MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 54662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016901	CAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706363
2	NC_016901	CAG	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706363
3	NC_016901	GTC	2	6	312	317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706363
4	NC_016901	ACG	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706363
5	NC_016901	GGT	2	6	542	547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706363
6	NC_016901	ATT	2	6	559	564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706363
7	NC_016901	TTG	2	6	599	604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706363
8	NC_016901	AAT	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706363
9	NC_016901	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
10	NC_016901	TAC	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706363
11	NC_016901	GAT	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706363
12	NC_016901	AAG	2	6	798	803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
13	NC_016901	TTC	2	6	806	811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
14	NC_016901	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706363
15	NC_016901	CCA	2	6	944	949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706363
16	NC_016901	CTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
17	NC_016901	GCC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706363
18	NC_016901	TAC	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706363
19	NC_016901	TGT	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706363
20	NC_016901	TGG	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706363
21	NC_016901	CAC	2	6	1360	1365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706363
22	NC_016901	AGA	2	6	1423	1428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706363
23	NC_016901	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706363
24	NC_016901	CCT	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378706364
25	NC_016901	GAA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
26	NC_016901	TAC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706364
27	NC_016901	GCT	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706364
28	NC_016901	AAC	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
29	NC_016901	ATA	2	6	1762	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706364
30	NC_016901	TGC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706364
31	NC_016901	AGA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
32	NC_016901	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706364
33	NC_016901	GTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706364
34	NC_016901	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
35	NC_016901	ATC	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706364
36	NC_016901	ACA	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
37	NC_016901	CAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706364
38	NC_016901	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706364
39	NC_016901	GAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706364
40	NC_016901	TAA	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706365
41	NC_016901	CGA	3	9	2972	2980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706365
42	NC_016901	GTG	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706365
43	NC_016901	TCG	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706365
44	NC_016901	ACT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706365
45	NC_016901	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706365
46	NC_016901	ACA	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706365
47	NC_016901	GAT	2	6	3687	3692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706365
48	NC_016901	CTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706365
49	NC_016901	ATA	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706366
50	NC_016901	TTC	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
51	NC_016901	CGA	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
52	NC_016901	CAT	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706366
53	NC_016901	AGT	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
54	NC_016901	GAA	2	6	4138	4143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
55	NC_016901	GCA	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
56	NC_016901	CGG	2	6	4185	4190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
57	NC_016901	CGA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
58	NC_016901	TCG	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
59	NC_016901	TGA	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
60	NC_016901	ACA	2	6	4511	4516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
61	NC_016901	ATT	2	6	4562	4567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706366
62	NC_016901	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706366
63	NC_016901	CAA	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
64	NC_016901	CAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706366
65	NC_016901	TGG	2	6	4716	4721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
66	NC_016901	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
67	NC_016901	TTG	2	6	4997	5002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
68	NC_016901	GCG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
69	NC_016901	CGT	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
70	NC_016901	GGT	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
71	NC_016901	CTG	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
72	NC_016901	TGT	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
73	NC_016901	AAG	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
74	NC_016901	CGA	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
75	NC_016901	CAT	4	12	5361	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706366
76	NC_016901	CTT	3	9	5421	5429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
77	NC_016901	CCA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706366
78	NC_016901	TTG	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
79	NC_016901	AGC	2	6	5678	5683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
80	NC_016901	ACC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706366
81	NC_016901	TGG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706366
82	NC_016901	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706366
83	NC_016901	CTG	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
84	NC_016901	CTT	2	6	5925	5930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706366
85	NC_016901	GCG	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
86	NC_016901	GGC	2	6	5995	6000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706366
87	NC_016901	AAG	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706366
88	NC_016901	TGA	2	6	6186	6191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706366
89	NC_016901	GTT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706366
90	NC_016901	TCG	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706366
91	NC_016901	TCT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706367
92	NC_016901	CAA	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706367
93	NC_016901	TGC	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706367
94	NC_016901	CAT	2	6	6581	6586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706367
95	NC_016901	GCA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706367
96	NC_016901	AGT	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706367
97	NC_016901	TAA	2	6	7390	7395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706368
98	NC_016901	AGC	2	6	7494	7499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706368
99	NC_016901	TTG	2	6	7556	7561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706368
100	NC_016901	GCA	2	6	7576	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706368
101	NC_016901	TCG	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706369
102	NC_016901	TTA	2	6	7642	7647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706369
103	NC_016901	CTC	2	6	7726	7731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378706369
104	NC_016901	CCG	2	6	7818	7823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706369
105	NC_016901	CTG	2	6	7840	7845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706369
106	NC_016901	CAG	2	6	7852	7857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706369
107	NC_016901	TGG	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706369
108	NC_016901	CTT	2	6	8048	8053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706369
109	NC_016901	AAT	2	6	8079	8084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706369
110	NC_016901	TCA	2	6	8174	8179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706369
111	NC_016901	GGC	2	6	8240	8245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706369
112	NC_016901	TGG	2	6	8330	8335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706369
113	NC_016901	ATG	2	6	8395	8400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706369
114	NC_016901	GAA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706369
115	NC_016901	GCA	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706369
116	NC_016901	GTG	2	6	8838	8843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706369
117	NC_016901	TTA	2	6	9124	9129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706370
118	NC_016901	TCG	2	6	9428	9433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706371
119	NC_016901	AGT	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706372
120	NC_016901	TCG	2	6	9722	9727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706372
121	NC_016901	AAT	2	6	9790	9795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706372
122	NC_016901	CTG	2	6	9815	9820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706372
123	NC_016901	CTT	2	6	10094	10099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706372
124	NC_016901	TCA	2	6	10197	10202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706372
125	NC_016901	CGC	2	6	10218	10223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706372
126	NC_016901	ATA	2	6	10440	10445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706372
127	NC_016901	TTA	2	6	10557	10562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706372
128	NC_016901	ATC	2	6	10568	10573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706372
129	NC_016901	TAA	2	6	10923	10928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706373
130	NC_016901	TGT	2	6	11084	11089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706373
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