MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_016863	GGC	2	6	25989	25994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
503	NC_016863	ACG	2	6	26071	26076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
504	NC_016863	GC	3	6	26084	26089	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
505	NC_016863	GCCT	2	8	26113	26120	0 %	25 %	25 %	50 %	378987427
506	NC_016863	GGC	3	9	26181	26189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
507	NC_016863	GCC	2	6	26224	26229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
508	NC_016863	GCA	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
509	NC_016863	GGC	2	6	26280	26285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
510	NC_016863	GGC	2	6	26398	26403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
511	NC_016863	ACT	2	6	26471	26476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987427
512	NC_016863	GCG	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
513	NC_016863	AGCGAC	2	12	26509	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
514	NC_016863	GCA	2	6	26523	26528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
515	NC_016863	ATT	2	6	26607	26612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
516	NC_016863	CCTT	2	8	26619	26626	0 %	50 %	0 %	50 %	378987427
517	NC_016863	GAC	2	6	26650	26655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
518	NC_016863	CAT	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987427
519	NC_016863	GCC	2	6	26769	26774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
520	NC_016863	CCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
521	NC_016863	GCG	2	6	26816	26821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
522	NC_016863	CCG	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987427
523	NC_016863	GGC	2	6	26909	26914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
524	NC_016863	GCG	2	6	26923	26928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
525	NC_016863	TAG	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
526	NC_016863	TCAG	2	8	26978	26985	25 %	25 %	25 %	25 %	378987427
527	NC_016863	GCG	2	6	27074	27079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
528	NC_016863	ATA	2	6	27143	27148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987427
529	NC_016863	GAT	2	6	27262	27267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
530	NC_016863	ATT	2	6	27344	27349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
531	NC_016863	TTA	2	6	27357	27362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
532	NC_016863	AGG	2	6	27367	27372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987427
533	NC_016863	ATCA	2	8	27391	27398	50 %	25 %	0 %	25 %	378987427
534	NC_016863	TTA	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987427
535	NC_016863	CAGC	2	8	27435	27442	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
536	NC_016863	TGA	2	6	27459	27464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
537	NC_016863	TTG	2	6	27475	27480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987427
538	NC_016863	ACA	2	6	27530	27535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
539	NC_016863	TGA	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
540	NC_016863	CTG	2	6	27718	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987427
541	NC_016863	ACA	2	6	27743	27748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
542	NC_016863	GCG	2	6	27785	27790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
543	NC_016863	CAG	2	6	27865	27870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987427
544	NC_016863	GGC	2	6	27889	27894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987427
545	NC_016863	TGG	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987427
546	NC_016863	AGCC	2	8	27925	27932	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
547	NC_016863	CG	3	6	28014	28019	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
548	NC_016863	GGT	2	6	28029	28034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987427
549	NC_016863	ACA	2	6	28045	28050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
550	NC_016863	GAT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
551	NC_016863	TGA	2	6	28107	28112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987427
552	NC_016863	CCGA	2	8	28132	28139	25 %	0 %	25 %	50 %	378987427
553	NC_016863	GC	3	6	28142	28147	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
554	NC_016863	GC	3	6	28178	28183	0 %	0 %	50 %	50 %	378987427
555	NC_016863	ACGGTG	2	12	28234	28245	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378987427
556	NC_016863	TTG	2	6	28268	28273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987427
557	NC_016863	GCGTC	2	10	28358	28367	0 %	20 %	40 %	40 %	378987427
558	NC_016863	ATC	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987427
559	NC_016863	TC	3	6	28374	28379	0 %	50 %	0 %	50 %	378987427
560	NC_016863	TCC	2	6	28381	28386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987427
561	NC_016863	ACA	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987427
562	NC_016863	CTG	2	6	28450	28455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987428
563	NC_016863	GT	3	6	28492	28497	0 %	50 %	50 %	0 %	378987428
564	NC_016863	ATTA	2	8	28525	28532	50 %	50 %	0 %	0 %	378987428
565	NC_016863	A	6	6	28592	28597	100 %	0 %	0 %	0 %	378987428
566	NC_016863	GT	3	6	28621	28626	0 %	50 %	50 %	0 %	378987428
567	NC_016863	CCG	2	6	28628	28633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987428
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590	NC_016863	CG	3	6	30432	30437	0 %	0 %	50 %	50 %	378987430
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593	NC_016863	TGCT	2	8	30542	30549	0 %	50 %	25 %	25 %	378987431
594	NC_016863	TATC	2	8	30598	30605	25 %	50 %	0 %	25 %	378987431
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599	NC_016863	GC	3	6	30764	30769	0 %	0 %	50 %	50 %	378987431
600	NC_016863	GGT	2	6	30787	30792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987431
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610	NC_016863	TAT	2	6	31278	31283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987432
611	NC_016863	CGC	2	6	31352	31357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987432
612	NC_016863	CGG	2	6	31390	31395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987432
613	NC_016863	GTCA	2	8	31407	31414	25 %	25 %	25 %	25 %	378987432
614	NC_016863	CGC	2	6	31475	31480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987432
615	NC_016863	CAG	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987432
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621	NC_016863	T	6	6	31723	31728	0 %	100 %	0 %	0 %	378987432
622	NC_016863	GGC	2	6	31754	31759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987432
623	NC_016863	GGGCG	2	10	31790	31799	0 %	0 %	80 %	20 %	378987432
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