MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 1825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	TTGCGC	2	12	5774	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
2	NC_016940	TTCGGC	2	12	13662	13673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728149
3	NC_016940	TAACCA	2	12	13859	13870	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379728150
4	NC_016940	GCCGTA	2	12	20244	20255	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379728158
5	NC_016940	GCTGGA	2	12	21294	21305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379728159
6	NC_016940	CAATGC	2	12	21422	21433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728159
7	NC_016940	TATTGA	2	12	26183	26194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728163
8	NC_016940	TGGTCT	2	12	30917	30928	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728167
9	NC_016940	AAAGGA	2	12	31543	31554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728168
10	NC_016940	GCCGCT	2	12	31913	31924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379728168
11	NC_016940	AGCGGC	2	12	34241	34252	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379728171
12	NC_016940	CAGAAG	2	12	34670	34681	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728172
13	NC_016940	GGCCAA	2	12	36945	36956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728175
14	NC_016940	CAGGCG	2	12	37030	37041	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379728175
15	NC_016940	CTACAA	2	12	39707	39718	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379728177
16	NC_016940	TGAAAA	2	12	42724	42735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379728184
17	NC_016940	TAATTG	2	12	45214	45225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728187
18	NC_016940	GCCGCT	2	12	48868	48879	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379728191
19	NC_016940	CCTCTC	2	12	51461	51472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728193
20	NC_016940	CCAAGC	2	12	53579	53590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379728195
21	NC_016940	GCTTTA	2	12	58067	58078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728201
22	NC_016940	GGACCA	2	12	62337	62348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728205
23	NC_016940	GGGCAA	2	12	63237	63248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379728205
24	NC_016940	CTAGCG	2	12	64305	64316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379728206
25	NC_016940	TAAGGA	2	12	68665	68676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379728208
26	NC_016940	TTTAGA	2	12	68946	68957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728209
27	NC_016940	TCCAGT	2	12	73663	73674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728218
28	NC_016940	TTGGGG	2	12	75448	75459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728219
29	NC_016940	ATTGCC	2	12	77924	77935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728222
30	NC_016940	TTTTCC	2	12	78042	78053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728222
31	NC_016940	AGCAGT	2	12	79628	79639	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379728224
32	NC_016940	TGGAAA	2	12	80440	80451	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379728224
33	NC_016940	CAAATT	2	12	85882	85893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728233
34	NC_016940	AAAGGC	2	12	88352	88363	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728234
35	NC_016940	CAGCTT	2	12	89104	89115	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728235
36	NC_016940	AAAGAG	2	12	90852	90863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728237
37	NC_016940	CAAAAG	2	12	91454	91465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379728237
38	NC_016940	GCCTCT	2	12	92553	92564	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379728239
39	NC_016940	ATCAAT	2	12	96629	96640	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728244
40	NC_016940	ATTTTT	2	12	99675	99686	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379728248
41	NC_016940	GTTTTC	2	12	102270	102281	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728251
42	NC_016940	AGCTAT	2	12	104379	104390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379728253
43	NC_016940	CATTGG	2	12	106305	106316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379728253
44	NC_016940	GGAGGC	2	12	110457	110468	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	379728257
45	NC_016940	GCCTTC	2	12	110901	110912	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379728258
46	NC_016940	ATGAGG	2	12	111658	111669	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379728258
47	NC_016940	TCAACC	2	12	114496	114507	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379728262
48	NC_016940	GGTTTC	2	12	117130	117141	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728266
49	NC_016940	CCAAAG	2	12	122805	122816	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379728271
50	NC_016940	GCCATT	2	12	122955	122966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728271
51	NC_016940	AAAGAG	2	12	125966	125977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728276
52	NC_016940	CAAACC	2	12	129006	129017	50 %	0 %	0 %	50 %	379728281
53	NC_016940	TCGGCT	2	12	130054	130065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728281
54	NC_016940	GTTTTC	2	12	131319	131330	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728283
55	NC_016940	ACTCTT	2	12	131743	131754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379728283
56	NC_016940	GCGCAA	2	12	132656	132667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728283
57	NC_016940	TAGCCA	2	12	134201	134212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728285
