MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	GAGAA	2	10	334	343	60 %	0 %	40 %	0 %	378715493
2	NC_016905	TTTAT	2	10	759	768	20 %	80 %	0 %	0 %	378715494
3	NC_016905	CTGTT	2	10	2970	2979	0 %	60 %	20 %	20 %	378715494
4	NC_016905	GCTGT	2	10	4193	4202	0 %	40 %	40 %	20 %	378715494
5	NC_016905	GCTCT	2	10	6455	6464	0 %	40 %	20 %	40 %	378715494
6	NC_016905	TTCTT	2	10	6537	6546	0 %	80 %	0 %	20 %	378715494
7	NC_016905	GCCGC	2	10	6564	6573	0 %	0 %	40 %	60 %	378715494
8	NC_016905	TCGTG	2	10	6819	6828	0 %	40 %	40 %	20 %	378715495
9	NC_016905	TGCGC	2	10	7065	7074	0 %	20 %	40 %	40 %	378715496
10	NC_016905	TGGTT	2	10	8073	8082	0 %	60 %	40 %	0 %	378715496
11	NC_016905	CACAC	2	10	8223	8232	40 %	0 %	0 %	60 %	378715496
12	NC_016905	CATGA	2	10	8743	8752	40 %	20 %	20 %	20 %	378715496
13	NC_016905	ATAGC	2	10	8833	8842	40 %	20 %	20 %	20 %	378715496
14	NC_016905	CAACA	2	10	9579	9588	60 %	0 %	0 %	40 %	378715497
15	NC_016905	TGGTT	2	10	11398	11407	0 %	60 %	40 %	0 %	378715499
16	NC_016905	TTTTG	2	10	12169	12178	0 %	80 %	20 %	0 %	378715499
17	NC_016905	GCCTT	2	10	14153	14162	0 %	40 %	20 %	40 %	378715500
18	NC_016905	GTTGC	2	10	15344	15353	0 %	40 %	40 %	20 %	378715503
19	NC_016905	TGGTT	2	10	15995	16004	0 %	60 %	40 %	0 %	378715503
20	NC_016905	CTTTG	2	10	18270	18279	0 %	60 %	20 %	20 %	378715505
21	NC_016905	AAATG	2	10	19364	19373	60 %	20 %	20 %	0 %	378715506
22	NC_016905	TGCCA	2	10	21478	21487	20 %	20 %	20 %	40 %	378715509
23	NC_016905	CTTCT	2	10	22158	22167	0 %	60 %	0 %	40 %	378715509
24	NC_016905	CGGTA	2	10	24443	24452	20 %	20 %	40 %	20 %	378715511
25	NC_016905	ATGGC	2	10	25782	25791	20 %	20 %	40 %	20 %	378715512
26	NC_016905	GACGA	2	10	26187	26196	40 %	0 %	40 %	20 %	378715513
27	NC_016905	TGTTT	2	10	26243	26252	0 %	80 %	20 %	0 %	378715513
28	NC_016905	ACTAG	2	10	33248	33257	40 %	20 %	20 %	20 %	378715523
29	NC_016905	ATGCC	2	10	35813	35822	20 %	20 %	20 %	40 %	378715523
30	NC_016905	GGTCT	2	10	37939	37948	0 %	40 %	40 %	20 %	378715524
31	NC_016905	ACGTC	2	10	38336	38345	20 %	20 %	20 %	40 %	378715524
32	NC_016905	CCACA	2	10	38347	38356	40 %	0 %	0 %	60 %	378715524
33	NC_016905	CTTCA	2	10	38583	38592	20 %	40 %	0 %	40 %	378715524
34	NC_016905	TTTTC	2	10	38623	38632	0 %	80 %	0 %	20 %	378715524
35	NC_016905	GTCAC	2	10	39439	39448	20 %	20 %	20 %	40 %	378715525
36	NC_016905	TGGTC	2	10	43370	43379	0 %	40 %	40 %	20 %	378715528
37	NC_016905	GATAC	2	10	44546	44555	40 %	20 %	20 %	20 %	378715529
38	NC_016905	CATCG	2	10	45424	45433	20 %	20 %	20 %	40 %	378715529
39	NC_016905	CTCCC	2	10	45776	45785	0 %	20 %	0 %	80 %	378715529
40	NC_016905	GAGAG	2	10	46852	46861	40 %	0 %	60 %	0 %	378715529
41	NC_016905	GCTGA	2	10	48225	48234	20 %	20 %	40 %	20 %	378715531
42	NC_016905	CGATG	2	10	48683	48692	20 %	20 %	40 %	20 %	378715531
43	NC_016905	GCGCA	2	10	48903	48912	20 %	0 %	40 %	40 %	378715531
44	NC_016905	GCCAA	2	10	48964	48973	40 %	0 %	20 %	40 %	378715531
45	NC_016905	ACGCT	2	10	50433	50442	20 %	20 %	20 %	40 %	378715531
46	NC_016905	AACGT	2	10	50464	50473	40 %	20 %	20 %	20 %	378715531
47	NC_016905	TCTTG	2	10	53244	53253	0 %	60 %	20 %	20 %	378715532
48	NC_016905	TCACT	2	10	53682	53691	20 %	40 %	0 %	40 %	378715532
49	NC_016905	TTTTC	2	10	54096	54105	0 %	80 %	0 %	20 %	378715532
50	NC_016905	TCATC	2	10	62317	62326	20 %	40 %	0 %	40 %	378715535
51	NC_016905	GAGTC	2	10	62554	62563	20 %	20 %	40 %	20 %	378715536
52	NC_016905	ATGAT	2	10	65304	65313	40 %	40 %	20 %	0 %	378715539
53	NC_016905	CCAAG	2	10	65579	65588	40 %	0 %	20 %	40 %	378715540
54	NC_016905	GTGAC	2	10	68249	68258	20 %	20 %	40 %	20 %	378715541
55	NC_016905	CTTGT	2	10	73792	73801	0 %	60 %	20 %	20 %	378715546
56	NC_016905	GCCAA	2	10	74852	74861	40 %	0 %	20 %	40 %	378715548
57	NC_016905	GATAT	2	10	76587	76596	40 %	40 %	20 %	0 %	378715550
58	NC_016905	CAAAA	2	10	79168	79177	80 %	0 %	0 %	20 %	378715554

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.