MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 31254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017040	AGCTA	2	10	233385	233394	40 %	20 %	20 %	20 %	383479421
4002	NC_017040	CAGA	2	8	233419	233426	50 %	0 %	25 %	25 %	383479421
4003	NC_017040	TGG	2	6	233465	233470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479421
4004	NC_017040	A	6	6	233473	233478	100 %	0 %	0 %	0 %	383479421
4005	NC_017040	ATA	2	6	233549	233554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479421
4006	NC_017040	AAG	2	6	233600	233605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479421
4007	NC_017040	AGC	2	6	233610	233615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
4008	NC_017040	CTA	2	6	233645	233650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
4009	NC_017040	AGAT	2	8	233795	233802	50 %	25 %	25 %	0 %	383479421
4010	NC_017040	ACT	2	6	233803	233808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
4011	NC_017040	GAAAC	2	10	233833	233842	60 %	0 %	20 %	20 %	383479421
4012	NC_017040	GCT	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479421
4013	NC_017040	TTG	2	6	233903	233908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479421
4014	NC_017040	TCT	2	6	234004	234009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479421
4015	NC_017040	TGA	2	6	234036	234041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479421
4016	NC_017040	ACA	2	6	234419	234424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479422
4017	NC_017040	A	6	6	234430	234435	100 %	0 %	0 %	0 %	383479422
4018	NC_017040	A	6	6	234502	234507	100 %	0 %	0 %	0 %	383479422
4019	NC_017040	GTT	2	6	234610	234615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479422
4020	NC_017040	TCGT	2	8	234665	234672	0 %	50 %	25 %	25 %	383479422
4021	NC_017040	ATA	2	6	234747	234752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479422
4022	NC_017040	TA	3	6	234820	234825	50 %	50 %	0 %	0 %	383479423
4023	NC_017040	GCT	2	6	234885	234890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479423
4024	NC_017040	AAG	2	6	234922	234927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479423
4025	NC_017040	ACA	2	6	234970	234975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479423
4026	NC_017040	GGT	2	6	235011	235016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479423
4027	NC_017040	CGT	2	6	235053	235058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479423
4028	NC_017040	ACA	2	6	235059	235064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479423
4029	NC_017040	GTTG	2	8	235075	235082	0 %	50 %	50 %	0 %	383479423
4030	NC_017040	GTG	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479423
4031	NC_017040	AC	3	6	235109	235114	50 %	0 %	0 %	50 %	383479423
4032	NC_017040	ACA	2	6	235156	235161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479423
4033	NC_017040	ACA	2	6	235800	235805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
4034	NC_017040	TAC	2	6	235818	235823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479424
4035	NC_017040	AC	3	6	235851	235856	50 %	0 %	0 %	50 %	383479424
4036	NC_017040	TGGA	2	8	235878	235885	25 %	25 %	50 %	0 %	383479424
4037	NC_017040	GCAAGA	2	12	235886	235897	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383479424
4038	NC_017040	ACA	2	6	235926	235931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
4039	NC_017040	CAT	2	6	235958	235963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479424
4040	NC_017040	AC	3	6	235966	235971	50 %	0 %	0 %	50 %	383479424
4041	NC_017040	TC	3	6	236007	236012	0 %	50 %	0 %	50 %	383479424
4042	NC_017040	CAA	2	6	236126	236131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
4043	NC_017040	CCAAT	2	10	236205	236214	40 %	20 %	0 %	40 %	383479424
4044	NC_017040	AGA	2	6	236228	236233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4045	NC_017040	GAA	2	6	236310	236315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4046	NC_017040	AGA	2	6	236324	236329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4047	NC_017040	TGA	2	6	236387	236392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
4048	NC_017040	TGA	3	9	236398	236406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
4049	NC_017040	GAA	2	6	236421	236426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4050	NC_017040	ACG	2	6	236434	236439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479424
4051	NC_017040	ATTG	2	8	236441	236448	25 %	50 %	25 %	0 %	383479424
4052	NC_017040	CAA	2	6	236464	236469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
4053	NC_017040	TTC	2	6	236481	236486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
4054	NC_017040	GAA	3	9	236613	236621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4055	NC_017040	TGA	2	6	236633	236638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
4056	NC_017040	TGAC	2	8	236671	236678	25 %	25 %	25 %	25 %	383479424
4057	NC_017040	TTC	2	6	236700	236705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
4058	NC_017040	ACA	2	6	236868	236873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