58	NC_016940	CCCTGC	2	12	140240	140251	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	379728294
59	NC_016940	TTCTTG	2	12	157036	157047	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728299
60	NC_016940	TTTCTC	2	12	157495	157506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728299
61	NC_016940	ATGATA	2	12	157884	157895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379728299
62	NC_016940	TTCAAT	2	12	158413	158424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379728299
63	NC_016940	TATAGA	2	12	159242	159253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379728300
64	NC_016940	AAAGCC	2	12	162265	162276	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379728303
65	NC_016940	GGCTTT	2	12	164242	164253	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728305
66	NC_016940	TTCAAT	2	12	164333	164344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379728305
67	NC_016940	TTTCGA	2	12	165070	165081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728305
68	NC_016940	CAAAGG	2	12	165994	166005	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728306
69	NC_016940	ATGCGT	2	12	167256	167267	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379728307
70	NC_016940	TTGGGA	2	12	172057	172068	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379728311
71	NC_016940	CAGCCC	2	12	175265	175276	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379728311
72	NC_016940	CACTAT	2	12	179483	179494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728317
73	NC_016940	TGTAGT	2	12	180350	180361	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379728318
74	NC_016940	GCCAAT	2	12	181645	181656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728320
75	NC_016940	TAGCCT	2	12	181857	181868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728320
76	NC_016940	ATTGAT	2	12	183702	183713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728323
77	NC_016940	TCCAAT	2	12	186248	186259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728325
78	NC_016940	GCTTTT	2	12	188596	188607	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728327
79	NC_016940	CGAACT	2	12	191492	191503	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728330
80	NC_016940	TTTAAA	2	12	194914	194925	50 %	50 %	0 %	0 %	379728336
81	NC_016940	CTTTTT	2	12	196443	196454	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728339
82	NC_016940	TCATTG	2	12	198614	198625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728341
83	NC_016940	AGTTTC	2	12	205789	205800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728346
84	NC_016940	AGTTCT	2	12	206219	206230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728346
85	NC_016940	ACTATA	2	12	210452	210463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728351
86	NC_016940	AGAGCT	2	12	211128	211139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379728353
87	NC_016940	GTAACC	2	12	213041	213052	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379728354
88	NC_016940	ATCTAG	2	12	213172	213183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379728354
89	NC_016940	TTGCAC	2	12	215707	215718	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728354
90	NC_016940	TACCGT	2	12	219025	219036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728354
91	NC_016940	GCCGCA	2	12	221048	221059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379728354
92	NC_016940	TAGCCG	2	12	221250	221261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379728354
93	NC_016940	CAAAGG	2	12	221574	221585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728354
94	NC_016940	CGATGG	2	12	228224	228235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379728362
95	NC_016940	AAGCCG	2	12	229912	229923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728364
96	NC_016940	TGTTTC	2	12	232657	232668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728366
97	NC_016940	GCTTGA	2	12	232775	232786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379728366
98	NC_016940	TTGATG	2	12	240381	240392	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379728369
99	NC_016940	AAGCAA	2	12	241284	241295	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379728370
100	NC_016940	CCATTG	2	12	243012	243023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728373
101	NC_016940	ATGGGC	2	12	254168	254179	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379728388
102	NC_016940	AGCCTT	2	12	256778	256789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379728392
103	NC_016940	CAAAGG	2	12	261508	261519	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379728398
104	NC_016940	CCTTTT	2	12	261981	261992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728398
105	NC_016940	GCTTCG	2	12	264765	264776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728399
106	NC_016940	AAAAAG	2	12	265526	265537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379728400
107	NC_016940	CTCTTC	2	12	265576	265587	0 %	50 %	0 %	50 %	379728400
108	NC_016940	CAGCCG	2	12	267019	267030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379728402
109	NC_016940	TTTTTC	2	12	267935	267946	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379728404
110	NC_016940	GGATTG	2	12	269673	269684	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379728405
111	NC_016940	CCCCTT	2	12	270769	270780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728406
112	NC_016940	AAGAAA	2	12	275961	275972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379728412
113	NC_016940	TCTATT	2	12	278621	278632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379728415
114	NC_016940	CGGCCA	2	12	285494	285505	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379728422
