MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 77614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016901	TGG	2	6	201107	201112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3002	NC_016901	GGT	2	6	201150	201155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3003	NC_016901	AACG	2	8	201236	201243	50 %	0 %	25 %	25 %	378706534
3004	NC_016901	GCA	2	6	201250	201255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3005	NC_016901	TAA	2	6	201407	201412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706534
3006	NC_016901	ACA	3	9	201435	201443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706534
3007	NC_016901	TAAC	2	8	201484	201491	50 %	25 %	0 %	25 %	378706534
3008	NC_016901	ATT	2	6	201495	201500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706534
3009	NC_016901	ATTTA	2	10	201542	201551	40 %	60 %	0 %	0 %	378706534
3010	NC_016901	GCG	2	6	201639	201644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3011	NC_016901	ACCTTA	2	12	201666	201677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706534
3012	NC_016901	GTTG	2	8	201697	201704	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3013	NC_016901	TGC	2	6	201713	201718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3014	NC_016901	ATG	2	6	201844	201849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3015	NC_016901	CGA	2	6	201853	201858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3016	NC_016901	GCG	2	6	201915	201920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3017	NC_016901	ACCAA	2	10	201963	201972	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
3018	NC_016901	GTTG	2	8	201973	201980	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3019	NC_016901	TGC	2	6	201989	201994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3020	NC_016901	ATG	2	6	202120	202125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3021	NC_016901	CGA	2	6	202129	202134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3022	NC_016901	ACCAA	2	10	202239	202248	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
3023	NC_016901	GTTG	2	8	202249	202256	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3024	NC_016901	TGC	2	6	202265	202270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3025	NC_016901	CAT	2	6	202424	202429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706534
3026	NC_016901	GCC	2	6	202431	202436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706534
3027	NC_016901	GCG	2	6	202467	202472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3028	NC_016901	GTTG	2	8	202525	202532	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3029	NC_016901	ATG	2	6	202672	202677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3030	NC_016901	GCG	2	6	202743	202748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3031	NC_016901	TGC	2	6	202817	202822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3032	NC_016901	ACGGAC	2	12	202890	202901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3033	NC_016901	CTG	2	6	202981	202986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3034	NC_016901	TACAGC	2	12	203004	203015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378706534
3035	NC_016901	ACCTTA	2	12	203046	203057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706534
3036	NC_016901	GTTG	2	8	203077	203084	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3037	NC_016901	ATG	2	6	203224	203229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3038	NC_016901	CTG	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3039	NC_016901	TACAGC	2	12	203280	203291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378706534
3040	NC_016901	GTTG	2	8	203353	203360	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3041	NC_016901	TGC	2	6	203369	203374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3042	NC_016901	GACA	2	8	203441	203448	50 %	0 %	25 %	25 %	378706534
3043	NC_016901	ATG	2	6	203500	203505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3044	NC_016901	ACCAA	2	10	203619	203628	60 %	0 %	0 %	40 %	378706534
3045	NC_016901	GTTG	2	8	203629	203636	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3046	NC_016901	TGC	2	6	203645	203650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3047	NC_016901	ATG	2	6	203776	203781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3048	NC_016901	GCG	2	6	203826	203831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3049	NC_016901	GCG	2	6	203847	203852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3050	NC_016901	ACCTTA	2	12	203874	203885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706534
3051	NC_016901	GTTG	2	8	203905	203912	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3052	NC_016901	TGC	2	6	203921	203926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3053	NC_016901	ACGGAC	2	12	203994	204005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3054	NC_016901	ATG	2	6	204052	204057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3055	NC_016901	CTG	2	6	204085	204090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3056	NC_016901	GCG	2	6	204102	204107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3057	NC_016901	GCG	2	6	204123	204128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3058	NC_016901	GTTG	2	8	204181	204188	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3059	NC_016901	GCC	2	6	204363	204368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706534
