MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017046	GATCA	2	10	162686	162695	40 %	20 %	20 %	20 %	383494961
3002	NC_017046	TGT	2	6	162771	162776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494961
3003	NC_017046	GCC	2	6	162821	162826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494961
3004	NC_017046	GCT	2	6	162877	162882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494961
3005	NC_017046	CCG	2	6	162916	162921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494961
3006	NC_017046	CTG	2	6	162929	162934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494961
3007	NC_017046	GCT	2	6	162997	163002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494961
3008	NC_017046	CAG	2	6	163019	163024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494961
3009	NC_017046	A	6	6	163080	163085	100 %	0 %	0 %	0 %	383494961
3010	NC_017046	TTA	2	6	163304	163309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494962
3011	NC_017046	GC	3	6	163336	163341	0 %	0 %	50 %	50 %	383494962
3012	NC_017046	CG	3	6	163383	163388	0 %	0 %	50 %	50 %	383494962
3013	NC_017046	CAT	2	6	163392	163397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494962
3014	NC_017046	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	383494962
3015	NC_017046	ACC	2	6	163442	163447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494962
3016	NC_017046	CAG	2	6	163486	163491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3017	NC_017046	CTG	2	6	163525	163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3018	NC_017046	CTG	2	6	163549	163554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494962
3019	NC_017046	TTC	2	6	163591	163596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494962
3020	NC_017046	A	6	6	163605	163610	100 %	0 %	0 %	0 %	383494962
3021	NC_017046	CGG	2	6	163647	163652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494962
3022	NC_017046	GGGC	2	8	163692	163699	0 %	0 %	75 %	25 %	383494962
3023	NC_017046	GAA	2	6	164065	164070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3024	NC_017046	CTG	2	6	164273	164278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3025	NC_017046	GAA	2	6	164299	164304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3026	NC_017046	A	6	6	164387	164392	100 %	0 %	0 %	0 %	383494963
3027	NC_017046	TCG	2	6	164477	164482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3028	NC_017046	ACG	2	6	164614	164619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3029	NC_017046	CGG	2	6	164654	164659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3030	NC_017046	GGC	2	6	164713	164718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3031	NC_017046	GGC	3	9	164752	164760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3032	NC_017046	GGC	2	6	164779	164784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3033	NC_017046	AG	3	6	164802	164807	50 %	0 %	50 %	0 %	383494963
3034	NC_017046	CGG	2	6	164808	164813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3035	NC_017046	AGA	2	6	164823	164828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3036	NC_017046	CGG	2	6	164892	164897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3037	NC_017046	CG	3	6	164911	164916	0 %	0 %	50 %	50 %	383494963
3038	NC_017046	CAC	2	6	165045	165050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494963
3039	NC_017046	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	383494964
3040	NC_017046	TGA	2	6	165213	165218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3041	NC_017046	GCCAGC	2	12	165257	165268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383494964
3042	NC_017046	GCA	2	6	165300	165305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3043	NC_017046	T	6	6	165377	165382	0 %	100 %	0 %	0 %	383494964
3044	NC_017046	GAA	2	6	165489	165494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3045	NC_017046	AGA	2	6	165590	165595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3046	NC_017046	CGCTGC	2	12	165596	165607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383494964
3047	NC_017046	AAT	2	6	165712	165717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494964
3048	NC_017046	AGA	2	6	165728	165733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3049	NC_017046	GGC	2	6	165763	165768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3050	NC_017046	GCA	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3051	NC_017046	GGC	2	6	165811	165816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3052	NC_017046	AAT	2	6	165826	165831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494964
3053	NC_017046	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	383494964
3054	NC_017046	AGC	2	6	165906	165911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3055	NC_017046	ATC	2	6	165947	165952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494964
3056	NC_017046	GCG	2	6	165963	165968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3057	NC_017046	ATGA	2	8	166117	166124	50 %	25 %	25 %	0 %	383494964
3058	NC_017046	TGA	2	6	166136	166141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3059	NC_017046	CTT	2	6	166161	166166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494964
3060	NC_017046	GCG	2	6	166175	166180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3061	NC_017046	TGA	2	6	166233	166238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3062	NC_017046	TGCC	2	8	166562	166569	0 %	25 %	25 %	50 %	383494965
3063	NC_017046	CAC	2	6	166607	166612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3064	NC_017046	ACC	2	6	166671	166676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3065	NC_017046	ATC	2	6	166695	166700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494965
3066	NC_017046	TGC	2	6	166719	166724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494965
3067	NC_017046	TGG	2	6	166744	166749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494965
3068	NC_017046	GCC	2	6	166791	166796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494965
3069	NC_017046	ATG	3	9	166842	166850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3070	NC_017046	GC	4	8	166870	166877	0 %	0 %	50 %	50 %	383494965
3071	NC_017046	GGAT	2	8	166908	166915	25 %	25 %	50 %	0 %	383494965
3072	NC_017046	GC	3	6	167002	167007	0 %	0 %	50 %	50 %	383494965
3073	NC_017046	CAA	2	6	167153	167158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494965
