MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 plasmid pSTUK-100

Total Repeats: 1528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016864	GTC	2	6	35252	35257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991899
502	NC_016864	GA	3	6	35278	35283	50 %	0 %	50 %	0 %	378991899
503	NC_016864	A	6	6	35365	35370	100 %	0 %	0 %	0 %	378991899
504	NC_016864	T	7	7	35432	35438	0 %	100 %	0 %	0 %	378991899
505	NC_016864	GT	3	6	35448	35453	0 %	50 %	50 %	0 %	378991899
506	NC_016864	GCA	2	6	36189	36194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
507	NC_016864	GGTC	2	8	36218	36225	0 %	25 %	50 %	25 %	378991900
508	NC_016864	CAGG	2	8	36314	36321	25 %	0 %	50 %	25 %	378991900
509	NC_016864	AC	3	6	36338	36343	50 %	0 %	0 %	50 %	378991900
510	NC_016864	ACC	2	6	36480	36485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991900
511	NC_016864	GGC	2	6	36504	36509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991900
512	NC_016864	CAGC	2	8	36536	36543	25 %	0 %	25 %	50 %	378991900
513	NC_016864	CAG	2	6	36546	36551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
514	NC_016864	CGG	2	6	36571	36576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991900
515	NC_016864	GCA	2	6	36615	36620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
516	NC_016864	GCA	3	9	36633	36641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
517	NC_016864	GCA	2	6	36644	36649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
518	NC_016864	GCC	2	6	36650	36655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991900
519	NC_016864	CGA	2	6	36683	36688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991900
520	NC_016864	GACA	2	8	36761	36768	50 %	0 %	25 %	25 %	378991901
521	NC_016864	CAT	2	6	36770	36775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991901
522	NC_016864	CCTG	2	8	36791	36798	0 %	25 %	25 %	50 %	378991901
523	NC_016864	GCA	2	6	36834	36839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991901
524	NC_016864	GCG	2	6	36943	36948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991901
525	NC_016864	AAT	2	6	37066	37071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991902
526	NC_016864	CGC	2	6	37129	37134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991902
527	NC_016864	CGG	2	6	37158	37163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991902
528	NC_016864	GAA	2	6	37178	37183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991902
529	NC_016864	AG	3	6	37249	37254	50 %	0 %	50 %	0 %	378991902
530	NC_016864	GTT	2	6	37307	37312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991902
531	NC_016864	CCCT	2	8	37317	37324	0 %	25 %	0 %	75 %	378991902
532	NC_016864	GGC	2	6	37363	37368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991902
533	NC_016864	CCG	2	6	37449	37454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991902
534	NC_016864	GCA	2	6	37474	37479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
535	NC_016864	CG	3	6	37517	37522	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
536	NC_016864	CTG	2	6	37562	37567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991902
537	NC_016864	GGCT	2	8	37611	37618	0 %	25 %	50 %	25 %	378991902
538	NC_016864	GCTG	2	8	37636	37643	0 %	25 %	50 %	25 %	378991902
539	NC_016864	CAC	2	6	37654	37659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991902
540	NC_016864	GGCGCT	2	12	37672	37683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378991902
541	NC_016864	GGA	2	6	37684	37689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991902
542	NC_016864	CAGGTG	2	12	37703	37714	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378991902
543	NC_016864	GGC	2	6	37720	37725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991902
544	NC_016864	CAA	2	6	37804	37809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991902
545	NC_016864	CGA	2	6	37876	37881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
546	NC_016864	CTG	2	6	37922	37927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991902
547	NC_016864	GTGG	2	8	37939	37946	0 %	25 %	75 %	0 %	378991902
548	NC_016864	CAG	2	6	38078	38083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
549	NC_016864	ACG	2	6	38109	38114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
550	NC_016864	GC	3	6	38209	38214	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
551	NC_016864	GTG	3	9	38225	38233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991902
552	NC_016864	CTG	2	6	38366	38371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991902
553	NC_016864	TG	3	6	38379	38384	0 %	50 %	50 %	0 %	378991902
554	NC_016864	GGC	2	6	38407	38412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991902
555	NC_016864	GCA	2	6	38419	38424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
556	NC_016864	CAG	2	6	38476	38481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
557	NC_016864	GCC	2	6	38548	38553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991902
558	NC_016864	AGG	2	6	38589	38594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991902
559	NC_016864	CAC	2	6	38641	38646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991902
560	NC_016864	GCG	2	6	38727	38732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991902
561	NC_016864	CAC	2	6	38740	38745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991902
562	NC_016864	CGCT	2	8	38775	38782	0 %	25 %	25 %	50 %	378991902
563	NC_016864	TGG	2	6	38798	38803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991902
