MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017046	GC	3	6	214043	214048	0 %	0 %	50 %	50 %	383495007
4002	NC_017046	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	383495007
4003	NC_017046	CAT	2	6	214212	214217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495007
4004	NC_017046	CGT	2	6	214236	214241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495007
4005	NC_017046	T	6	6	214269	214274	0 %	100 %	0 %	0 %	383495007
4006	NC_017046	CAG	2	6	214285	214290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495007
4007	NC_017046	GGC	2	6	214306	214311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495007
4008	NC_017046	TTC	2	6	214364	214369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495007
4009	NC_017046	ATG	2	6	214382	214387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495007
4010	NC_017046	AAC	2	6	214439	214444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495007
4011	NC_017046	GGT	2	6	214455	214460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495007
4012	NC_017046	GTT	2	6	214470	214475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495007
4013	NC_017046	GC	3	6	214531	214536	0 %	0 %	50 %	50 %	383495007
4014	NC_017046	GGA	2	6	214538	214543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495007
4015	NC_017046	GC	3	6	214631	214636	0 %	0 %	50 %	50 %	383495007
4016	NC_017046	CTT	2	6	214698	214703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495007
4017	NC_017046	CCG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495007
4018	NC_017046	GTA	2	6	214756	214761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495007
4019	NC_017046	TCT	2	6	214796	214801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495007
4020	NC_017046	TGT	2	6	214818	214823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495007
4021	NC_017046	GCA	3	9	214827	214835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495007
4022	NC_017046	ATG	2	6	214885	214890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495007
4023	NC_017046	ACG	2	6	214951	214956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495007
4024	NC_017046	CCA	2	6	214959	214964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495007
4025	NC_017046	AAT	2	6	214979	214984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495007
4026	NC_017046	CGC	3	9	215061	215069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495007
4027	NC_017046	CTC	2	6	215215	215220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495007
4028	NC_017046	GCA	2	6	215510	215515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4029	NC_017046	CTC	2	6	215517	215522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495008
4030	NC_017046	ACG	2	6	215545	215550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4031	NC_017046	GCCA	2	8	215693	215700	25 %	0 %	25 %	50 %	383495008
4032	NC_017046	TCG	2	6	215785	215790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4033	NC_017046	ACC	2	6	215791	215796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495008
4034	NC_017046	CGG	2	6	215827	215832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495008
4035	NC_017046	ATA	2	6	215836	215841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495008
4036	NC_017046	TCGC	2	8	215848	215855	0 %	25 %	25 %	50 %	383495008
4037	NC_017046	CGC	2	6	215879	215884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495008
4038	NC_017046	CAT	2	6	215891	215896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495008
4039	NC_017046	TGC	2	6	215914	215919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4040	NC_017046	CGG	2	6	215933	215938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495008
4041	NC_017046	CGT	2	6	215975	215980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4042	NC_017046	AGT	2	6	216023	216028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495008
4043	NC_017046	GCCAG	2	10	216050	216059	20 %	0 %	40 %	40 %	383495008
4044	NC_017046	G	6	6	216175	216180	0 %	0 %	100 %	0 %	383495008
4045	NC_017046	GCG	2	6	216247	216252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495008
4046	NC_017046	AGTC	2	8	216314	216321	25 %	25 %	25 %	25 %	383495008
4047	NC_017046	TGC	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495008
4048	NC_017046	CAGC	2	8	216421	216428	25 %	0 %	25 %	50 %	383495009
4049	NC_017046	GGC	2	6	216472	216477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495009
4050	NC_017046	TTC	2	6	216534	216539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495009
4051	NC_017046	TCT	2	6	216544	216549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495009
4052	NC_017046	CTC	2	6	216605	216610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495009
4053	NC_017046	GCGCG	2	10	216616	216625	0 %	0 %	60 %	40 %	383495009
4054	NC_017046	GGC	2	6	216647	216652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495009
4055	NC_017046	CTT	2	6	216838	216843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495009
4056	NC_017046	GTTC	2	8	217044	217051	0 %	50 %	25 %	25 %	383495010
4057	NC_017046	T	6	6	217059	217064	0 %	100 %	0 %	0 %	383495010
4058	NC_017046	GCA	2	6	217185	217190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495010
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4060	NC_017046	GCC	2	6	217220	217225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495010
4061	NC_017046	CTT	2	6	217455	217460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495010
4062	NC_017046	AATG	2	8	217495	217502	50 %	25 %	25 %	0 %	383495010
4063	NC_017046	CGT	2	6	217639	217644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495010
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4066	NC_017046	ACG	2	6	217822	217827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495011
