MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 1860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	CAAAT	2	10	1471	1480	60 %	20 %	0 %	20 %	379019813
2	NC_016928	AATTT	2	10	2519	2528	40 %	60 %	0 %	0 %	379019814
3	NC_016928	CAATT	2	10	2585	2594	40 %	40 %	0 %	20 %	379019814
4	NC_016928	AAATT	2	10	2963	2972	60 %	40 %	0 %	0 %	379019814
5	NC_016928	CAAAT	2	10	5993	6002	60 %	20 %	0 %	20 %	379019818
6	NC_016928	TGAAT	2	10	7503	7512	40 %	40 %	20 %	0 %	379019818
7	NC_016928	TTCAA	2	10	8490	8499	40 %	40 %	0 %	20 %	379019819
8	NC_016928	ATCGC	2	10	10952	10961	20 %	20 %	20 %	40 %	379019820
9	NC_016928	CGTTG	2	10	12495	12504	0 %	40 %	40 %	20 %	379019821
10	NC_016928	TTATT	2	10	16205	16214	20 %	80 %	0 %	0 %	379019824
11	NC_016928	TTTGA	2	10	17538	17547	20 %	60 %	20 %	0 %	379019825
12	NC_016928	TCAAT	2	10	19675	19684	40 %	40 %	0 %	20 %	379019827
13	NC_016928	AGTTA	2	10	22853	22862	40 %	40 %	20 %	0 %	379019829
14	NC_016928	ATGTA	2	10	24412	24421	40 %	40 %	20 %	0 %	379019830
15	NC_016928	ACCAA	2	10	27016	27025	60 %	0 %	0 %	40 %	379019832
16	NC_016928	ATCAA	2	10	27728	27737	60 %	20 %	0 %	20 %	379019832
17	NC_016928	GAAAC	2	10	28349	28358	60 %	0 %	20 %	20 %	379019833
18	NC_016928	GAAGT	2	10	28499	28508	40 %	20 %	40 %	0 %	379019833
19	NC_016928	ATTAT	2	10	30142	30151	40 %	60 %	0 %	0 %	379019834
20	NC_016928	AACGA	2	10	30215	30224	60 %	0 %	20 %	20 %	379019834
21	NC_016928	AAACG	2	10	32048	32057	60 %	0 %	20 %	20 %	379019836
22	NC_016928	AAGGT	2	10	33220	33229	40 %	20 %	40 %	0 %	379019836
23	NC_016928	TATGA	2	10	33417	33426	40 %	40 %	20 %	0 %	379019836
24	NC_016928	GTTGT	2	10	33810	33819	0 %	60 %	40 %	0 %	379019836
25	NC_016928	CATTA	2	10	34647	34656	40 %	40 %	0 %	20 %	379019838
26	NC_016928	GAATA	2	10	35789	35798	60 %	20 %	20 %	0 %	379019840
27	NC_016928	ATAAA	2	10	36268	36277	80 %	20 %	0 %	0 %	379019840
28	NC_016928	AAATC	2	10	41129	41138	60 %	20 %	0 %	20 %	379019845
29	NC_016928	CAAAC	2	10	41242	41251	60 %	0 %	0 %	40 %	379019845
30	NC_016928	TATGA	2	10	41653	41662	40 %	40 %	20 %	0 %	379019847
31	NC_016928	AAGCT	2	10	42878	42887	40 %	20 %	20 %	20 %	379019847
32	NC_016928	CATGG	2	10	44883	44892	20 %	20 %	40 %	20 %	379019850
33	NC_016928	TGAAT	2	10	47026	47035	40 %	40 %	20 %	0 %	379019852
34	NC_016928	TTGGT	2	10	47068	47077	0 %	60 %	40 %	0 %	379019852
35	NC_016928	AATAT	2	10	47136	47145	60 %	40 %	0 %	0 %	379019852
36	NC_016928	TTCGT	2	10	47347	47356	0 %	60 %	20 %	20 %	379019852
37	NC_016928	CAAAA	2	10	47707	47716	80 %	0 %	0 %	20 %	379019853
38	NC_016928	AAATT	2	10	49806	49815	60 %	40 %	0 %	0 %	379019854
39	NC_016928	TCAAA	2	10	53109	53118	60 %	20 %	0 %	20 %	379019857
40	NC_016928	TGAAA	2	10	53328	53337	60 %	20 %	20 %	0 %	379019858
41	NC_016928	AAAAC	2	10	53692	53701	80 %	0 %	0 %	20 %	379019859
42	NC_016928	AAATC	2	10	54101	54110	60 %	20 %	0 %	20 %	379019859
43	NC_016928	AAACT	2	10	55323	55332	60 %	20 %	0 %	20 %	379019860
44	NC_016928	ATAAA	2	10	55429	55438	80 %	20 %	0 %	0 %	379019860
45	NC_016928	AATAA	2	10	55908	55917	80 %	20 %	0 %	0 %	379019860