3060	NC_016901	GCG	2	6	204378	204383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3061	NC_016901	GCG	2	6	204399	204404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706534
3062	NC_016901	GTTG	2	8	204457	204464	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3063	NC_016901	GC	3	6	204520	204525	0 %	0 %	50 %	50 %	378706534
3064	NC_016901	ATG	2	6	204604	204609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3065	NC_016901	GTG	2	6	204711	204716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3066	NC_016901	ATG	2	6	204874	204879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3067	NC_016901	TGA	2	6	204893	204898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3068	NC_016901	ATG	2	6	204925	204930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3069	NC_016901	TTC	2	6	205299	205304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706534
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3071	NC_016901	GTG	2	6	205440	205445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3072	NC_016901	GT	3	6	205447	205452	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
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3079	NC_016901	TTG	2	6	205978	205983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706534
3080	NC_016901	ACGG	2	8	206019	206026	25 %	0 %	50 %	25 %	378706534
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3086	NC_016901	TGAT	2	8	206410	206417	25 %	50 %	25 %	0 %	378706534
3087	NC_016901	GC	3	6	206418	206423	0 %	0 %	50 %	50 %	378706534
3088	NC_016901	TAG	2	6	206435	206440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
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3090	NC_016901	GT	3	6	206513	206518	0 %	50 %	50 %	0 %	378706534
3091	NC_016901	ACGATG	2	12	206548	206559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378706534
3092	NC_016901	TCG	2	6	206578	206583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3093	NC_016901	CCG	2	6	206752	206757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706534
3094	NC_016901	CAG	2	6	206772	206777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3095	NC_016901	AGTG	2	8	206879	206886	25 %	25 %	50 %	0 %	378706534
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3100	NC_016901	GAC	2	6	207230	207235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3101	NC_016901	TGC	2	6	207283	207288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3102	NC_016901	GTCA	2	8	207300	207307	25 %	25 %	25 %	25 %	378706534
3103	NC_016901	AGC	2	6	207366	207371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706534
3104	NC_016901	TGA	2	6	207419	207424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3105	NC_016901	TGG	2	6	207472	207477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706534
3106	NC_016901	ATG	2	6	207631	207636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706534
3107	NC_016901	ATT	2	6	208162	208167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706535
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3109	NC_016901	TGA	2	6	208251	208256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706535
3110	NC_016901	TCA	2	6	208267	208272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706535
3111	NC_016901	GC	3	6	208289	208294	0 %	0 %	50 %	50 %	378706535
3112	NC_016901	TGC	2	6	208300	208305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706535
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3115	NC_016901	TGA	2	6	208519	208524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706535
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3118	NC_016901	AAT	2	6	208650	208655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706535
3119	NC_016901	AGA	2	6	208734	208739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706536
3120	NC_016901	CGA	2	6	208746	208751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706536
3121	NC_016901	ATTGCG	2	12	208756	208767	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378706536
3122	NC_016901	GCG	2	6	208864	208869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706536
3123	NC_016901	GCGT	2	8	208952	208959	0 %	25 %	50 %	25 %	378706536
3124	NC_016901	TTGG	2	8	208977	208984	0 %	50 %	50 %	0 %	378706536
3125	NC_016901	GTG	2	6	209024	209029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706536
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3133	NC_016901	TTGTC	2	10	209313	209322	0 %	60 %	20 %	20 %	378706536
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3141	NC_016901	TTG	2	6	209913	209918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706537
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3152	NC_016901	G	8	8	210775	210782	0 %	0 %	100 %	0 %	378706538
3153	NC_016901	T	6	6	210925	210930	0 %	100 %	0 %	0 %	378706539
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3230	NC_016901	GCA	2	6	215346	215351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706542
3231	NC_016901	CCAA	2	8	215418	215425	50 %	0 %	0 %	50 %	378706542