564	NC_016864	CGA	2	6	38808	38813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
565	NC_016864	TTC	2	6	38822	38827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378991902
566	NC_016864	A	6	6	38837	38842	100 %	0 %	0 %	0 %	378991902
567	NC_016864	ATC	2	6	38849	38854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991902
568	NC_016864	GGCGC	2	10	38882	38891	0 %	0 %	60 %	40 %	378991902
569	NC_016864	GAA	2	6	38908	38913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991902
570	NC_016864	GC	3	6	38977	38982	0 %	0 %	50 %	50 %	378991902
571	NC_016864	ACG	2	6	38997	39002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991902
572	NC_016864	CCA	2	6	39040	39045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378991902
573	NC_016864	ATG	2	6	39107	39112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991903
574	NC_016864	ATT	2	6	39119	39124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378991903
575	NC_016864	CGG	2	6	39178	39183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991903
576	NC_016864	CGC	2	6	39211	39216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991903
577	NC_016864	TGG	2	6	39277	39282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991903
578	NC_016864	T	6	6	39283	39288	0 %	100 %	0 %	0 %	378991903
579	NC_016864	TGG	2	6	39372	39377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991903
580	NC_016864	TGG	2	6	39465	39470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378991903
581	NC_016864	CAT	2	6	39505	39510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991903
582	NC_016864	GCA	2	6	39533	39538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991903
583	NC_016864	AGCC	2	8	39572	39579	25 %	0 %	25 %	50 %	378991904
584	NC_016864	GGC	2	6	39585	39590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378991904
585	NC_016864	GAA	2	6	39613	39618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991904
586	NC_016864	CGC	2	6	39622	39627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378991904
587	NC_016864	GCCC	2	8	39642	39649	0 %	0 %	25 %	75 %	378991904
588	NC_016864	T	6	6	39666	39671	0 %	100 %	0 %	0 %	378991904
589	NC_016864	GCA	2	6	39686	39691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991904
590	NC_016864	GAA	2	6	39744	39749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991904
591	NC_016864	CG	3	6	39873	39878	0 %	0 %	50 %	50 %	378991904
592	NC_016864	GGA	2	6	39933	39938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991904
593	NC_016864	GCT	2	6	39960	39965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991904
594	NC_016864	CTG	2	6	39976	39981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991904
595	NC_016864	CG	3	6	40062	40067	0 %	0 %	50 %	50 %	378991904
596	NC_016864	TGA	2	6	40143	40148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378991904
597	NC_016864	CAA	2	6	40236	40241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378991904
598	NC_016864	ATC	2	6	41913	41918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991905
599	NC_016864	GAC	2	6	41991	41996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991905
600	NC_016864	CTG	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991905
601	NC_016864	C	6	6	42060	42065	0 %	0 %	0 %	100 %	378991905
602	NC_016864	ATA	2	6	42088	42093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991905
603	NC_016864	CAGG	2	8	42112	42119	25 %	0 %	50 %	25 %	378991905
604	NC_016864	GTT	2	6	42132	42137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378991905
605	NC_016864	TTCC	2	8	42253	42260	0 %	50 %	0 %	50 %	378991905
606	NC_016864	TC	3	6	42299	42304	0 %	50 %	0 %	50 %	378991905
607	NC_016864	AGG	2	6	42356	42361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378991905
608	NC_016864	ACAG	2	8	42362	42369	50 %	0 %	25 %	25 %	378991905
609	NC_016864	TA	4	8	42815	42822	50 %	50 %	0 %	0 %	378991906
610	NC_016864	AATAA	2	10	42838	42847	80 %	20 %	0 %	0 %	378991906
611	NC_016864	ACG	2	6	42864	42869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378991906
612	NC_016864	GA	3	6	42882	42887	50 %	0 %	50 %	0 %	378991906
613	NC_016864	CAGA	2	8	42985	42992	50 %	0 %	25 %	25 %	378991906
614	NC_016864	TC	3	6	43063	43068	0 %	50 %	0 %	50 %	378991906
615	NC_016864	GAA	2	6	43171	43176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991906
616	NC_016864	AGAA	2	8	43392	43399	75 %	0 %	25 %	0 %	378991907
617	NC_016864	TAAA	2	8	43418	43425	75 %	25 %	0 %	0 %	378991907
618	NC_016864	GCT	2	6	43636	43641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378991907
619	NC_016864	ATA	2	6	43706	43711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991907
620	NC_016864	TTGTG	2	10	43721	43730	0 %	60 %	40 %	0 %	378991907
621	NC_016864	ATTT	2	8	43739	43746	25 %	75 %	0 %	0 %	378991907
622	NC_016864	ATC	2	6	43751	43756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378991907
623	NC_016864	T	7	7	43759	43765	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
624	NC_016864	TC	4	8	43792	43799	0 %	50 %	0 %	50 %	378991907
625	NC_016864	GAAC	2	8	43818	43825	50 %	0 %	25 %	25 %	378991907
626	NC_016864	T	6	6	43847	43852	0 %	100 %	0 %	0 %	378991907
627	NC_016864	AGA	2	6	43920	43925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378991907
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629	NC_016864	ATA	2	6	44011	44016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378991907
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