MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 77614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016901	TGC	2	6	269313	269318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706599
4002	NC_016901	CGG	2	6	269387	269392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706599
4003	NC_016901	CTT	2	6	269393	269398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706599
4004	NC_016901	AAG	2	6	269447	269452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706599
4005	NC_016901	ATCAGC	2	12	269458	269469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378706599
4006	NC_016901	TGA	2	6	269694	269699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706599
4007	NC_016901	GCT	2	6	269700	269705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706599
4008	NC_016901	TCG	2	6	269724	269729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706599
4009	NC_016901	ATG	2	6	269893	269898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706599
4010	NC_016901	TGG	2	6	269901	269906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706599
4011	NC_016901	TTC	2	6	269908	269913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706599
4012	NC_016901	AAT	2	6	269996	270001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706599
4013	NC_016901	GAA	2	6	270014	270019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706600
4014	NC_016901	TA	3	6	270070	270075	50 %	50 %	0 %	0 %	378706600
4015	NC_016901	GCA	2	6	270095	270100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706600
4016	NC_016901	GGAA	2	8	270116	270123	50 %	0 %	50 %	0 %	378706600
4017	NC_016901	AAGGT	2	10	270193	270202	40 %	20 %	40 %	0 %	378706600
4018	NC_016901	TG	3	6	270215	270220	0 %	50 %	50 %	0 %	378706600
4019	NC_016901	TCT	2	6	270284	270289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706600
4020	NC_016901	AGA	2	6	270335	270340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706600
4021	NC_016901	TAT	2	6	270455	270460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706600
4022	NC_016901	CAA	2	6	270525	270530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706600
4023	NC_016901	GCG	2	6	270543	270548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706600
4024	NC_016901	CAT	2	6	270559	270564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706600
4025	NC_016901	TGG	2	6	270586	270591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706601
4026	NC_016901	GAC	2	6	270613	270618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706601
4027	NC_016901	TCAAAA	2	12	270718	270729	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378706601
4028	NC_016901	GC	3	6	270755	270760	0 %	0 %	50 %	50 %	378706601
4029	NC_016901	GAT	2	6	270806	270811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706601
4030	NC_016901	ATC	2	6	270815	270820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706601
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4032	NC_016901	CGAA	2	8	270978	270985	50 %	0 %	25 %	25 %	378706601
4033	NC_016901	GAA	2	6	270992	270997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706601
4034	NC_016901	ATT	2	6	271062	271067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706602
4035	NC_016901	TGG	2	6	271095	271100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706602
4036	NC_016901	GCA	2	6	271125	271130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706602
4037	NC_016901	CGA	2	6	271133	271138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706602
4038	NC_016901	TTGAT	2	10	271157	271166	20 %	60 %	20 %	0 %	378706602
4039	NC_016901	ATC	2	6	271258	271263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706602
4040	NC_016901	CAA	2	6	271393	271398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706602
4041	NC_016901	TAC	2	6	271444	271449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706602
4042	NC_016901	ATTT	2	8	271503	271510	25 %	75 %	0 %	0 %	378706602
4043	NC_016901	GAT	2	6	278133	278138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706603
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4045	NC_016901	GAT	2	6	278211	278216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706603
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4047	NC_016901	AAC	2	6	278327	278332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706603
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4049	NC_016901	A	7	7	278888	278894	100 %	0 %	0 %	0 %	378706604
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4051	NC_016901	CGC	2	6	278946	278951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706604
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4053	NC_016901	ACCA	2	8	279194	279201	50 %	0 %	0 %	50 %	378706605
4054	NC_016901	T	6	6	279245	279250	0 %	100 %	0 %	0 %	378706605
4055	NC_016901	ACG	2	6	279277	279282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706605
4056	NC_016901	TAA	2	6	279291	279296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706605
4057	NC_016901	GCCA	2	8	279343	279350	25 %	0 %	25 %	50 %	378706605
4058	NC_016901	CTG	2	6	279380	279385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706605
4059	NC_016901	GAG	3	9	279394	279402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378706605
