MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 78235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016940	AGA	2	6	25514	25519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728163
502	NC_016940	A	6	6	25519	25524	100 %	0 %	0 %	0 %	379728163
503	NC_016940	TTG	2	6	25527	25532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728163
504	NC_016940	ACT	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728163
505	NC_016940	AGGC	2	8	25624	25631	25 %	0 %	50 %	25 %	379728163
506	NC_016940	AGC	2	6	25633	25638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728163
507	NC_016940	GCAG	2	8	25658	25665	25 %	0 %	50 %	25 %	379728163
508	NC_016940	ACA	2	6	25687	25692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728163
509	NC_016940	AAAAT	2	10	25753	25762	80 %	20 %	0 %	0 %	379728163
510	NC_016940	GAA	3	9	25791	25799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728163
511	NC_016940	T	7	7	25818	25824	0 %	100 %	0 %	0 %	379728163
512	NC_016940	TGA	2	6	25862	25867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728163
513	NC_016940	CGG	2	6	25870	25875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728163
514	NC_016940	TAT	2	6	25896	25901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728163
515	NC_016940	GA	3	6	25951	25956	50 %	0 %	50 %	0 %	379728163
516	NC_016940	CAA	2	6	26066	26071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728163
517	NC_016940	TCA	2	6	26099	26104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728163
518	NC_016940	GAT	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728163
519	NC_016940	GTT	2	6	26153	26158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728163
520	NC_016940	AATA	2	8	26172	26179	75 %	25 %	0 %	0 %	379728163
521	NC_016940	TATTGA	2	12	26183	26194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379728163
522	NC_016940	TTTG	2	8	26226	26233	0 %	75 %	25 %	0 %	379728163
523	NC_016940	AG	3	6	26397	26402	50 %	0 %	50 %	0 %	379728163
524	NC_016940	CGC	2	6	26524	26529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728163
525	NC_016940	A	6	6	26562	26567	100 %	0 %	0 %	0 %	379728163
526	NC_016940	AGC	2	6	26599	26604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728163
527	NC_016940	TGGC	2	8	26675	26682	0 %	25 %	50 %	25 %	379728163
528	NC_016940	TATG	2	8	26729	26736	25 %	50 %	25 %	0 %	379728163
529	NC_016940	GGC	2	6	26742	26747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728163
530	NC_016940	CAA	2	6	26786	26791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728163
531	NC_016940	CTA	2	6	26805	26810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728163
532	NC_016940	GCC	3	9	26928	26936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728163
533	NC_016940	TTGG	2	8	26986	26993	0 %	50 %	50 %	0 %	379728163
534	NC_016940	TC	3	6	27008	27013	0 %	50 %	0 %	50 %	379728163
535	NC_016940	TAA	2	6	27035	27040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728163
536	NC_016940	TATT	2	8	27195	27202	25 %	75 %	0 %	0 %	379728163
537	NC_016940	GAT	2	6	27219	27224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728163
538	NC_016940	TGC	2	6	27242	27247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728163
539	NC_016940	TCA	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728163
540	NC_016940	ATA	3	9	27271	27279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728163
541	NC_016940	CAG	2	6	27291	27296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728163
542	NC_016940	GGC	2	6	27327	27332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728163
543	NC_016940	AGTTT	2	10	27466	27475	20 %	60 %	20 %	0 %	379728164
544	NC_016940	CTG	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728164
545	NC_016940	AGC	2	6	27525	27530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728164
546	NC_016940	CTT	2	6	27533	27538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728164
547	NC_016940	CCT	2	6	27671	27676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728164
548	NC_016940	TCC	2	6	27685	27690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728164
549	NC_016940	GCT	2	6	27781	27786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728164
550	NC_016940	GCC	2	6	27820	27825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728164
551	NC_016940	CCA	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728164
552	NC_016940	GTC	2	6	27927	27932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728164
553	NC_016940	AGC	2	6	27978	27983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728164
554	NC_016940	CCA	2	6	28015	28020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728164
555	NC_016940	CT	3	6	28033	28038	0 %	50 %	0 %	50 %	379728164
556	NC_016940	GCT	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728164
557	NC_016940	TTC	2	6	28401	28406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728164
558	NC_016940	AACC	2	8	28411	28418	50 %	0 %	0 %	50 %	379728164
559	NC_016940	T	6	6	28482	28487	0 %	100 %	0 %	0 %	379728164
560	NC_016940	CTT	2	6	28634	28639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728164
561	NC_016940	TTC	2	6	28735	28740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728164
562	NC_016940	ACC	2	6	28999	29004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728164
563	NC_016940	TGG	2	6	29012	29017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728164
