MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus DSM 10332 plasmid unnamed

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016888	TCGG	2	8	1712	1719	0 %	25 %	50 %	25 %	379009186
2	NC_016888	ACCA	2	8	1900	1907	50 %	0 %	0 %	50 %	379009186
3	NC_016888	GACG	2	8	2172	2179	25 %	0 %	50 %	25 %	379009186
4	NC_016888	CGGT	2	8	2217	2224	0 %	25 %	50 %	25 %	379009186
5	NC_016888	CGGA	2	8	2445	2452	25 %	0 %	50 %	25 %	379009186
6	NC_016888	CCGT	2	8	2959	2966	0 %	25 %	25 %	50 %	379009187
7	NC_016888	TGAT	2	8	3229	3236	25 %	50 %	25 %	0 %	379009187
8	NC_016888	CTGG	2	8	3727	3734	0 %	25 %	50 %	25 %	379009188
9	NC_016888	TTGG	2	8	4417	4424	0 %	50 %	50 %	0 %	379009189
10	NC_016888	GACC	2	8	4435	4442	25 %	0 %	25 %	50 %	379009189
11	NC_016888	CGTC	2	8	5940	5947	0 %	25 %	25 %	50 %	379009193
12	NC_016888	GCTC	2	8	6569	6576	0 %	25 %	25 %	50 %	379009193
13	NC_016888	GCCG	2	8	8856	8863	0 %	0 %	50 %	50 %	379009194
14	NC_016888	CGGC	2	8	8865	8872	0 %	0 %	50 %	50 %	379009194
15	NC_016888	TCCT	2	8	8991	8998	0 %	50 %	0 %	50 %	379009194
16	NC_016888	CCAC	2	8	9574	9581	25 %	0 %	0 %	75 %	379009195
17	NC_016888	GGCG	2	8	10166	10173	0 %	0 %	75 %	25 %	379009196
18	NC_016888	CCAG	2	8	10196	10203	25 %	0 %	25 %	50 %	379009196
19	NC_016888	GGCC	2	8	10637	10644	0 %	0 %	50 %	50 %	379009196
20	NC_016888	ATGA	2	8	10647	10654	50 %	25 %	25 %	0 %	379009196
21	NC_016888	GAAA	2	8	11508	11515	75 %	0 %	25 %	0 %	379009197
22	NC_016888	CTGG	2	8	11694	11701	0 %	25 %	50 %	25 %	379009197
23	NC_016888	CAGA	2	8	12451	12458	50 %	0 %	25 %	25 %	379009197
24	NC_016888	ATCC	2	8	14213	14220	25 %	25 %	0 %	50 %	379009199
25	NC_016888	TCCG	2	8	14570	14577	0 %	25 %	25 %	50 %	379009199
26	NC_016888	GGCG	2	8	15528	15535	0 %	0 %	75 %	25 %	379009200
27	NC_016888	GAAC	2	8	16208	16215	50 %	0 %	25 %	25 %	379009200
28	NC_016888	TCCA	2	8	16618	16625	25 %	25 %	0 %	50 %	379009200
29	NC_016888	CGAA	2	8	17167	17174	50 %	0 %	25 %	25 %	379009201
30	NC_016888	ATGA	2	8	17564	17571	50 %	25 %	25 %	0 %	379009202
31	NC_016888	CTGG	2	8	17641	17648	0 %	25 %	50 %	25 %	379009202
32	NC_016888	CACC	2	8	19691	19698	25 %	0 %	0 %	75 %	379009203
33	NC_016888	TGGG	2	8	21881	21888	0 %	25 %	75 %	0 %	379009206
34	NC_016888	CGGT	2	8	22578	22585	0 %	25 %	50 %	25 %	379009207
35	NC_016888	TGGC	2	8	22775	22782	0 %	25 %	50 %	25 %	379009207
36	NC_016888	GAAA	2	8	22884	22891	75 %	0 %	25 %	0 %	379009208
37	NC_016888	TGCA	2	8	23282	23289	25 %	25 %	25 %	25 %	379009210
38	NC_016888	TGGT	2	8	24290	24297	0 %	50 %	50 %	0 %	379009211
39	NC_016888	GCAC	2	8	24366	24373	25 %	0 %	25 %	50 %	379009211
40	NC_016888	GATC	2	8	25201	25208	25 %	25 %	25 %	25 %	379009212
41	NC_016888	GATG	2	8	25585	25592	25 %	25 %	50 %	0 %	379009212
42	NC_016888	GCTT	2	8	25775	25782	0 %	50 %	25 %	25 %	379009213
43	NC_016888	GTCT	2	8	27436	27443	0 %	50 %	25 %	25 %	379009215
44	NC_016888	GCGT	2	8	28699	28706	0 %	25 %	50 %	25 %	379009215
45	NC_016888	CGCC	2	8	28956	28963	0 %	0 %	25 %	75 %	379009215
46	NC_016888	TTGG	2	8	29175	29182	0 %	50 %	50 %	0 %	379009216