3232	NC_016901	CCA	2	6	215464	215469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706542
3233	NC_016901	GGCT	2	8	215585	215592	0 %	25 %	50 %	25 %	378706542
3234	NC_016901	TGA	2	6	215616	215621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706542
3235	NC_016901	CAC	3	9	215638	215646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706542
3236	NC_016901	CAGC	2	8	215695	215702	25 %	0 %	25 %	50 %	378706542
3237	NC_016901	GCAGG	2	10	215706	215715	20 %	0 %	60 %	20 %	378706542
3238	NC_016901	TCA	2	6	215727	215732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706542
3239	NC_016901	GCA	2	6	215838	215843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706542
3240	NC_016901	TGTCGT	2	12	215895	215906	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378706542
3241	NC_016901	TGG	2	6	215918	215923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706542
3242	NC_016901	CAC	2	6	215973	215978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706542
3243	NC_016901	CATA	2	8	215985	215992	50 %	25 %	0 %	25 %	378706542
3244	NC_016901	TG	3	6	216024	216029	0 %	50 %	50 %	0 %	378706542
3245	NC_016901	GAT	2	6	216193	216198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706542
3246	NC_016901	T	6	6	216205	216210	0 %	100 %	0 %	0 %	378706542
3247	NC_016901	TCG	2	6	216390	216395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706543
3248	NC_016901	GAAC	2	8	216522	216529	50 %	0 %	25 %	25 %	378706543
3249	NC_016901	TGG	2	6	216542	216547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706543
3250	NC_016901	GAT	2	6	216573	216578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706543
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3252	NC_016901	GCG	2	6	216721	216726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706543
3253	NC_016901	GCA	2	6	216948	216953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706543
3254	NC_016901	ACG	2	6	217105	217110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706544
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3256	NC_016901	TGC	2	6	217199	217204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706544
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3260	NC_016901	TTC	2	6	217373	217378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706544
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3262	NC_016901	TA	3	6	217659	217664	50 %	50 %	0 %	0 %	378706544
3263	NC_016901	T	6	6	217722	217727	0 %	100 %	0 %	0 %	378706544
3264	NC_016901	GAT	2	6	217744	217749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706544
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3267	NC_016901	TCA	2	6	217811	217816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706544
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3269	NC_016901	CGC	2	6	217851	217856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706544
3270	NC_016901	A	6	6	217868	217873	100 %	0 %	0 %	0 %	378706544
3271	NC_016901	CAT	2	6	217936	217941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706544
3272	NC_016901	TTGA	2	8	217942	217949	25 %	50 %	25 %	0 %	378706544
3273	NC_016901	GCTG	2	8	217957	217964	0 %	25 %	50 %	25 %	378706544
3274	NC_016901	ATCGC	2	10	217975	217984	20 %	20 %	20 %	40 %	378706544
3275	NC_016901	GTC	2	6	218026	218031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706544
3276	NC_016901	TGC	2	6	218185	218190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706544
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3280	NC_016901	CAATG	2	10	218630	218639	40 %	20 %	20 %	20 %	378706545
3281	NC_016901	TGT	2	6	218672	218677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706545
3282	NC_016901	TGT	2	6	218711	218716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706545
3283	NC_016901	TCA	2	6	218821	218826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706545
3284	NC_016901	GAT	2	6	218838	218843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706545
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3286	NC_016901	ATG	2	6	218880	218885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706545
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3289	NC_016901	GA	4	8	219135	219142	50 %	0 %	50 %	0 %	378706545
3290	NC_016901	CAGT	2	8	219153	219160	25 %	25 %	25 %	25 %	378706545
3291	NC_016901	AAC	3	9	219203	219211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706545
3292	NC_016901	ATTG	2	8	219216	219223	25 %	50 %	25 %	0 %	378706545
3293	NC_016901	CGAA	2	8	219239	219246	50 %	0 %	25 %	25 %	378706545
3294	NC_016901	CAC	2	6	219248	219253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706545
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3297	NC_016901	CAAAAC	2	12	219438	219449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706546
3298	NC_016901	ACG	2	6	219454	219459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706546
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3302	NC_016901	CAA	2	6	219723	219728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706546
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3304	NC_016901	GTC	2	6	226103	226108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706547
3305	NC_016901	TTG	2	6	226186	226191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706547