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4068	NC_017046	TGGC	2	8	217875	217882	0 %	25 %	50 %	25 %	383495011
4069	NC_017046	GCA	2	6	217888	217893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495011
4070	NC_017046	AAC	2	6	217930	217935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495011
4071	NC_017046	GCGG	2	8	217940	217947	0 %	0 %	75 %	25 %	383495011
4072	NC_017046	GC	4	8	217951	217958	0 %	0 %	50 %	50 %	383495011
4073	NC_017046	CAA	2	6	217976	217981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495011
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4075	NC_017046	CAC	2	6	218012	218017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495011
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4078	NC_017046	CGTC	2	8	218172	218179	0 %	25 %	25 %	50 %	383495011
4079	NC_017046	GCG	2	6	218196	218201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495011
4080	NC_017046	GC	5	10	218218	218227	0 %	0 %	50 %	50 %	383495011
4081	NC_017046	GTC	2	6	218228	218233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495011
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4085	NC_017046	CGC	2	6	218406	218411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495012
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4087	NC_017046	CGGGG	2	10	218434	218443	0 %	0 %	80 %	20 %	383495012
4088	NC_017046	TCC	2	6	218499	218504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495012
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4090	NC_017046	GGC	2	6	218524	218529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495012
4091	NC_017046	TGAA	2	8	218562	218569	50 %	25 %	25 %	0 %	383495012
4092	NC_017046	GC	4	8	218599	218606	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4093	NC_017046	GTG	2	6	218639	218644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495012
4094	NC_017046	CGA	2	6	218862	218867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495012
4095	NC_017046	GC	3	6	218881	218886	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4096	NC_017046	GCG	2	6	218918	218923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495012
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4101	NC_017046	GTG	2	6	219149	219154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495012
4102	NC_017046	GTC	2	6	219206	219211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495012
4103	NC_017046	CG	3	6	219244	219249	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4104	NC_017046	TCAG	2	8	219282	219289	25 %	25 %	25 %	25 %	383495012
4105	NC_017046	GC	3	6	219304	219309	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4106	NC_017046	GC	3	6	219313	219318	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4107	NC_017046	GAC	2	6	219321	219326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495012
4108	NC_017046	CTG	2	6	219350	219355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495012
4109	NC_017046	GCGG	2	8	219373	219380	0 %	0 %	75 %	25 %	383495012
4110	NC_017046	CTGG	2	8	219475	219482	0 %	25 %	50 %	25 %	383495012
4111	NC_017046	GCC	2	6	219487	219492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495012
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4113	NC_017046	TAT	2	6	219522	219527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495012
4114	NC_017046	GC	3	6	219537	219542	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
4115	NC_017046	GC	3	6	219561	219566	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
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4118	NC_017046	GCC	2	6	219644	219649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495012
4119	NC_017046	GCC	2	6	219653	219658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495012
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4122	NC_017046	GTA	2	6	219713	219718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495012
4123	NC_017046	GCA	2	6	219742	219747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495012
4124	NC_017046	CAG	2	6	219755	219760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495012
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4133	NC_017046	CGTCTG	2	12	220247	220258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495012
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4141	NC_017046	CG	3	6	220641	220646	0 %	0 %	50 %	50 %	383495012
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4221	NC_017046	GGT	2	6	223984	223989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495014
4222	NC_017046	AGATGC	2	12	224001	224012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383495014
4223	NC_017046	CAGT	2	8	224021	224028	25 %	25 %	25 %	25 %	383495014
4224	NC_017046	AAG	2	6	224031	224036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495014
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4227	NC_017046	GTTGA	2	10	224216	224225	20 %	40 %	40 %	0 %	383495014
4228	NC_017046	CGTC	2	8	224238	224245	0 %	25 %	25 %	50 %	383495014
4229	NC_017046	ACT	2	6	224300	224305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495014
4230	NC_017046	GAAA	2	8	224314	224321	75 %	0 %	25 %	0 %	383495014
4231	NC_017046	TTCAA	2	10	224322	224331	40 %	40 %	0 %	20 %	383495014
4232	NC_017046	GGAC	2	8	224337	224344	25 %	0 %	50 %	25 %	383495014
4233	NC_017046	AGC	2	6	224439	224444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495014
4234	NC_017046	TGA	2	6	224500	224505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495014
4235	NC_017046	GAAC	2	8	224539	224546	50 %	0 %	25 %	25 %	383495014
4236	NC_017046	CTA	2	6	224557	224562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495014
4237	NC_017046	GGCT	2	8	224564	224571	0 %	25 %	50 %	25 %	383495014
4238	NC_017046	ACA	2	6	224646	224651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495014
4239	NC_017046	TGG	2	6	224673	224678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495014
