MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016863	TTG	2	6	52291	52296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987448
1002	NC_016863	AGC	2	6	52356	52361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987448
1003	NC_016863	GCA	2	6	52405	52410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987448
1004	NC_016863	TGA	2	6	52448	52453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987448
1005	NC_016863	CAT	2	6	52461	52466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987448
1006	NC_016863	GC	3	6	52513	52518	0 %	0 %	50 %	50 %	378987448
1007	NC_016863	GCA	2	6	52652	52657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987449
1008	NC_016863	GCG	2	6	52738	52743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987449
1009	NC_016863	TCT	2	6	52783	52788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987449
1010	NC_016863	TCA	2	6	52796	52801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987449
1011	NC_016863	TTAACC	2	12	52815	52826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987449
1012	NC_016863	CATA	2	8	52890	52897	50 %	25 %	0 %	25 %	378987450
1013	NC_016863	TCAG	2	8	52901	52908	25 %	25 %	25 %	25 %	378987450
1014	NC_016863	GT	3	6	52920	52925	0 %	50 %	50 %	0 %	378987450
1015	NC_016863	GAA	2	6	52990	52995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987450
1016	NC_016863	GGT	3	9	53016	53024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987450
1017	NC_016863	GCG	2	6	53123	53128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987450
1018	NC_016863	TGTGC	2	10	53136	53145	0 %	40 %	40 %	20 %	378987450
1019	NC_016863	CGC	2	6	53158	53163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987450
1020	NC_016863	CTG	2	6	53200	53205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987450
1021	NC_016863	GAT	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987450
1022	NC_016863	CG	3	6	53266	53271	0 %	0 %	50 %	50 %	378987450
1023	NC_016863	TTA	2	6	53284	53289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987450
1024	NC_016863	GGC	2	6	53347	53352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987450
1025	NC_016863	AGT	2	6	53362	53367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987450
1026	NC_016863	CTG	2	6	53419	53424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987450
1027	NC_016863	CGA	2	6	53463	53468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987450
1028	NC_016863	TGGC	2	8	53615	53622	0 %	25 %	50 %	25 %	378987450
1029	NC_016863	CAA	2	6	53629	53634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987450
1030	NC_016863	CTG	2	6	53647	53652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987450
1031	NC_016863	AGC	2	6	53717	53722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987450
1032	NC_016863	TGA	2	6	53736	53741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987450
1033	NC_016863	T	6	6	53785	53790	0 %	100 %	0 %	0 %	378987450
1034	NC_016863	TGA	2	6	53854	53859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1035	NC_016863	GCG	2	6	53908	53913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987451
1036	NC_016863	GAT	3	9	53955	53963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1037	NC_016863	CAT	2	6	53972	53977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987451
1038	NC_016863	A	6	6	53988	53993	100 %	0 %	0 %	0 %	378987451
1039	NC_016863	A	7	7	53997	54003	100 %	0 %	0 %	0 %	378987451
1040	NC_016863	ATG	2	6	54016	54021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1041	NC_016863	GCA	2	6	54040	54045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1042	NC_016863	CAT	2	6	54347	54352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987451
1043	NC_016863	CG	3	6	54354	54359	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
1044	NC_016863	GCGGAA	2	12	54441	54452	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378987451
1045	NC_016863	ACC	2	6	54576	54581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987451
1046	NC_016863	CTG	2	6	54762	54767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1047	NC_016863	CTG	2	6	55011	55016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1048	NC_016863	GC	3	6	55027	55032	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
1049	NC_016863	A	6	6	55045	55050	100 %	0 %	0 %	0 %	378987451
1050	NC_016863	GCA	2	6	55052	55057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1051	NC_016863	CG	3	6	55101	55106	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
1052	NC_016863	AAG	2	6	55135	55140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987451
1053	NC_016863	GCT	2	6	55307	55312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1054	NC_016863	GGC	2	6	55331	55336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987451
1055	NC_016863	GTG	2	6	55382	55387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987451
1056	NC_016863	GTTTG	2	10	55458	55467	0 %	60 %	40 %	0 %	378987451
1057	NC_016863	CCA	2	6	55477	55482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987451
1058	NC_016863	TGC	2	6	55523	55528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1059	NC_016863	TCC	2	6	55575	55580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987451