4059	NC_017040	TGA	2	6	236891	236896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
4060	NC_017040	CAAGA	2	10	236979	236988	60 %	0 %	20 %	20 %	383479424
4061	NC_017040	GAA	2	6	237015	237020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4062	NC_017040	AAAC	2	8	237040	237047	75 %	0 %	0 %	25 %	383479424
4063	NC_017040	TTG	2	6	237103	237108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479424
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4065	NC_017040	TTC	2	6	237204	237209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
4066	NC_017040	TGG	2	6	237221	237226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479424
4067	NC_017040	GAA	2	6	237270	237275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4068	NC_017040	TTCGAA	2	12	237285	237296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383479424
4069	NC_017040	TGG	2	6	237308	237313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479424
4070	NC_017040	GCA	2	6	237471	237476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479424
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4072	NC_017040	GAT	2	6	237530	237535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
4073	NC_017040	AGA	2	6	237557	237562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
4074	NC_017040	TCG	2	6	237596	237601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479424
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4081	NC_017040	TTG	2	6	238280	238285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479425
4082	NC_017040	AAG	2	6	238332	238337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479425
4083	NC_017040	TCA	2	6	238362	238367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479425
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4087	NC_017040	A	6	6	238496	238501	100 %	0 %	0 %	0 %	383479425
4088	NC_017040	GTT	2	6	238502	238507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479425
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4091	NC_017040	TAC	2	6	238606	238611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479425
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4093	NC_017040	TCG	2	6	238741	238746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479425
4094	NC_017040	TGC	2	6	238759	238764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479425
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4098	NC_017040	GCT	2	6	238931	238936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479425
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4104	NC_017040	TTG	2	6	239705	239710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479426
4105	NC_017040	CTTC	2	8	239715	239722	0 %	50 %	0 %	50 %	383479426
4106	NC_017040	CAAT	2	8	239728	239735	50 %	25 %	0 %	25 %	383479426
4107	NC_017040	GAT	2	6	239750	239755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479426
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4109	NC_017040	ACCA	2	8	239852	239859	50 %	0 %	0 %	50 %	383479426
4110	NC_017040	TCA	2	6	239886	239891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479426
4111	NC_017040	TGGCAA	2	12	239926	239937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383479426
4112	NC_017040	GTT	2	6	239941	239946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479426
4113	NC_017040	C	6	6	239951	239956	0 %	0 %	0 %	100 %	383479426
4114	NC_017040	TTTGG	2	10	239967	239976	0 %	60 %	40 %	0 %	383479426
4115	NC_017040	GGT	2	6	240062	240067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479426
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4118	NC_017040	CCAGAA	2	12	240258	240269	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383479426
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4121	NC_017040	AAT	2	6	240368	240373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479426
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4143	NC_017040	CAG	2	6	241331	241336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479427
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4242	NC_017040	ATTAC	2	10	247804	247813	40 %	40 %	0 %	20 %	383479432
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4248	NC_017040	CTAG	2	8	248218	248225	25 %	25 %	25 %	25 %	383479433
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4362	NC_017040	CAA	2	6	254316	254321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479438
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4490	NC_017040	TAAT	2	8	261253	261260	50 %	50 %	0 %	0 %	383479443
4491	NC_017040	GCT	2	6	261327	261332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479443
4492	NC_017040	TGAA	2	8	261337	261344	50 %	25 %	25 %	0 %	383479443
4493	NC_017040	CAT	2	6	261362	261367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479443
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4495	NC_017040	A	6	6	261421	261426	100 %	0 %	0 %	0 %	383479443
4496	NC_017040	ATG	2	6	261435	261440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479443
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