3074	NC_017046	GAC	2	6	167165	167170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494965
3075	NC_017046	CTT	2	6	167179	167184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494965
3076	NC_017046	CGCC	2	8	167221	167228	0 %	0 %	25 %	75 %	383494965
3077	NC_017046	GAA	2	6	167350	167355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494965
3078	NC_017046	GAT	2	6	167521	167526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3079	NC_017046	CA	3	6	167550	167555	50 %	0 %	0 %	50 %	383494965
3080	NC_017046	ACC	2	6	167619	167624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3081	NC_017046	TGA	2	6	167667	167672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3082	NC_017046	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	383494965
3083	NC_017046	TGT	2	6	167754	167759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494966
3084	NC_017046	CCAG	2	8	167795	167802	25 %	0 %	25 %	50 %	383494966
3085	NC_017046	GGCG	2	8	167825	167832	0 %	0 %	75 %	25 %	383494966
3086	NC_017046	ATG	2	6	167835	167840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
3087	NC_017046	TGA	2	6	167878	167883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
3088	NC_017046	TGA	2	6	167920	167925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
3089	NC_017046	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	383494966
3090	NC_017046	CCA	2	6	167970	167975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494966
3091	NC_017046	GAT	2	6	168098	168103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
3092	NC_017046	GTT	2	6	168142	168147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494966
3093	NC_017046	GA	3	6	168392	168397	50 %	0 %	50 %	0 %	383494967
3094	NC_017046	GC	4	8	168402	168409	0 %	0 %	50 %	50 %	383494967
3095	NC_017046	GC	3	6	168423	168428	0 %	0 %	50 %	50 %	383494967
3096	NC_017046	ATA	2	6	168572	168577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494967
3097	NC_017046	CGAAC	2	10	168680	168689	40 %	0 %	20 %	40 %	383494967
3098	NC_017046	ATA	2	6	168698	168703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494967
3099	NC_017046	GAT	2	6	168744	168749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494967
3100	NC_017046	GCC	3	9	168754	168762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494967
3101	NC_017046	GCCA	2	8	168838	168845	25 %	0 %	25 %	50 %	383494967
3102	NC_017046	GCG	2	6	168859	168864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
3103	NC_017046	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	383494967
3104	NC_017046	TTGG	2	8	168964	168971	0 %	50 %	50 %	0 %	383494967
3105	NC_017046	CAT	2	6	169014	169019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494967
3106	NC_017046	CGCC	2	8	169020	169027	0 %	0 %	25 %	75 %	383494967
3107	NC_017046	CGG	2	6	169191	169196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
3108	NC_017046	GTCG	2	8	169236	169243	0 %	25 %	50 %	25 %	383494967
3109	NC_017046	GGC	2	6	169262	169267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
3110	NC_017046	GTTG	2	8	169373	169380	0 %	50 %	50 %	0 %	383494968
3111	NC_017046	TGG	2	6	169448	169453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494968
3112	NC_017046	ATA	2	6	169457	169462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494968
3113	NC_017046	C	6	6	169471	169476	0 %	0 %	0 %	100 %	383494968
3114	NC_017046	ATT	2	6	169506	169511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494968
3115	NC_017046	T	7	7	169542	169548	0 %	100 %	0 %	0 %	383494968
3116	NC_017046	TCG	2	6	169590	169595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494968
3117	NC_017046	GCGT	2	8	169632	169639	0 %	25 %	50 %	25 %	383494968
3118	NC_017046	CAG	2	6	169747	169752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494968
3119	NC_017046	GCC	2	6	169756	169761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494968
3120	NC_017046	GCTA	2	8	169780	169787	25 %	25 %	25 %	25 %	383494968
3121	NC_017046	TCG	2	6	169897	169902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494968
3122	NC_017046	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	383494968
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3237	NC_017046	CAT	2	6	176512	176517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494974
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3239	NC_017046	GC	3	6	176527	176532	0 %	0 %	50 %	50 %	383494974
3240	NC_017046	A	6	6	176537	176542	100 %	0 %	0 %	0 %	383494974
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3242	NC_017046	ATG	2	6	176595	176600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494974
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3471	NC_017046	A	6	6	186533	186538	100 %	0 %	0 %	0 %	383494981
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3482	NC_017046	GGTC	2	8	187015	187022	0 %	25 %	50 %	25 %	383494981
3483	NC_017046	TCCG	2	8	187044	187051	0 %	25 %	25 %	50 %	383494981
3484	NC_017046	TAC	2	6	187096	187101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494981
3485	NC_017046	CGA	2	6	187117	187122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3486	NC_017046	CCG	2	6	187152	187157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
3487	NC_017046	CAC	2	6	187213	187218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
3488	NC_017046	CAC	2	6	187220	187225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
3489	NC_017046	TC	3	6	187260	187265	0 %	50 %	0 %	50 %	383494981
3490	NC_017046	TGC	3	9	187308	187316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3491	NC_017046	CGG	2	6	187333	187338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
3492	NC_017046	CGG	2	6	187377	187382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494981
3493	NC_017046	TCTGG	2	10	187385	187394	0 %	40 %	40 %	20 %	383494981
3494	NC_017046	GCC	2	6	187403	187408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
3495	NC_017046	CTG	2	6	187535	187540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3496	NC_017046	GAA	2	6	187549	187554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494981
3497	NC_017046	TCT	2	6	187569	187574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494981
3498	NC_017046	CCG	2	6	187647	187652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494981
3499	NC_017046	TTG	2	6	187698	187703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494981
3500	NC_017046	CTG	2	6	187727	187732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981

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