46	NC_016928	AGCTA	2	10	56359	56368	40 %	20 %	20 %	20 %	379019861
47	NC_016928	TAGAT	2	10	56530	56539	40 %	40 %	20 %	0 %	379019861
48	NC_016928	TATGA	2	10	59497	59506	40 %	40 %	20 %	0 %	379019864
49	NC_016928	AAATA	2	10	60686	60695	80 %	20 %	0 %	0 %	379019864
50	NC_016928	TAAAT	2	10	61315	61324	60 %	40 %	0 %	0 %	379019865
51	NC_016928	ATACA	2	10	62045	62054	60 %	20 %	0 %	20 %	379019867
52	NC_016928	TCATA	2	10	64533	64542	40 %	40 %	0 %	20 %	379019869
53	NC_016928	TCGTT	2	10	64776	64785	0 %	60 %	20 %	20 %	379019869
54	NC_016928	AAGGT	2	10	65693	65702	40 %	20 %	40 %	0 %	379019869
55	NC_016928	TGATT	2	10	66727	66736	20 %	60 %	20 %	0 %	379019870
56	NC_016928	TGATT	2	10	69902	69911	20 %	60 %	20 %	0 %	379019872
57	NC_016928	GGGTT	2	10	70098	70107	0 %	40 %	60 %	0 %	379019872
58	NC_016928	GAAAA	2	10	70696	70705	80 %	0 %	20 %	0 %	379019872
59	NC_016928	TCTTT	2	10	73965	73974	0 %	80 %	0 %	20 %	379019875
60	NC_016928	AATTA	2	10	74521	74530	60 %	40 %	0 %	0 %	379019875
61	NC_016928	TACAG	2	10	76786	76795	40 %	20 %	20 %	20 %	379019876
62	NC_016928	ATAAA	2	10	77490	77499	80 %	20 %	0 %	0 %	379019876
63	NC_016928	TTTAA	2	10	77784	77793	40 %	60 %	0 %	0 %	379019877
64	NC_016928	AAAAT	2	10	78232	78241	80 %	20 %	0 %	0 %	379019877
65	NC_016928	ATTCC	2	10	79020	79029	20 %	40 %	0 %	40 %	379019878
66	NC_016928	TGTTT	2	10	80824	80833	0 %	80 %	20 %	0 %	379019881
67	NC_016928	TTTGC	2	10	80910	80919	0 %	60 %	20 %	20 %	379019881
68	NC_016928	ATTTT	2	10	84184	84193	20 %	80 %	0 %	0 %	379019886
69	NC_016928	TATGG	2	10	86197	86206	20 %	40 %	40 %	0 %	379019888
70	NC_016928	TAACT	2	10	86502	86511	40 %	40 %	0 %	20 %	379019888
71	NC_016928	ATTTA	2	10	87196	87205	40 %	60 %	0 %	0 %	379019889
72	NC_016928	CAGAA	2	10	87286	87295	60 %	0 %	20 %	20 %	379019889
73	NC_016928	TAAAT	2	10	87781	87790	60 %	40 %	0 %	0 %	379019889
74	NC_016928	AATTA	2	10	88034	88043	60 %	40 %	0 %	0 %	379019890
75	NC_016928	GGATA	2	10	88574	88583	40 %	20 %	40 %	0 %	379019890
76	NC_016928	CAAAA	2	10	90712	90721	80 %	0 %	0 %	20 %	379019892
77	NC_016928	ATTGC	2	10	96374	96383	20 %	40 %	20 %	20 %	379019898
78	NC_016928	TCATT	2	10	96562	96571	20 %	60 %	0 %	20 %	379019898
79	NC_016928	TGAAA	2	10	98446	98455	60 %	20 %	20 %	0 %	379019899
80	NC_016928	TCAAT	2	10	98818	98827	40 %	40 %	0 %	20 %	379019899
81	NC_016928	GTATT	2	10	99307	99316	20 %	60 %	20 %	0 %	379019900
82	NC_016928	AGATA	2	10	105173	105182	60 %	20 %	20 %	0 %	379019903
83	NC_016928	TAAAA	2	10	105733	105742	80 %	20 %	0 %	0 %	379019903
84	NC_016928	ATACA	2	10	106164	106173	60 %	20 %	0 %	20 %	379019904
85	NC_016928	AAAGA	2	10	107367	107376	80 %	0 %	20 %	0 %	379019904
86	NC_016928	CAATT	2	10	108018	108027	40 %	40 %	0 %	20 %	379019905
87	NC_016928	TTGCG	2	10	109423	109432	0 %	40 %	40 %	20 %	379019906
88	NC_016928	AGTTA	2	10	111631	111640	40 %	40 %	20 %	0 %	379019908
89	NC_016928	TTGCG	2	10	112139	112148	0 %	40 %	40 %	20 %	379019908
90	NC_016928	AGATG	2	10	115004	115013	40 %	20 %	40 %	0 %	379019910
91	NC_016928	GAAAA	2	10	119037	119046	80 %	0 %	20 %	0 %	379019914
