 %	40 %	383494920
77	NC_017046	ACGTT	2	10	113340	113349	20 %	40 %	20 %	20 %	383494921
78	NC_017046	CCGCG	2	10	113608	113617	0 %	0 %	40 %	60 %	383494921
79	NC_017046	ACAGA	2	10	116935	116944	60 %	0 %	20 %	20 %	383494923
80	NC_017046	CAGCG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	383494925
81	NC_017046	GCCGG	2	10	118410	118419	0 %	0 %	60 %	40 %	383494925
82	NC_017046	CGAGC	2	10	118535	118544	20 %	0 %	40 %	40 %	383494925
83	NC_017046	ATTTG	2	10	118978	118987	20 %	60 %	20 %	0 %	383494925
84	NC_017046	TTGCC	2	10	123482	123491	0 %	40 %	20 %	40 %	383494929
85	NC_017046	AGCAG	2	10	124159	124168	40 %	0 %	40 %	20 %	383494930
86	NC_017046	AGTTT	2	10	126389	126398	20 %	60 %	20 %	0 %	383494931
87	NC_017046	TCGAT	2	10	128237	128246	20 %	40 %	20 %	20 %	383494932
88	NC_017046	CGGCG	2	10	130548	130557	0 %	0 %	60 %	40 %	383494934
89	NC_017046	CGTTT	2	10	131010	131019	0 %	60 %	20 %	20 %	383494934
90	NC_017046	GACCG	2	10	132454	132463	20 %	0 %	40 %	40 %	383494936
91	NC_017046	ATTCC	2	10	136111	136120	20 %	40 %	0 %	40 %	383494938
92	NC_017046	AAAGC	2	10	138408	138417	60 %	0 %	20 %	20 %	383494940
93	NC_017046	CCGCA	2	10	138941	138950	20 %	0 %	20 %	60 %	383494940
94	NC_017046	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	383494942
95	NC_017046	AAGCG	2	10	146065	146074	40 %	0 %	40 %	20 %	383494946
96	NC_017046	GTTTG	2	10	147968	147977	0 %	60 %	40 %	0 %	383494948
97	NC_017046	CGTAT	2	10	149439	149448	20 %	40 %	20 %	20 %	383494949
98	NC_017046	ATCAG	2	10	151275	151284	40 %	20 %	20 %	20 %	383494951
99	NC_017046	CTGCC	2	10	153284	153293	0 %	20 %	20 %	60 %	383494952
100	NC_017046	CGGCG	2	10	156014	156023	0 %	0 %	60 %	40 %	383494955
101	NC_017046	CCGGC	2	10	159368	159377	0 %	0 %	40 %	60 %	383494958
102	NC_017046	GATCA	2	10	162686	162695	40 %	20 %	20 %	20 %	383494961
103	NC_017046	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	383494962
104	NC_017046	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	383494964
105	NC_017046	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	383494964
106	NC_017046	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	383494965
107	NC_017046	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	383494966
108	NC_017046	CGAAC	2	10	168680	168689	40 %	0 %	20 %	40 %	383494967
109	NC_017046	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	383494967
110	NC_017046	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	383494968
111	NC_017046	CTGGA	2	10	170502	170511	20 %	20 %	40 %	20 %	383494969
112	NC_017046	CAGAA	2	10	172621	172630	60 %	0 %	20 %	20 %	383494971
113	NC_017046	CGAAG	2	10	175492	175501	40 %	0 %	40 %	20 %	383494973
114	NC_017046	GGCAT	2	10	182771	182780	20 %	20 %	40 %	20 %	383494977
115	NC_017046	GGCCA	2	10	183193	183202	20 %	0 %	40 %	40 %	383494978
116	NC_017046	GCGCC	2	10	183206	183215	0 %	0 %	40 %	60 %	383494978
117	NC_017046	CGTTT	2	10	183708	183717	0 %	60 %	20 %	20 %	383494978
118	NC_017046	GGGGA	2	10	183760	183769	20 %	0 %	80 %	0 %	383494978
119	NC_017046	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	383494981
120	NC_017046	CCGCT	2	10	191036	191045	0 %	20 %	20 %	60 %	383494984
121	NC_017046	GCCCA	2	10	193588	193597	20 %	0 %	20 %	60 %	383494987
122	NC_017046	GCGCA	2	10	193993	194002	20 %	0 %	40 %	40 %	383494987
123	NC_017046	ATCGG	2	10	195384	195393	20 %	20 %	40 %	20 %	383494989
124	NC_017046	GCCGC	2	10	196594	196603	0 %	0 %	40 %	60 %	383494991
125	NC_017046	ATCCA	2	10	201944	201953	40 %	20 %	0 %	40 %	383494994
126	NC_017046	CGGCG	2	10	204061	204070	0 %	0 %	60 %	40 %	383494997
127	NC_017046	TGGTC	2	10	204927	204936	0 %	40 %	40 %	20 %	383494997
128	NC_017046	CGTCA	2	10	206625	206634	20 %	20 %	20 %	40 %	383494998
129	NC_017046	CGGCG	2	10	209490	209499	0 %	0 %	60 %	40 %	383495001
130	NC_017046	TTCGG	2	10	210370	210379	0 %	40 %	40 %	20 %	383495002
131	NC_017046	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	383495003
132	NC_017046	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	383495004
133	NC_017046	AGATC	2	10	213460	213469	40 %	20 %	20 %	20 %	383495006
134	NC_017046	CGCGG	2	10	213882	213891	0 %	0 %	60 %	40 %	383495007
135	NC_017046	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	383495007
136	NC_017046	GCCAG	2	10	216050	216059	20 %	0 %	40 %	40 %	383495008
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252	NC_017046	GGCTG	2	10	425686	425695	0 %	20 %	60 %	20 %	383495182
253	NC_017046	ATCGT	2	10	425852	425861	20 %	40 %	20 %	20 %	383495182
254	NC_017046	TGGCG	2	10	427894	427903	0 %	20 %	60 %	20 %	383495183
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256	NC_017046	ACCCA	2	10	428558	428567	40 %	0 %	0 %	60 %	383495184
257	NC_017046	GCGCC	2	10	429042	429051	0 %	0 %	40 %	60 %	383495184
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259	NC_017046	TGATT	2	10	430189	430198	20 %	60 %	20 %	0 %	383495185
260	NC_017046	GTACG	2	10	431666	431675	20 %	20 %	40 %	20 %	383495186
261	NC_017046	GGCAG	2	10	431922	431931	20 %	0 %	60 %	20 %	383495186
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263	NC_017046	GCGCT	2	10	434546	434555	0 %	20 %	40 %	40 %	383495190
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