MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	CG	3	6	35	40	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
2	NC_016972	GC	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
3	NC_016972	CG	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
4	NC_016972	CG	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
5	NC_016972	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	386836022
6	NC_016972	TG	3	6	3502	3507	0 %	50 %	50 %	0 %	386836024
7	NC_016972	CG	3	6	3752	3757	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
8	NC_016972	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	386836024
9	NC_016972	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
10	NC_016972	GC	3	6	5210	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	386836025
11	NC_016972	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
12	NC_016972	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
13	NC_016972	GC	3	6	7274	7279	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
14	NC_016972	GC	3	6	7596	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
15	NC_016972	AG	3	6	9604	9609	50 %	0 %	50 %	0 %	386836029
16	NC_016972	GC	3	6	10293	10298	0 %	0 %	50 %	50 %	386836030
17	NC_016972	GC	3	6	11150	11155	0 %	0 %	50 %	50 %	386836031
18	NC_016972	CG	3	6	11621	11626	0 %	0 %	50 %	50 %	386836032
19	NC_016972	GC	3	6	12077	12082	0 %	0 %	50 %	50 %	386836032
20	NC_016972	CG	3	6	12455	12460	0 %	0 %	50 %	50 %	386836032
21	NC_016972	CG	4	8	13069	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	386836033
22	NC_016972	GC	3	6	15200	15205	0 %	0 %	50 %	50 %	386836036
23	NC_016972	GC	3	6	18277	18282	0 %	0 %	50 %	50 %	386836039
24	NC_016972	GC	3	6	19303	19308	0 %	0 %	50 %	50 %	386836039
25	NC_016972	GC	3	6	19516	19521	0 %	0 %	50 %	50 %	386836039
26	NC_016972	CG	4	8	22774	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
27	NC_016972	CG	3	6	22845	22850	0 %	0 %	50 %	50 %	386836044
28	NC_016972	CG	4	8	23673	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
29	NC_016972	CG	3	6	23899	23904	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
30	NC_016972	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
31	NC_016972	GC	3	6	25114	25119	0 %	0 %	50 %	50 %	386836046
32	NC_016972	GC	3	6	25298	25303	0 %	0 %	50 %	50 %	386836046
33	NC_016972	CG	3	6	25890	25895	0 %	0 %	50 %	50 %	386836047
34	NC_016972	GC	3	6	26179	26184	0 %	0 %	50 %	50 %	386836050
35	NC_016972	GA	3	6	26467	26472	50 %	0 %	50 %	0 %	386836050
36	NC_016972	GA	3	6	26570	26575	50 %	0 %	50 %	0 %	386836049
37	NC_016972	CT	3	6	26603	26608	0 %	50 %	0 %	50 %	386836049
38	NC_016972	CG	3	6	26924	26929	0 %	0 %	50 %	50 %	386836051
39	NC_016972	GC	3	6	27729	27734	0 %	0 %	50 %	50 %	386836052
40	NC_016972	GC	3	6	28249	28254	0 %	0 %	50 %	50 %	386836052
41	NC_016972	GC	3	6	28794	28799	0 %	0 %	50 %	50 %	386836052
42	NC_016972	CG	3	6	28898	28903	0 %	0 %	50 %	50 %	386836052
43	NC_016972	GC	3	6	30040	30045	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
44	NC_016972	GC	3	6	30305	30310	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
45	NC_016972	CG	3	6	30402	30407	0 %	0 %	50 %	50 %	386836053
46	NC_016972	CA	3	6	30540	30545	50 %	0 %	0 %	50 %	386836053
47	NC_016972	CG	3	6	32560	32565	0 %	0 %	50 %	50 %	386836055
48	NC_016972	CG	3	6	32927	32932	0 %	0 %	50 %	50 %	386836055
49	NC_016972	GC	3	6	33549	33554	0 %	0 %	50 %	50 %	386836056
50	NC_016972	AG	3	6	33869	33874	50 %	0 %	50 %	0 %	386836056
51	NC_016972	GT	3	6	33899	33904	0 %	50 %	50 %	0 %	386836056
52	NC_016972	GC	3	6	34395	34400	0 %	0 %	50 %	50 %	386836057
53	NC_016972	GC	3	6	35005	35010	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
54	NC_016972	GC	3	6	35491	35496	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
55	NC_016972	CG	3	6	35528	35533	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
56	NC_016972	GC	3	6	35599	35604	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
57	NC_016972	GC	3	6	35679	35684	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
58	NC_016972	GC	3	6	35970	35975	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
59	NC_016972	CG	4	8	37298	37305	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
