MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017046	TGA	2	6	52448	52453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494868
1003	NC_017046	CAT	2	6	52461	52466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494868
1004	NC_017046	TCT	2	6	52783	52788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494869
1005	NC_017046	TCA	2	6	52796	52801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494869
1006	NC_017046	TTAACC	2	12	52815	52826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494869
1007	NC_017046	GT	3	6	52920	52925	0 %	50 %	50 %	0 %	383494870
1008	NC_017046	GAA	2	6	52990	52995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494870
1009	NC_017046	GGT	3	9	53016	53024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494870
1010	NC_017046	GCG	2	6	53123	53128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494870
1011	NC_017046	TGTGC	2	10	53136	53145	0 %	40 %	40 %	20 %	383494870
1012	NC_017046	CGC	2	6	53158	53163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494870
1013	NC_017046	CTG	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494870
1014	NC_017046	GAT	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494870
1015	NC_017046	CG	3	6	53266	53271	0 %	0 %	50 %	50 %	383494870
1016	NC_017046	TTA	2	6	53284	53289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494870
1017	NC_017046	GGC	2	6	53347	53352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494870
1018	NC_017046	AGT	2	6	53362	53367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494870
1019	NC_017046	CTG	2	6	53419	53424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494870
1020	NC_017046	CGA	2	6	53463	53468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494870
1021	NC_017046	TGGC	2	8	53615	53622	0 %	25 %	50 %	25 %	383494870
1022	NC_017046	CAA	2	6	53629	53634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494870
1023	NC_017046	CTG	2	6	53647	53652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494870
1024	NC_017046	AGC	2	6	53717	53722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494870
1025	NC_017046	TGA	2	6	53736	53741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494870
1026	NC_017046	T	6	6	53785	53790	0 %	100 %	0 %	0 %	383494870
1027	NC_017046	TGA	2	6	53854	53859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1028	NC_017046	GCG	2	6	53908	53913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494871
1029	NC_017046	GAT	3	9	53955	53963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1030	NC_017046	CAT	2	6	53972	53977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494871
1031	NC_017046	A	6	6	53988	53993	100 %	0 %	0 %	0 %	383494871
1032	NC_017046	A	7	7	53997	54003	100 %	0 %	0 %	0 %	383494871
1033	NC_017046	ATG	2	6	54016	54021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1034	NC_017046	GCA	2	6	54040	54045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1035	NC_017046	CAT	2	6	54347	54352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494871
1036	NC_017046	CG	3	6	54354	54359	0 %	0 %	50 %	50 %	383494871
1037	NC_017046	GCGGAA	2	12	54441	54452	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383494871
1038	NC_017046	ACC	2	6	54576	54581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494871
1039	NC_017046	CTG	2	6	54762	54767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1040	NC_017046	CTG	2	6	55011	55016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1041	NC_017046	GC	3	6	55027	55032	0 %	0 %	50 %	50 %	383494871
1042	NC_017046	A	6	6	55045	55050	100 %	0 %	0 %	0 %	383494871
1043	NC_017046	GCA	2	6	55052	55057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1044	NC_017046	CG	3	6	55101	55106	0 %	0 %	50 %	50 %	383494871
1045	NC_017046	AAG	2	6	55135	55140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494871
1046	NC_017046	GCT	2	6	55307	55312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1047	NC_017046	GGC	2	6	55331	55336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494871
1048	NC_017046	GTG	2	6	55382	55387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494871
1049	NC_017046	GTTTG	2	10	55458	55467	0 %	60 %	40 %	0 %	383494871
1050	NC_017046	CCA	2	6	55477	55482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494871
1051	NC_017046	TGC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1052	NC_017046	TCC	2	6	55575	55580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494871
1053	NC_017046	TGA	2	6	55582	55587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1054	NC_017046	TGA	2	6	55708	55713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1055	NC_017046	TGC	2	6	55802	55807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1056	NC_017046	TCG	2	6	55817	55822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1057	NC_017046	CG	3	6	55835	55840	0 %	0 %	50 %	50 %	383494871
1058	NC_017046	CTG	2	6	55845	55850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1059	NC_017046	TGG	2	6	55903	55908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494871
1060	NC_017046	GCA	2	6	55946	55951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1061	NC_017046	GTTC	2	8	56032	56039	0 %	50 %	25 %	25 %	383494871
