MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 52464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016912	GATA	2	8	196385	196392	50 %	25 %	25 %	0 %	379013529
4002	NC_016912	A	6	6	196410	196415	100 %	0 %	0 %	0 %	379013529
4003	NC_016912	AGC	2	6	196469	196474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013529
4004	NC_016912	TCG	3	9	196523	196531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013529
4005	NC_016912	GAA	2	6	196563	196568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013529
4006	NC_016912	GGA	2	6	196578	196583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379013529
4007	NC_016912	AC	3	6	196602	196607	50 %	0 %	0 %	50 %	379013529
4008	NC_016912	GAT	2	6	196628	196633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013529
4009	NC_016912	TAAAT	2	10	196676	196685	60 %	40 %	0 %	0 %	379013529
4010	NC_016912	CAT	2	6	196692	196697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013529
4011	NC_016912	TTA	2	6	196762	196767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013529
4012	NC_016912	GAA	2	6	196772	196777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013529
4013	NC_016912	CGA	2	6	196783	196788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013529
4014	NC_016912	GAA	3	9	196989	196997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013529
4015	NC_016912	CAT	2	6	197153	197158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013530
4016	NC_016912	TGG	2	6	197189	197194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013530
4017	NC_016912	GAT	2	6	197282	197287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013530
4018	NC_016912	TTG	2	6	197350	197355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013530
4019	NC_016912	GGT	2	6	197360	197365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013530
4020	NC_016912	TAA	2	6	197378	197383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013530
4021	NC_016912	TG	3	6	197434	197439	0 %	50 %	50 %	0 %	379013530
4022	NC_016912	GAC	2	6	197456	197461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013530
4023	NC_016912	TAA	2	6	197492	197497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013530
4024	NC_016912	ATT	2	6	197507	197512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013530
4025	NC_016912	CA	3	6	197535	197540	50 %	0 %	0 %	50 %	379013530
4026	NC_016912	A	6	6	197559	197564	100 %	0 %	0 %	0 %	379013530
4027	NC_016912	TGGT	2	8	197581	197588	0 %	50 %	50 %	0 %	379013530
4028	NC_016912	TAG	2	6	197596	197601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013530
4029	NC_016912	CTGG	2	8	197635	197642	0 %	25 %	50 %	25 %	379013530
4030	NC_016912	CTA	2	6	197724	197729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013530
4031	NC_016912	AAC	2	6	197785	197790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013530
4032	NC_016912	GAT	2	6	197841	197846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013530
4033	NC_016912	AGCA	2	8	197879	197886	50 %	0 %	25 %	25 %	379013530
4034	NC_016912	AGA	2	6	197921	197926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013530
4035	NC_016912	ATTT	2	8	197968	197975	25 %	75 %	0 %	0 %	379013530
4036	NC_016912	AT	3	6	197985	197990	50 %	50 %	0 %	0 %	379013530
4037	NC_016912	AAAGC	2	10	198016	198025	60 %	0 %	20 %	20 %	379013530
4038	NC_016912	GA	3	6	198057	198062	50 %	0 %	50 %	0 %	379013530
4039	NC_016912	AGA	2	6	198098	198103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013530
4040	NC_016912	GAA	2	6	198120	198125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013530
4041	NC_016912	TAT	2	6	198274	198279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013531
4042	NC_016912	TGGAT	2	10	198326	198335	20 %	40 %	40 %	0 %	379013531
4043	NC_016912	GGT	2	6	198354	198359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013531
4044	NC_016912	GTT	2	6	198392	198397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013531
4045	NC_016912	CAGA	2	8	198439	198446	50 %	0 %	25 %	25 %	379013531
4046	NC_016912	AAG	2	6	198511	198516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013531
4047	NC_016912	GTT	2	6	198570	198575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013531
4048	NC_016912	GAT	2	6	198603	198608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013531
4049	NC_016912	TGCA	2	8	198757	198764	25 %	25 %	25 %	25 %	379013531
4050	NC_016912	AT	3	6	198821	198826	50 %	50 %	0 %	0 %	379013531
4051	NC_016912	TGG	2	6	198855	198860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013531
4052	NC_016912	TGC	2	6	198878	198883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013531
4053	NC_016912	TCA	2	6	198914	198919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013531
4054	NC_016912	TTA	3	9	199078	199086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013531
4055	NC_016912	TAT	2	6	199127	199132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013531
4056	NC_016912	AGA	2	6	199139	199144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013531
4057	NC_016912	CAG	2	6	199198	199203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013531