92	NC_016928	AATCA	2	10	122226	122235	60 %	20 %	0 %	20 %	379019916
93	NC_016928	ATTTT	2	10	122924	122933	20 %	80 %	0 %	0 %	379019917
94	NC_016928	ATCAC	2	10	124184	124193	40 %	20 %	0 %	40 %	379019918
95	NC_016928	AACGA	2	10	124861	124870	60 %	0 %	20 %	20 %	379019918
96	NC_016928	ACACA	2	10	126917	126926	60 %	0 %	0 %	40 %	379019920
97	NC_016928	GACAA	2	10	128068	128077	60 %	0 %	20 %	20 %	379019921
98	NC_016928	TCTTA	2	10	128851	128860	20 %	60 %	0 %	20 %	379019922
99	NC_016928	ATTAC	2	10	130897	130906	40 %	40 %	0 %	20 %	379019924
100	NC_016928	TATCT	2	10	131557	131566	20 %	60 %	0 %	20 %	379019925
101	NC_016928	ATACG	2	10	133990	133999	40 %	20 %	20 %	20 %	379019927
102	NC_016928	TTATA	2	10	134648	134657	40 %	60 %	0 %	0 %	379019928
103	NC_016928	TATAA	2	10	135018	135027	60 %	40 %	0 %	0 %	379019928
104	NC_016928	TTTTA	2	10	135446	135455	20 %	80 %	0 %	0 %	379019928
105	NC_016928	AATAA	2	10	136552	136561	80 %	20 %	0 %	0 %	379019929
106	NC_016928	TACGC	2	10	136819	136828	20 %	20 %	20 %	40 %	379019929
107	NC_016928	TCCCT	2	10	140690	140699	0 %	40 %	0 %	60 %	379019932
108	NC_016928	GCTTT	2	10	142924	142933	0 %	60 %	20 %	20 %	379019934
109	NC_016928	TAATT	2	10	143009	143018	40 %	60 %	0 %	0 %	379019934
110	NC_016928	ATACT	2	10	144190	144199	40 %	40 %	0 %	20 %	379019936
111	NC_016928	TAATA	2	10	145356	145365	60 %	40 %	0 %	0 %	379019937
112	NC_016928	ATTTT	2	10	146347	146356	20 %	80 %	0 %	0 %	379019938
113	NC_016928	TAAAA	2	10	146546	146555	80 %	20 %	0 %	0 %	379019938
114	NC_016928	TTGTA	2	10	148571	148580	20 %	60 %	20 %	0 %	379019940
115	NC_016928	TGCAA	2	10	149576	149585	40 %	20 %	20 %	20 %	379019941
116	NC_016928	ATATG	2	10	151594	151603	40 %	40 %	20 %	0 %	379019942
117	NC_016928	TATGA	2	10	153274	153283	40 %	40 %	20 %	0 %	379019944
118	NC_016928	AATAT	2	10	154280	154289	60 %	40 %	0 %	0 %	379019944
119	NC_016928	ACATC	2	10	159139	159148	40 %	20 %	0 %	40 %	379019947
120	NC_016928	TAATT	2	10	161362	161371	40 %	60 %	0 %	0 %	379019948
121	NC_016928	AGAGA	2	10	164388	164397	60 %	0 %	40 %	0 %	379019951
122	NC_016928	AATCC	2	10	164744	164753	40 %	20 %	0 %	40 %	379019951
123	NC_016928	TTGGA	2	10	167773	167782	20 %	40 %	40 %	0 %	379019954
124	NC_016928	TTATT	2	10	168188	168197	20 %	80 %	0 %	0 %	379019955
125	NC_016928	ATTTT	2	10	168254	168263	20 %	80 %	0 %	0 %	379019955
126	NC_016928	TATGG	2	10	168655	168664	20 %	40 %	40 %	0 %	379019955
127	NC_016928	ATCGT	2	10	169096	169105	20 %	40 %	20 %	20 %	379019955
128	NC_016928	TGAAT	2	10	173682	173691	40 %	40 %	20 %	0 %	379019960
129	NC_016928	CAAAA	2	10	175066	175075	80 %	0 %	0 %	20 %	379019962
130	NC_016928	TTCAT	2	10	177918	177927	20 %	60 %	0 %	20 %	379019964
131	NC_016928	TTTAC	2	10	178301	178310	20 %	60 %	0 %	20 %	379019964
132	NC_016928	TTATT	2	10	179281	179290	20 %	80 %	0 %	0 %	379019966
133	NC_016928	GGATT	2	10	180269	180278	20 %	40 %	40 %	0 %	379019967
134	NC_016928	CACAA	2	10	180921	180930	60 %	0 %	0 %	40 %	379019968
135	NC_016928	TAACT	2	10	183309	183318	40 %	40 %	0 %	20 %	379019970
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