1060	NC_016863	TGA	2	6	55582	55587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1061	NC_016863	TGA	2	6	55708	55713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1062	NC_016863	TGC	2	6	55802	55807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1063	NC_016863	TCG	2	6	55817	55822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1064	NC_016863	CG	3	6	55835	55840	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
1065	NC_016863	CTG	2	6	55845	55850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1066	NC_016863	TGG	2	6	55903	55908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987451
1067	NC_016863	GCA	2	6	55946	55951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1068	NC_016863	GTTC	2	8	56032	56039	0 %	50 %	25 %	25 %	378987451
1069	NC_016863	CAT	2	6	56048	56053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987451
1070	NC_016863	CG	3	6	56090	56095	0 %	0 %	50 %	50 %	378987451
1071	NC_016863	TGA	2	6	56174	56179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1072	NC_016863	ACG	2	6	56236	56241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987451
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1074	NC_016863	GAA	2	6	56265	56270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987451
1075	NC_016863	CAA	2	6	56318	56323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987451
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1078	NC_016863	TGA	3	9	56498	56506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1079	NC_016863	GCT	2	6	56581	56586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987451
1080	NC_016863	CACTA	2	10	56589	56598	40 %	20 %	0 %	40 %	378987451
1081	NC_016863	AAC	2	6	56671	56676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987451
1082	NC_016863	TGA	2	6	56688	56693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987451
1083	NC_016863	GTA	2	6	56735	56740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987452
1084	NC_016863	GCA	2	6	56763	56768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987452
1085	NC_016863	TCC	2	6	56778	56783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987452
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1087	NC_016863	TGA	2	6	56943	56948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987452
1088	NC_016863	ATC	2	6	56999	57004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987452
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1090	NC_016863	GC	3	6	57009	57014	0 %	0 %	50 %	50 %	378987452
1091	NC_016863	TGT	2	6	57049	57054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987452
1092	NC_016863	CGGCG	2	10	57127	57136	0 %	0 %	60 %	40 %	378987452
1093	NC_016863	TTCAC	2	10	57382	57391	20 %	40 %	0 %	40 %	378987453
1094	NC_016863	GAT	2	6	57402	57407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987453
1095	NC_016863	CGG	2	6	57415	57420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987453
1096	NC_016863	AGCC	2	8	57442	57449	25 %	0 %	25 %	50 %	378987453
1097	NC_016863	AGC	3	9	57490	57498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987453
1098	NC_016863	AAG	2	6	57511	57516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987453
1099	NC_016863	AAAG	2	8	57521	57528	75 %	0 %	25 %	0 %	378987453
1100	NC_016863	CGC	2	6	57548	57553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987453
1101	NC_016863	GGC	2	6	57608	57613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987453
1102	NC_016863	ATGG	2	8	57654	57661	25 %	25 %	50 %	0 %	378987453
1103	NC_016863	TTG	2	6	57858	57863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987454
1104	NC_016863	GC	3	6	57885	57890	0 %	0 %	50 %	50 %	378987454
1105	NC_016863	GC	4	8	58115	58122	0 %	0 %	50 %	50 %	378987454
1106	NC_016863	G	6	6	58211	58216	0 %	0 %	100 %	0 %	378987454
1107	NC_016863	TGG	2	6	58224	58229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987454
1108	NC_016863	TGAT	2	8	58326	58333	25 %	50 %	25 %	0 %	378987454
1109	NC_016863	TCG	2	6	58359	58364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987454
1110	NC_016863	TGG	2	6	58449	58454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987454
1111	NC_016863	TCTAAC	2	12	58472	58483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987454
1112	NC_016863	GAA	2	6	58512	58517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987454
1113	NC_016863	CGA	2	6	58531	58536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987454
1114	NC_016863	GCG	2	6	58538	58543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987454
1115	NC_016863	AGG	2	6	58551	58556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987454
1116	NC_016863	GCC	2	6	58571	58576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987454
1117	NC_016863	GGC	3	9	58652	58660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987454
1118	NC_016863	GAA	2	6	58685	58690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987454
1119	NC_016863	AAAAT	2	10	58953	58962	80 %	20 %	0 %	0 %	378987455
1120	NC_016863	TGGA	2	8	58995	59002	25 %	25 %	50 %	0 %	378987455
1121	NC_016863	CAA	2	6	59005	59010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987455
1122	NC_016863	CCTG	2	8	59031	59038	0 %	25 %	25 %	50 %	378987455
1123	NC_016863	CT	3	6	59105	59110	0 %	50 %	0 %	50 %	378987455
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1499	NC_016863	CGATG	2	10	77759	77768	20 %	20 %	40 %	20 %	378987472
1500	NC_016863	CGG	2	6	77885	77890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987472

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