4060	NC_016901	GGC	2	6	279447	279452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706605
4061	NC_016901	GTG	2	6	279487	279492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706605
4062	NC_016901	TGA	2	6	279529	279534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706605
4063	NC_016901	TGC	2	6	279559	279564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706605
4064	NC_016901	GAT	2	6	279881	279886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706606
4065	NC_016901	CAT	2	6	279919	279924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706606
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4069	NC_016901	ATG	2	6	280215	280220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706606
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4074	NC_016901	ATCT	2	8	280385	280392	25 %	50 %	0 %	25 %	378706606
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4088	NC_016901	AAT	2	6	281223	281228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706607
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4120	NC_016901	GTT	2	6	283130	283135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706611
4121	NC_016901	GCT	2	6	283182	283187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706611
4122	NC_016901	CGC	2	6	283196	283201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706611
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4230	NC_016901	TC	3	6	290702	290707	0 %	50 %	0 %	50 %	378706617
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4238	NC_016901	T	7	7	291679	291685	0 %	100 %	0 %	0 %	378706618
4239	NC_016901	TTA	2	6	291792	291797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706618
4240	NC_016901	CAAG	2	8	291805	291812	50 %	0 %	25 %	25 %	378706618
4241	NC_016901	TGA	2	6	291868	291873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706618
4242	NC_016901	GAT	2	6	291914	291919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706618
4243	NC_016901	CTT	2	6	292093	292098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706618
4244	NC_016901	ATT	2	6	292168	292173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706618
4245	NC_016901	TAA	2	6	292246	292251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706618
4246	NC_016901	AAG	2	6	292281	292286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706618
4247	NC_016901	CAA	2	6	292403	292408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706618
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4249	NC_016901	T	6	6	292449	292454	0 %	100 %	0 %	0 %	378706618
4250	NC_016901	AGCA	2	8	292466	292473	50 %	0 %	25 %	25 %	378706618
4251	NC_016901	CAT	2	6	292648	292653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706619
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4280	NC_016901	CTGC	2	8	294365	294372	0 %	25 %	25 %	50 %	378706621
4281	NC_016901	CAG	2	6	294395	294400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706621
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4344	NC_016901	ATCGAT	2	12	298835	298846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378706626
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4363	NC_016901	GACC	2	8	299761	299768	25 %	0 %	25 %	50 %	378706626
4364	NC_016901	AAT	2	6	299808	299813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706626
4365	NC_016901	ATAA	2	8	299817	299824	75 %	25 %	0 %	0 %	378706626
4366	NC_016901	GCC	2	6	299898	299903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706627
4367	NC_016901	T	6	6	299923	299928	0 %	100 %	0 %	0 %	378706627
4368	NC_016901	T	6	6	299977	299982	0 %	100 %	0 %	0 %	378706627
4369	NC_016901	TCA	2	6	300015	300020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706627
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4372	NC_016901	GTT	2	6	300170	300175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706627
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4376	NC_016901	ATC	2	6	300247	300252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706627
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4391	NC_016901	TGA	2	6	301208	301213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706628
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4441	NC_016901	ACTG	2	8	304803	304810	25 %	25 %	25 %	25 %	378706632
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4452	NC_016901	CAC	2	6	305567	305572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706633
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4454	NC_016901	CTGTG	2	10	305592	305601	0 %	40 %	40 %	20 %	378706633
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4467	NC_016901	ACG	2	6	306537	306542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706634
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4471	NC_016901	TGAGTG	2	12	306808	306819	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	378706634
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4474	NC_016901	CAT	2	6	307160	307165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706635
4475	NC_016901	TTC	2	6	307583	307588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706635
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4482	NC_016901	GCA	2	6	307924	307929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706636
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