1062	NC_017046	CAT	2	6	56048	56053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494871
1063	NC_017046	CG	3	6	56090	56095	0 %	0 %	50 %	50 %	383494871
1064	NC_017046	TGA	2	6	56174	56179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1065	NC_017046	ACG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1066	NC_017046	GTT	2	6	56243	56248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494871
1067	NC_017046	GAA	2	6	56265	56270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494871
1068	NC_017046	CAA	2	6	56318	56323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494871
1069	NC_017046	AAG	2	6	56415	56420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494871
1070	NC_017046	G	6	6	56489	56494	0 %	0 %	100 %	0 %	383494871
1071	NC_017046	TGA	3	9	56498	56506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1072	NC_017046	GCT	2	6	56581	56586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494871
1073	NC_017046	CACTA	2	10	56589	56598	40 %	20 %	0 %	40 %	383494871
1074	NC_017046	AAC	2	6	56671	56676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494871
1075	NC_017046	TGA	2	6	56688	56693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494871
1076	NC_017046	GTA	2	6	56735	56740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494872
1077	NC_017046	GCA	2	6	56763	56768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494872
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1079	NC_017046	GCG	2	6	56880	56885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494872
1080	NC_017046	TGA	2	6	56943	56948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494872
1081	NC_017046	ATC	2	6	56999	57004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494872
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1083	NC_017046	GC	3	6	57009	57014	0 %	0 %	50 %	50 %	383494872
1084	NC_017046	TGT	2	6	57049	57054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494872
1085	NC_017046	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	383494872
1086	NC_017046	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	383494873
1087	NC_017046	GAT	2	6	57402	57407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494873
1088	NC_017046	CGG	2	6	57415	57420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494873
1089	NC_017046	AGCC	2	8	57442	57449	25 %	0 %	25 %	50 %	383494873
1090	NC_017046	AGC	3	9	57490	57498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494873
1091	NC_017046	AAG	2	6	57511	57516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494873
1092	NC_017046	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	383494873
1093	NC_017046	CGC	2	6	57548	57553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494873
1094	NC_017046	GGC	2	6	57608	57613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494873
1095	NC_017046	ATGG	2	8	57654	57661	25 %	25 %	50 %	0 %	383494873
1096	NC_017046	TTG	2	6	57858	57863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494874
1097	NC_017046	GC	3	6	57885	57890	0 %	0 %	50 %	50 %	383494874
1098	NC_017046	GC	4	8	58115	58122	0 %	0 %	50 %	50 %	383494874
1099	NC_017046	G	6	6	58211	58216	0 %	0 %	100 %	0 %	383494874
1100	NC_017046	TGG	2	6	58224	58229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494874
1101	NC_017046	TGAT	2	8	58326	58333	25 %	50 %	25 %	0 %	383494874
1102	NC_017046	TCG	2	6	58359	58364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494874
1103	NC_017046	TGG	2	6	58449	58454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494874
1104	NC_017046	TCTAAC	2	12	58472	58483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494874
1105	NC_017046	GAA	2	6	58512	58517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494874
1106	NC_017046	CGA	2	6	58531	58536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494874
1107	NC_017046	GCG	2	6	58538	58543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494874
1108	NC_017046	AGG	2	6	58551	58556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494874
1109	NC_017046	GCC	2	6	58571	58576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494874
1110	NC_017046	GGC	3	9	58652	58660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494874
1111	NC_017046	GAA	2	6	58685	58690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494874
1112	NC_017046	AAAAT	2	10	58953	58962	80 %	20 %	0 %	0 %	383494875
1113	NC_017046	TGGA	2	8	58995	59002	25 %	25 %	50 %	0 %	383494875
1114	NC_017046	CAA	2	6	59005	59010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494875
1115	NC_017046	CCTG	2	8	59031	59038	0 %	25 %	25 %	50 %	383494875
1116	NC_017046	CT	3	6	59105	59110	0 %	50 %	0 %	50 %	383494875
1117	NC_017046	GAA	2	6	59199	59204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494875
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1119	NC_017046	A	6	6	59283	59288	100 %	0 %	0 %	0 %	383494875
1120	NC_017046	CACGAA	2	12	59351	59362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383494875
1121	NC_017046	GATT	2	8	59393	59400	25 %	50 %	25 %	0 %	383494875
1122	NC_017046	G	6	6	59509	59514	0 %	0 %	100 %	0 %	383494875
1123	NC_017046	GCG	2	6	59701	59706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494875
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