MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 87478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017046	CG	3	6	264131	264136	0 %	0 %	50 %	50 %	383495047
5002	NC_017046	TAC	2	6	264181	264186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495047
5003	NC_017046	GTGG	2	8	264237	264244	0 %	25 %	75 %	0 %	383495047
5004	NC_017046	GGC	2	6	264283	264288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495047
5005	NC_017046	GGT	2	6	264322	264327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495047
5006	NC_017046	CGTG	2	8	264336	264343	0 %	25 %	50 %	25 %	383495047
5007	NC_017046	ATG	2	6	264413	264418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495047
5008	NC_017046	GAT	2	6	264457	264462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495047
5009	NC_017046	GGT	2	6	264469	264474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495047
5010	NC_017046	TTA	2	6	264503	264508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495047
5011	NC_017046	TCA	2	6	264521	264526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495047
5012	NC_017046	CCT	2	6	264554	264559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495047
5013	NC_017046	TCT	2	6	264560	264565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495047
5014	NC_017046	TCT	2	6	264704	264709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495047
5015	NC_017046	TTA	2	6	264921	264926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495048
5016	NC_017046	GCT	2	6	264966	264971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495048
5017	NC_017046	AGA	2	6	265021	265026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495048
5018	NC_017046	A	6	6	265081	265086	100 %	0 %	0 %	0 %	383495048
5019	NC_017046	TCG	2	6	265226	265231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495048
5020	NC_017046	GAA	2	6	265239	265244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495048
5021	NC_017046	CAA	2	6	265247	265252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495048
5022	NC_017046	A	6	6	265281	265286	100 %	0 %	0 %	0 %	383495048
5023	NC_017046	TGG	2	6	265312	265317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495048
5024	NC_017046	ACA	2	6	265339	265344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495048
5025	NC_017046	TCA	2	6	265468	265473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495049
5026	NC_017046	CAA	2	6	265498	265503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495049
5027	NC_017046	GCG	2	6	265611	265616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495049
5028	NC_017046	CG	3	6	265646	265651	0 %	0 %	50 %	50 %	383495049
5029	NC_017046	TAC	2	6	265670	265675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495049
5030	NC_017046	TGAT	2	8	265711	265718	25 %	50 %	25 %	0 %	383495049
5031	NC_017046	TCG	2	6	265819	265824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495049
5032	NC_017046	A	6	6	265826	265831	100 %	0 %	0 %	0 %	383495049
5033	NC_017046	TCCAG	2	10	265912	265921	20 %	20 %	20 %	40 %	383495049
5034	NC_017046	ATT	2	6	266001	266006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495049
5035	NC_017046	ACC	2	6	266034	266039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495049
5036	NC_017046	GAT	2	6	266058	266063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495049
5037	NC_017046	ATT	2	6	266085	266090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495049
5038	NC_017046	CGT	2	6	266117	266122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495049
5039	NC_017046	GGC	2	6	266199	266204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495049
5040	NC_017046	CTC	2	6	266300	266305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495049
5041	NC_017046	CAA	2	6	266324	266329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495049
5042	NC_017046	CTG	2	6	266344	266349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495049
5043	NC_017046	TGA	2	6	266356	266361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495049
5044	NC_017046	TGA	2	6	266366	266371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495049
5045	NC_017046	CAA	2	6	266412	266417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495049
5046	NC_017046	ACT	2	6	266532	266537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495050
5047	NC_017046	GAA	2	6	266625	266630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495050
5048	NC_017046	TGCG	2	8	266641	266648	0 %	25 %	50 %	25 %	383495050
5049	NC_017046	TAT	2	6	266799	266804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495050
5050	NC_017046	TGA	2	6	266816	266821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495050
5051	NC_017046	GC	3	6	266823	266828	0 %	0 %	50 %	50 %	383495050
5052	NC_017046	GGT	2	6	266840	266845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495050
5053	NC_017046	GAT	2	6	266858	266863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495050
5054	NC_017046	ATG	2	6	266955	266960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495050
5055	NC_017046	TG	3	6	266959	266964	0 %	50 %	50 %	0 %	383495050
5056	NC_017046	TGAT	2	8	266989	266996	25 %	50 %	25 %	0 %	383495051
5057	NC_017046	TTG	2	6	267079	267084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495051
5058	NC_017046	GTGAA	2	10	267193	267202	40 %	20 %	40 %	0 %	383495051
5059	NC_017046	CTG	2	6	267333	267338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495051
5060	NC_017046	GGTA	2	8	267371	267378	25 %	25 %	50 %	0 %	383495051
5061	NC_017046	CAA	2	6	267395	267400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495051
5062	NC_017046	GAT	2	6	267429	267434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495051
5063	NC_017046	ATC	2	6	267441	267446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495051
5064	NC_017046	TCA	2	6	267464	267469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495051
5065	NC_017046	CGG	2	6	267500	267505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495051
5066	NC_017046	TGG	2	6	267622	267627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495051
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5068	NC_017046	CGA	2	6	267674	267679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495051
5069	NC_017046	CG	3	6	267757	267762	0 %	0 %	50 %	50 %	383495051
5070	NC_017046	GGC	2	6	267778	267783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495052
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5072	NC_017046	TTG	2	6	267969	267974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495052
5073	NC_017046	TTG	2	6	267998	268003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495052
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5076	NC_017046	CATT	2	8	268126	268133	25 %	50 %	0 %	25 %	383495052
5077	NC_017046	CCGT	2	8	268142	268149	0 %	25 %	25 %	50 %	383495052
5078	NC_017046	ATGCC	2	10	268284	268293	20 %	20 %	20 %	40 %	383495052
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5080	NC_017046	CG	3	6	268317	268322	0 %	0 %	50 %	50 %	383495052
5081	NC_017046	TGC	2	6	268428	268433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495052
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5084	NC_017046	GC	3	6	268556	268561	0 %	0 %	50 %	50 %	383495052
5085	NC_017046	GAT	2	6	268567	268572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495052