4240	NC_017046	A	6	6	224757	224762	100 %	0 %	0 %	0 %	383495014
4241	NC_017046	GCG	2	6	224783	224788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495014
4242	NC_017046	ATGCGT	2	12	224921	224932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383495014
4243	NC_017046	GC	3	6	224958	224963	0 %	0 %	50 %	50 %	383495014
4244	NC_017046	CGG	2	6	225010	225015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495014
4245	NC_017046	AAAC	2	8	225044	225051	75 %	0 %	0 %	25 %	383495014
4246	NC_017046	GGAAT	2	10	225076	225085	40 %	20 %	40 %	0 %	383495014
4247	NC_017046	CGG	2	6	225103	225108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495014
4248	NC_017046	AT	3	6	225172	225177	50 %	50 %	0 %	0 %	383495014
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4255	NC_017046	GCAGC	2	10	225735	225744	20 %	0 %	40 %	40 %	383495014
4256	NC_017046	GATG	2	8	225748	225755	25 %	25 %	50 %	0 %	383495014
4257	NC_017046	GTC	2	6	225758	225763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495014
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4263	NC_017046	GCC	2	6	226153	226158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495015
4264	NC_017046	AGC	2	6	226205	226210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495015
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4267	NC_017046	TGG	2	6	226284	226289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495015
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4347	NC_017046	ATG	2	6	229212	229217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495017
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4349	NC_017046	CGC	2	6	229353	229358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495017
4350	NC_017046	GCG	2	6	229381	229386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495017
4351	NC_017046	CG	3	6	229391	229396	0 %	0 %	50 %	50 %	383495017
4352	NC_017046	GCT	2	6	229433	229438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495017
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4354	NC_017046	CGA	2	6	229468	229473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495017
4355	NC_017046	CGG	2	6	229642	229647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495017
4356	NC_017046	GC	3	6	229669	229674	0 %	0 %	50 %	50 %	383495017
4357	NC_017046	A	8	8	229711	229718	100 %	0 %	0 %	0 %	383495017
4358	NC_017046	CAG	2	6	230657	230662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495018
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4360	NC_017046	TGC	2	6	230715	230720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495018
4361	NC_017046	CGA	2	6	230790	230795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495018
4362	NC_017046	CAC	2	6	230898	230903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495018
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4364	NC_017046	CGG	3	9	230985	230993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495018
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4458	NC_017046	GAT	2	6	236626	236631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495024
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4461	NC_017046	CAGTT	2	10	236715	236724	20 %	40 %	20 %	20 %	383495024
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4469	NC_017046	CG	3	6	237226	237231	0 %	0 %	50 %	50 %	383495025
4470	NC_017046	TAT	2	6	237242	237247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495025
4471	NC_017046	GTC	2	6	237252	237257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495025
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4473	NC_017046	CGAC	2	8	237269	237276	25 %	0 %	25 %	50 %	383495025
4474	NC_017046	TCC	2	6	237319	237324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495025
4475	NC_017046	GAA	2	6	237336	237341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495025
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4477	NC_017046	GCC	2	6	237426	237431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495025
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4481	NC_017046	TTCA	2	8	237543	237550	25 %	50 %	0 %	25 %	383495025
4482	NC_017046	GCC	2	6	237565	237570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495025
4483	NC_017046	CGA	2	6	237646	237651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4484	NC_017046	CGC	2	6	237677	237682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495025
4485	NC_017046	GAT	2	6	237684	237689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495025
4486	NC_017046	CAGGT	2	10	237700	237709	20 %	20 %	40 %	20 %	383495025
4487	NC_017046	ACG	2	6	237715	237720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4488	NC_017046	GTA	2	6	237723	237728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495025
4489	NC_017046	TCG	2	6	237772	237777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4490	NC_017046	CAG	2	6	237783	237788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4491	NC_017046	GC	3	6	237811	237816	0 %	0 %	50 %	50 %	383495025
4492	NC_017046	GCG	2	6	237839	237844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495025
4493	NC_017046	CGA	2	6	237875	237880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4494	NC_017046	CG	3	6	237918	237923	0 %	0 %	50 %	50 %	383495025
4495	NC_017046	GC	3	6	238013	238018	0 %	0 %	50 %	50 %	383495025
4496	NC_017046	CAG	2	6	238035	238040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4497	NC_017046	AGC	2	6	238061	238066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4498	NC_017046	TCG	2	6	238127	238132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495025
4499	NC_017046	GC	3	6	238223	238228	0 %	0 %	50 %	50 %	383495025
4500	NC_017046	CAT	2	6	238346	238351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495025

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