MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 88570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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61502	NC_016863	GCT	2	6	3358560	3358565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61503	NC_016863	CTG	2	6	3358585	3358590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61504	NC_016863	GAAG	2	8	3358617	3358624	50 %	0 %	50 %	0 %	378990542
61505	NC_016863	CGTA	2	8	3358713	3358720	25 %	25 %	25 %	25 %	378990542
61506	NC_016863	CTG	2	6	3358729	3358734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61507	NC_016863	CGC	2	6	3358742	3358747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990542
61508	NC_016863	TGC	2	6	3358748	3358753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61509	NC_016863	CAC	2	6	3358824	3358829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990542
61510	NC_016863	GC	3	6	3358878	3358883	0 %	0 %	50 %	50 %	378990542
61511	NC_016863	CTG	2	6	3358894	3358899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61512	NC_016863	TCG	2	6	3358979	3358984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990542
61513	NC_016863	AAT	2	6	3359099	3359104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378990542
61514	NC_016863	GCTT	2	8	3359488	3359495	0 %	50 %	25 %	25 %	378990543
61515	NC_016863	TCG	2	6	3359506	3359511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
61516	NC_016863	ACC	2	6	3359572	3359577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990543
61517	NC_016863	A	6	6	3359587	3359592	100 %	0 %	0 %	0 %	378990543
61518	NC_016863	TCTT	2	8	3359611	3359618	0 %	75 %	0 %	25 %	378990543
61519	NC_016863	GGC	2	6	3359648	3359653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990543
61520	NC_016863	CCTTC	2	10	3359671	3359680	0 %	40 %	0 %	60 %	378990543
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61522	NC_016863	CTG	2	6	3359751	3359756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
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61527	NC_016863	CTG	2	6	3360009	3360014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
61528	NC_016863	GTC	2	6	3360015	3360020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
61529	NC_016863	TGC	2	6	3360034	3360039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
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61532	NC_016863	GCCT	2	8	3360111	3360118	0 %	25 %	25 %	50 %	378990543
61533	NC_016863	GCG	2	6	3360127	3360132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990543
61534	NC_016863	CTT	2	6	3360140	3360145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990543
61535	NC_016863	GCC	2	6	3360159	3360164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378990543
61536	NC_016863	TACT	2	8	3360215	3360222	25 %	50 %	0 %	25 %	378990543
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61540	NC_016863	TG	3	6	3360364	3360369	0 %	50 %	50 %	0 %	378990543
61541	NC_016863	GCG	2	6	3360373	3360378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378990543
61542	NC_016863	TGC	2	6	3360403	3360408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990543
61543	NC_016863	GTA	2	6	3360462	3360467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990543
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61550	NC_016863	TGC	2	6	3361269	3361274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990544
61551	NC_016863	GCTG	2	8	3361323	3361330	0 %	25 %	50 %	25 %	378990544
61552	NC_016863	CT	3	6	3361358	3361363	0 %	50 %	0 %	50 %	378990544
61553	NC_016863	ATC	2	6	3361380	3361385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990544
61554	NC_016863	GCT	2	6	3361462	3361467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990544
61555	NC_016863	CCA	2	6	3361470	3361475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378990544
61556	NC_016863	CG	3	6	3361501	3361506	0 %	0 %	50 %	50 %	378990544
61557	NC_016863	TTC	2	6	3361514	3361519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378990544
61558	NC_016863	TTG	2	6	3361535	3361540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378990544
61559	NC_016863	CTG	2	6	3361571	3361576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990544
61560	NC_016863	TGC	3	9	3361629	3361637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378990544
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61562	NC_016863	T	6	6	3361652	3361657	0 %	100 %	0 %	0 %	378990544
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61566	NC_016863	CAT	2	6	3361886	3361891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378990545
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61581	NC_016863	AG	3	6	3362799	3362804	50 %	0 %	50 %	0 %	378990547
61582	NC_016863	GTGAT	2	10	3362828	3362837	20 %	40 %	40 %	0 %	378990547
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61587	NC_016863	TGG	2	6	3363046	3363051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378990548
61588	NC_016863	GTA	2	6	3363072	3363077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990548
61589	NC_016863	GAA	2	6	3363084	3363089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378990548
61590	NC_016863	GAT	2	6	3363215	3363220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990548
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61597	NC_016863	CTGG	2	8	3363451	3363458	0 %	25 %	50 %	25 %	378990549
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61600	NC_016863	CAA	2	6	3363638	3363643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378990549
61601	NC_016863	TC	3	6	3363808	3363813	0 %	50 %	0 %	50 %	378990550
61602	NC_016863	ATG	2	6	3363825	3363830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378990550
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61606	NC_016863	TTA	2	6	3363954	3363959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378990550
61607	NC_016863	CA	3	6	3363994	3363999	50 %	0 %	0 %	50 %	378990550
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