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3307	NC_016901	TGG	2	6	226265	226270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706547
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3313	NC_016901	CTG	2	6	226789	226794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706547
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3315	NC_016901	CGA	2	6	226873	226878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706547
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3318	NC_016901	TGC	2	6	226970	226975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706547
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3320	NC_016901	GAA	2	6	227156	227161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706548
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3322	NC_016901	TGAT	2	8	227339	227346	25 %	50 %	25 %	0 %	378706548
3323	NC_016901	GTT	2	6	227378	227383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706548
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3330	NC_016901	TGA	2	6	228015	228020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706548
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3341	NC_016901	CTCA	2	8	228979	228986	25 %	25 %	0 %	50 %	378706549
3342	NC_016901	TGAAT	2	10	229055	229064	40 %	40 %	20 %	0 %	378706549
3343	NC_016901	GCTAAA	2	12	229797	229808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378706550
3344	NC_016901	ACTG	2	8	229874	229881	25 %	25 %	25 %	25 %	378706550
3345	NC_016901	TC	3	6	229888	229893	0 %	50 %	0 %	50 %	378706550
3346	NC_016901	TC	3	6	229933	229938	0 %	50 %	0 %	50 %	378706550
3347	NC_016901	AGA	2	6	229955	229960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706550
3348	NC_016901	CAAT	2	8	229978	229985	50 %	25 %	0 %	25 %	378706550
3349	NC_016901	TGC	2	6	230078	230083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706550
3350	NC_016901	TAG	3	9	230104	230112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706550
3351	NC_016901	CGTAC	2	10	230174	230183	20 %	20 %	20 %	40 %	378706550
3352	NC_016901	ATC	2	6	230184	230189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706550
3353	NC_016901	GAA	2	6	230223	230228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706550
3354	NC_016901	TGA	2	6	230288	230293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706550
3355	NC_016901	GTA	2	6	230472	230477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706550
3356	NC_016901	AAC	2	6	230552	230557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706550
3357	NC_016901	GCT	2	6	230585	230590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706550
3358	NC_016901	GT	3	6	230620	230625	0 %	50 %	50 %	0 %	378706550
3359	NC_016901	TGA	2	6	230645	230650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706550
3360	NC_016901	TCAA	2	8	230685	230692	50 %	25 %	0 %	25 %	378706550
3361	NC_016901	CA	3	6	230695	230700	50 %	0 %	0 %	50 %	378706550
3362	NC_016901	AGA	2	6	230735	230740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706550
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3366	NC_016901	GTA	2	6	230955	230960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706550
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3383	NC_016901	CTTA	2	8	232532	232539	25 %	50 %	0 %	25 %	378706553
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3481	NC_016901	TGGT	2	8	237521	237528	0 %	50 %	50 %	0 %	378706557
3482	NC_016901	AGA	2	6	237564	237569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706557
3483	NC_016901	ATC	2	6	237655	237660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706557
3484	NC_016901	GAA	2	6	237775	237780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706557
3485	NC_016901	TGC	2	6	237840	237845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706557
3486	NC_016901	AAAC	2	8	237892	237899	75 %	0 %	0 %	25 %	378706557
3487	NC_016901	AAG	2	6	237952	237957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706557
3488	NC_016901	TGA	2	6	237990	237995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706557
3489	NC_016901	GTC	2	6	238076	238081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706557
3490	NC_016901	GAA	2	6	238270	238275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706557
3491	NC_016901	GCTG	2	8	238284	238291	0 %	25 %	50 %	25 %	378706557
3492	NC_016901	ATTC	2	8	238358	238365	25 %	50 %	0 %	25 %	378706557
3493	NC_016901	TGA	3	9	238368	238376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706557
3494	NC_016901	AAAGAG	2	12	238444	238455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706557
3495	NC_016901	GTT	2	6	238506	238511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706557
3496	NC_016901	TACATG	2	12	238558	238569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378706557
3497	NC_016901	TGA	2	6	238590	238595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706557
3498	NC_016901	CAA	2	6	238639	238644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706557
3499	NC_016901	GGT	2	6	238669	238674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706557
3500	NC_016901	TCG	2	6	238796	238801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706557

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