47	NC_016888	TCAT	2	8	29328	29335	25 %	50 %	0 %	25 %	379009216
48	NC_016888	TGGC	2	8	29375	29382	0 %	25 %	50 %	25 %	379009216
49	NC_016888	TCCA	2	8	29546	29553	25 %	25 %	0 %	50 %	379009216
50	NC_016888	TCGG	2	8	30158	30165	0 %	25 %	50 %	25 %	379009217
51	NC_016888	TCAT	2	8	30250	30257	25 %	50 %	0 %	25 %	379009217
52	NC_016888	CCGG	2	8	30372	30379	0 %	0 %	50 %	50 %	379009217
53	NC_016888	GCAG	2	8	30834	30841	25 %	0 %	50 %	25 %	379009218
54	NC_016888	ACGG	2	8	31551	31558	25 %	0 %	50 %	25 %	379009219
55	NC_016888	GGTG	2	8	32170	32177	0 %	25 %	75 %	0 %	379009220
56	NC_016888	GTCG	2	8	32288	32295	0 %	25 %	50 %	25 %	379009220
57	NC_016888	GGAG	2	8	32468	32475	25 %	0 %	75 %	0 %	379009220
58	NC_016888	GCCA	2	8	32624	32631	25 %	0 %	25 %	50 %	379009220
59	NC_016888	GAAG	2	8	32909	32916	50 %	0 %	50 %	0 %	379009221
60	NC_016888	GTTC	2	8	35186	35193	0 %	50 %	25 %	25 %	379009224
61	NC_016888	GACA	2	8	35199	35206	50 %	0 %	25 %	25 %	379009224
62	NC_016888	CGAT	2	8	35799	35806	25 %	25 %	25 %	25 %	379009225
63	NC_016888	GGCC	2	8	36764	36771	0 %	0 %	50 %	50 %	379009226
64	NC_016888	ATGC	2	8	37221	37228	25 %	25 %	25 %	25 %	379009226
65	NC_016888	ACCA	2	8	38138	38145	50 %	0 %	0 %	50 %	379009227
66	NC_016888	GGTT	2	8	39435	39442	0 %	50 %	50 %	0 %	379009229
67	NC_016888	AAAG	2	8	39830	39837	75 %	0 %	25 %	0 %	379009229
68	NC_016888	GTTT	2	8	40133	40140	0 %	75 %	25 %	0 %	379009230
69	NC_016888	CTAT	2	8	40283	40290	25 %	50 %	0 %	25 %	379009230
70	NC_016888	CGGT	2	8	40927	40934	0 %	25 %	50 %	25 %	379009230
71	NC_016888	AAAG	2	8	41290	41297	75 %	0 %	25 %	0 %	379009231
72	NC_016888	CCGG	2	8	41356	41363	0 %	0 %	50 %	50 %	379009231
73	NC_016888	GAGG	2	8	41992	41999	25 %	0 %	75 %	0 %	379009231
74	NC_016888	CATT	2	8	45226	45233	25 %	50 %	0 %	25 %	379009236
75	NC_016888	TGCG	2	8	45749	45756	0 %	25 %	50 %	25 %	379009236
76	NC_016888	GGGA	2	8	47290	47297	25 %	0 %	75 %	0 %	379009237
77	NC_016888	CGGG	2	8	47582	47589	0 %	0 %	75 %	25 %	379009238
78	NC_016888	ATGC	2	8	47886	47893	25 %	25 %	25 %	25 %	379009238
79	NC_016888	TCGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	25 %	25 %	379009238
80	NC_016888	CTCA	2	8	49014	49021	25 %	25 %	0 %	50 %	379009238
81	NC_016888	GTGG	2	8	49062	49069	0 %	25 %	75 %	0 %	379009238
82	NC_016888	ATCG	2	8	49686	49693	25 %	25 %	25 %	25 %	379009238
83	NC_016888	GCGG	2	8	51808	51815	0 %	0 %	75 %	25 %	379009239
84	NC_016888	GCCA	2	8	53182	53189	25 %	0 %	25 %	50 %	379009240
85	NC_016888	GGTC	2	8	53594	53601	0 %	25 %	50 %	25 %	379009240
86	NC_016888	TCGA	2	8	54063	54070	25 %	25 %	25 %	25 %	379009240
87	NC_016888	TTTC	2	8	54782	54789	0 %	75 %	0 %	25 %	379009241
88	NC_016888	TGGG	2	8	55222	55229	0 %	25 %	75 %	0 %	379009241
89	NC_016888	ATTG	2	8	55880	55887	25 %	50 %	25 %	0 %	379009241
90	NC_016888	TTTG	2	8	55987	55994	0 %	75 %	25 %	0 %	379009241
91	NC_016888	ATAA	2	8	56028	56035	75 %	25 %	0 %	0 %	379009241
92	NC_016888	CGGG	2	8	57058	57065	0 %	0 %	75 %	25 %	379009242
93	NC_016888	ACCG	2	8	57108	57115	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