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5087	NC_017046	CGG	2	6	268605	268610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495052
5088	NC_017046	CTGG	2	8	268675	268682	0 %	25 %	50 %	25 %	383495052
5089	NC_017046	CTG	2	6	268724	268729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495052
5090	NC_017046	CAG	2	6	268862	268867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495052
5091	NC_017046	GGC	2	6	268891	268896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495052
5092	NC_017046	CA	3	6	268940	268945	50 %	0 %	0 %	50 %	383495053
5093	NC_017046	TGG	2	6	268988	268993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495053
5094	NC_017046	CCG	3	9	269006	269014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495053
5095	NC_017046	TCG	2	6	269039	269044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495053
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5101	NC_017046	GC	3	6	269196	269201	0 %	0 %	50 %	50 %	383495053
5102	NC_017046	GTG	2	6	269284	269289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495053
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5105	NC_017046	GCA	2	6	269400	269405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495053
5106	NC_017046	CAC	2	6	269464	269469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495053
5107	NC_017046	GGC	2	6	269630	269635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495054
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5111	NC_017046	AAT	2	6	269808	269813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495054
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5121	NC_017046	ATT	2	6	270238	270243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495054
5122	NC_017046	GCA	2	6	270248	270253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495054
5123	NC_017046	GAA	3	9	270267	270275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495054
5124	NC_017046	ACC	2	6	270399	270404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495054
5125	NC_017046	A	6	6	270420	270425	100 %	0 %	0 %	0 %	383495054
5126	NC_017046	GAA	2	6	270471	270476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495054
5127	NC_017046	TGG	2	6	270646	270651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495054
5128	NC_017046	CTG	2	6	270696	270701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495054
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5130	NC_017046	GCC	2	6	270929	270934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495054
5131	NC_017046	GGC	2	6	271077	271082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495054
5132	NC_017046	ATC	2	6	271230	271235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495054
5133	NC_017046	GAT	2	6	271250	271255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495054
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5138	NC_017046	TGC	2	6	271336	271341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495054
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5140	NC_017046	CG	3	6	271378	271383	0 %	0 %	50 %	50 %	383495054
5141	NC_017046	TGG	2	6	271441	271446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495054
5142	NC_017046	GAA	2	6	271515	271520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495054
5143	NC_017046	CT	3	6	271521	271526	0 %	50 %	0 %	50 %	383495054
5144	NC_017046	GCA	2	6	271544	271549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495054
5145	NC_017046	CAT	2	6	271586	271591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495054
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5149	NC_017046	GAA	2	6	271722	271727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495054
5150	NC_017046	TGG	2	6	271780	271785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495054
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5152	NC_017046	GGC	2	6	271889	271894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495054
5153	NC_017046	TGA	2	6	271897	271902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495054
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5165	NC_017046	TGA	2	6	272233	272238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495054
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5175	NC_017046	TGA	2	6	272819	272824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495054
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5182	NC_017046	GC	3	6	273234	273239	0 %	0 %	50 %	50 %	383495055
5183	NC_017046	TGA	2	6	273284	273289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495055
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5186	NC_017046	TGA	2	6	273323	273328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495055
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5189	NC_017046	TGA	2	6	273373	273378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495055
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5195	NC_017046	TGC	2	6	273691	273696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495055
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5202	NC_017046	GCT	2	6	273902	273907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495055
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5205	NC_017046	CGT	2	6	273957	273962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495055
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5213	NC_017046	TACT	2	8	274495	274502	25 %	50 %	0 %	25 %	383495056
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5224	NC_017046	CTA	2	6	275131	275136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495056
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5236	NC_017046	TAA	2	6	275936	275941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495056
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5240	NC_017046	GCG	2	6	276171	276176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495057
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5242	NC_017046	T	6	6	276317	276322	0 %	100 %	0 %	0 %	383495057
5243	NC_017046	GCTG	2	8	276337	276344	0 %	25 %	50 %	25 %	383495057
5244	NC_017046	TCA	2	6	276364	276369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495057
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5487	NC_017046	CTG	2	6	295751	295756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495073
5488	NC_017046	CCTG	2	8	295847	295854	0 %	25 %	25 %	50 %	383495073
5489	NC_017046	ATTA	2	8	295857	295864	50 %	50 %	0 %	0 %	383495073
5490	NC_017046	TA	3	6	295918	295923	50 %	50 %	0 %	0 %	383495074
5491	NC_017046	GTA	2	6	295978	295983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495074
5492	NC_017046	CAG	2	6	296026	296031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495074
5493	NC_017046	CCA	2	6	296034	296039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495074
5494	NC_017046	CG	3	6	296048	296053	0 %	0 %	50 %	50 %	383495074
5495	NC_017046	ATCA	2	8	296062	296069	50 %	25 %	0 %	25 %	383495074
5496	NC_017046	GTT	2	6	296112	296117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495074
5497	NC_017046	GAA	2	6	296138	296143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495074
5498	NC_017046	GGCGA	2	10	296288	296297	20 %	0 %	60 %	20 %	383495074
5499	NC_017046	GC	5	10	296326	296335	0 %	0 %	50 %	50 %	383495074
5500	NC_017046	TGA	2	6	296397	296402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495074

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