115	NC_016940	GGAAGA	2	12	286275	286286	50 %	0 %	50 %	0 %	379728422
116	NC_016940	GGATTT	2	12	295612	295623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379728433
117	NC_016940	CTTCGG	2	12	301768	301779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728442
118	NC_016940	AAACTC	2	12	303335	303346	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379728444
119	NC_016940	TAGAAG	2	12	310260	310271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379728449
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122	NC_016940	TGCGTT	2	12	314067	314078	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728453
123	NC_016940	CTTTGG	2	12	314582	314593	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728453
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131	NC_016940	AAGAGG	2	12	350879	350890	50 %	0 %	50 %	0 %	379728492
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149	NC_016940	GGCTTT	2	12	391920	391931	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728540
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230	NC_016940	ATGCTT	2	12	562555	562566	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379728679
231	NC_016940	GCCTCC	2	12	566225	566236	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	379728684
232	NC_016940	ATAGGC	2	12	571184	571195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379728690
233	NC_016940	GATAGC	2	12	572171	572182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379728690
234	NC_016940	TCAAAA	2	12	572375	572386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379728691
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259	NC_016940	TGCCGC	2	12	649644	649655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379728781
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326	NC_016940	GTTCTT	2	12	787210	787221	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728895
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331	NC_016940	GCTTTT	2	12	799922	799933	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379728906
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336	NC_016940	TATTTG	2	12	814309	814320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379728920
337	NC_016940	GCCAAA	2	12	815055	815066	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379728922
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340	NC_016940	GCAACA	2	12	823161	823172	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379728931
341	NC_016940	TCGCCT	2	12	825856	825867	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379728933
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343	NC_016940	AAATCT	2	12	834839	834850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379728940
344	NC_016940	TTGGCA	2	12	838015	838026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379728945
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446	NC_016940	AGCTCC	2	12	1067869	1067880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379729165
447	NC_016940	CTATGT	2	12	1070579	1070590	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379729168
448	NC_016940	GTCAAA	2	12	1074490	1074501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379729170
449	NC_016940	GATGCC	2	12	1077307	1077318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379729172
450	NC_016940	GGCAAA	2	12	1083656	1083667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379729179
451	NC_016940	CCCGAA	2	12	1090224	1090235	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379729187
452	NC_016940	TTTTGC	2	12	1091848	1091859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379729189
453	NC_016940	TTTTGA	2	12	1101643	1101654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379729199
454	NC_016940	GGCGGG	2	12	1103332	1103343	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	379729200
455	NC_016940	TTCGGC	2	12	1103464	1103475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379729200
456	NC_016940	TGGCGA	2	12	1103713	1103724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379729200
457	NC_016940	TAAATT	2	12	1105307	1105318	50 %	50 %	0 %	0 %	379729201
458	NC_016940	AAGAGG	2	12	1108149	1108160	50 %	0 %	50 %	0 %	379729206
459	NC_016940	AAGAAA	2	12	1108337	1108348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379729206
460	NC_016940	GCCGAA	2	12	1109368	1109379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379729208
461	NC_016940	AAGGCC	2	12	1121413	1121424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379729221
462	NC_016940	GCTCAG	2	12	1121829	1121840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379729221
463	NC_016940	TACCGT	2	12	1125236	1125247	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379729223
464	NC_016940	ATTGAG	2	12	1125467	1125478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379729223
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481	NC_016940	AGCTAA	2	12	1179613	1179624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379729283
482	NC_016940	GCATTG	2	12	1185025	1185036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379729287
483	NC_016940	ACCTCT	2	12	1188220	1188231	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379729291
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489	NC_016940	ACCTTG	2	12	1197417	1197428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379729301
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499	NC_016940	GCCTAT	2	12	1224520	1224531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379729335
500	NC_016940	CTTTAG	2	12	1226511	1226522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379729335

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