94	NC_016888	CGCA	2	8	57454	57461	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
95	NC_016888	ACCG	2	8	57802	57809	25 %	0 %	25 %	50 %	379009242
96	NC_016888	TGGG	2	8	57868	57875	0 %	25 %	75 %	0 %	379009242
97	NC_016888	GGGC	2	8	59113	59120	0 %	0 %	75 %	25 %	379009244
98	NC_016888	GGCG	2	8	59204	59211	0 %	0 %	75 %	25 %	379009244
99	NC_016888	TCCG	2	8	64079	64086	0 %	25 %	25 %	50 %	379009247
100	NC_016888	GAGT	2	8	64420	64427	25 %	25 %	50 %	0 %	379009247
101	NC_016888	GCTG	2	8	65737	65744	0 %	25 %	50 %	25 %	379009249
102	NC_016888	GTCG	2	8	65926	65933	0 %	25 %	50 %	25 %	379009249
103	NC_016888	TGGC	2	8	66191	66198	0 %	25 %	50 %	25 %	379009249
104	NC_016888	CCCG	2	8	66805	66812	0 %	0 %	25 %	75 %	379009250
105	NC_016888	GAGC	2	8	67292	67299	25 %	0 %	50 %	25 %	379009251
106	NC_016888	TTGA	2	8	67770	67777	25 %	50 %	25 %	0 %	379009252
107	NC_016888	CAAT	2	8	67780	67787	50 %	25 %	0 %	25 %	379009252
108	NC_016888	GATC	2	8	68108	68115	25 %	25 %	25 %	25 %	379009252
109	NC_016888	CTGG	2	8	68297	68304	0 %	25 %	50 %	25 %	379009252
110	NC_016888	TACA	2	8	69413	69420	50 %	25 %	0 %	25 %	379009254
111	NC_016888	GCAC	2	8	69916	69923	25 %	0 %	25 %	50 %	379009254
112	NC_016888	GGTC	2	8	70040	70047	0 %	25 %	50 %	25 %	379009254
113	NC_016888	GGAA	2	8	70794	70801	50 %	0 %	50 %	0 %	379009256
114	NC_016888	CACT	2	8	71060	71067	25 %	25 %	0 %	50 %	379009256
115	NC_016888	TGCA	2	8	71151	71158	25 %	25 %	25 %	25 %	379009256
116	NC_016888	GCTC	2	8	72114	72121	0 %	25 %	25 %	50 %	379009256
117	NC_016888	GTTC	2	8	72498	72505	0 %	50 %	25 %	25 %	379009256
118	NC_016888	CAGG	2	8	72584	72591	25 %	0 %	50 %	25 %	379009256
119	NC_016888	GCCG	2	8	72808	72815	0 %	0 %	50 %	50 %	379009256
120	NC_016888	CGCA	2	8	73050	73057	25 %	0 %	25 %	50 %	379009256
121	NC_016888	CTGT	2	8	73858	73865	0 %	50 %	25 %	25 %	379009259
122	NC_016888	GTTT	2	8	75022	75029	0 %	75 %	25 %	0 %	379009260
123	NC_016888	TCCG	2	8	75665	75672	0 %	25 %	25 %	50 %	379009260
124	NC_016888	GCGG	2	8	75751	75758	0 %	0 %	75 %	25 %	379009260
125	NC_016888	ACAG	2	8	75853	75860	50 %	0 %	25 %	25 %	379009260
126	NC_016888	CTCA	2	8	76525	76532	25 %	25 %	0 %	50 %	379009262
127	NC_016888	TCCA	2	8	76822	76829	25 %	25 %	0 %	50 %	379009262
128	NC_016888	CCCA	2	8	79126	79133	25 %	0 %	0 %	75 %	379009263
129	NC_016888	GGAT	2	8	79517	79524	25 %	25 %	50 %	0 %	379009264
130	NC_016888	GATG	2	8	80982	80989	25 %	25 %	50 %	0 %	379009265
131	NC_016888	CGCA	2	8	81179	81186	25 %	0 %	25 %	50 %	379009265
132	NC_016888	TTGG	2	8	81449	81456	0 %	50 %	50 %	0 %	379009265
133	NC_016888	TGGC	2	8	81476	81483	0 %	25 %	50 %	25 %	379009265
134	NC_016888	GCAC	2	8	82002	82009	25 %	0 %	25 %	50 %	379009266
135	NC_016888	GTTG	2	8	82653	82660	0 %	50 %	50 %	0 %	379009268
136	NC_016888	AGCA	2	8	82810	82817	50 %	0 %	25 %	25 %	379009268
137	NC_016888	CAGC	2	8	83197	83204	25 %	0 %	25 %	50 %	379009269
138	NC_016888	GGGT	2	8	83841	83848	0 %	25 %	75 %	0 %	379009269

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.