60	NC_016972	GC	3	6	37390	37395	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
61	NC_016972	GC	3	6	37682	37687	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
62	NC_016972	GC	3	6	38206	38211	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
63	NC_016972	CG	3	6	38579	38584	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
64	NC_016972	GC	3	6	38608	38613	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
65	NC_016972	CG	3	6	38777	38782	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
66	NC_016972	CG	3	6	39227	39232	0 %	0 %	50 %	50 %	386836058
67	NC_016972	GC	3	6	40736	40741	0 %	0 %	50 %	50 %	386836059
68	NC_016972	CG	3	6	41528	41533	0 %	0 %	50 %	50 %	386836060
69	NC_016972	CA	3	6	41894	41899	50 %	0 %	0 %	50 %	386836061
70	NC_016972	GC	3	6	42452	42457	0 %	0 %	50 %	50 %	386836062
71	NC_016972	GC	3	6	42734	42739	0 %	0 %	50 %	50 %	386836063
72	NC_016972	GC	3	6	43563	43568	0 %	0 %	50 %	50 %	386836064
73	NC_016972	CG	3	6	43596	43601	0 %	0 %	50 %	50 %	386836064
74	NC_016972	CG	3	6	44284	44289	0 %	0 %	50 %	50 %	386836066
75	NC_016972	CG	3	6	44804	44809	0 %	0 %	50 %	50 %	386836066
76	NC_016972	GC	3	6	45397	45402	0 %	0 %	50 %	50 %	386836068
77	NC_016972	CG	3	6	45768	45773	0 %	0 %	50 %	50 %	386836068
78	NC_016972	CG	3	6	45918	45923	0 %	0 %	50 %	50 %	386836068
79	NC_016972	CG	3	6	46095	46100	0 %	0 %	50 %	50 %	386836068
80	NC_016972	GC	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	386836069
81	NC_016972	TG	3	6	46720	46725	0 %	50 %	50 %	0 %	386836069
82	NC_016972	GC	3	6	46981	46986	0 %	0 %	50 %	50 %	386836069
83	NC_016972	GC	3	6	47459	47464	0 %	0 %	50 %	50 %	386836069
84	NC_016972	GC	4	8	47554	47561	0 %	0 %	50 %	50 %	386836069
85	NC_016972	GA	3	6	48736	48741	50 %	0 %	50 %	0 %	386836071
86	NC_016972	GC	4	8	49692	49699	0 %	0 %	50 %	50 %	386836072
87	NC_016972	CG	3	6	50045	50050	0 %	0 %	50 %	50 %	386836073
88	NC_016972	AC	3	6	50229	50234	50 %	0 %	0 %	50 %	386836074
89	NC_016972	GC	3	6	50438	50443	0 %	0 %	50 %	50 %	386836074
90	NC_016972	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	386836074
91	NC_016972	GT	3	6	51672	51677	0 %	50 %	50 %	0 %	386836075
92	NC_016972	CG	3	6	52030	52035	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
93	NC_016972	CG	3	6	52449	52454	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
94	NC_016972	GC	3	6	52486	52491	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
95	NC_016972	GC	3	6	52729	52734	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
96	NC_016972	CA	3	6	53299	53304	50 %	0 %	0 %	50 %	386836075
97	NC_016972	GC	3	6	53365	53370	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
98	NC_016972	GC	3	6	53563	53568	0 %	0 %	50 %	50 %	386836075
99	NC_016972	GC	3	6	54364	54369	0 %	0 %	50 %	50 %	386836076
100	NC_016972	CG	3	6	55189	55194	0 %	0 %	50 %	50 %	386836077
101	NC_016972	TC	3	6	56455	56460	0 %	50 %	0 %	50 %	386836078
102	NC_016972	CG	4	8	57375	57382	0 %	0 %	50 %	50 %	386836079
103	NC_016972	TG	3	6	58435	58440	0 %	50 %	50 %	0 %	386836079
104	NC_016972	CG	3	6	59305	59310	0 %	0 %	50 %	50 %	386836080
105	NC_016972	GC	3	6	59652	59657	0 %	0 %	50 %	50 %	386836081
106	NC_016972	CG	4	8	59786	59793	0 %	0 %	50 %	50 %	386836081
107	NC_016972	CG	3	6	59802	59807	0 %	0 %	50 %	50 %	386836081
108	NC_016972	GC	3	6	61203	61208	0 %	0 %	50 %	50 %	386836082
109	NC_016972	CG	3	6	61664	61669	0 %	0 %	50 %	50 %	386836082
110	NC_016972	CG	3	6	61963	61968	0 %	0 %	50 %	50 %	386836082
111	NC_016972	GC	3	6	63965	63970	0 %	0 %	50 %	50 %	386836085
112	NC_016972	GC	4	8	64269	64276	0 %	0 %	50 %	50 %	386836086
113	NC_016972	CG	4	8	64319	64326	0 %	0 %	50 %	50 %	386836086
114	NC_016972	GC	3	6	64696	64701	0 %	0 %	50 %	50 %	386836087
115	NC_016972	CG	4	8	65132	65139	0 %	0 %	50 %	50 %	386836087
116	NC_016972	GC	3	6	65960	65965	0 %	0 %	50 %	50 %	386836088
117	NC_016972	CA	3	6	66089	66094	50 %	0 %	0 %	50 %	386836088
118	NC_016972	AG	3	6	69800	69805	50 %	0 %	50 %	0 %	386836093
119	NC_016972	TG	3	6	71246	71251	0 %	50 %	50 %	0 %	386836095
120	NC_016972	CG	3	6	72190	72195	0 %	0 %	50 %	50 %	386836096
121	NC_016972	GC	3	6	72287	72292	0 %	0 %	50 %	50 %	386836096
122	NC_016972	GC	3	6	72575	72580	0 %	0 %	50 %	50 %	386836096

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.