564	NC_016940	CAG	2	6	29057	29062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728164
565	NC_016940	CGG	2	6	29098	29103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728164
566	NC_016940	GCAC	2	8	29120	29127	25 %	0 %	25 %	50 %	379728164
567	NC_016940	T	6	6	29223	29228	0 %	100 %	0 %	0 %	379728165
568	NC_016940	GGC	2	6	29232	29237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728165
569	NC_016940	CTT	2	6	29255	29260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728165
570	NC_016940	TCT	2	6	29269	29274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728165
571	NC_016940	CAA	2	6	29283	29288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728165
572	NC_016940	CTT	2	6	29375	29380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728165
573	NC_016940	T	6	6	29379	29384	0 %	100 %	0 %	0 %	379728165
574	NC_016940	CTC	2	6	29409	29414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728165
575	NC_016940	CTC	2	6	29451	29456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728165
576	NC_016940	CAA	2	6	29531	29536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728165
577	NC_016940	GTT	2	6	29596	29601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728165
578	NC_016940	GCG	2	6	29631	29636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728165
579	NC_016940	CT	4	8	29691	29698	0 %	50 %	0 %	50 %	379728165
580	NC_016940	AGT	2	6	29746	29751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728165
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582	NC_016940	GCC	2	6	29888	29893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728166
583	NC_016940	T	6	6	29898	29903	0 %	100 %	0 %	0 %	379728166
584	NC_016940	GCC	2	6	29909	29914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728166
585	NC_016940	CTTG	2	8	30239	30246	0 %	50 %	25 %	25 %	379728167
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590	NC_016940	CTG	2	6	30569	30574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728167
591	NC_016940	CTC	2	6	30693	30698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728167
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593	NC_016940	CAT	2	6	30830	30835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728167
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595	NC_016940	CTG	2	6	30848	30853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728167
596	NC_016940	GGA	2	6	30867	30872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728167
597	NC_016940	GCT	2	6	30874	30879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728167
598	NC_016940	TGGTCT	2	12	30917	30928	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379728167
599	NC_016940	AGT	2	6	30933	30938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728167
600	NC_016940	ACTT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	0 %	25 %	379728167
601	NC_016940	GTT	2	6	30952	30957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728167
602	NC_016940	GCT	2	6	31034	31039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728167
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604	NC_016940	GC	3	6	31066	31071	0 %	0 %	50 %	50 %	379728167
605	NC_016940	CTT	2	6	31094	31099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728167
606	NC_016940	A	7	7	31453	31459	100 %	0 %	0 %	0 %	379728168
607	NC_016940	GTT	2	6	31474	31479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379728168
608	NC_016940	ATA	2	6	31486	31491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728168
609	NC_016940	AAAGGA	2	12	31543	31554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728168
610	NC_016940	GGGT	2	8	31583	31590	0 %	25 %	75 %	0 %	379728168
611	NC_016940	GGCG	2	8	31600	31607	0 %	0 %	75 %	25 %	379728168
612	NC_016940	ATG	2	6	31611	31616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728168
613	NC_016940	AAG	2	6	31626	31631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728168
614	NC_016940	CCA	2	6	31705	31710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728168
615	NC_016940	GTGA	2	8	31731	31738	25 %	25 %	50 %	0 %	379728168
616	NC_016940	TCG	2	6	31755	31760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728168
617	NC_016940	GGC	2	6	31778	31783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728168
618	NC_016940	AGC	2	6	31831	31836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728168
619	NC_016940	ATC	2	6	31887	31892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728168
620	NC_016940	TCT	3	9	31902	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728168
621	NC_016940	GCCGCT	2	12	31913	31924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379728168
622	NC_016940	GAT	2	6	32006	32011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728168
623	NC_016940	AAT	2	6	32042	32047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728168
624	NC_016940	CGA	2	6	32095	32100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728168
625	NC_016940	T	6	6	32110	32115	0 %	100 %	0 %	0 %	379728168
626	NC_016940	CAT	3	9	32174	32182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728168
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628	NC_016940	TCT	2	6	32232	32237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728168
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