4058	NC_016912	TGG	2	6	199209	199214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013531
4059	NC_016912	ATA	2	6	199217	199222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013531
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4061	NC_016912	TAA	2	6	199645	199650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013532
4062	NC_016912	GT	3	6	199669	199674	0 %	50 %	50 %	0 %	379013532
4063	NC_016912	TAA	3	9	199675	199683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013532
4064	NC_016912	ATG	2	6	199703	199708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013532
4065	NC_016912	AAG	2	6	199712	199717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013532
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4067	NC_016912	TAA	2	6	199755	199760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013532
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4071	NC_016912	ATAA	2	8	199823	199830	75 %	25 %	0 %	0 %	379013532
4072	NC_016912	TAA	2	6	199896	199901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013532
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4074	NC_016912	ATAG	2	8	200063	200070	50 %	25 %	25 %	0 %	379013532
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4093	NC_016912	TAT	2	6	201237	201242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013533
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4101	NC_016912	TCT	2	6	201600	201605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013533
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4103	NC_016912	GAA	2	6	201656	201661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013533
4104	NC_016912	TGCT	2	8	202053	202060	0 %	50 %	25 %	25 %	379013534
4105	NC_016912	AAT	2	6	202064	202069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
4106	NC_016912	T	6	6	202092	202097	0 %	100 %	0 %	0 %	379013534
4107	NC_016912	AAT	2	6	202211	202216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
4108	NC_016912	TCGCA	2	10	202251	202260	20 %	20 %	20 %	40 %	379013534
4109	NC_016912	ATA	2	6	202353	202358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
4110	NC_016912	ATC	2	6	202359	202364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013534
4111	NC_016912	CAT	2	6	202394	202399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013534
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4114	NC_016912	TAA	2	6	202500	202505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
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4116	NC_016912	AT	3	6	202540	202545	50 %	50 %	0 %	0 %	379013534
4117	NC_016912	ATA	2	6	202565	202570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
4118	NC_016912	TGA	2	6	202571	202576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013534
4119	NC_016912	TGT	2	6	202666	202671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013534
4120	NC_016912	TATTG	2	10	202713	202722	20 %	60 %	20 %	0 %	379013534
4121	NC_016912	AAT	2	6	202767	202772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013534
4122	NC_016912	TCA	3	9	202777	202785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013534
4123	NC_016912	A	6	6	202866	202871	100 %	0 %	0 %	0 %	379013535
4124	NC_016912	CAT	2	6	202953	202958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013535
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4126	NC_016912	CAT	2	6	203125	203130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013535
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4128	NC_016912	TCA	2	6	203189	203194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013535
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4131	NC_016912	ATTGT	2	10	203349	203358	20 %	60 %	20 %	0 %	379013535
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4241	NC_016912	ATC	2	6	209132	209137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013539
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4367	NC_016912	ACT	2	6	216111	216116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013544
4368	NC_016912	ATTG	2	8	216165	216172	25 %	50 %	25 %	0 %	379013544
4369	NC_016912	CAT	2	6	216181	216186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013544
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4371	NC_016912	AATC	2	8	216298	216305	50 %	25 %	0 %	25 %	379013544
4372	NC_016912	ATT	2	6	216344	216349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013544
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4379	NC_016912	CAT	2	6	216931	216936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013544
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4385	NC_016912	CAT	2	6	217162	217167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013544
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4388	NC_016912	TAATA	2	10	217220	217229	60 %	40 %	0 %	0 %	379013544
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4396	NC_016912	AT	3	6	217461	217466	50 %	50 %	0 %	0 %	379013544
4397	NC_016912	CAT	3	9	217474	217482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013544
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