MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 52464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1003	NC_016912	ATA	2	6	48867	48872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013406
1004	NC_016912	GCA	2	6	48911	48916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013406
1005	NC_016912	ATA	2	6	48917	48922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013406
1006	NC_016912	AAGGAA	2	12	48936	48947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013406
1007	NC_016912	TTA	2	6	48953	48958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013406
1008	NC_016912	ACT	2	6	49020	49025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013406
1009	NC_016912	CAT	2	6	49046	49051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013406
1010	NC_016912	GTTA	2	8	49523	49530	25 %	50 %	25 %	0 %	379013407
1011	NC_016912	TGG	2	6	49532	49537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013407
1012	NC_016912	TAT	2	6	49538	49543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013407
1013	NC_016912	GAT	2	6	49547	49552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013407
1014	NC_016912	A	6	6	49577	49582	100 %	0 %	0 %	0 %	379013407
1015	NC_016912	T	6	6	49602	49607	0 %	100 %	0 %	0 %	379013407
1016	NC_016912	TAA	2	6	49616	49621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013407
1017	NC_016912	CTA	2	6	49645	49650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013407
1018	NC_016912	T	6	6	49652	49657	0 %	100 %	0 %	0 %	379013407
1019	NC_016912	TATAT	2	10	49699	49708	40 %	60 %	0 %	0 %	379013407
1020	NC_016912	T	6	6	49723	49728	0 %	100 %	0 %	0 %	379013407
1021	NC_016912	T	7	7	49765	49771	0 %	100 %	0 %	0 %	379013407
1022	NC_016912	A	7	7	49810	49816	100 %	0 %	0 %	0 %	379013407
1023	NC_016912	A	6	6	49818	49823	100 %	0 %	0 %	0 %	379013407
1024	NC_016912	A	6	6	49833	49838	100 %	0 %	0 %	0 %	379013407
1025	NC_016912	GCGG	2	8	49968	49975	0 %	0 %	75 %	25 %	379013407
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1030	NC_016912	AAATAA	2	12	50036	50047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379013407
1031	NC_016912	GTT	2	6	50392	50397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013408
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1034	NC_016912	TAT	2	6	50536	50541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013408
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1042	NC_016912	ATG	2	6	50901	50906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
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1044	NC_016912	ATT	2	6	50941	50946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013408
1045	NC_016912	CTT	2	6	51010	51015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013408
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1052	NC_016912	AT	3	6	51297	51302	50 %	50 %	0 %	0 %	379013408
1053	NC_016912	TAG	2	6	51312	51317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
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1055	NC_016912	CAAAA	2	10	51370	51379	80 %	0 %	0 %	20 %	379013408
1056	NC_016912	GAT	2	6	51392	51397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
1057	NC_016912	TACT	2	8	51407	51414	25 %	50 %	0 %	25 %	379013408
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1059	NC_016912	AT	3	6	51477	51482	50 %	50 %	0 %	0 %	379013408
1060	NC_016912	GAA	2	6	51503	51508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013408
1061	NC_016912	TAC	2	6	51726	51731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013408
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1065	NC_016912	ATG	2	6	51852	51857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
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1089	NC_016912	AATT	2	8	52515	52522	50 %	50 %	0 %	0 %	379013408
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1097	NC_016912	AAG	2	6	52827	52832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013408
1098	NC_016912	CAAT	2	8	52861	52868	50 %	25 %	0 %	25 %	379013408
1099	NC_016912	A	6	6	52905	52910	100 %	0 %	0 %	0 %	379013408
1100	NC_016912	TAA	3	9	52987	52995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013408
1101	NC_016912	AGT	2	6	53098	53103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
1102	NC_016912	ATT	2	6	53107	53112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013408
1103	NC_016912	TGA	2	6	53116	53121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
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1105	NC_016912	CAG	2	6	53184	53189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013408
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1107	NC_016912	ATA	2	6	53346	53351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013408
1108	NC_016912	AAGA	2	8	53420	53427	75 %	0 %	25 %	0 %	379013408
1109	NC_016912	AAAG	2	8	53489	53496	75 %	0 %	25 %	0 %	379013408
1110	NC_016912	AAT	2	6	53562	53567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013409
1111	NC_016912	AAC	2	6	53578	53583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013409
1112	NC_016912	GAA	2	6	53635	53640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013409
1113	NC_016912	TTGC	2	8	53689	53696	0 %	50 %	25 %	25 %	379013409
1114	NC_016912	ATTC	2	8	53715	53722	25 %	50 %	0 %	25 %	379013409
1115	NC_016912	ATCA	2	8	53742	53749	50 %	25 %	0 %	25 %	379013409
1116	NC_016912	ATC	3	9	53758	53766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013409
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1118	NC_016912	CAT	2	6	53906	53911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013409
1119	NC_016912	CAG	2	6	53921	53926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013409
1120	NC_016912	AT	3	6	53939	53944	50 %	50 %	0 %	0 %	379013409
1121	NC_016912	GGT	2	6	53998	54003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013409
1122	NC_016912	TAG	2	6	54293	54298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013410
1123	NC_016912	TGA	2	6	54299	54304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013410
1124	NC_016912	TGGT	2	8	54306	54313	0 %	50 %	50 %	0 %	379013410
1125	NC_016912	TGA	2	6	54375	54380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013410
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1127	NC_016912	T	6	6	54517	54522	0 %	100 %	0 %	0 %	379013410
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